RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468380.1

LINC00888-201, long intergenic non-protein coding RNA 888, humanhuman

TSL 2

Gene LINC00888, Length 1,241 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00888-201ENST00000468380 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP25.27■■□□□ 1.64
LINC00888-201ENST00000468380 PCGF6Q9BYE7 350 aa25.27■■□□□ 1.64
LINC00888-201ENST00000468380 GNAT3A8MTJ3 354 aa25.26■■□□□ 1.63
LINC00888-201ENST00000468380 VEGFBP49765 207 aa25.26■■□□□ 1.63
LINC00888-201ENST00000468380 PRDM10Q9NQV6 1147 aa25.26■■□□□ 1.63
LINC00888-201ENST00000468380 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP25.25■■□□□ 1.63
LINC00888-201ENST00000468380 ST5P78524 1137 aa25.25■■□□□ 1.63
LINC00888-201ENST00000468380 FMNL2Q96PY5 1086 aa25.25■■□□□ 1.63
LINC00888-201ENST00000468380 IQCA1LA6NCM1 817 aa25.24■■□□□ 1.63
LINC00888-201ENST00000468380 NPHP1O15259 732 aa25.24■■□□□ 1.63
LINC00888-201ENST00000468380 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP25.24■■□□□ 1.63
LINC00888-201ENST00000468380 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
LINC00888-201ENST00000468380 SOGA3Q5TF21 947 aa25.24■■□□□ 1.63
LINC00888-201ENST00000468380 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
LINC00888-201ENST00000468380 USP16Q9Y5T5 823 aa25.24■■□□□ 1.63
LINC00888-201ENST00000468380 OLFM4Q6UX06 510 aa25.23■■□□□ 1.63
LINC00888-201ENST00000468380 CACNA1SQ13698 1873 aa25.23■■□□□ 1.63
LINC00888-201ENST00000468380 ZNF541Q9H0D2 1346 aa25.22■■□□□ 1.63
LINC00888-201ENST00000468380 TMEM88BA6NKF7 163 aa25.22■■□□□ 1.63
LINC00888-201ENST00000468380 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa25.21■■□□□ 1.63
LINC00888-201ENST00000468380 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
LINC00888-201ENST00000468380 GAS2L2Q8NHY3 880 aa25.21■■□□□ 1.63
LINC00888-201ENST00000468380 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
LINC00888-201ENST00000468380 WBP1LQ9NX94 342 aa25.21■■□□□ 1.63
LINC00888-201ENST00000468380 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
LINC00888-201ENST00000468380 KIF7Q2M1P5 1343 aa25.2■■□□□ 1.62
LINC00888-201ENST00000468380 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
LINC00888-201ENST00000468380 CCDC93Q567U6 631 aa25.2■■□□□ 1.62
LINC00888-201ENST00000468380 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
LINC00888-201ENST00000468380 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
LINC00888-201ENST00000468380 SCN4AP35499 1836 aa25.19■■□□□ 1.62
LINC00888-201ENST00000468380 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
LINC00888-201ENST00000468380 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP25.19■■□□□ 1.62
LINC00888-201ENST00000468380 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
LINC00888-201ENST00000468380 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa25.18■■□□□ 1.62
LINC00888-201ENST00000468380 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa25.18■■□□□ 1.62
LINC00888-201ENST00000468380 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
LINC00888-201ENST00000468380 BTBD11A6QL63 1104 aa25.18■■□□□ 1.62
LINC00888-201ENST00000468380 NPR1P16066 1061 aa25.18■■□□□ 1.62
LINC00888-201ENST00000468380 LBX1P52954 281 aa25.18■■□□□ 1.62
LINC00888-201ENST00000468380 AIDAQ96BJ3 306 aa25.18■■□□□ 1.62
LINC00888-201ENST00000468380 PHACTR3Q96KR7 559 aa25.18■■□□□ 1.62
LINC00888-201ENST00000468380 CLEC4GQ6UXB4 293 aa25.17■■□□□ 1.62
LINC00888-201ENST00000468380 HACL1Q9UJ83 578 aa25.17■■□□□ 1.62
LINC00888-201ENST00000468380 CLEC11AQ9Y240 323 aa25.17■■□□□ 1.62
LINC00888-201ENST00000468380 EPHX2P34913 555 aa25.16■■□□□ 1.62
LINC00888-201ENST00000468380 BCORQ6W2J9 1755 aa25.16■■□□□ 1.62
LINC00888-201ENST00000468380 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
