RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461017.1

RABGEF1-206, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 3

Gene RABGEF1, Length 711 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-206ENST00000461017 KCNA3P22001 575 aa9.22□□□□□ -0.93
RABGEF1-206ENST00000461017 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP9.22□□□□□ -0.93
RABGEF1-206ENST00000461017 TBC1D9BQ66K14 1250 aa9.22□□□□□ -0.93
RABGEF1-206ENST00000461017 MRS2Q9HD23 443 aa9.22□□□□□ -0.93
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP9.22□□□□□ -0.93
RABGEF1-206ENST00000461017 CD2APQ9Y5K6 639 aa9.22□□□□□ -0.93
RABGEF1-206ENST00000461017 A0A0G2JLW4 131 aa9.21□□□□□ -0.94
RABGEF1-206ENST00000461017 ZPR1O75312 459 aa9.21□□□□□ -0.94
RABGEF1-206ENST00000461017 ANXA1P04083 346 aa9.21□□□□□ -0.94
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF853P0CG23 659 aa9.21□□□□□ -0.94
RABGEF1-206ENST00000461017 PDIA6Q15084 440 aa9.21□□□□□ -0.94
RABGEF1-206ENST00000461017 HLFQ16534 295 aa9.21□□□□□ -0.94
RABGEF1-206ENST00000461017 BICDL1Q6ZP65 573 aa9.21□□□□□ -0.94
RABGEF1-206ENST00000461017 LRP10Q7Z4F1 713 aa9.21□□□□□ -0.94
RABGEF1-206ENST00000461017 CCDC24Q8N4L8 307 aa9.21□□□□□ -0.94
RABGEF1-206ENST00000461017 CLEC11AQ9Y240 323 aa9.21□□□□□ -0.94
RABGEF1-206ENST00000461017 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP9.21□□□□□ -0.94
RABGEF1-206ENST00000461017 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa9.21□□□□□ -0.94
RABGEF1-206ENST00000461017 C10orf71Q711Q0 1435 aa9.21□□□□□ -0.94
RABGEF1-206ENST00000461017 PXDNLA1KZ92 1463 aa9.21□□□□□ -0.94
RABGEF1-206ENST00000461017 PROSER3Q2NL68 480 aa9.2□□□□□ -0.94
RABGEF1-206ENST00000461017 TTLL7Q6ZT98 887 aa9.2□□□□□ -0.94
RABGEF1-206ENST00000461017 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP9.2□□□□□ -0.94
RABGEF1-206ENST00000461017 NGEFQ8N5V2 710 aa9.2□□□□□ -0.94
RABGEF1-206ENST00000461017 NECTIN2Q92692 538 aa9.2□□□□□ -0.94
RABGEF1-206ENST00000461017 PARP3Q9Y6F1 533 aa9.2□□□□□ -0.94
RABGEF1-206ENST00000461017 CARMIL3Q8ND23 1372 aa9.2□□□□□ -0.94
RABGEF1-206ENST00000461017 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa9.19□□□□□ -0.94
RABGEF1-206ENST00000461017 SBF1O95248 1867 aa9.19□□□□□ -0.94
RABGEF1-206ENST00000461017 SERPINB2P05120 415 aa9.19□□□□□ -0.94
RABGEF1-206ENST00000461017 DPEP1P16444 411 aa9.19□□□□□ -0.94
RABGEF1-206ENST00000461017 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP9.19□□□□□ -0.94
RABGEF1-206ENST00000461017 LMOD3Q0VAK6 560 aa9.19□□□□□ -0.94
RABGEF1-206ENST00000461017 GPR162Q16538 588 aa9.19□□□□□ -0.94
RABGEF1-206ENST00000461017 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP9.19□□□□□ -0.94
RABGEF1-206ENST00000461017 MBIPQ9NS73 344 aa9.19□□□□□ -0.94
RABGEF1-206ENST00000461017 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP9.19□□□□□ -0.94
RABGEF1-206ENST00000461017 DLEC1Q9Y238 1755 aa9.19□□□□□ -0.94
RABGEF1-206ENST00000461017 MYL6BP14649 208 aa9.18□□□□□ -0.94
RABGEF1-206ENST00000461017 CHRNA5P30532 468 aa9.18□□□□□ -0.94
RABGEF1-206ENST00000461017 CFAP44Q96MT7 982 aa9.18□□□□□ -0.94
RABGEF1-206ENST00000461017 BABAM1Q9NWV8 329 aa9.18□□□□□ -0.94
RABGEF1-206ENST00000461017 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP9.18□□□□□ -0.94
RABGEF1-206ENST00000461017 SLX4Q8IY92 1834 aa9.17□□□□□ -0.94
RABGEF1-206ENST00000461017 A0A087WZG4 1122 aa9.17□□□□□ -0.94
RABGEF1-206ENST00000461017 TGFB2P61812 414 aa9.17□□□□□ -0.94
RABGEF1-206ENST00000461017 WWC1Q8IX03 1113 aa9.17□□□□□ -0.94
RABGEF1-206ENST00000461017 FAM9BQ8IZU0 186 aa9.17□□□□□ -0.94
RABGEF1-206ENST00000461017 TSPYL6Q8N831 410 aa9.17□□□□□ -0.94
RABGEF1-206ENST00000461017 C8orf58Q8NAV2 365 aa9.17□□□□□ -0.94
RABGEF1-206ENST00000461017 TAF1P21675 1872 aa9.17□□□□□ -0.94
