RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000273482.10

TRPC1-201, Transcript of transient receptor potential cation channel subfamily C member 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRPC1, Length 4,324 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC1-201ENST00000273482 MAP3K5Q99683 1374 aa20.18■□□□□ 0.82
TRPC1-201ENST00000273482 UVSSAQ2YD98 709 aa20.18■□□□□ 0.82
TRPC1-201ENST00000273482 SMC2O95347 1197 aa20.17■□□□□ 0.82
TRPC1-201ENST00000273482 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa20.17■□□□□ 0.82
TRPC1-201ENST00000273482 A2ML1A8K2U0 1454 aa20.17■□□□□ 0.82
TRPC1-201ENST00000273482 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa20.16■□□□□ 0.82
TRPC1-201ENST00000273482 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
TRPC1-201ENST00000273482 CCDC158Q5M9N0 1113 aa20.16■□□□□ 0.82
TRPC1-201ENST00000273482 ACSBG1Q96GR2 724 aa20.16■□□□□ 0.82
TRPC1-201ENST00000273482 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa20.16■□□□□ 0.82
TRPC1-201ENST00000273482 E9PCH4 1651 aa20.15■□□□□ 0.82
TRPC1-201ENST00000273482 CHL1O00533 1208 aa20.15■□□□□ 0.82
TRPC1-201ENST00000273482 ZNF445P59923 1031 aa20.15■□□□□ 0.82
TRPC1-201ENST00000273482 TTC39AQ5SRH9 613 aa20.15■□□□□ 0.82
TRPC1-201ENST00000273482 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa20.15■□□□□ 0.82
TRPC1-201ENST00000273482 ANKRD44Q8N8A2 993 aa20.15■□□□□ 0.82
TRPC1-201ENST00000273482 SLAIN2Q9P270 581 aa20.15■□□□□ 0.82
TRPC1-201ENST00000273482 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa20.15■□□□□ 0.82
TRPC1-201ENST00000273482 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
TRPC1-201ENST00000273482 USP26Q9BXU7 913 aa20.15■□□□□ 0.82
TRPC1-201ENST00000273482 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.82
TRPC1-201ENST00000273482 STX6O43752 255 aa20.14■□□□□ 0.82
TRPC1-201ENST00000273482 GIMAP6Q6P9H5 292 aa20.14■□□□□ 0.82
TRPC1-201ENST00000273482 DCTPP1Q9H773 170 aa20.14■□□□□ 0.82
TRPC1-201ENST00000273482 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
TRPC1-201ENST00000273482 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa20.14■□□□□ 0.81
TRPC1-201ENST00000273482 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
TRPC1-201ENST00000273482 USP48Q86UV5 1035 aa20.14■□□□□ 0.81
TRPC1-201ENST00000273482 CKAP2LQ8IYA6 745 aa20.14■□□□□ 0.81
TRPC1-201ENST00000273482 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa20.14■□□□□ 0.81
TRPC1-201ENST00000273482 RNMTO43148 476 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
TRPC1-201ENST00000273482 UBE2HP62256 183 aa20.13■□□□□ 0.81
TRPC1-201ENST00000273482 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa20.13■□□□□ 0.81
TRPC1-201ENST00000273482 HIP1O00291 1037 aa20.13■□□□□ 0.81
TRPC1-201ENST00000273482 KDM4AO75164 1064 aa20.13■□□□□ 0.81
TRPC1-201ENST00000273482 ANKRD1Q15327 319 aa20.13■□□□□ 0.81
TRPC1-201ENST00000273482 BTG4Q9NY30 223 aa20.13■□□□□ 0.81
TRPC1-201ENST00000273482 TNNT1P13805 278 aa20.13■□□□□ 0.81
TRPC1-201ENST00000273482 IL2RBP14784 551 aa20.13■□□□□ 0.81
TRPC1-201ENST00000273482 PDE1AP54750 535 aa20.12■□□□□ 0.81
TRPC1-201ENST00000273482 STK11IPQ8N1F8 1099 aa20.12■□□□□ 0.81
TRPC1-201ENST00000273482 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP20.12■□□□□ 0.81
TRPC1-201ENST00000273482 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
TRPC1-201ENST00000273482 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa20.12■□□□□ 0.81
TRPC1-201ENST00000273482 NLRP1Q9C000 1473 aa20.12■□□□□ 0.81
TRPC1-201ENST00000273482 NFXL1Q6ZNB6 911 aa20.12■□□□□ 0.81
TRPC1-201ENST00000273482 TMEM94Q12767 1356 aa20.12■□□□□ 0.81
TRPC1-201ENST00000273482 CEP152O94986 1710 aa20.12■□□□□ 0.81
