RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000370408.2

ERLIN1-201, Transcript of ER lipid raft associated 1, humanhuman

TSL 5

Gene ERLIN1, Length 962 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERLIN1-201ENST00000370408 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP28.7■■■□□ 2.18
ERLIN1-201ENST00000370408 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP28.69■■■□□ 2.18
ERLIN1-201ENST00000370408 RGL2O15211 777 aa28.69■■■□□ 2.18
ERLIN1-201ENST00000370408 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP28.69■■■□□ 2.18
ERLIN1-201ENST00000370408 KDM2BQ8NHM5 1336 aa28.69■■■□□ 2.18
ERLIN1-201ENST00000370408 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa28.68■■■□□ 2.18
ERLIN1-201ENST00000370408 SRGNP10124 158 aa28.68■■■□□ 2.18
ERLIN1-201ENST00000370408 DLG5Q8TDM6 1919 aa28.68■■■□□ 2.18
ERLIN1-201ENST00000370408 DLEC1Q9Y238 1755 aa28.67■■■□□ 2.18
ERLIN1-201ENST00000370408 TMPOP42166 694 aaKnown RBP28.67■■■□□ 2.18
ERLIN1-201ENST00000370408 STYK1Q6J9G0 422 aa28.67■■■□□ 2.18
ERLIN1-201ENST00000370408 CNKSR1Q969H4 720 aa28.67■■■□□ 2.18
ERLIN1-201ENST00000370408 RRAGCQ9HB90 399 aa28.67■■■□□ 2.18
ERLIN1-201ENST00000370408 BCORQ6W2J9 1755 aa28.67■■■□□ 2.18
ERLIN1-201ENST00000370408 FAM177BA6PVY3 158 aa28.66■■■□□ 2.18
ERLIN1-201ENST00000370408 TPTE2Q6XPS3 522 aa28.66■■■□□ 2.18
ERLIN1-201ENST00000370408 MASTLQ96GX5 879 aa28.66■■■□□ 2.18
ERLIN1-201ENST00000370408 TSPYL4Q9UJ04 414 aa28.66■■■□□ 2.18
ERLIN1-201ENST00000370408 CEP350Q5VT06 3117 aa28.65■■■□□ 2.18
ERLIN1-201ENST00000370408 MYL6BP14649 208 aa28.64■■■□□ 2.18
ERLIN1-201ENST00000370408 TTLL7Q6ZT98 887 aa28.64■■■□□ 2.18
ERLIN1-201ENST00000370408 CCDC146Q8IYE0 955 aa28.64■■■□□ 2.18
ERLIN1-201ENST00000370408 KDM3BQ7LBC6 1761 aa28.63■■■□□ 2.17
ERLIN1-201ENST00000370408 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP28.63■■■□□ 2.17
ERLIN1-201ENST00000370408 SBF1O95248 1867 aa28.63■■■□□ 2.17
ERLIN1-201ENST00000370408 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP28.63■■■□□ 2.17
ERLIN1-201ENST00000370408 ERVV-1B6SEH8 477 aa28.62■■■□□ 2.17
ERLIN1-201ENST00000370408 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP28.62■■■□□ 2.17
ERLIN1-201ENST00000370408 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP28.61■■■□□ 2.17
ERLIN1-201ENST00000370408 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP28.61■■■□□ 2.17
ERLIN1-201ENST00000370408 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa28.61■■■□□ 2.17
ERLIN1-201ENST00000370408 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP28.6■■■□□ 2.17
ERLIN1-201ENST00000370408 GLTPD2A6NH11 291 aa28.6■■■□□ 2.17
ERLIN1-201ENST00000370408 LMOD3Q0VAK6 560 aa28.6■■■□□ 2.17
ERLIN1-201ENST00000370408 NEUROD2Q15784 382 aa28.6■■■□□ 2.17
ERLIN1-201ENST00000370408 NPR1P16066 1061 aa28.59■■■□□ 2.17
ERLIN1-201ENST00000370408 KIF6Q6ZMV9 814 aa28.59■■■□□ 2.17
ERLIN1-201ENST00000370408 BABAM1Q9NWV8 329 aa28.59■■■□□ 2.17
ERLIN1-201ENST00000370408 ZBTB3Q9H5J0 574 aa28.58■■■□□ 2.17
ERLIN1-201ENST00000370408 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP28.57■■■□□ 2.16
ERLIN1-201ENST00000370408 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP28.57■■■□□ 2.16
ERLIN1-201ENST00000370408 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP28.57■■■□□ 2.16
ERLIN1-201ENST00000370408 C7orf43Q8WVR3 580 aa28.57■■■□□ 2.16
ERLIN1-201ENST00000370408 RUNDC1Q96C34 613 aa28.57■■■□□ 2.16
ERLIN1-201ENST00000370408 ADAMTS8Q9UP79 889 aa28.57■■■□□ 2.16
ERLIN1-201ENST00000370408 LAMB4A4D0S4 1761 aa28.57■■■□□ 2.16
ERLIN1-201ENST00000370408 ERBB4Q15303 1308 aa28.56■■■□□ 2.16
ERLIN1-201ENST00000370408 TAOK3Q9H2K8 898 aa28.56■■■□□ 2.16
ERLIN1-201ENST00000370408 LTBP3Q9NS15 1303 aa28.55■■■□□ 2.16
