RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000227638.7

PANX1-201, Transcript of pannexin 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PANX1, Length 2,769 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PANX1-201ENST00000227638 PXDNQ92626 1479 aa21.9■■□□□ 1.1
PANX1-201ENST00000227638 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.1
PANX1-201ENST00000227638 MSNP26038 577 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.1
PANX1-201ENST00000227638 AACSQ86V21 672 aa21.89■■□□□ 1.1
PANX1-201ENST00000227638 RAD50Q92878 1312 aa21.89■■□□□ 1.09
PANX1-201ENST00000227638 SUCLG2Q96I99 432 aa21.88■■□□□ 1.09
PANX1-201ENST00000227638 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
PANX1-201ENST00000227638 ARID3AQ99856 593 aa21.88■■□□□ 1.09
PANX1-201ENST00000227638 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa21.88■■□□□ 1.09
PANX1-201ENST00000227638 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa21.88■■□□□ 1.09
PANX1-201ENST00000227638 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa21.88■■□□□ 1.09
PANX1-201ENST00000227638 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
PANX1-201ENST00000227638 LRRC37A3O60309 1634 aa21.88■■□□□ 1.09
PANX1-201ENST00000227638 NFAT5O94916 1531 aa21.88■■□□□ 1.09
PANX1-201ENST00000227638 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
PANX1-201ENST00000227638 CNTROBQ8N137 903 aa21.87■■□□□ 1.09
PANX1-201ENST00000227638 KAZALD1Q96I82 304 aa21.87■■□□□ 1.09
PANX1-201ENST00000227638 BOLA2Q9H3K6 86 aa21.87■■□□□ 1.09
PANX1-201ENST00000227638 RNMTO43148 476 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
PANX1-201ENST00000227638 RRP9O43818 475 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
PANX1-201ENST00000227638 SYT1P21579 422 aa21.87■■□□□ 1.09
PANX1-201ENST00000227638 RBM10P98175 930 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
PANX1-201ENST00000227638 ANKRD24Q8TF21 1146 aa21.87■■□□□ 1.09
PANX1-201ENST00000227638 ANAPC15P60006 121 aa21.87■■□□□ 1.09
PANX1-201ENST00000227638 FERMT3Q86UX7 667 aa21.87■■□□□ 1.09
PANX1-201ENST00000227638 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
PANX1-201ENST00000227638 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
PANX1-201ENST00000227638 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
PANX1-201ENST00000227638 PLCB2Q00722 1185 aa21.86■■□□□ 1.09
PANX1-201ENST00000227638 KCNH5Q8NCM2 988 aa21.86■■□□□ 1.09
PANX1-201ENST00000227638 C1orf141Q5JVX7 400 aa21.86■■□□□ 1.09
PANX1-201ENST00000227638 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
PANX1-201ENST00000227638 TTC14Q96N46 770 aa21.86■■□□□ 1.09
PANX1-201ENST00000227638 RAB11FIP3O75154 756 aa21.85■■□□□ 1.09
PANX1-201ENST00000227638 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
PANX1-201ENST00000227638 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
PANX1-201ENST00000227638 ARHGEF25Q86VW2 580 aa21.85■■□□□ 1.09
PANX1-201ENST00000227638 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
PANX1-201ENST00000227638 TCHHQ07283 1943 aa21.84■■□□□ 1.09
PANX1-201ENST00000227638 PPFIA3O75145 1194 aa21.84■■□□□ 1.09
PANX1-201ENST00000227638 SASH1O94885 1247 aa21.84■■□□□ 1.09
PANX1-201ENST00000227638 MCM2P49736 904 aa21.84■■□□□ 1.09
PANX1-201ENST00000227638 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
PANX1-201ENST00000227638 EPHA10Q5JZY3 1008 aa21.84■■□□□ 1.09
PANX1-201ENST00000227638 KRT28Q7Z3Y7 464 aa21.84■■□□□ 1.09
PANX1-201ENST00000227638 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
PANX1-201ENST00000227638 ST3GAL1Q11201 340 aa21.83■■□□□ 1.09
PANX1-201ENST00000227638 AKAP4Q5JQC9 854 aa21.83■■□□□ 1.09