LINC00888-201ENST00000468380 CNTROBQ8N137 903 aa25.15■■□□□ 1.62
LINC00888-201ENST00000468380 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa25.13■■□□□ 1.61
LINC00888-201ENST00000468380 RASSF10A6NK89 507 aa25.13■■□□□ 1.61
LINC00888-201ENST00000468380 NBPF26B4DH59 902 aa25.13■■□□□ 1.61
LINC00888-201ENST00000468380 FZD9O00144 591 aa25.13■■□□□ 1.61
LINC00888-201ENST00000468380 DEFB115Q30KQ5 88 aa25.13■■□□□ 1.61
LINC00888-201ENST00000468380 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
LINC00888-201ENST00000468380 SYNE4Q8N205 404 aa25.13■■□□□ 1.61
LINC00888-201ENST00000468380 NBPF15Q8N660 670 aa25.13■■□□□ 1.61
LINC00888-201ENST00000468380 RNF123Q5XPI4 1314 aa25.12■■□□□ 1.61
LINC00888-201ENST00000468380 FAM177BA6PVY3 158 aa25.12■■□□□ 1.61
LINC00888-201ENST00000468380 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
LINC00888-201ENST00000468380 TPTE2Q6XPS3 522 aa25.12■■□□□ 1.61
LINC00888-201ENST00000468380 RTKN2Q8IZC4 609 aa25.12■■□□□ 1.61
LINC00888-201ENST00000468380 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
LINC00888-201ENST00000468380 IARSP41252 1262 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
LINC00888-201ENST00000468380 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP25.11■■□□□ 1.61
LINC00888-201ENST00000468380 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
LINC00888-201ENST00000468380 ZNF652Q9Y2D9 606 aa25.1■■□□□ 1.61
LINC00888-201ENST00000468380 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
LINC00888-201ENST00000468380 PRKAR2BP31323 418 aa25.09■■□□□ 1.61
LINC00888-201ENST00000468380 HLFQ16534 295 aa25.09■■□□□ 1.61
LINC00888-201ENST00000468380 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
LINC00888-201ENST00000468380 RSPH6AQ9H0K4 717 aa25.08■■□□□ 1.61
LINC00888-201ENST00000468380 ALDH1B1P30837 517 aa25.07■■□□□ 1.6
LINC00888-201ENST00000468380 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP25.07■■□□□ 1.6
LINC00888-201ENST00000468380 GPC2Q8N158 579 aa25.07■■□□□ 1.6
LINC00888-201ENST00000468380 ABHD8Q96I13 439 aa25.07■■□□□ 1.6
LINC00888-201ENST00000468380 SNED1Q8TER0 1413 aa25.06■■□□□ 1.6
LINC00888-201ENST00000468380 MCM10Q7L590 875 aa25.06■■□□□ 1.6
LINC00888-201ENST00000468380 RGL2O15211 777 aa25.04■■□□□ 1.6
LINC00888-201ENST00000468380 PSMD1Q99460 953 aa25.04■■□□□ 1.6
LINC00888-201ENST00000468380 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP25.04■■□□□ 1.6
LINC00888-201ENST00000468380 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
LINC00888-201ENST00000468380 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa25.04■■□□□ 1.6
LINC00888-201ENST00000468380 COL4A5P29400 1685 aa25.04■■□□□ 1.6
LINC00888-201ENST00000468380 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP25.03■■□□□ 1.6
LINC00888-201ENST00000468380 DCTN1Q14203 1278 aa25.03■■□□□ 1.6
LINC00888-201ENST00000468380 SLC51AQ86UW1 340 aa25.02■■□□□ 1.6
LINC00888-201ENST00000468380 JDP2Q8WYK2 163 aa25.02■■□□□ 1.6
LINC00888-201ENST00000468380 GJA3Q9Y6H8 435 aa25.02■■□□□ 1.6
LINC00888-201ENST00000468380 EPS15P42566 896 aa25.01■■□□□ 1.59
LINC00888-201ENST00000468380 FAM161AQ3B820 660 aa25.01■■□□□ 1.59
LINC00888-201ENST00000468380 CRY2Q49AN0 593 aa25.01■■□□□ 1.59
LINC00888-201ENST00000468380 NUTM1Q86Y26 1132 aa25.01■■□□□ 1.59
LINC00888-201ENST00000468380 LTBP1Q14766 1721 aa25■■□□□ 1.59
LINC00888-201ENST00000468380 SLC34A2O95436 690 aa25■■□□□ 1.59
LINC00888-201ENST00000468380 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP25■■□□□ 1.59
LINC00888-201ENST00000468380 SCNN1DP51172 638 aa24.99■■□□□ 1.59
LINC00888-201ENST00000468380 CST9Q5W186 159 aa24.99■■□□□ 1.59
LINC00888-201ENST00000468380 ABCC12Q96J65 1359 aa24.99■■□□□ 1.59
LINC00888-201ENST00000468380 EIF6P56537 245 aaKnown RBP24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.9 ms