RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000444040.6

SHQ1-202, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 2

Gene SHQ1, Length 2,844 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SHQ1-202ENST00000444040 SLC39A6Q13433 755 aa19.38■□□□□ 0.69
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SHQ1-202ENST00000444040 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa19.38■□□□□ 0.69
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SHQ1-202ENST00000444040 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP19.38■□□□□ 0.69
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SHQ1-202ENST00000444040 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa19.31■□□□□ 0.68
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SHQ1-202ENST00000444040 CYP27B1O15528 508 aa19.29■□□□□ 0.68
SHQ1-202ENST00000444040 EPHA10Q5JZY3 1008 aa19.29■□□□□ 0.68
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SHQ1-202ENST00000444040 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP19.29■□□□□ 0.68
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SHQ1-202ENST00000444040 KLHDC4Q8TBB5 520 aa19.28■□□□□ 0.68
SHQ1-202ENST00000444040 TM6SF1Q9BZW5 370 aa19.28■□□□□ 0.68
SHQ1-202ENST00000444040 SNRKQ9NRH2 765 aa19.28■□□□□ 0.68
SHQ1-202ENST00000444040 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP19.28■□□□□ 0.68
SHQ1-202ENST00000444040 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa19.28■□□□□ 0.68
SHQ1-202ENST00000444040 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP19.28■□□□□ 0.68
SHQ1-202ENST00000444040 SIL1Q9H173 461 aa19.28■□□□□ 0.68
SHQ1-202ENST00000444040 CCDC171Q6TFL3 1326 aa19.27■□□□□ 0.68
SHQ1-202ENST00000444040 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa19.27■□□□□ 0.68
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