RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000382034.9

TOM1-201, Transcript of target of myb1 membrane trafficking protein, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TOM1, Length 1,300 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOM1-201ENST00000382034 CHMP4AQ9BY43 222 aa20.63■□□□□ 0.89
TOM1-201ENST00000382034 PDE6BP35913 854 aa20.62■□□□□ 0.89
TOM1-201ENST00000382034 NGEFQ8N5V2 710 aa20.62■□□□□ 0.89
TOM1-201ENST00000382034 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa20.62■□□□□ 0.89
TOM1-201ENST00000382034 NUP98P52948 1817 aa20.61■□□□□ 0.89
TOM1-201ENST00000382034 PDIA6Q15084 440 aa20.61■□□□□ 0.89
TOM1-201ENST00000382034 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
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TOM1-201ENST00000382034 LRP10Q7Z4F1 713 aa20.61■□□□□ 0.89
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TOM1-201ENST00000382034 MBIPQ9NS73 344 aa20.61■□□□□ 0.89
TOM1-201ENST00000382034 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
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TOM1-201ENST00000382034 ST5P78524 1137 aa20.6■□□□□ 0.89
TOM1-201ENST00000382034 TPTE2Q6XPS3 522 aa20.6■□□□□ 0.89
TOM1-201ENST00000382034 BCS1LQ9Y276 419 aa20.6■□□□□ 0.89
TOM1-201ENST00000382034 IL16Q14005 1332 aa20.59■□□□□ 0.89
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TOM1-201ENST00000382034 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP20.59■□□□□ 0.89
TOM1-201ENST00000382034 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP20.59■□□□□ 0.89
TOM1-201ENST00000382034 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa20.59■□□□□ 0.89
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TOM1-201ENST00000382034 CHRNA5P30532 468 aa20.58■□□□□ 0.89
TOM1-201ENST00000382034 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
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TOM1-201ENST00000382034 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa20.56■□□□□ 0.88
TOM1-201ENST00000382034 DUSP27Q5VZP5 1158 aa20.56■□□□□ 0.88
TOM1-201ENST00000382034 TTLL7Q6ZT98 887 aa20.56■□□□□ 0.88
TOM1-201ENST00000382034 C2CD5Q86YS7 1000 aa20.56■□□□□ 0.88
TOM1-201ENST00000382034 TTLL6Q8N841 843 aa20.56■□□□□ 0.88
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TOM1-201ENST00000382034 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
TOM1-201ENST00000382034 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa20.54■□□□□ 0.88
TOM1-201ENST00000382034 ZNF34Q8IZ26 560 aa20.54■□□□□ 0.88
TOM1-201ENST00000382034 HYPKQ9NX55 129 aa20.54■□□□□ 0.88
TOM1-201ENST00000382034 KRT24Q2M2I5 525 aa20.53■□□□□ 0.88
TOM1-201ENST00000382034 PROSER3Q2NL68 480 aa20.53■□□□□ 0.88
TOM1-201ENST00000382034 PARP10Q53GL7 1025 aa20.53■□□□□ 0.88
TOM1-201ENST00000382034 STYK1Q6J9G0 422 aa20.53■□□□□ 0.88
TOM1-201ENST00000382034 WDR63Q8IWG1 891 aa20.53■□□□□ 0.88
TOM1-201ENST00000382034 ADCY9O60503 1353 aa20.53■□□□□ 0.88
TOM1-201ENST00000382034 RNF123Q5XPI4 1314 aa20.53■□□□□ 0.88
TOM1-201ENST00000382034 RIC1Q4ADV7 1423 aa20.53■□□□□ 0.88
TOM1-201ENST00000382034 COPS6Q7L5N1 327 aa20.53■□□□□ 0.88
TOM1-201ENST00000382034 ZBTB3Q9H5J0 574 aa20.53■□□□□ 0.88
TOM1-201ENST00000382034 WWC3Q9ULE0 1092 aa20.53■□□□□ 0.88
TOM1-201ENST00000382034 SRGNP10124 158 aa20.52■□□□□ 0.87
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TOM1-201ENST00000382034 MASTLQ96GX5 879 aa20.51■□□□□ 0.87
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TOM1-201ENST00000382034 NECTIN2Q92692 538 aa20.5■□□□□ 0.87
TOM1-201ENST00000382034 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa20.49■□□□□ 0.87
TOM1-201ENST00000382034 NPR1P16066 1061 aa20.49■□□□□ 0.87
TOM1-201ENST00000382034 PLBD2Q8NHP8 589 aa20.49■□□□□ 0.87
TOM1-201ENST00000382034 UBN2Q6ZU65 1347 aa20.48■□□□□ 0.87
TOM1-201ENST00000382034 ANXA1P04083 346 aa20.48■□□□□ 0.87
TOM1-201ENST00000382034 SOGA3Q5TF21 947 aa20.48■□□□□ 0.87
TOM1-201ENST00000382034 CCDC30Q5VVM6 783 aa20.48■□□□□ 0.87
TOM1-201ENST00000382034 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa20.48■□□□□ 0.87
TOM1-201ENST00000382034 FAM9BQ8IZU0 186 aa20.48■□□□□ 0.87
TOM1-201ENST00000382034 C8orf58Q8NAV2 365 aa20.48■□□□□ 0.87
TOM1-201ENST00000382034 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP20.48■□□□□ 0.87
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TOM1-201ENST00000382034 TCIRG1Q13488 830 aa20.47■□□□□ 0.87
TOM1-201ENST00000382034 CRY2Q49AN0 593 aa20.47■□□□□ 0.87
TOM1-201ENST00000382034 NTSR2O95665 410 aa20.46■□□□□ 0.87
TOM1-201ENST00000382034 GPTP24298 496 aa20.46■□□□□ 0.87
TOM1-201ENST00000382034 ALDH1B1P30837 517 aa20.46■□□□□ 0.87
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TOM1-201ENST00000382034 CCDC24Q8N4L8 307 aa20.46■□□□□ 0.87
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TOM1-201ENST00000382034 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
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TOM1-201ENST00000382034 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
TOM1-201ENST00000382034 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
TOM1-201ENST00000382034 ERFEQ4G0M1 354 aa20.43■□□□□ 0.86
TOM1-201ENST00000382034 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
TOM1-201ENST00000382034 NLRP10Q86W26 655 aa20.43■□□□□ 0.86
TOM1-201ENST00000382034 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
TOM1-201ENST00000382034 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa20.43■□□□□ 0.86
TOM1-201ENST00000382034 LTBP3Q9NS15 1303 aa20.43■□□□□ 0.86
TOM1-201ENST00000382034 SLX4Q8IY92 1834 aa20.42■□□□□ 0.86
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