RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000223864.6

PLGRKT-201, Transcript of plasminogen receptor with a C-terminal lysine, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PLGRKT, Length 932 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLGRKT-201ENST00000223864 POTEFA5A3E0 1075 aa22.79■■□□□ 1.24
PLGRKT-201ENST00000223864 DCTN1Q14203 1278 aa22.79■■□□□ 1.24
PLGRKT-201ENST00000223864 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa22.79■■□□□ 1.24
PLGRKT-201ENST00000223864 STK24Q9Y6E0 443 aa22.79■■□□□ 1.24
PLGRKT-201ENST00000223864 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
PLGRKT-201ENST00000223864 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa22.78■■□□□ 1.24
PLGRKT-201ENST00000223864 KCNQ3O43525 872 aa22.77■■□□□ 1.24
PLGRKT-201ENST00000223864 NFE2L2Q16236 605 aa22.77■■□□□ 1.24
PLGRKT-201ENST00000223864 ZPR1O75312 459 aa22.76■■□□□ 1.23
PLGRKT-201ENST00000223864 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
PLGRKT-201ENST00000223864 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
PLGRKT-201ENST00000223864 COL15A1P39059 1388 aa22.76■■□□□ 1.23
PLGRKT-201ENST00000223864 CANXP27824 592 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
PLGRKT-201ENST00000223864 EFCAB3Q8N7B9 438 aa22.75■■□□□ 1.23
PLGRKT-201ENST00000223864 PARP3Q9Y6F1 533 aa22.75■■□□□ 1.23
PLGRKT-201ENST00000223864 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa22.74■■□□□ 1.23
PLGRKT-201ENST00000223864 KDM3BQ7LBC6 1761 aa22.74■■□□□ 1.23
PLGRKT-201ENST00000223864 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
PLGRKT-201ENST00000223864 NARFQ9UHQ1 456 aa22.74■■□□□ 1.23
PLGRKT-201ENST00000223864 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP22.73■■□□□ 1.23
PLGRKT-201ENST00000223864 EIF5P55010 431 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
PLGRKT-201ENST00000223864 USPL1Q5W0Q7 1092 aa22.73■■□□□ 1.23
PLGRKT-201ENST00000223864 HS6ST3Q8IZP7 471 aa22.73■■□□□ 1.23
PLGRKT-201ENST00000223864 GRIN3BO60391 1043 aa22.72■■□□□ 1.23
PLGRKT-201ENST00000223864 METRNQ9UJH8 293 aa22.72■■□□□ 1.23
PLGRKT-201ENST00000223864 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
PLGRKT-201ENST00000223864 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
PLGRKT-201ENST00000223864 C10orf71Q711Q0 1435 aa22.72■■□□□ 1.23
PLGRKT-201ENST00000223864 A0A087WZG4 1122 aa22.71■■□□□ 1.23
PLGRKT-201ENST00000223864 TM4SF1P30408 202 aa22.71■■□□□ 1.23
PLGRKT-201ENST00000223864 TAOK2Q9UL54 1235 aa22.71■■□□□ 1.23
PLGRKT-201ENST00000223864 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
PLGRKT-201ENST00000223864 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
PLGRKT-201ENST00000223864 TGFB2P61812 414 aa22.7■■□□□ 1.22
PLGRKT-201ENST00000223864 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
PLGRKT-201ENST00000223864 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
PLGRKT-201ENST00000223864 A1BGP04217 495 aa22.69■■□□□ 1.22
PLGRKT-201ENST00000223864 DDR1Q08345 913 aa22.69■■□□□ 1.22
PLGRKT-201ENST00000223864 SLC39A7Q92504 469 aa22.69■■□□□ 1.22
PLGRKT-201ENST00000223864 USP16Q9Y5T5 823 aa22.69■■□□□ 1.22
PLGRKT-201ENST00000223864 LAMB4A4D0S4 1761 aa22.68■■□□□ 1.22
PLGRKT-201ENST00000223864 PXDNLA1KZ92 1463 aa22.68■■□□□ 1.22
PLGRKT-201ENST00000223864 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP22.68■■□□□ 1.22
PLGRKT-201ENST00000223864 BCL2L12Q9HB09 334 aa22.68■■□□□ 1.22
PLGRKT-201ENST00000223864 MIS18AQ9NYP9 233 aa22.68■■□□□ 1.22
PLGRKT-201ENST00000223864 SCN7AQ01118 1682 aa22.68■■□□□ 1.22
PLGRKT-201ENST00000223864 RIPK4P57078 832 aa22.67■■□□□ 1.22
PLGRKT-201ENST00000223864 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
