RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493016.1

TSC22D1-208, Transcript of TSC22 domain family member 1, humanhuman

TSL 4

Gene TSC22D1, Length 690 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSC22D1-208ENST00000493016 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
TSC22D1-208ENST00000493016 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa21.56■■□□□ 1.04
TSC22D1-208ENST00000493016 NUP98P52948 1817 aa21.55■■□□□ 1.04
TSC22D1-208ENST00000493016 TOMM70O94826 608 aa21.55■■□□□ 1.04
TSC22D1-208ENST00000493016 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
TSC22D1-208ENST00000493016 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
TSC22D1-208ENST00000493016 SLX4Q8IY92 1834 aa21.55■■□□□ 1.04
TSC22D1-208ENST00000493016 KDM2BQ8NHM5 1336 aa21.55■■□□□ 1.04
TSC22D1-208ENST00000493016 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
TSC22D1-208ENST00000493016 LMNB1P20700 586 aa21.54■■□□□ 1.04
TSC22D1-208ENST00000493016 CEP350Q5VT06 3117 aa21.54■■□□□ 1.04
TSC22D1-208ENST00000493016 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
TSC22D1-208ENST00000493016 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
TSC22D1-208ENST00000493016 TIAM2Q8IVF5 1701 aa21.53■■□□□ 1.04
TSC22D1-208ENST00000493016 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
TSC22D1-208ENST00000493016 PRELPP51888 382 aa21.52■■□□□ 1.04
TSC22D1-208ENST00000493016 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP21.52■■□□□ 1.04
TSC22D1-208ENST00000493016 NFKBIEO00221 500 aa21.51■■□□□ 1.03
TSC22D1-208ENST00000493016 SRGNP10124 158 aa21.51■■□□□ 1.03
TSC22D1-208ENST00000493016 RIPK4P57078 832 aa21.51■■□□□ 1.03
TSC22D1-208ENST00000493016 STYK1Q6J9G0 422 aa21.51■■□□□ 1.03
TSC22D1-208ENST00000493016 CNKSR1Q969H4 720 aa21.51■■□□□ 1.03
TSC22D1-208ENST00000493016 C21orf2O43822 256 aa21.5■■□□□ 1.03
TSC22D1-208ENST00000493016 HLFQ16534 295 aa21.5■■□□□ 1.03
TSC22D1-208ENST00000493016 TPTE2Q6XPS3 522 aa21.5■■□□□ 1.03
TSC22D1-208ENST00000493016 MASTLQ96GX5 879 aa21.5■■□□□ 1.03
TSC22D1-208ENST00000493016 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
TSC22D1-208ENST00000493016 TMPOP42166 694 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
TSC22D1-208ENST00000493016 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
TSC22D1-208ENST00000493016 NGEFQ8N5V2 710 aa21.48■■□□□ 1.03
TSC22D1-208ENST00000493016 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
TSC22D1-208ENST00000493016 RRAGCQ9HB90 399 aa21.48■■□□□ 1.03
TSC22D1-208ENST00000493016 TSPYL4Q9UJ04 414 aa21.48■■□□□ 1.03
TSC22D1-208ENST00000493016 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
TSC22D1-208ENST00000493016 ERVV-1B6SEH8 477 aa21.47■■□□□ 1.03
TSC22D1-208ENST00000493016 LMOD3Q0VAK6 560 aa21.47■■□□□ 1.03
TSC22D1-208ENST00000493016 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
TSC22D1-208ENST00000493016 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
TSC22D1-208ENST00000493016 FAM177BA6PVY3 158 aa21.46■■□□□ 1.03
TSC22D1-208ENST00000493016 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
TSC22D1-208ENST00000493016 BABAM1Q9NWV8 329 aa21.46■■□□□ 1.03
TSC22D1-208ENST00000493016 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa21.46■■□□□ 1.03
TSC22D1-208ENST00000493016 GLTPD2A6NH11 291 aa21.45■■□□□ 1.02
TSC22D1-208ENST00000493016 MYL6BP14649 208 aa21.45■■□□□ 1.02
TSC22D1-208ENST00000493016 SOGA3Q5TF21 947 aa21.45■■□□□ 1.02
TSC22D1-208ENST00000493016 KIF6Q6ZMV9 814 aa21.45■■□□□ 1.02
TSC22D1-208ENST00000493016 TTLL7Q6ZT98 887 aa21.45■■□□□ 1.02
TSC22D1-208ENST00000493016 ERBB4Q15303 1308 aa21.45■■□□□ 1.02
