RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511663.5

SH3BP2-220, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 966 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-220ENST00000511663 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP25.48■■□□□ 1.67
SH3BP2-220ENST00000511663 SOGA3Q5TF21 947 aa25.48■■□□□ 1.67
SH3BP2-220ENST00000511663 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa25.47■■□□□ 1.67
SH3BP2-220ENST00000511663 NFKBIEO00221 500 aa25.47■■□□□ 1.67
SH3BP2-220ENST00000511663 SMC1BQ8NDV3 1235 aa25.47■■□□□ 1.67
SH3BP2-220ENST00000511663 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP25.47■■□□□ 1.67
SH3BP2-220ENST00000511663 RGL2O15211 777 aa25.46■■□□□ 1.67
SH3BP2-220ENST00000511663 SRGNP10124 158 aa25.46■■□□□ 1.67
SH3BP2-220ENST00000511663 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP25.46■■□□□ 1.67
SH3BP2-220ENST00000511663 NBPF26B4DH59 902 aa25.45■■□□□ 1.66
SH3BP2-220ENST00000511663 ERFEQ4G0M1 354 aa25.45■■□□□ 1.66
SH3BP2-220ENST00000511663 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP25.45■■□□□ 1.66
SH3BP2-220ENST00000511663 NBPF15Q8N660 670 aa25.45■■□□□ 1.66
SH3BP2-220ENST00000511663 PRELPP51888 382 aa25.44■■□□□ 1.66
SH3BP2-220ENST00000511663 NFE2L2Q16236 605 aa25.44■■□□□ 1.66
SH3BP2-220ENST00000511663 TAOK3Q9H2K8 898 aa25.44■■□□□ 1.66
SH3BP2-220ENST00000511663 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP25.43■■□□□ 1.66
SH3BP2-220ENST00000511663 NGEFQ8N5V2 710 aa25.43■■□□□ 1.66
SH3BP2-220ENST00000511663 PLEKHF1Q96S99 279 aa25.43■■□□□ 1.66
SH3BP2-220ENST00000511663 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa25.43■■□□□ 1.66
SH3BP2-220ENST00000511663 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP25.42■■□□□ 1.66
SH3BP2-220ENST00000511663 FAM177BA6PVY3 158 aa25.42■■□□□ 1.66
SH3BP2-220ENST00000511663 NPR1P16066 1061 aa25.42■■□□□ 1.66
SH3BP2-220ENST00000511663 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa25.41■■□□□ 1.66
SH3BP2-220ENST00000511663 LTBP3Q9NS15 1303 aa25.4■■□□□ 1.66
SH3BP2-220ENST00000511663 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP25.4■■□□□ 1.66
SH3BP2-220ENST00000511663 BCORQ6W2J9 1755 aa25.39■■□□□ 1.66
SH3BP2-220ENST00000511663 RALBP1Q15311 655 aa25.39■■□□□ 1.66
SH3BP2-220ENST00000511663 KIF6Q6ZMV9 814 aa25.39■■□□□ 1.66
SH3BP2-220ENST00000511663 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa25.38■■□□□ 1.65
SH3BP2-220ENST00000511663 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP25.38■■□□□ 1.65
SH3BP2-220ENST00000511663 HLFQ16534 295 aa25.38■■□□□ 1.65
SH3BP2-220ENST00000511663 IFFO2Q5TF58 517 aa25.38■■□□□ 1.65
SH3BP2-220ENST00000511663 NYXQ9GZU5 481 aa25.38■■□□□ 1.65
SH3BP2-220ENST00000511663 ERVV-1B6SEH8 477 aa25.37■■□□□ 1.65
SH3BP2-220ENST00000511663 ALDH1B1P30837 517 aa25.37■■□□□ 1.65
SH3BP2-220ENST00000511663 CCDC93Q567U6 631 aa25.37■■□□□ 1.65
SH3BP2-220ENST00000511663 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP25.37■■□□□ 1.65
SH3BP2-220ENST00000511663 MYL6BP14649 208 aa25.36■■□□□ 1.65
SH3BP2-220ENST00000511663 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP25.35■■□□□ 1.65
SH3BP2-220ENST00000511663 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP25.34■■□□□ 1.65
SH3BP2-220ENST00000511663 RIPK4P57078 832 aa25.34■■□□□ 1.65
SH3BP2-220ENST00000511663 HTRA3P83110 453 aa25.34■■□□□ 1.65
SH3BP2-220ENST00000511663 KLRG1Q96E93 195 aa25.34■■□□□ 1.65
SH3BP2-220ENST00000511663 TSPYL4Q9UJ04 414 aa25.34■■□□□ 1.65
SH3BP2-220ENST00000511663 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa25.34■■□□□ 1.65
SH3BP2-220ENST00000511663 RTKN2Q8IZC4 609 aa25.33■■□□□ 1.65
SH3BP2-220ENST00000511663 CEP350Q5VT06 3117 aa25.33■■□□□ 1.65
SH3BP2-220ENST00000511663 SLX4Q8IY92 1834 aa25.33■■□□□ 1.64
