RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000430861.1

PCDH9-AS1-201, PCDH9 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PCDH9-AS1, Length 532 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDH9-AS1-201ENST00000430861 GPC6Q9Y625 555 aaPredicted RBP7.58□□□□□ -1.2
PCDH9-AS1-201ENST00000430861 PARP3Q9Y6F1 533 aa7.58□□□□□ -1.2
PCDH9-AS1-201ENST00000430861 SCO2A0A1W2PP80 73 aa7.57□□□□□ -1.2
PCDH9-AS1-201ENST00000430861 GTF2IP78347 998 aa7.57□□□□□ -1.2
PCDH9-AS1-201ENST00000430861 POM121Q96HA1 1249 aa7.57□□□□□ -1.2
PCDH9-AS1-201ENST00000430861 TPSG1Q9NRR2 321 aa7.57□□□□□ -1.2
PCDH9-AS1-201ENST00000430861 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
PCDH9-AS1-201ENST00000430861 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
PCDH9-AS1-201ENST00000430861 DYRK3O43781 588 aa7.56□□□□□ -1.2
PCDH9-AS1-201ENST00000430861 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
PCDH9-AS1-201ENST00000430861 NCOA4Q13772 614 aa7.56□□□□□ -1.2
PCDH9-AS1-201ENST00000430861 TEAD4Q15561 434 aa7.56□□□□□ -1.2
PCDH9-AS1-201ENST00000430861 NEUROD4Q9HD90 331 aa7.56□□□□□ -1.2
PCDH9-AS1-201ENST00000430861 ZNF358Q9NW07 568 aa7.56□□□□□ -1.2
PCDH9-AS1-201ENST00000430861 M0R082 166 aa7.55□□□□□ -1.2
PCDH9-AS1-201ENST00000430861 RAD21O60216 631 aa7.55□□□□□ -1.2
PCDH9-AS1-201ENST00000430861 NOS2P35228 1153 aa7.55□□□□□ -1.2
PCDH9-AS1-201ENST00000430861 TXLNAP40222 546 aa7.55□□□□□ -1.2
PCDH9-AS1-201ENST00000430861 PSME1Q06323 249 aa7.55□□□□□ -1.2
PCDH9-AS1-201ENST00000430861 ZNF417Q8TAU3 575 aa7.55□□□□□ -1.2
PCDH9-AS1-201ENST00000430861 TNFRSF25Q93038 417 aa7.55□□□□□ -1.2
PCDH9-AS1-201ENST00000430861 L3MBTL2Q969R5 705 aa7.55□□□□□ -1.2
PCDH9-AS1-201ENST00000430861 ZNF587Q96SQ5 575 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
PCDH9-AS1-201ENST00000430861 EML1O00423 815 aa7.54□□□□□ -1.2
PCDH9-AS1-201ENST00000430861 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
PCDH9-AS1-201ENST00000430861 NEUROD1Q13562 356 aa7.54□□□□□ -1.2
PCDH9-AS1-201ENST00000430861 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa7.54□□□□□ -1.2
PCDH9-AS1-201ENST00000430861 DEPDC4Q8N2C3 294 aa7.54□□□□□ -1.2
PCDH9-AS1-201ENST00000430861 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa7.53□□□□□ -1.2
PCDH9-AS1-201ENST00000430861 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
PCDH9-AS1-201ENST00000430861 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
PCDH9-AS1-201ENST00000430861 TNS4Q8IZW8 715 aa7.53□□□□□ -1.2
PCDH9-AS1-201ENST00000430861 MICALL1Q8N3F8 863 aa7.53□□□□□ -1.2
PCDH9-AS1-201ENST00000430861 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa7.53□□□□□ -1.2
PCDH9-AS1-201ENST00000430861 C7orf43Q8WVR3 580 aa7.53□□□□□ -1.2
PCDH9-AS1-201ENST00000430861 USP17L5A8MUK1 530 aa7.52□□□□□ -1.21
PCDH9-AS1-201ENST00000430861 EPHA4P54764 986 aa7.52□□□□□ -1.21
PCDH9-AS1-201ENST00000430861 FLIIQ13045 1269 aa7.52□□□□□ -1.21
PCDH9-AS1-201ENST00000430861 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
PCDH9-AS1-201ENST00000430861 ARTNQ5T4W7 220 aa7.52□□□□□ -1.21
PCDH9-AS1-201ENST00000430861 TRIM50Q86XT4 487 aa7.52□□□□□ -1.21
PCDH9-AS1-201ENST00000430861 ZFP64Q9NPA5 681 aa7.52□□□□□ -1.21
PCDH9-AS1-201ENST00000430861 STARD13Q9Y3M8 1113 aa7.52□□□□□ -1.21
PCDH9-AS1-201ENST00000430861 FAM229AH3BQW9 127 aa7.51□□□□□ -1.21
PCDH9-AS1-201ENST00000430861 ALBP02768 609 aa7.51□□□□□ -1.21
PCDH9-AS1-201ENST00000430861 ADH7P40394 386 aa7.51□□□□□ -1.21
PCDH9-AS1-201ENST00000430861 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa7.51□□□□□ -1.21
PCDH9-AS1-201ENST00000430861 SLC30A3Q99726 388 aa7.51□□□□□ -1.21
PCDH9-AS1-201ENST00000430861 ZNF232Q9UNY5 417 aa7.51□□□□□ -1.21
