RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409739.2

TRAF3IP1-203, Transcript of TRAF3 interacting protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene TRAF3IP1, Length 1,070 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3IP1-203ENST00000409739 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa40.44■■■■■ 4.06
TRAF3IP1-203ENST00000409739 CLEC4GQ6UXB4 293 aa40.44■■■■■ 4.06
TRAF3IP1-203ENST00000409739 TTLL7Q6ZT98 887 aa40.44■■■■■ 4.06
TRAF3IP1-203ENST00000409739 ZNF652Q9Y2D9 606 aa40.44■■■■■ 4.06
TRAF3IP1-203ENST00000409739 SERPINB2P05120 415 aa40.43■■■■■ 4.06
TRAF3IP1-203ENST00000409739 WDR63Q8IWG1 891 aa40.42■■■■■ 4.06
TRAF3IP1-203ENST00000409739 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa40.42■■■■■ 4.06
TRAF3IP1-203ENST00000409739 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa40.42■■■■■ 4.06
TRAF3IP1-203ENST00000409739 UTRNP46939 3433 aa40.41■■■■■ 4.06
TRAF3IP1-203ENST00000409739 KIF6Q6ZMV9 814 aa40.41■■■■■ 4.06
TRAF3IP1-203ENST00000409739 DLEC1Q9Y238 1755 aa40.4■■■■■ 4.06
TRAF3IP1-203ENST00000409739 HLFQ16534 295 aa40.4■■■■■ 4.06
TRAF3IP1-203ENST00000409739 MIER1Q8N108 512 aa40.4■■■■■ 4.06
TRAF3IP1-203ENST00000409739 C8orf58Q8NAV2 365 aa40.4■■■■■ 4.06
TRAF3IP1-203ENST00000409739 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP40.4■■■■■ 4.06
TRAF3IP1-203ENST00000409739 CHPF2Q9P2E5 772 aa40.4■■■■■ 4.06
TRAF3IP1-203ENST00000409739 CHD4Q14839 1912 aa40.4■■■■■ 4.06
TRAF3IP1-203ENST00000409739 SETDB2Q96T68 719 aa40.39■■■■■ 4.06
TRAF3IP1-203ENST00000409739 ERVV-1B6SEH8 477 aa40.38■■■■■ 4.05
TRAF3IP1-203ENST00000409739 TGFB2P61812 414 aa40.38■■■■■ 4.05
TRAF3IP1-203ENST00000409739 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP40.37■■■■■ 4.05
TRAF3IP1-203ENST00000409739 GPR162Q16538 588 aa40.37■■■■■ 4.05
TRAF3IP1-203ENST00000409739 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP40.37■■■■■ 4.05
TRAF3IP1-203ENST00000409739 ZBTB3Q9H5J0 574 aa40.35■■■■■ 4.05
TRAF3IP1-203ENST00000409739 FANCIQ9NVI1 1328 aa40.35■■■■■ 4.05
TRAF3IP1-203ENST00000409739 ATP10DQ9P241 1426 aa40.34■■■■■ 4.05
TRAF3IP1-203ENST00000409739 TSPYL6Q8N831 410 aa40.34■■■■■ 4.05
TRAF3IP1-203ENST00000409739 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP40.33■■■■■ 4.05
TRAF3IP1-203ENST00000409739 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP40.33■■■■■ 4.05
TRAF3IP1-203ENST00000409739 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP40.33■■■■■ 4.05
TRAF3IP1-203ENST00000409739 ZNF521Q96K83 1311 aa40.33■■■■■ 4.05
TRAF3IP1-203ENST00000409739 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP40.33■■■■■ 4.05
TRAF3IP1-203ENST00000409739 A0A0G2JLW4 131 aa40.32■■■■■ 4.05
TRAF3IP1-203ENST00000409739 DPEP1P16444 411 aa40.32■■■■■ 4.05
TRAF3IP1-203ENST00000409739 XAGE3Q8WTP9 111 aa40.32■■■■■ 4.05
TRAF3IP1-203ENST00000409739 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa40.32■■■■■ 4.04
TRAF3IP1-203ENST00000409739 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa40.31■■■■■ 4.04
TRAF3IP1-203ENST00000409739 PRR5LQ6MZQ0 368 aa40.31■■■■■ 4.04
TRAF3IP1-203ENST00000409739 WWC3Q9ULE0 1092 aa40.31■■■■■ 4.04
TRAF3IP1-203ENST00000409739 COPS6Q7L5N1 327 aa40.3■■■■■ 4.04
TRAF3IP1-203ENST00000409739 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP40.3■■■■■ 4.04
TRAF3IP1-203ENST00000409739 CACNA1FO60840 1977 aa40.29■■■■■ 4.04
TRAF3IP1-203ENST00000409739 CNBD1Q8NA66 436 aa40.29■■■■■ 4.04
TRAF3IP1-203ENST00000409739 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP40.28■■■■■ 4.04
TRAF3IP1-203ENST00000409739 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP40.27■■■■■ 4.04
TRAF3IP1-203ENST00000409739 KCNA3P22001 575 aa40.26■■■■■ 4.04
TRAF3IP1-203ENST00000409739 CHRNA5P30532 468 aa40.25■■■■■ 4.03
TRAF3IP1-203ENST00000409739 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP40.25■■■■■ 4.03
