RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490668.5

SFPQ-210, Transcript of splicing factor proline and glutamine rich, humanhuman

TSL 2

Gene SFPQ, Length 434 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFPQ-210ENST00000490668 USP17L1Q7RTZ2 530 aa5.87□□□□□ -1.47
SFPQ-210ENST00000490668 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP5.87□□□□□ -1.47
SFPQ-210ENST00000490668 EYA1Q99502 592 aa5.87□□□□□ -1.47
SFPQ-210ENST00000490668 FAM198AQ9UFP1 575 aa5.87□□□□□ -1.47
SFPQ-210ENST00000490668 USP19O94966 1318 aa5.87□□□□□ -1.47
SFPQ-210ENST00000490668 PLCH1Q4KWH8 1693 aa5.87□□□□□ -1.47
SFPQ-210ENST00000490668 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
SFPQ-210ENST00000490668 ABCC6O95255 1503 aa5.86□□□□□ -1.47
SFPQ-210ENST00000490668 NSD2O96028 1365 aa5.86□□□□□ -1.47
SFPQ-210ENST00000490668 USP31Q70CQ4 1352 aa5.86□□□□□ -1.47
SFPQ-210ENST00000490668 CGNL1Q0VF96 1302 aa5.86□□□□□ -1.47
SFPQ-210ENST00000490668 WASHC2AQ641Q2 1341 aa5.86□□□□□ -1.47
SFPQ-210ENST00000490668 FAM196BA6NMK8 535 aa5.86□□□□□ -1.47
SFPQ-210ENST00000490668 ADAMTS2O95450 1211 aa5.86□□□□□ -1.47
SFPQ-210ENST00000490668 CD44P16070 742 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
SFPQ-210ENST00000490668 ATP2B4P23634 1241 aa5.86□□□□□ -1.47
SFPQ-210ENST00000490668 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP5.86□□□□□ -1.47
SFPQ-210ENST00000490668 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
SFPQ-210ENST00000490668 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa5.86□□□□□ -1.47
SFPQ-210ENST00000490668 NUTM2GQ5VZR2 741 aa5.86□□□□□ -1.47
SFPQ-210ENST00000490668 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa5.86□□□□□ -1.47
SFPQ-210ENST00000490668 SULF1Q8IWU6 871 aa5.86□□□□□ -1.47
SFPQ-210ENST00000490668 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
SFPQ-210ENST00000490668 NWD2Q9ULI1 1742 aa5.85□□□□□ -1.47
SFPQ-210ENST00000490668 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa5.85□□□□□ -1.47
SFPQ-210ENST00000490668 NFAT5O94916 1531 aa5.85□□□□□ -1.47
SFPQ-210ENST00000490668 CPDO75976 1380 aa5.85□□□□□ -1.47
SFPQ-210ENST00000490668 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa5.85□□□□□ -1.47
SFPQ-210ENST00000490668 CFAP99D6REC4 459 aa5.85□□□□□ -1.47
SFPQ-210ENST00000490668 HOXA2O43364 376 aa5.85□□□□□ -1.47
SFPQ-210ENST00000490668 FDX1P10109 184 aa5.85□□□□□ -1.47
SFPQ-210ENST00000490668 PRSS12P56730 875 aa5.85□□□□□ -1.47
SFPQ-210ENST00000490668 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa5.85□□□□□ -1.47
SFPQ-210ENST00000490668 PTK7Q13308 1070 aa5.85□□□□□ -1.47
SFPQ-210ENST00000490668 LDLRAD1Q5T700 205 aa5.85□□□□□ -1.47
SFPQ-210ENST00000490668 NME9Q86XW9 330 aa5.85□□□□□ -1.47
SFPQ-210ENST00000490668 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa5.85□□□□□ -1.47
SFPQ-210ENST00000490668 KCNH5Q8NCM2 988 aa5.85□□□□□ -1.47
SFPQ-210ENST00000490668 COG3Q96JB2 828 aa5.85□□□□□ -1.47
SFPQ-210ENST00000490668 PRDM11Q9NQV5 511 aa5.85□□□□□ -1.47
SFPQ-210ENST00000490668 SLIT2O94813 1529 aa5.84□□□□□ -1.47
SFPQ-210ENST00000490668 KIAA0232Q92628 1395 aa5.84□□□□□ -1.47
SFPQ-210ENST00000490668 AFF2P51816 1311 aa5.84□□□□□ -1.47
SFPQ-210ENST00000490668 USP17L5A8MUK1 530 aa5.84□□□□□ -1.47
SFPQ-210ENST00000490668 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.47
SFPQ-210ENST00000490668 C3orf80F5H4A9 247 aa5.84□□□□□ -1.47
SFPQ-210ENST00000490668 SLC34A2O95436 690 aa5.84□□□□□ -1.47
SFPQ-210ENST00000490668 GUCA2AQ02747 115 aa5.84□□□□□ -1.47
