RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000453216.1

TRAM2-AS1-201, Transcript of TRAM2 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene TRAM2-AS1, Length 664 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MLYCDO95822 493 aa24.56■■□□□ 1.52
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SERPINA6P08185 405 aa24.56■■□□□ 1.52
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SMIM10L1P0DMW3 83 aa24.56■■□□□ 1.52
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PAFAH1B1P43034 410 aa24.56■■□□□ 1.52
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 BTG2P78543 158 aa24.56■■□□□ 1.52
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TSNQ15631 228 aaKnown RBP24.56■■□□□ 1.52
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TOR1AIP1Q5JTV8 583 aa24.56■■□□□ 1.52
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MTFR2Q6P444 385 aa24.56■■□□□ 1.52
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ADAMTSL2Q86TH1 951 aa24.56■■□□□ 1.52
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MARVELD3Q96A59 401 aa24.56■■□□□ 1.52
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CCDC120Q96HB5 630 aa24.56■■□□□ 1.52
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SMIM10Q96HG1 83 aa24.56■■□□□ 1.52
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RHBGQ9H310 441 aa24.56■■□□□ 1.52
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RHOJQ9H4E5 214 aa24.56■■□□□ 1.52
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SH3BGRL2Q9UJC5 107 aa24.56■■□□□ 1.52
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MAOAP21397 527 aa24.55■■□□□ 1.52
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CASP6P55212 293 aa24.55■■□□□ 1.52
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CEP97Q8IW35 865 aa24.55■■□□□ 1.52
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CREB3L4Q8TEY5 395 aa24.55■■□□□ 1.52
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ITLN2Q8WWU7 325 aaPredicted RBP24.55■■□□□ 1.52
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 POPDC3Q9HBV1 291 aa24.55■■□□□ 1.52
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GPAMQ9HCL2 828 aa24.55■■□□□ 1.52
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PRDM9Q9NQV7 894 aa24.55■■□□□ 1.52
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LRFN1Q9P244 771 aa24.55■■□□□ 1.52
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CDK2AP1O14519 115 aa24.54■■□□□ 1.52
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SLC19A2O60779 497 aa24.54■■□□□ 1.52
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 H2AFYO75367 372 aaKnown RBP24.54■■□□□ 1.52
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NEURL1O76050 574 aa24.54■■□□□ 1.52
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 WDR47O94967 919 aa24.54■■□□□ 1.52
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SP1P08047 785 aa24.54■■□□□ 1.52
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GNAZP19086 355 aa24.54■■□□□ 1.52
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RPL21P46778 160 aaKnown RBP24.54■■□□□ 1.52
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SLC12A2P55011 1212 aa24.54■■□□□ 1.52
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ALDH6A1Q02252 535 aaKnown RBP24.54■■□□□ 1.52
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ART3Q13508 389 aa24.54■■□□□ 1.52
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZBED8Q8IZ13 594 aa24.54■■□□□ 1.52
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FAM98AQ8NCA5 519 aaKnown RBP24.54■■□□□ 1.52
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ARMC2Q8NEN0 867 aa24.54■■□□□ 1.52
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SNX24Q9Y343 169 aa24.54■■□□□ 1.52
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TCRBV16S1A1N1A0A5B0 115 aa24.53■■□□□ 1.52
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ASPDHA6ND91 283 aa24.53■■□□□ 1.52
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SAGE2PA6NJ88 616 aa24.53■■□□□ 1.52
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 C4orf51C9J302 202 aa24.53■■□□□ 1.52
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 C1GALT1C1LP0DN25 315 aa24.53■■□□□ 1.52
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GDF5P43026 501 aa24.53■■□□□ 1.52
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 STXBP1P61764 594 aaKnown RBP24.53■■□□□ 1.52
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP24.53■■□□□ 1.52
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 C18orf21Q32NC0 220 aaPredicted RBP24.53■■□□□ 1.52
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KRTCAP3Q53RY4 240 aa24.53■■□□□ 1.52
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SLC25A25Q6KCM7 469 aa24.53■■□□□ 1.52
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GALNTL5Q7Z4T8 443 aa24.53■■□□□ 1.52
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MRGPRGQ86SM5 289 aa24.53■■□□□ 1.52
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KLHDC8AQ8IYD2 350 aa24.53■■□□□ 1.52
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CA13Q8N1Q1 262 aa24.53■■□□□ 1.52
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP24.53■■□□□ 1.52
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RHBDF1Q96CC6 855 aa24.53■■□□□ 1.52
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GPR137Q96N19 417 aa24.53■■□□□ 1.52
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FRMD6Q96NE9 622 aa24.53■■□□□ 1.52
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KRT12Q99456 494 aa24.53■■□□□ 1.52
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NECTIN3Q9NQS3 549 aa24.53■■□□□ 1.52
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ABCA12Q86UK0 2595 aa24.52■■□□□ 1.52
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IGKV3D-11A0A0A0MRZ8 115 aa24.52■■□□□ 1.52
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TPP2P29144 1249 aaPredicted RBP24.52■■□□□ 1.52
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SLC6A12P48065 614 aa24.52■■□□□ 1.52
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 BTN3A2P78410 334 aa24.52■■□□□ 1.52
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CBLBQ13191 982 aa24.52■■□□□ 1.52
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF468Q5VIY5 522 aaPredicted RBP24.52■■□□□ 1.52
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TMIGD1Q6UXZ0 262 aa24.52■■□□□ 1.52
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RPTNQ6XPR3 784 aa24.52■■□□□ 1.52
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa24.52■■□□□ 1.52
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CAPN12Q6ZSI9 719 aa24.52■■□□□ 1.52
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP24.52■■□□□ 1.52
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF808Q8N4W9 903 aaPredicted RBP24.52■■□□□ 1.52
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TTLQ8NG68 377 aa24.52■■□□□ 1.52
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MAGED4Q96JG8 741 aa24.52■■□□□ 1.52
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FAR2Q96K12 515 aa24.52■■□□□ 1.52
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MCMBPQ9BTE3 642 aa24.52■■□□□ 1.52
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 AICDAQ9GZX7 198 aa24.52■■□□□ 1.52
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP24.52■■□□□ 1.52
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RNF14Q9UBS8 474 aa24.52■■□□□ 1.52
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KLF2Q9Y5W3 355 aaPredicted RBP24.52■■□□□ 1.52
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ENO4A6NNW6 628 aa24.51■■□□□ 1.51
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 A8MUA0 341 aa24.51■■□□□ 1.51
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MLF1P58340 268 aa24.51■■□□□ 1.51
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 POU4F1Q01851 419 aa24.51■■□□□ 1.51
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP24.51■■□□□ 1.51
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MAPKAPK3Q16644 382 aa24.51■■□□□ 1.51
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PNPLA5Q7Z6Z6 429 aaPredicted RBP24.51■■□□□ 1.51
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 BBOF1Q8ND07 529 aa24.51■■□□□ 1.51
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NFAM1Q8NET5 270 aaPredicted RBP24.51■■□□□ 1.51
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PYROXD1Q8WU10 500 aa24.51■■□□□ 1.51
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GAL3ST3Q96A11 431 aa24.51■■□□□ 1.51
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DEFB126Q9BYW3 111 aa24.51■■□□□ 1.51
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DERL2Q9GZP9 239 aa24.51■■□□□ 1.51
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SMYD2Q9NRG4 433 aa24.51■■□□□ 1.51
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