RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000432502.1

NUP50-AS1-202, humanhuman

TSL 2

Gene NUP50-AS1, Length 596 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP50-AS1-202ENST00000432502 ST5P78524 1137 aa25.83■■□□□ 1.73
NUP50-AS1-202ENST00000432502 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP25.81■■□□□ 1.72
NUP50-AS1-202ENST00000432502 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP25.81■■□□□ 1.72
NUP50-AS1-202ENST00000432502 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa25.81■■□□□ 1.72
NUP50-AS1-202ENST00000432502 NPHP1O15259 732 aa25.8■■□□□ 1.72
NUP50-AS1-202ENST00000432502 SRGNP10124 158 aa25.8■■□□□ 1.72
NUP50-AS1-202ENST00000432502 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP25.8■■□□□ 1.72
NUP50-AS1-202ENST00000432502 STYK1Q6J9G0 422 aa25.8■■□□□ 1.72
NUP50-AS1-202ENST00000432502 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP25.8■■□□□ 1.72
NUP50-AS1-202ENST00000432502 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP25.8■■□□□ 1.72
NUP50-AS1-202ENST00000432502 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa25.8■■□□□ 1.72
NUP50-AS1-202ENST00000432502 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa25.79■■□□□ 1.72
NUP50-AS1-202ENST00000432502 CNKSR1Q969H4 720 aa25.79■■□□□ 1.72
NUP50-AS1-202ENST00000432502 C21orf2O43822 256 aa25.78■■□□□ 1.72
NUP50-AS1-202ENST00000432502 MASTLQ96GX5 879 aa25.78■■□□□ 1.72
NUP50-AS1-202ENST00000432502 TIAM2Q8IVF5 1701 aa25.77■■□□□ 1.72
NUP50-AS1-202ENST00000432502 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa25.77■■□□□ 1.72
NUP50-AS1-202ENST00000432502 APLP1P51693 650 aa25.77■■□□□ 1.72
NUP50-AS1-202ENST00000432502 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP25.77■■□□□ 1.72
NUP50-AS1-202ENST00000432502 RRAGCQ9HB90 399 aa25.77■■□□□ 1.72
NUP50-AS1-202ENST00000432502 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP25.77■■□□□ 1.72
NUP50-AS1-202ENST00000432502 SLX4Q8IY92 1834 aa25.77■■□□□ 1.72
NUP50-AS1-202ENST00000432502 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP25.76■■□□□ 1.71
NUP50-AS1-202ENST00000432502 GLTPD2A6NH11 291 aa25.76■■□□□ 1.71
NUP50-AS1-202ENST00000432502 LTBP3Q9NS15 1303 aa25.75■■□□□ 1.71
NUP50-AS1-202ENST00000432502 HLFQ16534 295 aa25.75■■□□□ 1.71
NUP50-AS1-202ENST00000432502 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP25.75■■□□□ 1.71
NUP50-AS1-202ENST00000432502 TPTE2Q6XPS3 522 aa25.75■■□□□ 1.71
NUP50-AS1-202ENST00000432502 FSTL1Q12841 308 aa25.74■■□□□ 1.71
NUP50-AS1-202ENST00000432502 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP25.74■■□□□ 1.71
NUP50-AS1-202ENST00000432502 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP25.74■■□□□ 1.71
NUP50-AS1-202ENST00000432502 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP25.74■■□□□ 1.71
NUP50-AS1-202ENST00000432502 CACNA1SQ13698 1873 aa25.73■■□□□ 1.71
NUP50-AS1-202ENST00000432502 ERVV-1B6SEH8 477 aa25.73■■□□□ 1.71
NUP50-AS1-202ENST00000432502 RIPK4P57078 832 aa25.72■■□□□ 1.71
NUP50-AS1-202ENST00000432502 SOGA3Q5TF21 947 aa25.72■■□□□ 1.71
NUP50-AS1-202ENST00000432502 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP25.71■■□□□ 1.71
NUP50-AS1-202ENST00000432502 NPR1P16066 1061 aa25.71■■□□□ 1.71
NUP50-AS1-202ENST00000432502 C7orf43Q8WVR3 580 aa25.71■■□□□ 1.71
NUP50-AS1-202ENST00000432502 TAOK3Q9H2K8 898 aa25.71■■□□□ 1.71
NUP50-AS1-202ENST00000432502 NUP98P52948 1817 aa25.71■■□□□ 1.71
NUP50-AS1-202ENST00000432502 ERBB4Q15303 1308 aa25.7■■□□□ 1.71
NUP50-AS1-202ENST00000432502 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa25.7■■□□□ 1.71
NUP50-AS1-202ENST00000432502 BABAM1Q9NWV8 329 aa25.7■■□□□ 1.7
NUP50-AS1-202ENST00000432502 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP25.7■■□□□ 1.7
NUP50-AS1-202ENST00000432502 TMPOP42166 694 aaKnown RBP25.69■■□□□ 1.7
NUP50-AS1-202ENST00000432502 NGEFQ8N5V2 710 aa25.69■■□□□ 1.7