SFPQ-210ENST00000490668 ECM1Q16610 540 aa5.84□□□□□ -1.47
SFPQ-210ENST00000490668 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.47
SFPQ-210ENST00000490668 FAM174AQ8TBP5 190 aa5.84□□□□□ -1.47
SFPQ-210ENST00000490668 PIK3R5Q8WYR1 880 aa5.84□□□□□ -1.47
SFPQ-210ENST00000490668 NGLY1Q96IV0 654 aa5.84□□□□□ -1.47
SFPQ-210ENST00000490668 BACH2Q9BYV9 841 aa5.84□□□□□ -1.47
SFPQ-210ENST00000490668 KNSTRNQ9Y448 316 aa5.84□□□□□ -1.47
SFPQ-210ENST00000490668 NRAPQ86VF7 1730 aa5.84□□□□□ -1.47
SFPQ-210ENST00000490668 LMO7Q8WWI1 1683 aa5.84□□□□□ -1.47
SFPQ-210ENST00000490668 RTL1A6NKG5 1358 aa5.83□□□□□ -1.48
SFPQ-210ENST00000490668 GCP02774 474 aa5.83□□□□□ -1.48
SFPQ-210ENST00000490668 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
SFPQ-210ENST00000490668 NR6A1Q15406 480 aa5.83□□□□□ -1.48
SFPQ-210ENST00000490668 C9orf131Q5VYM1 1079 aa5.83□□□□□ -1.48
SFPQ-210ENST00000490668 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP5.83□□□□□ -1.48
SFPQ-210ENST00000490668 C1orf216Q8TAB5 229 aa5.83□□□□□ -1.48
SFPQ-210ENST00000490668 HLA-CQ95604 372 aa5.83□□□□□ -1.48
SFPQ-210ENST00000490668 CDCA7LQ96GN5 454 aa5.83□□□□□ -1.48
SFPQ-210ENST00000490668 ASB16Q96NS5 453 aa5.83□□□□□ -1.48
SFPQ-210ENST00000490668 LNPKQ9C0E8 428 aa5.83□□□□□ -1.48
SFPQ-210ENST00000490668 GGNBP2Q9H3C7 697 aa5.83□□□□□ -1.48
SFPQ-210ENST00000490668 PANK3Q9H999 370 aa5.83□□□□□ -1.48
SFPQ-210ENST00000490668 LTN1O94822 1766 aa5.83□□□□□ -1.48
SFPQ-210ENST00000490668 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP5.82□□□□□ -1.48
SFPQ-210ENST00000490668 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP5.82□□□□□ -1.48
SFPQ-210ENST00000490668 AATKQ6ZMQ8 1374 aa5.82□□□□□ -1.48
SFPQ-210ENST00000490668 MARCH6O60337 910 aa5.82□□□□□ -1.48
SFPQ-210ENST00000490668 SKIP12755 728 aa5.82□□□□□ -1.48
SFPQ-210ENST00000490668 FOSBP53539 338 aa5.82□□□□□ -1.48
SFPQ-210ENST00000490668 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP5.82□□□□□ -1.48
SFPQ-210ENST00000490668 SLF2Q8IX21 1173 aa5.82□□□□□ -1.48
SFPQ-210ENST00000490668 DEPDC4Q8N2C3 294 aa5.82□□□□□ -1.48
SFPQ-210ENST00000490668 FAM200AQ8TCP9 573 aa5.82□□□□□ -1.48
SFPQ-210ENST00000490668 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP5.82□□□□□ -1.48
SFPQ-210ENST00000490668 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP5.82□□□□□ -1.48
SFPQ-210ENST00000490668 CARD14Q9BXL6 1004 aa5.82□□□□□ -1.48
SFPQ-210ENST00000490668 OCEL1Q9H607 264 aa5.82□□□□□ -1.48
SFPQ-210ENST00000490668 EGFL7Q9UHF1 273 aa5.82□□□□□ -1.48
SFPQ-210ENST00000490668 USP21Q9UK80 565 aa5.82□□□□□ -1.48
SFPQ-210ENST00000490668 BRPF3Q9ULD4 1205 aa5.82□□□□□ -1.48
SFPQ-210ENST00000490668 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP5.82□□□□□ -1.48
SFPQ-210ENST00000490668 ATRNO75882 1429 aa5.82□□□□□ -1.48
SFPQ-210ENST00000490668 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP5.82□□□□□ -1.48
SFPQ-210ENST00000490668 KIF24Q5T7B8 1368 aa5.81□□□□□ -1.48
SFPQ-210ENST00000490668 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa5.81□□□□□ -1.48
SFPQ-210ENST00000490668 G3V3G9 751 aa5.81□□□□□ -1.48
SFPQ-210ENST00000490668 FYB1O15117 783 aa5.81□□□□□ -1.48
SFPQ-210ENST00000490668 USP46P62068 366 aa5.81□□□□□ -1.48
SFPQ-210ENST00000490668 NR1H3Q13133 447 aa5.81□□□□□ -1.48
SFPQ-210ENST00000490668 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP5.81□□□□□ -1.48
SFPQ-210ENST00000490668 MTMR2Q13614 643 aa5.81□□□□□ -1.48
SFPQ-210ENST00000490668 COL19A1Q14993 1142 aa5.81□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 81.6 ms