SH3BP2-220ENST00000511663 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa25.32■■□□□ 1.64
SH3BP2-220ENST00000511663 TIAM2Q8IVF5 1701 aa25.32■■□□□ 1.64
SH3BP2-220ENST00000511663 DLG5Q8TDM6 1919 aa25.32■■□□□ 1.64
SH3BP2-220ENST00000511663 LMOD3Q0VAK6 560 aa25.32■■□□□ 1.64
SH3BP2-220ENST00000511663 C7orf43Q8WVR3 580 aa25.32■■□□□ 1.64
SH3BP2-220ENST00000511663 WDR90Q96KV7 1748 aa25.32■■□□□ 1.64
SH3BP2-220ENST00000511663 POTECB2RU33 542 aa25.3■■□□□ 1.64
SH3BP2-220ENST00000511663 DDNO94850 711 aaPredicted RBP25.3■■□□□ 1.64
SH3BP2-220ENST00000511663 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP25.3■■□□□ 1.64
SH3BP2-220ENST00000511663 TTLL7Q6ZT98 887 aa25.3■■□□□ 1.64
SH3BP2-220ENST00000511663 ZBTB3Q9H5J0 574 aa25.3■■□□□ 1.64
SH3BP2-220ENST00000511663 ERBB4Q15303 1308 aa25.3■■□□□ 1.64
SH3BP2-220ENST00000511663 LAMB4A4D0S4 1761 aa25.28■■□□□ 1.64
SH3BP2-220ENST00000511663 CACNA1SQ13698 1873 aa25.28■■□□□ 1.64
SH3BP2-220ENST00000511663 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP25.28■■□□□ 1.64
SH3BP2-220ENST00000511663 IQCA1LA6NCM1 817 aa25.28■■□□□ 1.64
SH3BP2-220ENST00000511663 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP25.28■■□□□ 1.64
SH3BP2-220ENST00000511663 GPTP24298 496 aa25.28■■□□□ 1.64
SH3BP2-220ENST00000511663 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP25.28■■□□□ 1.64
SH3BP2-220ENST00000511663 NUTM1Q86Y26 1132 aa25.28■■□□□ 1.64
SH3BP2-220ENST00000511663 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP25.28■■□□□ 1.64
SH3BP2-220ENST00000511663 BABAM1Q9NWV8 329 aa25.28■■□□□ 1.64
SH3BP2-220ENST00000511663 KDM3BQ7LBC6 1761 aa25.27■■□□□ 1.64
SH3BP2-220ENST00000511663 TMPOP42166 694 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
SH3BP2-220ENST00000511663 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa25.26■■□□□ 1.63
SH3BP2-220ENST00000511663 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP25.26■■□□□ 1.63
SH3BP2-220ENST00000511663 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa25.25■■□□□ 1.63
SH3BP2-220ENST00000511663 CHADLQ6NUI6 762 aa25.25■■□□□ 1.63
SH3BP2-220ENST00000511663 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
SH3BP2-220ENST00000511663 JMYQ8N9B5 988 aa25.25■■□□□ 1.63
SH3BP2-220ENST00000511663 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa25.25■■□□□ 1.63
SH3BP2-220ENST00000511663 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
SH3BP2-220ENST00000511663 NEUROD2Q15784 382 aa25.24■■□□□ 1.63
SH3BP2-220ENST00000511663 SYNE4Q8N205 404 aa25.24■■□□□ 1.63
SH3BP2-220ENST00000511663 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP25.24■■□□□ 1.63
SH3BP2-220ENST00000511663 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP25.23■■□□□ 1.63
SH3BP2-220ENST00000511663 CRY2Q49AN0 593 aa25.23■■□□□ 1.63
SH3BP2-220ENST00000511663 PARP10Q53GL7 1025 aa25.23■■□□□ 1.63
SH3BP2-220ENST00000511663 SUSD4Q5VX71 490 aa25.23■■□□□ 1.63
SH3BP2-220ENST00000511663 OLFM4Q6UX06 510 aa25.23■■□□□ 1.63
SH3BP2-220ENST00000511663 ZNF34Q8IZ26 560 aa25.23■■□□□ 1.63
SH3BP2-220ENST00000511663 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
SH3BP2-220ENST00000511663 IARSP41252 1262 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
SH3BP2-220ENST00000511663 GRIPAP1Q4V328 841 aa25.22■■□□□ 1.63
SH3BP2-220ENST00000511663 JDP2Q8WYK2 163 aa25.22■■□□□ 1.63
SH3BP2-220ENST00000511663 NLRP3Q96P20 1036 aa25.21■■□□□ 1.63
SH3BP2-220ENST00000511663 NUP98P52948 1817 aa25.21■■□□□ 1.63
SH3BP2-220ENST00000511663 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.63
SH3BP2-220ENST00000511663 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
SH3BP2-220ENST00000511663 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
SH3BP2-220ENST00000511663 ABCC12Q96J65 1359 aa25.19■■□□□ 1.62
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