RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466624.1

GPC1-207, Transcript of glypican 1, humanhuman

TSL 2

Gene GPC1, Length 782 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1-207ENST00000466624 RARSP54136 660 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
GPC1-207ENST00000466624 CLEC4GQ6UXB4 293 aa20.48■□□□□ 0.87
GPC1-207ENST00000466624 TTLL7Q6ZT98 887 aa20.48■□□□□ 0.87
GPC1-207ENST00000466624 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
GPC1-207ENST00000466624 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
GPC1-207ENST00000466624 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
GPC1-207ENST00000466624 USPL1Q5W0Q7 1092 aa20.47■□□□□ 0.87
GPC1-207ENST00000466624 MTFR1LQ9H019 292 aa20.47■□□□□ 0.87
GPC1-207ENST00000466624 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
GPC1-207ENST00000466624 DDX58O95786 925 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
GPC1-207ENST00000466624 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
GPC1-207ENST00000466624 FLIIQ13045 1269 aa20.46■□□□□ 0.87
GPC1-207ENST00000466624 NLGN1Q8N2Q7 840 aa20.46■□□□□ 0.87
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GPC1-207ENST00000466624 BCL2L12Q9HB09 334 aa20.46■□□□□ 0.87
GPC1-207ENST00000466624 SMC4Q9NTJ3 1288 aa20.46■□□□□ 0.87
GPC1-207ENST00000466624 ZNF652Q9Y2D9 606 aa20.46■□□□□ 0.87
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GPC1-207ENST00000466624 ARXQ96QS3 562 aa20.45■□□□□ 0.86
GPC1-207ENST00000466624 ATP10DQ9P241 1426 aa20.44■□□□□ 0.86
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GPC1-207ENST00000466624 ZBTB3Q9H5J0 574 aa20.43■□□□□ 0.86
GPC1-207ENST00000466624 KIF16BQ96L93 1317 aa20.43■□□□□ 0.86
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GPC1-207ENST00000466624 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa20.42■□□□□ 0.86
GPC1-207ENST00000466624 BCL2L13Q9BXK5 485 aa20.42■□□□□ 0.86
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GPC1-207ENST00000466624 RIC3Q7Z5B4 369 aa20.41■□□□□ 0.86
GPC1-207ENST00000466624 ADCY9O60503 1353 aa20.41■□□□□ 0.86
GPC1-207ENST00000466624 NRXN2Q9P2S2 1712 aa20.41■□□□□ 0.86
GPC1-207ENST00000466624 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
GPC1-207ENST00000466624 PI4KAP2A4QPH2 592 aa20.4■□□□□ 0.86
GPC1-207ENST00000466624 ZBTB7AO95365 584 aa20.4■□□□□ 0.86
GPC1-207ENST00000466624 TM4SF1P30408 202 aa20.4■□□□□ 0.86
GPC1-207ENST00000466624 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa20.4■□□□□ 0.86
GPC1-207ENST00000466624 RCAN3Q9UKA8 241 aa20.4■□□□□ 0.86
GPC1-207ENST00000466624 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.86
GPC1-207ENST00000466624 ARHGAP45Q92619 1136 aa20.39■□□□□ 0.85
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GPC1-207ENST00000466624 TCIRG1Q13488 830 aa20.38■□□□□ 0.85
GPC1-207ENST00000466624 NFIXQ14938 502 aa20.38■□□□□ 0.85
GPC1-207ENST00000466624 TBC1D9BQ66K14 1250 aa20.38■□□□□ 0.85
GPC1-207ENST00000466624 MSL1Q68DK7 614 aa20.38■□□□□ 0.85
GPC1-207ENST00000466624 ZNF34Q8IZ26 560 aa20.38■□□□□ 0.85
GPC1-207ENST00000466624 SGIP1Q9BQI5 828 aa20.38■□□□□ 0.85
GPC1-207ENST00000466624 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
GPC1-207ENST00000466624 SPON1Q9HCB6 807 aa20.38■□□□□ 0.85
GPC1-207ENST00000466624 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa20.38■□□□□ 0.85
GPC1-207ENST00000466624 PXDNLA1KZ92 1463 aa20.37■□□□□ 0.85
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GPC1-207ENST00000466624 PTGER2P43116 358 aa20.36■□□□□ 0.85
GPC1-207ENST00000466624 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
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GPC1-207ENST00000466624 ISCA1Q9BUE6 129 aa20.36■□□□□ 0.85
GPC1-207ENST00000466624 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
GPC1-207ENST00000466624 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP20.36■□□□□ 0.85
GPC1-207ENST00000466624 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
GPC1-207ENST00000466624 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
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GPC1-207ENST00000466624 NEXNQ0ZGT2 675 aa20.34■□□□□ 0.85
GPC1-207ENST00000466624 PARP3Q9Y6F1 533 aa20.34■□□□□ 0.85
GPC1-207ENST00000466624 KIF13BQ9NQT8 1826 aa20.34■□□□□ 0.85
GPC1-207ENST00000466624 UBN2Q6ZU65 1347 aa20.33■□□□□ 0.85
GPC1-207ENST00000466624 BICDL1Q6ZP65 573 aa20.33■□□□□ 0.85
GPC1-207ENST00000466624 MYD88Q99836 296 aa20.33■□□□□ 0.85
GPC1-207ENST00000466624 RNF123Q5XPI4 1314 aa20.32■□□□□ 0.84
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GPC1-207ENST00000466624 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa20.32■□□□□ 0.84
GPC1-207ENST00000466624 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa20.32■□□□□ 0.84
GPC1-207ENST00000466624 NLRP10Q86W26 655 aa20.32■□□□□ 0.84
GPC1-207ENST00000466624 CCDC191Q8NCU4 936 aa20.32■□□□□ 0.84
GPC1-207ENST00000466624 LINS1Q8NG48 757 aa20.32■□□□□ 0.84
GPC1-207ENST00000466624 SERPINB2P05120 415 aa20.31■□□□□ 0.84
GPC1-207ENST00000466624 GPTP24298 496 aa20.31■□□□□ 0.84
GPC1-207ENST00000466624 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa20.31■□□□□ 0.84
GPC1-207ENST00000466624 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
GPC1-207ENST00000466624 NYXQ9GZU5 481 aa20.31■□□□□ 0.84
GPC1-207ENST00000466624 IGKV5-2P06315 115 aa20.3■□□□□ 0.84
GPC1-207ENST00000466624 BEND3Q5T5X7 828 aa20.3■□□□□ 0.84
GPC1-207ENST00000466624 LAMB2P55268 1798 aa20.3■□□□□ 0.84
GPC1-207ENST00000466624 ABCC4O15439 1325 aa20.29■□□□□ 0.84
GPC1-207ENST00000466624 RIC1Q4ADV7 1423 aa20.29■□□□□ 0.84
GPC1-207ENST00000466624 NEURL1BA8MQ27 555 aa20.29■□□□□ 0.84
GPC1-207ENST00000466624 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa20.29■□□□□ 0.84
GPC1-207ENST00000466624 TRIM27P14373 513 aa20.29■□□□□ 0.84
GPC1-207ENST00000466624 SUSD4Q5VX71 490 aa20.29■□□□□ 0.84
GPC1-207ENST00000466624 TPTE2Q6XPS3 522 aa20.29■□□□□ 0.84
GPC1-207ENST00000466624 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
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