TSC22D1-208ENST00000493016 LTBP3Q9NS15 1303 aa21.45■■□□□ 1.02
TSC22D1-208ENST00000493016 NPR1P16066 1061 aa21.44■■□□□ 1.02
TSC22D1-208ENST00000493016 CCDC146Q8IYE0 955 aa21.44■■□□□ 1.02
TSC22D1-208ENST00000493016 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
TSC22D1-208ENST00000493016 APLP1P51693 650 aa21.43■■□□□ 1.02
TSC22D1-208ENST00000493016 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP21.43■■□□□ 1.02
TSC22D1-208ENST00000493016 TAOK3Q9H2K8 898 aa21.43■■□□□ 1.02
TSC22D1-208ENST00000493016 NEUROD2Q15784 382 aa21.42■■□□□ 1.02
TSC22D1-208ENST00000493016 RUNDC1Q96C34 613 aa21.42■■□□□ 1.02
TSC22D1-208ENST00000493016 NYXQ9GZU5 481 aa21.42■■□□□ 1.02
TSC22D1-208ENST00000493016 FSTL1Q12841 308 aa21.41■■□□□ 1.02
TSC22D1-208ENST00000493016 ERFEQ4G0M1 354 aa21.41■■□□□ 1.02
TSC22D1-208ENST00000493016 C7orf43Q8WVR3 580 aa21.41■■□□□ 1.02
TSC22D1-208ENST00000493016 ZBTB3Q9H5J0 574 aa21.41■■□□□ 1.02
TSC22D1-208ENST00000493016 WDR90Q96KV7 1748 aa21.41■■□□□ 1.02
TSC22D1-208ENST00000493016 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
TSC22D1-208ENST00000493016 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
TSC22D1-208ENST00000493016 DPY19L2Q6NUT2 758 aa21.4■■□□□ 1.02
TSC22D1-208ENST00000493016 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
TSC22D1-208ENST00000493016 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.02
TSC22D1-208ENST00000493016 PDIA6Q15084 440 aa21.39■■□□□ 1.01
TSC22D1-208ENST00000493016 ADAMTS8Q9UP79 889 aa21.39■■□□□ 1.01
TSC22D1-208ENST00000493016 ABCC12Q96J65 1359 aa21.38■■□□□ 1.01
TSC22D1-208ENST00000493016 UBN2Q6ZU65 1347 aa21.38■■□□□ 1.01
TSC22D1-208ENST00000493016 GPTP24298 496 aa21.38■■□□□ 1.01
TSC22D1-208ENST00000493016 ALDH1B1P30837 517 aa21.38■■□□□ 1.01
TSC22D1-208ENST00000493016 CCDC93Q567U6 631 aa21.38■■□□□ 1.01
TSC22D1-208ENST00000493016 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
TSC22D1-208ENST00000493016 LRP10Q7Z4F1 713 aa21.38■■□□□ 1.01
TSC22D1-208ENST00000493016 NUTM1Q86Y26 1132 aa21.38■■□□□ 1.01
TSC22D1-208ENST00000493016 ZNF34Q8IZ26 560 aa21.38■■□□□ 1.01
TSC22D1-208ENST00000493016 TRIM35Q9UPQ4 493 aa21.38■■□□□ 1.01
TSC22D1-208ENST00000493016 SMC1BQ8NDV3 1235 aa21.37■■□□□ 1.01
TSC22D1-208ENST00000493016 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa21.37■■□□□ 1.01
TSC22D1-208ENST00000493016 CHL1O00533 1208 aa21.36■■□□□ 1.01
TSC22D1-208ENST00000493016 CRY2Q49AN0 593 aa21.36■■□□□ 1.01
TSC22D1-208ENST00000493016 SUSD4Q5VX71 490 aa21.36■■□□□ 1.01
TSC22D1-208ENST00000493016 RIC1Q4ADV7 1423 aa21.36■■□□□ 1.01
TSC22D1-208ENST00000493016 ANXA1P04083 346 aa21.35■■□□□ 1.01
TSC22D1-208ENST00000493016 PROSER3Q2NL68 480 aa21.35■■□□□ 1.01
TSC22D1-208ENST00000493016 POTECB2RU33 542 aa21.34■■□□□ 1.01
TSC22D1-208ENST00000493016 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP21.34■■□□□ 1.01
TSC22D1-208ENST00000493016 RTKN2Q8IZC4 609 aa21.34■■□□□ 1.01
TSC22D1-208ENST00000493016 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
TSC22D1-208ENST00000493016 NTSR2O95665 410 aa21.33■■□□□ 1.01
TSC22D1-208ENST00000493016 PARP10Q53GL7 1025 aa21.33■■□□□ 1.01
TSC22D1-208ENST00000493016 OLFM4Q6UX06 510 aa21.33■■□□□ 1.01
TSC22D1-208ENST00000493016 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa21.33■■□□□ 1.01
TSC22D1-208ENST00000493016 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa21.33■■□□□ 1.01
TSC22D1-208ENST00000493016 NECTIN2Q92692 538 aa21.33■■□□□ 1.01
TSC22D1-208ENST00000493016 KRT24Q2M2I5 525 aa21.32■■□□□ 1
TSC22D1-208ENST00000493016 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP21.31■■□□□ 1
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