RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000328379.5

PTRHD1-201, Transcript of peptidyl-tRNA hydrolase domain containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTRHD1, Length 1,105 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTRHD1-201ENST00000328379 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP23.06■■□□□ 1.28
PTRHD1-201ENST00000328379 ERVV-1B6SEH8 477 aa23.05■■□□□ 1.28
PTRHD1-201ENST00000328379 C9orf131Q5VYM1 1079 aa23.05■■□□□ 1.28
PTRHD1-201ENST00000328379 SCN7AQ01118 1682 aa23.05■■□□□ 1.28
PTRHD1-201ENST00000328379 KDM3BQ7LBC6 1761 aa23.04■■□□□ 1.28
PTRHD1-201ENST00000328379 KIF6Q6ZMV9 814 aa23.04■■□□□ 1.28
PTRHD1-201ENST00000328379 CCDC24Q8N4L8 307 aa23.04■■□□□ 1.28
PTRHD1-201ENST00000328379 ERBB4Q15303 1308 aa23.04■■□□□ 1.28
PTRHD1-201ENST00000328379 MYL6BP14649 208 aa23.03■■□□□ 1.28
PTRHD1-201ENST00000328379 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP23.03■■□□□ 1.28
PTRHD1-201ENST00000328379 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP23.02■■□□□ 1.28
PTRHD1-201ENST00000328379 CNKSR1Q969H4 720 aa23.02■■□□□ 1.28
PTRHD1-201ENST00000328379 HLFQ16534 295 aa23.01■■□□□ 1.27
PTRHD1-201ENST00000328379 RNF181Q9P0P0 153 aa23.01■■□□□ 1.27
PTRHD1-201ENST00000328379 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
PTRHD1-201ENST00000328379 CHL1O00533 1208 aa23■■□□□ 1.27
PTRHD1-201ENST00000328379 STYK1Q6J9G0 422 aa23■■□□□ 1.27
PTRHD1-201ENST00000328379 MASTLQ96GX5 879 aa23■■□□□ 1.27
PTRHD1-201ENST00000328379 TRIM35Q9UPQ4 493 aa23■■□□□ 1.27
PTRHD1-201ENST00000328379 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa23■■□□□ 1.27
PTRHD1-201ENST00000328379 NYXQ9GZU5 481 aa22.99■■□□□ 1.27
PTRHD1-201ENST00000328379 LAMB4A4D0S4 1761 aa22.99■■□□□ 1.27
PTRHD1-201ENST00000328379 BCORQ6W2J9 1755 aa22.99■■□□□ 1.27
PTRHD1-201ENST00000328379 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa22.98■■□□□ 1.27
PTRHD1-201ENST00000328379 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
PTRHD1-201ENST00000328379 FAM177BA6PVY3 158 aa22.98■■□□□ 1.27
PTRHD1-201ENST00000328379 SRGNP10124 158 aa22.98■■□□□ 1.27
PTRHD1-201ENST00000328379 LMNB1P20700 586 aa22.98■■□□□ 1.27
PTRHD1-201ENST00000328379 TTLL7Q6ZT98 887 aa22.97■■□□□ 1.27
PTRHD1-201ENST00000328379 C21orf2O43822 256 aa22.96■■□□□ 1.27
PTRHD1-201ENST00000328379 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
PTRHD1-201ENST00000328379 SOGA3Q5TF21 947 aa22.96■■□□□ 1.27
PTRHD1-201ENST00000328379 KDM2BQ8NHM5 1336 aa22.96■■□□□ 1.27
PTRHD1-201ENST00000328379 DLEC1Q9Y238 1755 aa22.96■■□□□ 1.27
PTRHD1-201ENST00000328379 NPR1P16066 1061 aa22.95■■□□□ 1.26
PTRHD1-201ENST00000328379 CFAP44Q96MT7 982 aa22.95■■□□□ 1.26
PTRHD1-201ENST00000328379 ZBTB3Q9H5J0 574 aa22.95■■□□□ 1.26
PTRHD1-201ENST00000328379 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
PTRHD1-201ENST00000328379 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa22.94■■□□□ 1.26
PTRHD1-201ENST00000328379 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
PTRHD1-201ENST00000328379 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
PTRHD1-201ENST00000328379 APAF1O14727 1248 aa22.94■■□□□ 1.26
PTRHD1-201ENST00000328379 ALDH1B1P30837 517 aa22.94■■□□□ 1.26
PTRHD1-201ENST00000328379 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
PTRHD1-201ENST00000328379 KIF3CO14782 793 aa22.93■■□□□ 1.26
PTRHD1-201ENST00000328379 RASSF7Q02833 373 aa22.93■■□□□ 1.26
PTRHD1-201ENST00000328379 PDIA6Q15084 440 aa22.93■■□□□ 1.26
PTRHD1-201ENST00000328379 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
