RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000440289.6

PTPRJ-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRJ, Length 3,158 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-202ENST00000440289 KCNA6P17658 529 aa21.86■■□□□ 1.09
PTPRJ-202ENST00000440289 DNAAF4Q8WXU2 420 aa21.86■■□□□ 1.09
PTPRJ-202ENST00000440289 DDX11Q96FC9 970 aa21.86■■□□□ 1.09
PTPRJ-202ENST00000440289 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
PTPRJ-202ENST00000440289 RAB11FIP3O75154 756 aa21.85■■□□□ 1.09
PTPRJ-202ENST00000440289 ANAPC15P60006 121 aa21.85■■□□□ 1.09
PTPRJ-202ENST00000440289 LRRC2Q9BYS8 371 aa21.85■■□□□ 1.09
PTPRJ-202ENST00000440289 PTPRUQ92729 1446 aa21.85■■□□□ 1.09
PTPRJ-202ENST00000440289 MYL6BP14649 208 aa21.85■■□□□ 1.09
PTPRJ-202ENST00000440289 HS1BP3Q53T59 392 aa21.85■■□□□ 1.09
PTPRJ-202ENST00000440289 PI4K2BQ8TCG2 481 aa21.85■■□□□ 1.09
PTPRJ-202ENST00000440289 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa21.84■■□□□ 1.09
PTPRJ-202ENST00000440289 BTBD11A6QL63 1104 aa21.84■■□□□ 1.09
PTPRJ-202ENST00000440289 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
PTPRJ-202ENST00000440289 HOXC9P31274 260 aa21.84■■□□□ 1.09
PTPRJ-202ENST00000440289 FSD1Q9BTV5 496 aa21.84■■□□□ 1.09
PTPRJ-202ENST00000440289 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa21.84■■□□□ 1.09
PTPRJ-202ENST00000440289 RAD50Q92878 1312 aa21.84■■□□□ 1.09
PTPRJ-202ENST00000440289 LUZP1Q86V48 1076 aa21.83■■□□□ 1.09
PTPRJ-202ENST00000440289 ZNF592Q92610 1267 aa21.83■■□□□ 1.09
PTPRJ-202ENST00000440289 FLT4P35916 1363 aa21.83■■□□□ 1.09
PTPRJ-202ENST00000440289 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
PTPRJ-202ENST00000440289 PROSER3Q2NL68 480 aa21.83■■□□□ 1.09
PTPRJ-202ENST00000440289 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
PTPRJ-202ENST00000440289 SALL3Q9BXA9 1300 aa21.83■■□□□ 1.08
PTPRJ-202ENST00000440289 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa21.83■■□□□ 1.08
PTPRJ-202ENST00000440289 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.08
PTPRJ-202ENST00000440289 A0A087WWV3 80 aa21.82■■□□□ 1.08
PTPRJ-202ENST00000440289 CHGBP05060 677 aa21.82■■□□□ 1.08
PTPRJ-202ENST00000440289 UBE2HP62256 183 aa21.82■■□□□ 1.08
PTPRJ-202ENST00000440289 BICD2Q8TD16 824 aa21.82■■□□□ 1.08
PTPRJ-202ENST00000440289 ME3Q16798 604 aa21.82■■□□□ 1.08
PTPRJ-202ENST00000440289 SSH3Q8TE77 659 aa21.81■■□□□ 1.08
PTPRJ-202ENST00000440289 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP21.81■■□□□ 1.08
PTPRJ-202ENST00000440289 TAF6LQ9Y6J9 622 aa21.81■■□□□ 1.08
PTPRJ-202ENST00000440289 CDC37L1Q7L3B6 337 aa21.81■■□□□ 1.08
PTPRJ-202ENST00000440289 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
PTPRJ-202ENST00000440289 PYCARDQ9ULZ3 195 aa21.8■■□□□ 1.08
PTPRJ-202ENST00000440289 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
PTPRJ-202ENST00000440289 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
PTPRJ-202ENST00000440289 USP6P35125 1406 aa21.8■■□□□ 1.08
PTPRJ-202ENST00000440289 STAP2Q9UGK3 403 aa21.79■■□□□ 1.08
PTPRJ-202ENST00000440289 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa21.79■■□□□ 1.08
PTPRJ-202ENST00000440289 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
PTPRJ-202ENST00000440289 AP5Z1O43299 807 aa21.79■■□□□ 1.08
PTPRJ-202ENST00000440289 LIG1P18858 919 aa21.79■■□□□ 1.08
PTPRJ-202ENST00000440289 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa21.78■■□□□ 1.08
PTPRJ-202ENST00000440289 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
