RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262643.7

CCNE1-201, Transcript of cyclin E1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCNE1, Length 2,043 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNE1-201ENST00000262643 ANXA1P04083 346 aa27.58■■■□□ 2.01
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CCNE1-201ENST00000262643 NRXN2Q9P2S2 1712 aa27.58■■■□□ 2.01
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CCNE1-201ENST00000262643 TTLL7Q6ZT98 887 aa27.58■■■□□ 2.01
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CCNE1-201ENST00000262643 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP27.5■■□□□ 1.99
CCNE1-201ENST00000262643 PIM2Q9P1W9 311 aa27.5■■□□□ 1.99
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CCNE1-201ENST00000262643 C8orf58Q8NAV2 365 aa27.48■■□□□ 1.99
CCNE1-201ENST00000262643 XAGE3Q8WTP9 111 aa27.48■■□□□ 1.99
CCNE1-201ENST00000262643 ST5P78524 1137 aa27.47■■□□□ 1.99
CCNE1-201ENST00000262643 C2CD5Q86YS7 1000 aa27.47■■□□□ 1.99
CCNE1-201ENST00000262643 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa27.47■■□□□ 1.99
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CCNE1-201ENST00000262643 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP27.46■■□□□ 1.99
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CCNE1-201ENST00000262643 IL16Q14005 1332 aa27.45■■□□□ 1.98
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CCNE1-201ENST00000262643 DLEC1Q9Y238 1755 aa27.41■■□□□ 1.98
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CCNE1-201ENST00000262643 ZNF34Q8IZ26 560 aa27.4■■□□□ 1.98
CCNE1-201ENST00000262643 NUTM1Q86Y26 1132 aa27.4■■□□□ 1.98
CCNE1-201ENST00000262643 FANCIQ9NVI1 1328 aa27.39■■□□□ 1.98
CCNE1-201ENST00000262643 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa27.39■■□□□ 1.98
CCNE1-201ENST00000262643 CDCA7LQ96GN5 454 aa27.39■■□□□ 1.98
CCNE1-201ENST00000262643 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP27.39■■□□□ 1.97
CCNE1-201ENST00000262643 SUSD4Q5VX71 490 aa27.38■■□□□ 1.97
CCNE1-201ENST00000262643 TTLL6Q8N841 843 aa27.38■■□□□ 1.97
CCNE1-201ENST00000262643 NYXQ9GZU5 481 aa27.38■■□□□ 1.97
CCNE1-201ENST00000262643 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa27.38■■□□□ 1.97
CCNE1-201ENST00000262643 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP27.37■■□□□ 1.97
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CCNE1-201ENST00000262643 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP27.36■■□□□ 1.97
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CCNE1-201ENST00000262643 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa27.36■■□□□ 1.97
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CCNE1-201ENST00000262643 ABCC12Q96J65 1359 aa27.34■■□□□ 1.97
CCNE1-201ENST00000262643 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa27.34■■□□□ 1.97
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CCNE1-201ENST00000262643 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP27.33■■□□□ 1.97
CCNE1-201ENST00000262643 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa27.33■■□□□ 1.97
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CCNE1-201ENST00000262643 GOLGA2Q08379 1002 aa27.33■■□□□ 1.96
CCNE1-201ENST00000262643 ZNF428Q96B54 188 aa27.33■■□□□ 1.96
CCNE1-201ENST00000262643 MASTLQ96GX5 879 aa27.32■■□□□ 1.96
CCNE1-201ENST00000262643 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP27.32■■□□□ 1.96
CCNE1-201ENST00000262643 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP27.32■■□□□ 1.96
CCNE1-201ENST00000262643 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP27.31■■□□□ 1.96
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