PLGRKT-201ENST00000223864 NRXN2Q9P2S2 1712 aa22.67■■□□□ 1.22
PLGRKT-201ENST00000223864 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa22.66■■□□□ 1.22
PLGRKT-201ENST00000223864 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
PLGRKT-201ENST00000223864 TMPOP42166 694 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
PLGRKT-201ENST00000223864 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
PLGRKT-201ENST00000223864 NFIXQ14938 502 aa22.66■■□□□ 1.22
PLGRKT-201ENST00000223864 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
PLGRKT-201ENST00000223864 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
PLGRKT-201ENST00000223864 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
PLGRKT-201ENST00000223864 BCORQ6W2J9 1755 aa22.64■■□□□ 1.22
PLGRKT-201ENST00000223864 A0A0G2JLW4 131 aa22.64■■□□□ 1.21
PLGRKT-201ENST00000223864 POTEB2H3BUK9 544 aa22.64■■□□□ 1.21
PLGRKT-201ENST00000223864 C7P10643 843 aa22.64■■□□□ 1.21
PLGRKT-201ENST00000223864 LMOD3Q0VAK6 560 aa22.64■■□□□ 1.21
PLGRKT-201ENST00000223864 RUNDC1Q96C34 613 aa22.64■■□□□ 1.21
PLGRKT-201ENST00000223864 ADAMTS8Q9UP79 889 aa22.64■■□□□ 1.21
PLGRKT-201ENST00000223864 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa22.64■■□□□ 1.21
PLGRKT-201ENST00000223864 UTRNP46939 3433 aa22.63■■□□□ 1.21
PLGRKT-201ENST00000223864 CCDC146Q8IYE0 955 aa22.63■■□□□ 1.21
PLGRKT-201ENST00000223864 WWC3Q9ULE0 1092 aa22.63■■□□□ 1.21
PLGRKT-201ENST00000223864 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
PLGRKT-201ENST00000223864 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa22.61■■□□□ 1.21
PLGRKT-201ENST00000223864 DPEP1P16444 411 aa22.61■■□□□ 1.21
PLGRKT-201ENST00000223864 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
PLGRKT-201ENST00000223864 IER5LQ5T953 404 aa22.61■■□□□ 1.21
PLGRKT-201ENST00000223864 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
PLGRKT-201ENST00000223864 SERPINB2P05120 415 aa22.6■■□□□ 1.21
PLGRKT-201ENST00000223864 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
PLGRKT-201ENST00000223864 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
PLGRKT-201ENST00000223864 NBPF26B4DH59 902 aa22.59■■□□□ 1.21
PLGRKT-201ENST00000223864 CAMTA2O94983 1202 aa22.59■■□□□ 1.21
PLGRKT-201ENST00000223864 GOLGA2Q08379 1002 aa22.59■■□□□ 1.21
PLGRKT-201ENST00000223864 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
PLGRKT-201ENST00000223864 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
PLGRKT-201ENST00000223864 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
PLGRKT-201ENST00000223864 NBPF15Q8N660 670 aa22.59■■□□□ 1.21
PLGRKT-201ENST00000223864 BABAM1Q9NWV8 329 aa22.59■■□□□ 1.21
PLGRKT-201ENST00000223864 KCNA3P22001 575 aa22.58■■□□□ 1.21
PLGRKT-201ENST00000223864 NEUROD2Q15784 382 aa22.58■■□□□ 1.21
PLGRKT-201ENST00000223864 TBC1D9BQ66K14 1250 aa22.58■■□□□ 1.21
PLGRKT-201ENST00000223864 BICDL1Q6ZP65 573 aa22.58■■□□□ 1.21
PLGRKT-201ENST00000223864 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.21
PLGRKT-201ENST00000223864 DLEC1Q9Y238 1755 aa22.58■■□□□ 1.2
PLGRKT-201ENST00000223864 TSPYL4Q9UJ04 414 aa22.57■■□□□ 1.2
PLGRKT-201ENST00000223864 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
PLGRKT-201ENST00000223864 PIM2Q9P1W9 311 aa22.56■■□□□ 1.2
PLGRKT-201ENST00000223864 BCS1LQ9Y276 419 aa22.56■■□□□ 1.2
PLGRKT-201ENST00000223864 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa22.56■■□□□ 1.2
PLGRKT-201ENST00000223864 MFRPQ9BY79 579 aa22.55■■□□□ 1.2
PLGRKT-201ENST00000223864 CARMIL3Q8ND23 1372 aa22.54■■□□□ 1.2
PLGRKT-201ENST00000223864 CLEC4GQ6UXB4 293 aa22.54■■□□□ 1.2
PLGRKT-201ENST00000223864 NUP98P52948 1817 aa22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 86.9 ms