PTPRJ-202ENST00000440289 PTGS1P23219 599 aa21.78■■□□□ 1.08
PTPRJ-202ENST00000440289 NBPF6Q5VWK0 638 aa21.78■■□□□ 1.08
PTPRJ-202ENST00000440289 RUFY2Q8WXA3 655 aa21.78■■□□□ 1.08
PTPRJ-202ENST00000440289 NBPF4Q96M43 638 aa21.78■■□□□ 1.08
PTPRJ-202ENST00000440289 PLEKHG3A1L390 1219 aa21.78■■□□□ 1.08
PTPRJ-202ENST00000440289 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP21.78■■□□□ 1.08
PTPRJ-202ENST00000440289 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
PTPRJ-202ENST00000440289 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
PTPRJ-202ENST00000440289 HYPKQ9NX55 129 aa21.78■■□□□ 1.08
PTPRJ-202ENST00000440289 KDM4AO75164 1064 aa21.77■■□□□ 1.08
PTPRJ-202ENST00000440289 SLC39A6Q13433 755 aa21.77■■□□□ 1.08
PTPRJ-202ENST00000440289 TRIM5Q9C035 493 aa21.77■■□□□ 1.08
PTPRJ-202ENST00000440289 TPCN1Q9ULQ1 816 aa21.77■■□□□ 1.08
PTPRJ-202ENST00000440289 LRMPQ12912 555 aa21.77■■□□□ 1.08
PTPRJ-202ENST00000440289 GPATCH3Q96I76 525 aa21.77■■□□□ 1.08
PTPRJ-202ENST00000440289 ECHDC1Q9NTX5 307 aa21.77■■□□□ 1.08
PTPRJ-202ENST00000440289 MTMR6Q9Y217 621 aa21.77■■□□□ 1.08
PTPRJ-202ENST00000440289 UBR1Q8IWV7 1749 aa21.77■■□□□ 1.07
PTPRJ-202ENST00000440289 DYNC1I1O14576 645 aa21.77■■□□□ 1.07
PTPRJ-202ENST00000440289 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.07
PTPRJ-202ENST00000440289 DACT1Q9NYF0 836 aa21.77■■□□□ 1.07
PTPRJ-202ENST00000440289 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
PTPRJ-202ENST00000440289 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
PTPRJ-202ENST00000440289 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
PTPRJ-202ENST00000440289 SIRT1Q96EB6 747 aa21.76■■□□□ 1.07
PTPRJ-202ENST00000440289 IGSF1Q8N6C5 1336 aa21.76■■□□□ 1.07
PTPRJ-202ENST00000440289 MAP3K5Q99683 1374 aa21.76■■□□□ 1.07
PTPRJ-202ENST00000440289 GUCY1B3Q02153 619 aa21.75■■□□□ 1.07
PTPRJ-202ENST00000440289 TNMDQ9H2S6 317 aa21.75■■□□□ 1.07
PTPRJ-202ENST00000440289 SBNO1A3KN83 1393 aa21.75■■□□□ 1.07
PTPRJ-202ENST00000440289 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa21.75■■□□□ 1.07
PTPRJ-202ENST00000440289 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa21.75■■□□□ 1.07
PTPRJ-202ENST00000440289 TTC6Q86TZ1 520 aa21.75■■□□□ 1.07
PTPRJ-202ENST00000440289 ESCO1Q5FWF5 840 aa21.75■■□□□ 1.07
PTPRJ-202ENST00000440289 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa21.75■■□□□ 1.07
PTPRJ-202ENST00000440289 NUP62CLQ9H1M0 184 aa21.75■■□□□ 1.07
PTPRJ-202ENST00000440289 NRBP1Q9UHY1 535 aa21.75■■□□□ 1.07
PTPRJ-202ENST00000440289 TECPR2O15040 1411 aa21.75■■□□□ 1.07
PTPRJ-202ENST00000440289 NPHP1O15259 732 aa21.74■■□□□ 1.07
PTPRJ-202ENST00000440289 CCDC192P0DO97 292 aa21.74■■□□□ 1.07
PTPRJ-202ENST00000440289 MCM5P33992 734 aa21.74■■□□□ 1.07
PTPRJ-202ENST00000440289 BEND3Q5T5X7 828 aa21.74■■□□□ 1.07
PTPRJ-202ENST00000440289 FAM184AQ8NB25 1140 aa21.74■■□□□ 1.07
PTPRJ-202ENST00000440289 TTC14Q96N46 770 aa21.74■■□□□ 1.07
PTPRJ-202ENST00000440289 PEAK1Q9H792 1746 aa21.74■■□□□ 1.07
PTPRJ-202ENST00000440289 PSME1Q06323 249 aa21.74■■□□□ 1.07
PTPRJ-202ENST00000440289 CREB3L3Q68CJ9 461 aa21.74■■□□□ 1.07
PTPRJ-202ENST00000440289 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa21.74■■□□□ 1.07
PTPRJ-202ENST00000440289 RIC3Q7Z5B4 369 aa21.74■■□□□ 1.07
PTPRJ-202ENST00000440289 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP21.74■■□□□ 1.07
PTPRJ-202ENST00000440289 PIBF1Q8WXW3 757 aa21.74■■□□□ 1.07
PTPRJ-202ENST00000440289 H3BQV1 296 aa21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 83.3 ms