RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233468.4

SF3B6-201, Transcript of splicing factor 3b subunit 6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SF3B6, Length 770 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SF3B6-201ENST00000233468 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
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SF3B6-201ENST00000233468 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
SF3B6-201ENST00000233468 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa14.57□□□□□ -0.08
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SF3B6-201ENST00000233468 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
SF3B6-201ENST00000233468 C8orf58Q8NAV2 365 aa14.51□□□□□ -0.09
SF3B6-201ENST00000233468 NECTIN2Q92692 538 aa14.51□□□□□ -0.09
SF3B6-201ENST00000233468 STK31Q9BXU1 1019 aa14.51□□□□□ -0.09
SF3B6-201ENST00000233468 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
SF3B6-201ENST00000233468 PRELPP51888 382 aa14.5□□□□□ -0.09
SF3B6-201ENST00000233468 SETDB2Q96T68 719 aa14.5□□□□□ -0.09
SF3B6-201ENST00000233468 RRAGCQ9HB90 399 aa14.5□□□□□ -0.09
SF3B6-201ENST00000233468 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa14.5□□□□□ -0.09
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