ERLIN1-201ENST00000370408 APLP1P51693 650 aa28.55■■■□□ 2.16
ERLIN1-201ENST00000370408 PDIA6Q15084 440 aa28.55■■■□□ 2.16
ERLIN1-201ENST00000370408 ERFEQ4G0M1 354 aa28.55■■■□□ 2.16
ERLIN1-201ENST00000370408 SOGA3Q5TF21 947 aa28.55■■■□□ 2.16
ERLIN1-201ENST00000370408 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP28.55■■■□□ 2.16
ERLIN1-201ENST00000370408 GPTP24298 496 aa28.54■■■□□ 2.16
ERLIN1-201ENST00000370408 LRP10Q7Z4F1 713 aa28.54■■■□□ 2.16
ERLIN1-201ENST00000370408 NUTM1Q86Y26 1132 aa28.54■■■□□ 2.16
ERLIN1-201ENST00000370408 NYXQ9GZU5 481 aa28.54■■■□□ 2.16
ERLIN1-201ENST00000370408 TRIM35Q9UPQ4 493 aa28.54■■■□□ 2.16
ERLIN1-201ENST00000370408 SLX4Q8IY92 1834 aa28.54■■■□□ 2.16
ERLIN1-201ENST00000370408 FSTL1Q12841 308 aa28.53■■■□□ 2.16
ERLIN1-201ENST00000370408 UBN2Q6ZU65 1347 aa28.52■■■□□ 2.16
ERLIN1-201ENST00000370408 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP28.52■■■□□ 2.16
ERLIN1-201ENST00000370408 PROSER3Q2NL68 480 aa28.52■■■□□ 2.16
ERLIN1-201ENST00000370408 ZNF34Q8IZ26 560 aa28.52■■■□□ 2.16
ERLIN1-201ENST00000370408 CHL1O00533 1208 aa28.51■■■□□ 2.15
ERLIN1-201ENST00000370408 ANXA1P04083 346 aa28.51■■■□□ 2.15
ERLIN1-201ENST00000370408 SUSD4Q5VX71 490 aa28.51■■■□□ 2.15
ERLIN1-201ENST00000370408 DPY19L2Q6NUT2 758 aa28.51■■■□□ 2.15
ERLIN1-201ENST00000370408 OLFM4Q6UX06 510 aa28.51■■■□□ 2.15
ERLIN1-201ENST00000370408 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP28.51■■■□□ 2.15
ERLIN1-201ENST00000370408 ABCC12Q96J65 1359 aa28.5■■■□□ 2.15
ERLIN1-201ENST00000370408 CCDC93Q567U6 631 aa28.5■■■□□ 2.15
ERLIN1-201ENST00000370408 NECTIN2Q92692 538 aa28.5■■■□□ 2.15
ERLIN1-201ENST00000370408 POTECB2RU33 542 aa28.49■■■□□ 2.15
ERLIN1-201ENST00000370408 ALDH1B1P30837 517 aa28.49■■■□□ 2.15
ERLIN1-201ENST00000370408 KRT24Q2M2I5 525 aa28.49■■■□□ 2.15
ERLIN1-201ENST00000370408 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP28.49■■■□□ 2.15
ERLIN1-201ENST00000370408 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa28.47■■■□□ 2.15
ERLIN1-201ENST00000370408 CRY2Q49AN0 593 aa28.47■■■□□ 2.15
ERLIN1-201ENST00000370408 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa28.47■■■□□ 2.15
ERLIN1-201ENST00000370408 SMC1BQ8NDV3 1235 aa28.46■■■□□ 2.15
ERLIN1-201ENST00000370408 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP28.45■■■□□ 2.15
ERLIN1-201ENST00000370408 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa28.45■■■□□ 2.15
ERLIN1-201ENST00000370408 NTSR2O95665 410 aa28.45■■■□□ 2.14
ERLIN1-201ENST00000370408 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP28.45■■■□□ 2.14
ERLIN1-201ENST00000370408 COPS6Q7L5N1 327 aa28.45■■■□□ 2.14
ERLIN1-201ENST00000370408 RTKN2Q8IZC4 609 aa28.44■■■□□ 2.14
ERLIN1-201ENST00000370408 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP28.44■■■□□ 2.14
ERLIN1-201ENST00000370408 DDNO94850 711 aaPredicted RBP28.43■■■□□ 2.14
ERLIN1-201ENST00000370408 HTRA3P83110 453 aa28.43■■■□□ 2.14
ERLIN1-201ENST00000370408 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP28.43■■■□□ 2.14
ERLIN1-201ENST00000370408 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa28.43■■■□□ 2.14
ERLIN1-201ENST00000370408 XAGE3Q8WTP9 111 aa28.43■■■□□ 2.14
ERLIN1-201ENST00000370408 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP28.43■■■□□ 2.14
ERLIN1-201ENST00000370408 NUP98P52948 1817 aa28.43■■■□□ 2.14
ERLIN1-201ENST00000370408 TIAM2Q8IVF5 1701 aa28.43■■■□□ 2.14
ERLIN1-201ENST00000370408 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP28.42■■■□□ 2.14
ERLIN1-201ENST00000370408 PARP10Q53GL7 1025 aa28.42■■■□□ 2.14
ERLIN1-201ENST00000370408 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP28.42■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 88.1 ms