RABGEF1-206ENST00000461017 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa9.17□□□□□ -0.94
RABGEF1-206ENST00000461017 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP9.16□□□□□ -0.94
RABGEF1-206ENST00000461017 PRR5LQ6MZQ0 368 aa9.16□□□□□ -0.94
RABGEF1-206ENST00000461017 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP9.16□□□□□ -0.94
RABGEF1-206ENST00000461017 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa9.15□□□□□ -0.94
RABGEF1-206ENST00000461017 YY1P25490 414 aa9.15□□□□□ -0.94
RABGEF1-206ENST00000461017 DUSP27Q5VZP5 1158 aa9.15□□□□□ -0.94
RABGEF1-206ENST00000461017 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP9.15□□□□□ -0.94
RABGEF1-206ENST00000461017 ZBTB3Q9H5J0 574 aa9.15□□□□□ -0.94
RABGEF1-206ENST00000461017 IFT57Q9NWB7 429 aa9.15□□□□□ -0.94
RABGEF1-206ENST00000461017 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP9.15□□□□□ -0.94
RABGEF1-206ENST00000461017 LAMB2P55268 1798 aa9.14□□□□□ -0.95
RABGEF1-206ENST00000461017 UBN2Q6ZU65 1347 aa9.14□□□□□ -0.95
RABGEF1-206ENST00000461017 CACNA1FO60840 1977 aa9.14□□□□□ -0.95
RABGEF1-206ENST00000461017 SPDYE4A6NLX3 237 aa9.14□□□□□ -0.95
RABGEF1-206ENST00000461017 FAM177BA6PVY3 158 aa9.14□□□□□ -0.95
RABGEF1-206ENST00000461017 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP9.14□□□□□ -0.95
RABGEF1-206ENST00000461017 CCDC27Q2M243 656 aa9.14□□□□□ -0.95
RABGEF1-206ENST00000461017 CLEC4GQ6UXB4 293 aa9.14□□□□□ -0.95
RABGEF1-206ENST00000461017 COPS6Q7L5N1 327 aa9.14□□□□□ -0.95
RABGEF1-206ENST00000461017 XAGE3Q8WTP9 111 aa9.14□□□□□ -0.95
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF428Q96B54 188 aa9.14□□□□□ -0.95
RABGEF1-206ENST00000461017 SETDB2Q96T68 719 aa9.14□□□□□ -0.95
RABGEF1-206ENST00000461017 CHPF2Q9P2E5 772 aa9.14□□□□□ -0.95
RABGEF1-206ENST00000461017 BCS1LQ9Y276 419 aa9.14□□□□□ -0.95
RABGEF1-206ENST00000461017 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa9.14□□□□□ -0.95
RABGEF1-206ENST00000461017 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa9.13□□□□□ -0.95
RABGEF1-206ENST00000461017 ERVV-1B6SEH8 477 aa9.13□□□□□ -0.95
RABGEF1-206ENST00000461017 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
RABGEF1-206ENST00000461017 GPTP24298 496 aa9.13□□□□□ -0.95
RABGEF1-206ENST00000461017 GNAI1P63096 354 aa9.13□□□□□ -0.95
RABGEF1-206ENST00000461017 SUSD4Q5VX71 490 aa9.13□□□□□ -0.95
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF34Q8IZ26 560 aa9.13□□□□□ -0.95
RABGEF1-206ENST00000461017 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP9.13□□□□□ -0.95
RABGEF1-206ENST00000461017 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP9.13□□□□□ -0.95
RABGEF1-206ENST00000461017 ERBB4Q15303 1308 aa9.12□□□□□ -0.95
RABGEF1-206ENST00000461017 PRR29P0C7W0 189 aa9.12□□□□□ -0.95
RABGEF1-206ENST00000461017 PRELPP51888 382 aa9.12□□□□□ -0.95
RABGEF1-206ENST00000461017 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa9.12□□□□□ -0.95
RABGEF1-206ENST00000461017 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
RABGEF1-206ENST00000461017 SLC51AQ86UW1 340 aa9.12□□□□□ -0.95
RABGEF1-206ENST00000461017 NUTM1Q86Y26 1132 aa9.12□□□□□ -0.95
RABGEF1-206ENST00000461017 C2CD5Q86YS7 1000 aa9.12□□□□□ -0.95
RABGEF1-206ENST00000461017 SYNE4Q8N205 404 aa9.12□□□□□ -0.95
RABGEF1-206ENST00000461017 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
RABGEF1-206ENST00000461017 ABCC12Q96J65 1359 aa9.12□□□□□ -0.95
RABGEF1-206ENST00000461017 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP9.11□□□□□ -0.95
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF521Q96K83 1311 aa9.11□□□□□ -0.95
RABGEF1-206ENST00000461017 GRIN3BO60391 1043 aa9.11□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 110.6 ms