RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000222753.5

HOXA13-201, Transcript of homeobox A13, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXA13, Length 5,030 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13-201ENST00000222753 SPA17Q15506 151 aa21.54■■□□□ 1.04
HOXA13-201ENST00000222753 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa21.54■■□□□ 1.04
HOXA13-201ENST00000222753 STK11IPQ8N1F8 1099 aa21.54■■□□□ 1.04
HOXA13-201ENST00000222753 TAF4BQ92750 862 aa21.54■■□□□ 1.04
HOXA13-201ENST00000222753 PIK3R4Q99570 1358 aa21.54■■□□□ 1.04
HOXA13-201ENST00000222753 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
HOXA13-201ENST00000222753 CENPHQ9H3R5 247 aa21.54■■□□□ 1.04
HOXA13-201ENST00000222753 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
HOXA13-201ENST00000222753 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa21.54■■□□□ 1.04
HOXA13-201ENST00000222753 ANO6Q4KMQ2 910 aa21.53■■□□□ 1.04
HOXA13-201ENST00000222753 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
HOXA13-201ENST00000222753 RHPN1Q8TCX5 695 aa21.53■■□□□ 1.04
HOXA13-201ENST00000222753 NEK1Q96PY6 1258 aa21.53■■□□□ 1.04
HOXA13-201ENST00000222753 MEIS3Q99687 375 aa21.53■■□□□ 1.04
HOXA13-201ENST00000222753 GUCY1B3Q02153 619 aa21.53■■□□□ 1.04
HOXA13-201ENST00000222753 FEZ1Q99689 392 aa21.53■■□□□ 1.04
HOXA13-201ENST00000222753 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
HOXA13-201ENST00000222753 SOGA3Q5TF21 947 aa21.53■■□□□ 1.04
HOXA13-201ENST00000222753 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
HOXA13-201ENST00000222753 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
HOXA13-201ENST00000222753 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa21.53■■□□□ 1.04
HOXA13-201ENST00000222753 CFAP43Q8NDM7 1665 aa21.53■■□□□ 1.04
HOXA13-201ENST00000222753 IDI1Q13907 227 aa21.52■■□□□ 1.04
HOXA13-201ENST00000222753 AIDAQ96BJ3 306 aa21.52■■□□□ 1.04
HOXA13-201ENST00000222753 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa21.52■■□□□ 1.04
HOXA13-201ENST00000222753 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa21.52■■□□□ 1.04
HOXA13-201ENST00000222753 WASLO00401 505 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.03
HOXA13-201ENST00000222753 KCNH5Q8NCM2 988 aa21.52■■□□□ 1.03
HOXA13-201ENST00000222753 HYPKQ9NX55 129 aa21.52■■□□□ 1.03
HOXA13-201ENST00000222753 TNNQ9UQP3 1299 aa21.52■■□□□ 1.03
HOXA13-201ENST00000222753 AMOTQ4VCS5 1084 aa21.51■■□□□ 1.03
HOXA13-201ENST00000222753 FAM177BA6PVY3 158 aa21.51■■□□□ 1.03
HOXA13-201ENST00000222753 ZNF445P59923 1031 aa21.51■■□□□ 1.03
HOXA13-201ENST00000222753 SLU7O95391 586 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
HOXA13-201ENST00000222753 PRDM11Q9NQV5 511 aa21.51■■□□□ 1.03
HOXA13-201ENST00000222753 YEATS4O95619 227 aa21.5■■□□□ 1.03
HOXA13-201ENST00000222753 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
HOXA13-201ENST00000222753 MPHOSPH8Q99549 860 aa21.5■■□□□ 1.03
HOXA13-201ENST00000222753 IDH1O75874 414 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
HOXA13-201ENST00000222753 TSHZ3Q63HK5 1081 aa21.5■■□□□ 1.03
HOXA13-201ENST00000222753 KLHL10Q6JEL2 608 aa21.5■■□□□ 1.03
HOXA13-201ENST00000222753 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP21.5■■□□□ 1.03
HOXA13-201ENST00000222753 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa21.5■■□□□ 1.03
HOXA13-201ENST00000222753 USP26Q9BXU7 913 aa21.5■■□□□ 1.03
HOXA13-201ENST00000222753 DACT1Q9NYF0 836 aa21.5■■□□□ 1.03
HOXA13-201ENST00000222753 GNG11P61952 73 aa21.5■■□□□ 1.03
HOXA13-201ENST00000222753 NPHP3Q7Z494 1330 aa21.49■■□□□ 1.03
HOXA13-201ENST00000222753 GOLGA8BA8MQT2 603 aa21.49■■□□□ 1.03