NUP50-AS1-202ENST00000432502 TSPYL4Q9UJ04 414 aa25.69■■□□□ 1.7
NUP50-AS1-202ENST00000432502 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP25.68■■□□□ 1.7
NUP50-AS1-202ENST00000432502 ERFEQ4G0M1 354 aa25.68■■□□□ 1.7
NUP50-AS1-202ENST00000432502 TTLL7Q6ZT98 887 aa25.68■■□□□ 1.7
NUP50-AS1-202ENST00000432502 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa25.68■■□□□ 1.7
NUP50-AS1-202ENST00000432502 FAM177BA6PVY3 158 aa25.67■■□□□ 1.7
NUP50-AS1-202ENST00000432502 LMOD3Q0VAK6 560 aa25.67■■□□□ 1.7
NUP50-AS1-202ENST00000432502 KIF6Q6ZMV9 814 aa25.67■■□□□ 1.7
NUP50-AS1-202ENST00000432502 WDR90Q96KV7 1748 aa25.67■■□□□ 1.7
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NUP50-AS1-202ENST00000432502 DPY19L2Q6NUT2 758 aa25.66■■□□□ 1.7
NUP50-AS1-202ENST00000432502 SMC1BQ8NDV3 1235 aa25.66■■□□□ 1.7
NUP50-AS1-202ENST00000432502 NYXQ9GZU5 481 aa25.66■■□□□ 1.7
NUP50-AS1-202ENST00000432502 POTECB2RU33 542 aa25.65■■□□□ 1.7
NUP50-AS1-202ENST00000432502 LRP10Q7Z4F1 713 aa25.65■■□□□ 1.7
NUP50-AS1-202ENST00000432502 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP25.65■■□□□ 1.7
NUP50-AS1-202ENST00000432502 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP25.64■■□□□ 1.7
NUP50-AS1-202ENST00000432502 CCDC93Q567U6 631 aa25.64■■□□□ 1.7
NUP50-AS1-202ENST00000432502 PDIA6Q15084 440 aa25.63■■□□□ 1.69
NUP50-AS1-202ENST00000432502 CRY2Q49AN0 593 aa25.63■■□□□ 1.69
NUP50-AS1-202ENST00000432502 ABCC12Q96J65 1359 aa25.63■■□□□ 1.69
NUP50-AS1-202ENST00000432502 RIC1Q4ADV7 1423 aa25.63■■□□□ 1.69
NUP50-AS1-202ENST00000432502 UBN2Q6ZU65 1347 aa25.63■■□□□ 1.69
NUP50-AS1-202ENST00000432502 ALDH1B1P30837 517 aa25.62■■□□□ 1.69
NUP50-AS1-202ENST00000432502 ZNF34Q8IZ26 560 aa25.62■■□□□ 1.69
NUP50-AS1-202ENST00000432502 ZBTB3Q9H5J0 574 aa25.62■■□□□ 1.69
NUP50-AS1-202ENST00000432502 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP25.61■■□□□ 1.69
NUP50-AS1-202ENST00000432502 NUTM1Q86Y26 1132 aa25.61■■□□□ 1.69
NUP50-AS1-202ENST00000432502 GPTP24298 496 aa25.6■■□□□ 1.69
NUP50-AS1-202ENST00000432502 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP25.6■■□□□ 1.69
NUP50-AS1-202ENST00000432502 CCDC146Q8IYE0 955 aa25.6■■□□□ 1.69
NUP50-AS1-202ENST00000432502 RUNDC1Q96C34 613 aa25.6■■□□□ 1.69
NUP50-AS1-202ENST00000432502 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP25.59■■□□□ 1.69
NUP50-AS1-202ENST00000432502 SUSD4Q5VX71 490 aa25.59■■□□□ 1.69
NUP50-AS1-202ENST00000432502 RTKN2Q8IZC4 609 aa25.59■■□□□ 1.69
NUP50-AS1-202ENST00000432502 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP25.58■■□□□ 1.69
NUP50-AS1-202ENST00000432502 OLFM4Q6UX06 510 aa25.58■■□□□ 1.69
NUP50-AS1-202ENST00000432502 TRIM35Q9UPQ4 493 aa25.58■■□□□ 1.69
NUP50-AS1-202ENST00000432502 SNED1Q8TER0 1413 aa25.57■■□□□ 1.68
NUP50-AS1-202ENST00000432502 CHL1O00533 1208 aa25.57■■□□□ 1.68
NUP50-AS1-202ENST00000432502 NTSR2O95665 410 aa25.57■■□□□ 1.68
NUP50-AS1-202ENST00000432502 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP25.57■■□□□ 1.68
NUP50-AS1-202ENST00000432502 HTRA3P83110 453 aa25.57■■□□□ 1.68
NUP50-AS1-202ENST00000432502 NEUROD2Q15784 382 aa25.57■■□□□ 1.68
NUP50-AS1-202ENST00000432502 PROSER3Q2NL68 480 aa25.57■■□□□ 1.68
NUP50-AS1-202ENST00000432502 ADAMTS8Q9UP79 889 aa25.57■■□□□ 1.68
NUP50-AS1-202ENST00000432502 DDNO94850 711 aaPredicted RBP25.56■■□□□ 1.68
NUP50-AS1-202ENST00000432502 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP25.56■■□□□ 1.68
NUP50-AS1-202ENST00000432502 PARP10Q53GL7 1025 aa25.55■■□□□ 1.68
NUP50-AS1-202ENST00000432502 KLRG1Q96E93 195 aa25.55■■□□□ 1.68
NUP50-AS1-202ENST00000432502 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP25.55■■□□□ 1.68
NUP50-AS1-202ENST00000432502 ANXA1P04083 346 aa25.54■■□□□ 1.68
NUP50-AS1-202ENST00000432502 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa25.54■■□□□ 1.68
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