PCDH9-AS1-201ENST00000430861 POM121CA8CG34 1229 aa7.5□□□□□ -1.21
PCDH9-AS1-201ENST00000430861 C9orf172C9J069 976 aa7.5□□□□□ -1.21
PCDH9-AS1-201ENST00000430861 NID1P14543 1247 aa7.5□□□□□ -1.21
PCDH9-AS1-201ENST00000430861 UBTFP17480 764 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
PCDH9-AS1-201ENST00000430861 SPEM2Q0P670 501 aa7.5□□□□□ -1.21
PCDH9-AS1-201ENST00000430861 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
PCDH9-AS1-201ENST00000430861 TBCELQ5QJ74 424 aa7.5□□□□□ -1.21
PCDH9-AS1-201ENST00000430861 SLC9A9Q8IVB4 645 aa7.5□□□□□ -1.21
PCDH9-AS1-201ENST00000430861 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa7.5□□□□□ -1.21
PCDH9-AS1-201ENST00000430861 SERTM1A2A2V5 107 aa7.49□□□□□ -1.21
PCDH9-AS1-201ENST00000430861 H2AFB1P0C5Y9 115 aa7.49□□□□□ -1.21
PCDH9-AS1-201ENST00000430861 H2AFB2P0C5Z0 115 aa7.49□□□□□ -1.21
PCDH9-AS1-201ENST00000430861 ATP1A2P50993 1020 aa7.49□□□□□ -1.21
PCDH9-AS1-201ENST00000430861 PRSS36Q5K4E3 855 aa7.49□□□□□ -1.21
PCDH9-AS1-201ENST00000430861 CCDC102BQ68D86 513 aa7.49□□□□□ -1.21
PCDH9-AS1-201ENST00000430861 NBPF11Q86T75 865 aa7.49□□□□□ -1.21
PCDH9-AS1-201ENST00000430861 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa7.49□□□□□ -1.21
PCDH9-AS1-201ENST00000430861 RHPN1Q8TCX5 695 aa7.49□□□□□ -1.21
PCDH9-AS1-201ENST00000430861 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa7.49□□□□□ -1.21
PCDH9-AS1-201ENST00000430861 CLDN10P78369 228 aa7.48□□□□□ -1.21
PCDH9-AS1-201ENST00000430861 GRIK4Q16099 956 aa7.48□□□□□ -1.21
PCDH9-AS1-201ENST00000430861 C1orf53Q5VUE5 145 aa7.48□□□□□ -1.21
PCDH9-AS1-201ENST00000430861 C20orf204Q6ZNR8 217 aa7.48□□□□□ -1.21
PCDH9-AS1-201ENST00000430861 TPCN2Q8NHX9 752 aa7.48□□□□□ -1.21
PCDH9-AS1-201ENST00000430861 USP17L3A6NCW0 530 aa7.47□□□□□ -1.21
PCDH9-AS1-201ENST00000430861 USP17L4A6NCW7 530 aa7.47□□□□□ -1.21
PCDH9-AS1-201ENST00000430861 LILRB5O75023 590 aa7.47□□□□□ -1.21
PCDH9-AS1-201ENST00000430861 KCNQ4P56696 695 aa7.47□□□□□ -1.21
PCDH9-AS1-201ENST00000430861 TRAPPC3LQ5T215 181 aa7.47□□□□□ -1.21
PCDH9-AS1-201ENST00000430861 USP17L2Q6R6M4 530 aa7.47□□□□□ -1.21
PCDH9-AS1-201ENST00000430861 C8orf86Q6ZUL3 223 aa7.47□□□□□ -1.21
PCDH9-AS1-201ENST00000430861 USP17L1Q7RTZ2 530 aa7.47□□□□□ -1.21
PCDH9-AS1-201ENST00000430861 LARGE2Q8N3Y3 721 aa7.47□□□□□ -1.21
PCDH9-AS1-201ENST00000430861 BRD7Q9NPI1 651 aa7.47□□□□□ -1.21
PCDH9-AS1-201ENST00000430861 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
PCDH9-AS1-201ENST00000430861 KIAA1024Q9UPX6 916 aa7.47□□□□□ -1.21
PCDH9-AS1-201ENST00000430861 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
PCDH9-AS1-201ENST00000430861 ATP9BO43861 1147 aa7.46□□□□□ -1.22
PCDH9-AS1-201ENST00000430861 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
PCDH9-AS1-201ENST00000430861 ADGRE1Q14246 886 aa7.46□□□□□ -1.22
PCDH9-AS1-201ENST00000430861 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa7.46□□□□□ -1.22
PCDH9-AS1-201ENST00000430861 OGFOD1Q8N543 542 aa7.46□□□□□ -1.22
PCDH9-AS1-201ENST00000430861 CEP63Q96MT8 703 aa7.46□□□□□ -1.22
PCDH9-AS1-201ENST00000430861 UCN2Q96RP3 112 aa7.46□□□□□ -1.22
PCDH9-AS1-201ENST00000430861 KCNH4Q9UQ05 1017 aa7.46□□□□□ -1.22
PCDH9-AS1-201ENST00000430861 CHMP3Q9Y3E7 222 aa7.46□□□□□ -1.22
PCDH9-AS1-201ENST00000430861 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa7.46□□□□□ -1.22
PCDH9-AS1-201ENST00000430861 M0R2N6 131 aa7.45□□□□□ -1.22
PCDH9-AS1-201ENST00000430861 ELNP15502 786 aa7.45□□□□□ -1.22
PCDH9-AS1-201ENST00000430861 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
PCDH9-AS1-201ENST00000430861 PSMA6P60900 246 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.9 ms