PTRHD1-201ENST00000328379 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa22.92■■□□□ 1.26
PTRHD1-201ENST00000328379 SBF1O95248 1867 aa22.92■■□□□ 1.26
PTRHD1-201ENST00000328379 TOMM70O94826 608 aa22.91■■□□□ 1.26
PTRHD1-201ENST00000328379 HOXB7P09629 217 aa22.91■■□□□ 1.26
PTRHD1-201ENST00000328379 GPTP24298 496 aa22.91■■□□□ 1.26
PTRHD1-201ENST00000328379 PARP10Q53GL7 1025 aa22.91■■□□□ 1.26
PTRHD1-201ENST00000328379 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
PTRHD1-201ENST00000328379 ZNF34Q8IZ26 560 aa22.91■■□□□ 1.26
PTRHD1-201ENST00000328379 NECTIN2Q92692 538 aa22.91■■□□□ 1.26
PTRHD1-201ENST00000328379 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP22.91■■□□□ 1.26
PTRHD1-201ENST00000328379 NUP98P52948 1817 aa22.9■■□□□ 1.26
PTRHD1-201ENST00000328379 ANP32CO43423 234 aa22.9■■□□□ 1.26
PTRHD1-201ENST00000328379 GNAI1P63096 354 aa22.9■■□□□ 1.26
PTRHD1-201ENST00000328379 COPS6Q7L5N1 327 aa22.9■■□□□ 1.26
PTRHD1-201ENST00000328379 NFKBIEO00221 500 aa22.89■■□□□ 1.25
PTRHD1-201ENST00000328379 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
PTRHD1-201ENST00000328379 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa22.89■■□□□ 1.25
PTRHD1-201ENST00000328379 DPY19L2Q6NUT2 758 aa22.89■■□□□ 1.25
PTRHD1-201ENST00000328379 NMRK2Q9NPI5 230 aa22.89■■□□□ 1.25
PTRHD1-201ENST00000328379 SUSD4Q5VX71 490 aa22.88■■□□□ 1.25
PTRHD1-201ENST00000328379 LRP10Q7Z4F1 713 aa22.88■■□□□ 1.25
PTRHD1-201ENST00000328379 NUTM1Q86Y26 1132 aa22.88■■□□□ 1.25
PTRHD1-201ENST00000328379 TAOK3Q9H2K8 898 aa22.88■■□□□ 1.25
PTRHD1-201ENST00000328379 ANXA1P04083 346 aa22.87■■□□□ 1.25
PTRHD1-201ENST00000328379 PROSER3Q2NL68 480 aa22.87■■□□□ 1.25
PTRHD1-201ENST00000328379 ERFEQ4G0M1 354 aa22.87■■□□□ 1.25
PTRHD1-201ENST00000328379 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa22.87■■□□□ 1.25
PTRHD1-201ENST00000328379 XAGE3Q8WTP9 111 aa22.87■■□□□ 1.25
PTRHD1-201ENST00000328379 CHMP4AQ9BY43 222 aa22.87■■□□□ 1.25
PTRHD1-201ENST00000328379 RRAGCQ9HB90 399 aa22.87■■□□□ 1.25
PTRHD1-201ENST00000328379 IFT57Q9NWB7 429 aa22.87■■□□□ 1.25
PTRHD1-201ENST00000328379 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
PTRHD1-201ENST00000328379 LTBP3Q9NS15 1303 aa22.86■■□□□ 1.25
PTRHD1-201ENST00000328379 GLTPD2A6NH11 291 aa22.86■■□□□ 1.25
PTRHD1-201ENST00000328379 KRT24Q2M2I5 525 aa22.86■■□□□ 1.25
PTRHD1-201ENST00000328379 CCDC93Q567U6 631 aa22.86■■□□□ 1.25
PTRHD1-201ENST00000328379 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
PTRHD1-201ENST00000328379 ZNF853P0CG23 659 aa22.85■■□□□ 1.25
PTRHD1-201ENST00000328379 DUSP27Q5VZP5 1158 aa22.85■■□□□ 1.25
PTRHD1-201ENST00000328379 RTKN2Q8IZC4 609 aa22.85■■□□□ 1.25
PTRHD1-201ENST00000328379 C7orf43Q8WVR3 580 aa22.85■■□□□ 1.25
PTRHD1-201ENST00000328379 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
PTRHD1-201ENST00000328379 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
PTRHD1-201ENST00000328379 MBIPQ9NS73 344 aa22.85■■□□□ 1.25
PTRHD1-201ENST00000328379 SLX4Q8IY92 1834 aa22.85■■□□□ 1.25
PTRHD1-201ENST00000328379 UBN2Q6ZU65 1347 aa22.84■■□□□ 1.25
PTRHD1-201ENST00000328379 HSPA6P17066 643 aa22.84■■□□□ 1.25
PTRHD1-201ENST00000328379 PRELPP51888 382 aa22.84■■□□□ 1.25
PTRHD1-201ENST00000328379 NLRP3Q96P20 1036 aa22.84■■□□□ 1.25
PTRHD1-201ENST00000328379 HYPKQ9NX55 129 aa22.84■■□□□ 1.25
PTRHD1-201ENST00000328379 CHPF2Q9P2E5 772 aa22.84■■□□□ 1.25
PTRHD1-201ENST00000328379 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
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