RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470356.3

HMG20B-209, Transcript of high mobility group 20B, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene HMG20B, Length 806 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMG20B-209ENST00000470356 TOMM70O94826 608 aa41.32■■■■■ 4.21
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HMG20B-209ENST00000470356 KDM2BQ8NHM5 1336 aa41.31■■■■■ 4.2
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HMG20B-209ENST00000470356 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa41.3■■■■■ 4.2
HMG20B-209ENST00000470356 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP41.29■■■■■ 4.2
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HMG20B-209ENST00000470356 PRELPP51888 382 aa41.27■■■■■ 4.2
HMG20B-209ENST00000470356 RIPK4P57078 832 aa41.27■■■■■ 4.2
HMG20B-209ENST00000470356 STYK1Q6J9G0 422 aa41.27■■■■■ 4.2
HMG20B-209ENST00000470356 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP41.27■■■■■ 4.2
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HMG20B-209ENST00000470356 TPTE2Q6XPS3 522 aa41.25■■■■■ 4.19
HMG20B-209ENST00000470356 HLFQ16534 295 aa41.24■■■■■ 4.19
HMG20B-209ENST00000470356 C21orf2O43822 256 aa41.23■■■■■ 4.19
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HMG20B-209ENST00000470356 MASTLQ96GX5 879 aa41.23■■■■■ 4.19
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HMG20B-209ENST00000470356 SLX4Q8IY92 1834 aa41.22■■■■■ 4.19
HMG20B-209ENST00000470356 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa41.21■■■■■ 4.19
HMG20B-209ENST00000470356 NGEFQ8N5V2 710 aa41.21■■■■■ 4.19
HMG20B-209ENST00000470356 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP41.21■■■■■ 4.19
HMG20B-209ENST00000470356 TSPYL4Q9UJ04 414 aa41.21■■■■■ 4.19
HMG20B-209ENST00000470356 ERVV-1B6SEH8 477 aa41.2■■■■■ 4.19
HMG20B-209ENST00000470356 LMOD3Q0VAK6 560 aa41.2■■■■■ 4.19
HMG20B-209ENST00000470356 BABAM1Q9NWV8 329 aa41.2■■■■■ 4.19
HMG20B-209ENST00000470356 NUP98P52948 1817 aa41.18■■■■■ 4.18
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HMG20B-209ENST00000470356 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa41.18■■■■■ 4.18
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HMG20B-209ENST00000470356 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa41.17■■■■■ 4.18
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HMG20B-209ENST00000470356 MYL6BP14649 208 aa41.15■■■■■ 4.18
HMG20B-209ENST00000470356 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP41.14■■■■■ 4.18
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HMG20B-209ENST00000470356 FAM177BA6PVY3 158 aa41.14■■■■■ 4.18
HMG20B-209ENST00000470356 NPR1P16066 1061 aa41.14■■■■■ 4.18
HMG20B-209ENST00000470356 SOGA3Q5TF21 947 aa41.14■■■■■ 4.18
HMG20B-209ENST00000470356 KIF6Q6ZMV9 814 aa41.14■■■■■ 4.18
HMG20B-209ENST00000470356 TTLL7Q6ZT98 887 aa41.14■■■■■ 4.18
HMG20B-209ENST00000470356 LTBP3Q9NS15 1303 aa41.14■■■■■ 4.18
HMG20B-209ENST00000470356 TIAM2Q8IVF5 1701 aa41.13■■■■■ 4.18
HMG20B-209ENST00000470356 CCDC146Q8IYE0 955 aa41.12■■■■■ 4.17
HMG20B-209ENST00000470356 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP41.11■■■■■ 4.17
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HMG20B-209ENST00000470356 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP41.1■■■■■ 4.17
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HMG20B-209ENST00000470356 C7orf43Q8WVR3 580 aa41.1■■■■■ 4.17
HMG20B-209ENST00000470356 RUNDC1Q96C34 613 aa41.1■■■■■ 4.17
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HMG20B-209ENST00000470356 FSTL1Q12841 308 aa41.07■■■■■ 4.17
HMG20B-209ENST00000470356 NEUROD2Q15784 382 aa41.07■■■■■ 4.17
HMG20B-209ENST00000470356 ZBTB3Q9H5J0 574 aa41.07■■■■■ 4.17
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HMG20B-209ENST00000470356 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP41.05■■■■■ 4.16
HMG20B-209ENST00000470356 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP41.04■■■■■ 4.16
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HMG20B-209ENST00000470356 DPY19L2Q6NUT2 758 aa41.03■■■■■ 4.16
HMG20B-209ENST00000470356 LRP10Q7Z4F1 713 aa41.03■■■■■ 4.16
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HMG20B-209ENST00000470356 CHL1O00533 1208 aa41.02■■■■■ 4.16
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HMG20B-209ENST00000470356 ZNF34Q8IZ26 560 aa41.02■■■■■ 4.16
HMG20B-209ENST00000470356 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP41.01■■■■■ 4.16
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HMG20B-209ENST00000470356 CCDC93Q567U6 631 aa41.01■■■■■ 4.16
HMG20B-209ENST00000470356 NUTM1Q86Y26 1132 aa41.01■■■■■ 4.16
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HMG20B-209ENST00000470356 CRY2Q49AN0 593 aa41■■■■■ 4.15
HMG20B-209ENST00000470356 ABCC12Q96J65 1359 aa40.99■■■■■ 4.15
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HMG20B-209ENST00000470356 SUSD4Q5VX71 490 aa40.97■■■■■ 4.15
HMG20B-209ENST00000470356 SMC1BQ8NDV3 1235 aa40.97■■■■■ 4.15
HMG20B-209ENST00000470356 WDR90Q96KV7 1748 aa40.96■■■■■ 4.15
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HMG20B-209ENST00000470356 POTECB2RU33 542 aa40.94■■■■■ 4.14
HMG20B-209ENST00000470356 ANXA1P04083 346 aa40.94■■■■■ 4.14
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HMG20B-209ENST00000470356 NTSR2O95665 410 aa40.91■■■■■ 4.14
HMG20B-209ENST00000470356 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP40.91■■■■■ 4.14
HMG20B-209ENST00000470356 OLFM4Q6UX06 510 aa40.91■■■■■ 4.14
HMG20B-209ENST00000470356 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa40.91■■■■■ 4.14
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HMG20B-209ENST00000470356 NECTIN2Q92692 538 aa40.9■■■■■ 4.14
HMG20B-209ENST00000470356 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP40.89■■■■■ 4.14
HMG20B-209ENST00000470356 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP40.89■■■■■ 4.14
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