TRPC1-201ENST00000273482 TOM1O60784 492 aa20.11■□□□□ 0.81
TRPC1-201ENST00000273482 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
TRPC1-201ENST00000273482 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
TRPC1-201ENST00000273482 PLEKHF1Q96S99 279 aa20.11■□□□□ 0.81
TRPC1-201ENST00000273482 ERICH4A6NGS2 130 aa20.11■□□□□ 0.81
TRPC1-201ENST00000273482 ME1P48163 572 aa20.11■□□□□ 0.81
TRPC1-201ENST00000273482 C8orf37Q96NL8 207 aa20.11■□□□□ 0.81
TRPC1-201ENST00000273482 PPP1R9BQ96SB3 815 aa20.11■□□□□ 0.81
TRPC1-201ENST00000273482 LMBRD1Q9NUN5 540 aa20.11■□□□□ 0.81
TRPC1-201ENST00000273482 PTPN14Q15678 1187 aa20.1■□□□□ 0.81
TRPC1-201ENST00000273482 KLHL34Q8N239 644 aa20.1■□□□□ 0.81
TRPC1-201ENST00000273482 RAD21O60216 631 aa20.1■□□□□ 0.81
TRPC1-201ENST00000273482 RAB11FIP3O75154 756 aa20.1■□□□□ 0.81
TRPC1-201ENST00000273482 TERF1P54274 439 aa20.1■□□□□ 0.81
TRPC1-201ENST00000273482 METTL24Q5JXM2 366 aa20.1■□□□□ 0.81
TRPC1-201ENST00000273482 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
TRPC1-201ENST00000273482 CNPY2Q9Y2B0 182 aa20.1■□□□□ 0.81
TRPC1-201ENST00000273482 SYNMO15061 1565 aa20.09■□□□□ 0.81
TRPC1-201ENST00000273482 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
TRPC1-201ENST00000273482 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
TRPC1-201ENST00000273482 PES1O00541 588 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
TRPC1-201ENST00000273482 IL17REQ8NFR9 667 aa20.09■□□□□ 0.81
TRPC1-201ENST00000273482 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa20.09■□□□□ 0.81
TRPC1-201ENST00000273482 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa20.09■□□□□ 0.81
TRPC1-201ENST00000273482 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa20.09■□□□□ 0.81
TRPC1-201ENST00000273482 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa20.09■□□□□ 0.81
TRPC1-201ENST00000273482 KSR2Q6VAB6 950 aa20.08■□□□□ 0.81
TRPC1-201ENST00000273482 PDILTQ8N807 584 aa20.08■□□□□ 0.81
TRPC1-201ENST00000273482 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
TRPC1-201ENST00000273482 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
TRPC1-201ENST00000273482 TPM1P09493 284 aa20.08■□□□□ 0.81
TRPC1-201ENST00000273482 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.8
TRPC1-201ENST00000273482 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.8
TRPC1-201ENST00000273482 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.8
TRPC1-201ENST00000273482 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.8
TRPC1-201ENST00000273482 CFAP45Q9UL16 551 aa20.08■□□□□ 0.8
TRPC1-201ENST00000273482 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
TRPC1-201ENST00000273482 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
TRPC1-201ENST00000273482 TRIM29Q14134 588 aa20.07■□□□□ 0.8
TRPC1-201ENST00000273482 STK38Q15208 465 aa20.07■□□□□ 0.8
TRPC1-201ENST00000273482 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
TRPC1-201ENST00000273482 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
TRPC1-201ENST00000273482 DCAF5Q96JK2 942 aa20.07■□□□□ 0.8
TRPC1-201ENST00000273482 CEP57L1Q8IYX8 460 aa20.07■□□□□ 0.8
TRPC1-201ENST00000273482 CLIP2Q9UDT6 1046 aa20.07■□□□□ 0.8
TRPC1-201ENST00000273482 MTMR7Q9Y216 660 aa20.07■□□□□ 0.8
TRPC1-201ENST00000273482 KCNQ3O43525 872 aa20.07■□□□□ 0.8
TRPC1-201ENST00000273482 IDH1O75874 414 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
TRPC1-201ENST00000273482 RHPN1Q8TCX5 695 aa20.07■□□□□ 0.8
TRPC1-201ENST00000273482 LMTK3Q96Q04 1460 aa20.06■□□□□ 0.8
TRPC1-201ENST00000273482 GJB2P29033 226 aa20.06■□□□□ 0.8
TRPC1-201ENST00000273482 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.2 ms