PANX1-201ENST00000227638 CABLES1Q8TDN4 633 aa21.83■■□□□ 1.09
PANX1-201ENST00000227638 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
PANX1-201ENST00000227638 KCNJ4P48050 445 aa21.83■■□□□ 1.08
PANX1-201ENST00000227638 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.08
PANX1-201ENST00000227638 SLFNL1Q499Z3 407 aa21.83■■□□□ 1.08
PANX1-201ENST00000227638 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
PANX1-201ENST00000227638 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
PANX1-201ENST00000227638 STK3Q13188 491 aa21.82■■□□□ 1.08
PANX1-201ENST00000227638 PDLIM2Q96JY6 352 aa21.82■■□□□ 1.08
PANX1-201ENST00000227638 USP25Q9UHP3 1055 aa21.82■■□□□ 1.08
PANX1-201ENST00000227638 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
PANX1-201ENST00000227638 GJB2P29033 226 aa21.82■■□□□ 1.08
PANX1-201ENST00000227638 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
PANX1-201ENST00000227638 GIMAP6Q6P9H5 292 aa21.82■■□□□ 1.08
PANX1-201ENST00000227638 SMC3Q9UQE7 1217 aa21.82■■□□□ 1.08
PANX1-201ENST00000227638 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP21.81■■□□□ 1.08
PANX1-201ENST00000227638 STX6O43752 255 aa21.81■■□□□ 1.08
PANX1-201ENST00000227638 TSPY26PQ9H489 355 aa21.81■■□□□ 1.08
PANX1-201ENST00000227638 ECHDC1Q9NTX5 307 aa21.81■■□□□ 1.08
PANX1-201ENST00000227638 HYPKQ9NX55 129 aa21.81■■□□□ 1.08
PANX1-201ENST00000227638 A0A0D9SFI3 127 aa21.81■■□□□ 1.08
PANX1-201ENST00000227638 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa21.81■■□□□ 1.08
PANX1-201ENST00000227638 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
PANX1-201ENST00000227638 ME3Q16798 604 aa21.8■■□□□ 1.08
PANX1-201ENST00000227638 PDRG1Q9NUG6 133 aa21.8■■□□□ 1.08
PANX1-201ENST00000227638 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
PANX1-201ENST00000227638 IGKV5-2P06315 115 aa21.8■■□□□ 1.08
PANX1-201ENST00000227638 PTMAP06454 111 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
PANX1-201ENST00000227638 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
PANX1-201ENST00000227638 KSR2Q6VAB6 950 aa21.8■■□□□ 1.08
PANX1-201ENST00000227638 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa21.8■■□□□ 1.08
PANX1-201ENST00000227638 MBD3O95983 291 aa21.79■■□□□ 1.08
PANX1-201ENST00000227638 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa21.79■■□□□ 1.08
PANX1-201ENST00000227638 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa21.79■■□□□ 1.08
PANX1-201ENST00000227638 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
PANX1-201ENST00000227638 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
PANX1-201ENST00000227638 RIC3Q7Z5B4 369 aa21.78■■□□□ 1.08
PANX1-201ENST00000227638 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
PANX1-201ENST00000227638 TPCN1Q9ULQ1 816 aa21.78■■□□□ 1.08
PANX1-201ENST00000227638 NLRP2Q9NX02 1062 aa21.78■■□□□ 1.08
PANX1-201ENST00000227638 PDIA6Q15084 440 aa21.77■■□□□ 1.08
PANX1-201ENST00000227638 GRM8O00222 908 aa21.77■■□□□ 1.08
PANX1-201ENST00000227638 CHRNA2Q15822 529 aa21.77■■□□□ 1.08
PANX1-201ENST00000227638 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa21.77■■□□□ 1.08
PANX1-201ENST00000227638 MYD88Q99836 296 aa21.77■■□□□ 1.08
PANX1-201ENST00000227638 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
PANX1-201ENST00000227638 FOSBP53539 338 aa21.76■■□□□ 1.07
PANX1-201ENST00000227638 BABAM1Q9NWV8 329 aa21.76■■□□□ 1.07
PANX1-201ENST00000227638 USP54Q70EL1 1684 aa21.76■■□□□ 1.07
PANX1-201ENST00000227638 AOX1Q06278 1338 aa21.76■■□□□ 1.07
PANX1-201ENST00000227638 COPS6Q7L5N1 327 aa21.76■■□□□ 1.07
PANX1-201ENST00000227638 XAGE3Q8WTP9 111 aa21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.3 ms