RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000444916.5

SH3BP4-205, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 4

Gene SH3BP4, Length 570 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-205ENST00000444916 KLRG1Q96E93 195 aa18.51■□□□□ 0.55
SH3BP4-205ENST00000444916 CHL1O00533 1208 aa18.5■□□□□ 0.55
SH3BP4-205ENST00000444916 CHRNA5P30532 468 aa18.5■□□□□ 0.55
SH3BP4-205ENST00000444916 TBC1D9BQ66K14 1250 aa18.5■□□□□ 0.55
SH3BP4-205ENST00000444916 RRAGCQ9HB90 399 aa18.5■□□□□ 0.55
SH3BP4-205ENST00000444916 MRS2Q9HD23 443 aa18.5■□□□□ 0.55
SH3BP4-205ENST00000444916 RNF181Q9P0P0 153 aa18.5■□□□□ 0.55
SH3BP4-205ENST00000444916 PIM2Q9P1W9 311 aa18.5■□□□□ 0.55
SH3BP4-205ENST00000444916 SERPINB2P05120 415 aa18.49■□□□□ 0.55
SH3BP4-205ENST00000444916 BICDL1Q6ZP65 573 aa18.49■□□□□ 0.55
SH3BP4-205ENST00000444916 CARMIL3Q8ND23 1372 aa18.48■□□□□ 0.55
SH3BP4-205ENST00000444916 RGL2O15211 777 aa18.48■□□□□ 0.55
SH3BP4-205ENST00000444916 CAPN15O75808 1086 aa18.48■□□□□ 0.55
SH3BP4-205ENST00000444916 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
SH3BP4-205ENST00000444916 CLEC4GQ6UXB4 293 aa18.48■□□□□ 0.55
SH3BP4-205ENST00000444916 JMYQ8N9B5 988 aa18.48■□□□□ 0.55
SH3BP4-205ENST00000444916 ERBB4Q15303 1308 aa18.48■□□□□ 0.55
SH3BP4-205ENST00000444916 FSTL1Q12841 308 aa18.47■□□□□ 0.55
SH3BP4-205ENST00000444916 ZNF652Q9Y2D9 606 aa18.47■□□□□ 0.55
SH3BP4-205ENST00000444916 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
SH3BP4-205ENST00000444916 SBF1O95248 1867 aa18.46■□□□□ 0.55
SH3BP4-205ENST00000444916 CFAP44Q96MT7 982 aa18.46■□□□□ 0.55
SH3BP4-205ENST00000444916 SETDB2Q96T68 719 aa18.46■□□□□ 0.55
SH3BP4-205ENST00000444916 KDM2BQ8NHM5 1336 aa18.46■□□□□ 0.55
SH3BP4-205ENST00000444916 DLEC1Q9Y238 1755 aa18.45■□□□□ 0.54
SH3BP4-205ENST00000444916 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP18.45■□□□□ 0.54
SH3BP4-205ENST00000444916 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa18.44■□□□□ 0.54
SH3BP4-205ENST00000444916 MYL6BP14649 208 aa18.44■□□□□ 0.54
SH3BP4-205ENST00000444916 RASSF7Q02833 373 aa18.44■□□□□ 0.54
SH3BP4-205ENST00000444916 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP18.43■□□□□ 0.54
SH3BP4-205ENST00000444916 NGEFQ8N5V2 710 aa18.43■□□□□ 0.54
SH3BP4-205ENST00000444916 NUP98P52948 1817 aa18.43■□□□□ 0.54
SH3BP4-205ENST00000444916 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP18.42■□□□□ 0.54
SH3BP4-205ENST00000444916 ZNF853P0CG23 659 aa18.42■□□□□ 0.54
SH3BP4-205ENST00000444916 PRELPP51888 382 aa18.42■□□□□ 0.54
SH3BP4-205ENST00000444916 KRT24Q2M2I5 525 aa18.42■□□□□ 0.54
SH3BP4-205ENST00000444916 PRR5LQ6MZQ0 368 aa18.42■□□□□ 0.54
SH3BP4-205ENST00000444916 KIF6Q6ZMV9 814 aa18.42■□□□□ 0.54
SH3BP4-205ENST00000444916 MBIPQ9NS73 344 aa18.42■□□□□ 0.54
SH3BP4-205ENST00000444916 IFT57Q9NWB7 429 aa18.42■□□□□ 0.54
SH3BP4-205ENST00000444916 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa18.42■□□□□ 0.54
SH3BP4-205ENST00000444916 ERVV-1B6SEH8 477 aa18.41■□□□□ 0.54
SH3BP4-205ENST00000444916 HOXB7P09629 217 aa18.41■□□□□ 0.54
SH3BP4-205ENST00000444916 PDIA6Q15084 440 aa18.41■□□□□ 0.54
SH3BP4-205ENST00000444916 HLFQ16534 295 aa18.41■□□□□ 0.54
SH3BP4-205ENST00000444916 CNBD1Q8NA66 436 aa18.41■□□□□ 0.54
SH3BP4-205ENST00000444916 GNAI1P63096 354 aa18.4■□□□□ 0.54
SH3BP4-205ENST00000444916 CCDC27Q2M243 656 aa18.4■□□□□ 0.54
SH3BP4-205ENST00000444916 TTLL7Q6ZT98 887 aa18.4■□□□□ 0.54
SH3BP4-205ENST00000444916 LRP10Q7Z4F1 713 aa18.4■□□□□ 0.54
SH3BP4-205ENST00000444916 TNS4Q8IZW8 715 aa18.4■□□□□ 0.54
SH3BP4-205ENST00000444916 BRIP1Q9BX63 1249 aa18.4■□□□□ 0.54