TRAF3IP1-203ENST00000409739 CCDC24Q8N4L8 307 aa40.25■■■■■ 4.03
TRAF3IP1-203ENST00000409739 HYPKQ9NX55 129 aa40.25■■■■■ 4.03
TRAF3IP1-203ENST00000409739 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP40.24■■■■■ 4.03
TRAF3IP1-203ENST00000409739 NPHP1O15259 732 aa40.23■■■■■ 4.03
TRAF3IP1-203ENST00000409739 UBN2Q6ZU65 1347 aa40.22■■■■■ 4.03
TRAF3IP1-203ENST00000409739 CACNA1SQ13698 1873 aa40.22■■■■■ 4.03
TRAF3IP1-203ENST00000409739 CCDC30Q5VVM6 783 aa40.22■■■■■ 4.03
TRAF3IP1-203ENST00000409739 GPTP24298 496 aa40.21■■■■■ 4.03
TRAF3IP1-203ENST00000409739 ST5P78524 1137 aa40.21■■■■■ 4.03
TRAF3IP1-203ENST00000409739 GOLGA2Q08379 1002 aa40.21■■■■■ 4.03
TRAF3IP1-203ENST00000409739 ZNF34Q8IZ26 560 aa40.21■■■■■ 4.03
TRAF3IP1-203ENST00000409739 CHMP4AQ9BY43 222 aa40.21■■■■■ 4.03
TRAF3IP1-203ENST00000409739 BRIP1Q9BX63 1249 aa40.2■■■■■ 4.03
TRAF3IP1-203ENST00000409739 MYH16Q9H6N6 1097 aa40.2■■■■■ 4.03
TRAF3IP1-203ENST00000409739 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP40.2■■■■■ 4.03
TRAF3IP1-203ENST00000409739 FAM177BA6PVY3 158 aa40.19■■■■■ 4.02
TRAF3IP1-203ENST00000409739 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP40.19■■■■■ 4.02
TRAF3IP1-203ENST00000409739 GRIN3BO60391 1043 aa40.18■■■■■ 4.02
TRAF3IP1-203ENST00000409739 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP40.18■■■■■ 4.02
TRAF3IP1-203ENST00000409739 TPTE2Q6XPS3 522 aa40.17■■■■■ 4.02
TRAF3IP1-203ENST00000409739 PIM2Q9P1W9 311 aa40.17■■■■■ 4.02
TRAF3IP1-203ENST00000409739 C2CD5Q86YS7 1000 aa40.16■■■■■ 4.02
TRAF3IP1-203ENST00000409739 PLBD2Q8NHP8 589 aa40.16■■■■■ 4.02
TRAF3IP1-203ENST00000409739 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP40.16■■■■■ 4.02
TRAF3IP1-203ENST00000409739 BCS1LQ9Y276 419 aa40.16■■■■■ 4.02
TRAF3IP1-203ENST00000409739 PDE6BP35913 854 aa40.15■■■■■ 4.02
TRAF3IP1-203ENST00000409739 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa40.14■■■■■ 4.02
TRAF3IP1-203ENST00000409739 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa40.14■■■■■ 4.02
TRAF3IP1-203ENST00000409739 NYXQ9GZU5 481 aa40.14■■■■■ 4.02
TRAF3IP1-203ENST00000409739 ABCC12Q96J65 1359 aa40.12■■■■■ 4.01
TRAF3IP1-203ENST00000409739 H0YIN7 160 aa40.12■■■■■ 4.01
TRAF3IP1-203ENST00000409739 SUSD4Q5VX71 490 aa40.12■■■■■ 4.01
TRAF3IP1-203ENST00000409739 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP40.11■■■■■ 4.01
TRAF3IP1-203ENST00000409739 TCIRG1Q13488 830 aa40.11■■■■■ 4.01
TRAF3IP1-203ENST00000409739 PARP10Q53GL7 1025 aa40.11■■■■■ 4.01
TRAF3IP1-203ENST00000409739 STK31Q9BXU1 1019 aa40.11■■■■■ 4.01
TRAF3IP1-203ENST00000409739 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa40.11■■■■■ 4.01
TRAF3IP1-203ENST00000409739 VAMP4O75379 141 aa40.1■■■■■ 4.01
TRAF3IP1-203ENST00000409739 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP40.1■■■■■ 4.01
TRAF3IP1-203ENST00000409739 NTSR2O95665 410 aa40.09■■■■■ 4.01
TRAF3IP1-203ENST00000409739 NUTM1Q86Y26 1132 aa40.09■■■■■ 4.01
TRAF3IP1-203ENST00000409739 LAMB2P55268 1798 aa40.08■■■■■ 4.01
TRAF3IP1-203ENST00000409739 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP40.08■■■■■ 4.01
TRAF3IP1-203ENST00000409739 RIC1Q4ADV7 1423 aa40.08■■■■■ 4.01
TRAF3IP1-203ENST00000409739 E9PSI1 815 aa40.06■■■■■ 4
TRAF3IP1-203ENST00000409739 ERFEQ4G0M1 354 aa40.06■■■■■ 4
TRAF3IP1-203ENST00000409739 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa40.06■■■■■ 4
TRAF3IP1-203ENST00000409739 SLX4Q8IY92 1834 aa40.06■■■■■ 4
TRAF3IP1-203ENST00000409739 NLRP10Q86W26 655 aa40.05■■■■■ 4
TRAF3IP1-203ENST00000409739 RIC3Q7Z5B4 369 aa40.04■■■■■ 4
TRAF3IP1-203ENST00000409739 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP40.03■■■■■ 4
TRAF3IP1-203ENST00000409739 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP40.03■■■■■ 4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 73.4 ms