RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492947.1

AGRN-209, Transcript of agrin, humanhuman

TSL 2

Gene AGRN, Length 690 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGRN-209ENST00000492947 KIF3CO14782 793 aa22.15■■□□□ 1.14
AGRN-209ENST00000492947 PRELPP51888 382 aa22.15■■□□□ 1.14
AGRN-209ENST00000492947 C2CD5Q86YS7 1000 aa22.14■■□□□ 1.13
AGRN-209ENST00000492947 CCDC146Q8IYE0 955 aa22.14■■□□□ 1.13
AGRN-209ENST00000492947 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
AGRN-209ENST00000492947 SETDB2Q96T68 719 aa22.14■■□□□ 1.13
AGRN-209ENST00000492947 BABAM1Q9NWV8 329 aa22.14■■□□□ 1.13
AGRN-209ENST00000492947 CEP350Q5VT06 3117 aa22.14■■□□□ 1.13
AGRN-209ENST00000492947 C9orf131Q5VYM1 1079 aa22.13■■□□□ 1.13
AGRN-209ENST00000492947 CCDC24Q8N4L8 307 aa22.13■■□□□ 1.13
AGRN-209ENST00000492947 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
AGRN-209ENST00000492947 H0YIN7 160 aa22.12■■□□□ 1.13
AGRN-209ENST00000492947 NEUROD2Q15784 382 aa22.12■■□□□ 1.13
AGRN-209ENST00000492947 TTLL6Q8N841 843 aa22.12■■□□□ 1.13
AGRN-209ENST00000492947 HLFQ16534 295 aa22.11■■□□□ 1.13
AGRN-209ENST00000492947 LRP10Q7Z4F1 713 aa22.11■■□□□ 1.13
AGRN-209ENST00000492947 SBF1O95248 1867 aa22.11■■□□□ 1.13
AGRN-209ENST00000492947 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
AGRN-209ENST00000492947 PDE6BP35913 854 aa22.1■■□□□ 1.13
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AGRN-209ENST00000492947 SRGNP10124 158 aa22.08■■□□□ 1.13
AGRN-209ENST00000492947 PDIA6Q15084 440 aa22.08■■□□□ 1.13
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AGRN-209ENST00000492947 RNF181Q9P0P0 153 aa22.06■■□□□ 1.12
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AGRN-209ENST00000492947 NMRK2Q9NPI5 230 aa22.05■■□□□ 1.12
AGRN-209ENST00000492947 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP22.05■■□□□ 1.12
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AGRN-209ENST00000492947 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
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AGRN-209ENST00000492947 GLTPD2A6NH11 291 aa21.94■■□□□ 1.1
AGRN-209ENST00000492947 NTSR2O95665 410 aa21.94■■□□□ 1.1
AGRN-209ENST00000492947 ERFEQ4G0M1 354 aa21.94■■□□□ 1.1
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AGRN-209ENST00000492947 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa21.93■■□□□ 1.1
AGRN-209ENST00000492947 NYXQ9GZU5 481 aa21.93■■□□□ 1.1
AGRN-209ENST00000492947 RRAGCQ9HB90 399 aa21.93■■□□□ 1.1
AGRN-209ENST00000492947 IFT57Q9NWB7 429 aa21.93■■□□□ 1.1
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