HOXA13-201ENST00000222753 MICALCLQ6ZW33 695 aa21.49■■□□□ 1.03
HOXA13-201ENST00000222753 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa21.49■■□□□ 1.03
HOXA13-201ENST00000222753 KANK3Q6NY19 840 aa21.49■■□□□ 1.03
HOXA13-201ENST00000222753 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
HOXA13-201ENST00000222753 PAFAH1B1P43034 410 aa21.48■■□□□ 1.03
HOXA13-201ENST00000222753 ATP8B2P98198 1209 aa21.48■■□□□ 1.03
HOXA13-201ENST00000222753 FKBP15Q5T1M5 1219 aa21.48■■□□□ 1.03
HOXA13-201ENST00000222753 BIN1O00499 593 aa21.48■■□□□ 1.03
HOXA13-201ENST00000222753 TYRO3Q06418 890 aa21.48■■□□□ 1.03
HOXA13-201ENST00000222753 CCDC102BQ68D86 513 aa21.48■■□□□ 1.03
HOXA13-201ENST00000222753 ARFGAP3Q9NP61 516 aa21.48■■□□□ 1.03
HOXA13-201ENST00000222753 ZNF213O14771 459 aa21.48■■□□□ 1.03
HOXA13-201ENST00000222753 CCT2P78371 535 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
HOXA13-201ENST00000222753 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
HOXA13-201ENST00000222753 USO1O60763 962 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
HOXA13-201ENST00000222753 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
HOXA13-201ENST00000222753 ZMYM3Q14202 1370 aa21.47■■□□□ 1.03
HOXA13-201ENST00000222753 LMAN1P49257 510 aa21.47■■□□□ 1.03
HOXA13-201ENST00000222753 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
HOXA13-201ENST00000222753 FAM83GA6ND36 823 aa21.47■■□□□ 1.03
HOXA13-201ENST00000222753 GIMAP7Q8NHV1 300 aa21.47■■□□□ 1.03
HOXA13-201ENST00000222753 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
HOXA13-201ENST00000222753 VAMP4O75379 141 aa21.46■■□□□ 1.03
HOXA13-201ENST00000222753 KCNG4Q8TDN1 519 aa21.46■■□□□ 1.03
HOXA13-201ENST00000222753 RBSNQ9H1K0 784 aa21.46■■□□□ 1.03
HOXA13-201ENST00000222753 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
HOXA13-201ENST00000222753 OGFRQ9NZT2 677 aa21.46■■□□□ 1.03
HOXA13-201ENST00000222753 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
HOXA13-201ENST00000222753 ITSN2Q9NZM3 1697 aa21.46■■□□□ 1.03
HOXA13-201ENST00000222753 USP16Q9Y5T5 823 aa21.46■■□□□ 1.03
HOXA13-201ENST00000222753 NECAB1Q8N987 351 aa21.45■■□□□ 1.02
HOXA13-201ENST00000222753 TRERF1Q96PN7 1200 aa21.45■■□□□ 1.02
HOXA13-201ENST00000222753 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
HOXA13-201ENST00000222753 MYD88Q99836 296 aa21.45■■□□□ 1.02
HOXA13-201ENST00000222753 FANCAO15360 1455 aa21.45■■□□□ 1.02
HOXA13-201ENST00000222753 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
HOXA13-201ENST00000222753 PRM3Q9NNZ6 103 aa21.45■■□□□ 1.02
HOXA13-201ENST00000222753 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
HOXA13-201ENST00000222753 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
HOXA13-201ENST00000222753 CEP85Q6P2H3 762 aa21.44■■□□□ 1.02
HOXA13-201ENST00000222753 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
HOXA13-201ENST00000222753 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
HOXA13-201ENST00000222753 RAI14Q9P0K7 980 aa21.44■■□□□ 1.02
HOXA13-201ENST00000222753 IVLP07476 585 aa21.44■■□□□ 1.02
HOXA13-201ENST00000222753 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
HOXA13-201ENST00000222753 NAPBQ9H115 298 aa21.44■■□□□ 1.02
HOXA13-201ENST00000222753 DNAJC25Q9H1X3 360 aa21.44■■□□□ 1.02
HOXA13-201ENST00000222753 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
HOXA13-201ENST00000222753 SLC12A7Q9Y666 1083 aa21.44■■□□□ 1.02
HOXA13-201ENST00000222753 UBASH3AP57075 661 aa21.44■■□□□ 1.02
HOXA13-201ENST00000222753 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
HOXA13-201ENST00000222753 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28 ms