SH3BP4-205ENST00000444916 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP18.4■□□□□ 0.54
SH3BP4-205ENST00000444916 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP18.4■□□□□ 0.54
SH3BP4-205ENST00000444916 NPHP1O15259 732 aa18.39■□□□□ 0.53
SH3BP4-205ENST00000444916 ST5P78524 1137 aa18.39■□□□□ 0.53
SH3BP4-205ENST00000444916 PROSER3Q2NL68 480 aa18.39■□□□□ 0.53
SH3BP4-205ENST00000444916 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP18.39■□□□□ 0.53
SH3BP4-205ENST00000444916 C2CD5Q86YS7 1000 aa18.39■□□□□ 0.53
SH3BP4-205ENST00000444916 SMC1BQ8NDV3 1235 aa18.39■□□□□ 0.53
SH3BP4-205ENST00000444916 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa18.39■□□□□ 0.53
SH3BP4-205ENST00000444916 PDE6BP35913 854 aa18.38■□□□□ 0.53
SH3BP4-205ENST00000444916 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP18.38■□□□□ 0.53
SH3BP4-205ENST00000444916 NECTIN2Q92692 538 aa18.38■□□□□ 0.53
SH3BP4-205ENST00000444916 ZBTB3Q9H5J0 574 aa18.38■□□□□ 0.53
SH3BP4-205ENST00000444916 H0YIN7 160 aa18.37■□□□□ 0.53
SH3BP4-205ENST00000444916 ANXA1P04083 346 aa18.37■□□□□ 0.53
SH3BP4-205ENST00000444916 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa18.37■□□□□ 0.53
SH3BP4-205ENST00000444916 CCDC24Q8N4L8 307 aa18.37■□□□□ 0.53
SH3BP4-205ENST00000444916 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP18.37■□□□□ 0.53
SH3BP4-205ENST00000444916 DUSP27Q5VZP5 1158 aa18.36■□□□□ 0.53
SH3BP4-205ENST00000444916 TPTE2Q6XPS3 522 aa18.36■□□□□ 0.53
SH3BP4-205ENST00000444916 WWC1Q8IX03 1113 aa18.36■□□□□ 0.53
SH3BP4-205ENST00000444916 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP18.35■□□□□ 0.53
SH3BP4-205ENST00000444916 TTLL6Q8N841 843 aa18.35■□□□□ 0.53
SH3BP4-205ENST00000444916 CHPF2Q9P2E5 772 aa18.35■□□□□ 0.53
SH3BP4-205ENST00000444916 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa18.35■□□□□ 0.53
SH3BP4-205ENST00000444916 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP18.34■□□□□ 0.53
SH3BP4-205ENST00000444916 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP18.34■□□□□ 0.53
SH3BP4-205ENST00000444916 LMNB1P20700 586 aa18.34■□□□□ 0.53
SH3BP4-205ENST00000444916 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP18.33■□□□□ 0.53
SH3BP4-205ENST00000444916 GLTPD2A6NH11 291 aa18.33■□□□□ 0.52
SH3BP4-205ENST00000444916 FAM177BA6PVY3 158 aa18.33■□□□□ 0.52
SH3BP4-205ENST00000444916 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP18.33■□□□□ 0.52
SH3BP4-205ENST00000444916 COPS6Q7L5N1 327 aa18.33■□□□□ 0.52
SH3BP4-205ENST00000444916 FAM9BQ8IZU0 186 aa18.33■□□□□ 0.52
SH3BP4-205ENST00000444916 XAGE3Q8WTP9 111 aa18.33■□□□□ 0.52
SH3BP4-205ENST00000444916 NYXQ9GZU5 481 aa18.33■□□□□ 0.52
SH3BP4-205ENST00000444916 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP18.33■□□□□ 0.52
SH3BP4-205ENST00000444916 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa18.33■□□□□ 0.52
SH3BP4-205ENST00000444916 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa18.32■□□□□ 0.52
SH3BP4-205ENST00000444916 TIAM2Q8IVF5 1701 aa18.32■□□□□ 0.52
SH3BP4-205ENST00000444916 IL16Q14005 1332 aa18.32■□□□□ 0.52
SH3BP4-205ENST00000444916 UBN2Q6ZU65 1347 aa18.32■□□□□ 0.52
SH3BP4-205ENST00000444916 SRGNP10124 158 aa18.32■□□□□ 0.52
SH3BP4-205ENST00000444916 GPTP24298 496 aa18.32■□□□□ 0.52
SH3BP4-205ENST00000444916 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP18.32■□□□□ 0.52
SH3BP4-205ENST00000444916 ZNF34Q8IZ26 560 aa18.32■□□□□ 0.52
SH3BP4-205ENST00000444916 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP18.32■□□□□ 0.52
SH3BP4-205ENST00000444916 CACNA1SQ13698 1873 aa18.32■□□□□ 0.52
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