RNA–Protein interactions for RNA: YFL023W

BUD27, Transcript of Unconventional prefoldin protein involved in translation initiation, yeast

Gene BUD27, Length 2,391 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
BUD27	YFL023W	NFS1	P25374	497 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BUD27	YFL023W	AFR1	P33304	620 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BUD27	YFL023W	BDF2	Q07442	638 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BUD27	YFL023W	PUS7	Q08647	676 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
BUD27	YFL023W	NUP159	P40477	1460 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BUD27	YFL023W	GDB1	Q06625	1536 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BUD27	YFL023W	AGP1	P25376	633 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BUD27	YFL023W	BAP2	P38084	609 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BUD27	YFL023W	PEX7	P39108	375 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BUD27	YFL023W	YGL176C	P46945	554 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BUD27	YFL023W	TMA46	Q12000	345 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
BUD27	YFL023W	FAL1	Q12099	399 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
BUD27	YFL023W	YKR073C	P36153	106 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BUD27	YFL023W	YBR184W	P38299	523 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BUD27	YFL023W	NPP2	P39997	493 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BUD27	YFL023W	GIC2	Q06648	383 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BUD27	YFL023W	ARO1	P08566	1588 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
BUD27	YFL023W	RSC6	P25632	483 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BUD27	YFL023W	SAF1	P38352	637 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BUD27	YFL023W	PNT1	P38969	423 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BUD27	YFL023W	PDR10	P51533	1564 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BUD27	YFL023W	RPL11A	P0C0W9	174 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
BUD27	YFL023W	TAT1	P38085	619 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BUD27	YFL023W	MTC3	P53077	123 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BUD27	YFL023W	SPO21	Q12411	609 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BUD27	YFL023W	RPL11B	Q3E757	174 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
BUD27	YFL023W	GLT1	Q12680	2145 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
BUD27	YFL023W	MNN4	P36044	1178 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BUD27	YFL023W	ERT1	P38140	529 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BUD27	YFL023W	CTH1	P47976	325 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BUD27	YFL023W	HUL5	P53119	910 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BUD27	YFL023W	CWC24	P53769	259 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BUD27	YFL023W	AVO1	Q08236	1176 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BUD27	YFL023W	PDR12	Q02785	1511 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BUD27	YFL023W	RGD1	P38339	666 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BUD27	YFL023W	GCN2	P15442	1659 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BUD27	YFL023W	HBS1	P32769	611 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
BUD27	YFL023W	SLA2	P33338	968 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BUD27	YFL023W	NNK1	P36003	928 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BUD27	YFL023W	BUL2	Q03758	920 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
BUD27	YFL023W	TPP1	Q03796	238 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BUD27	YFL023W	SHE9	Q04172	456 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BUD27	YFL023W	NSE3	Q05541	303 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BUD27	YFL023W	YOL098C	Q12496	1037 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BUD27	YFL023W	RAD4	P14736	754 aa		4.9	□□□□□ -1.62
BUD27	YFL023W	YSC84	P32793	468 aa		4.9	□□□□□ -1.62
BUD27	YFL023W	TDA5	Q06417	326 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
BUD27	YFL023W	FMP25	Q08023	583 aa		4.9	□□□□□ -1.62
BUD27	YFL023W	RIB2	Q12362	591 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
BUD27	YFL023W	SPO14	P36126	1683 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BUD27	YFL023W	CIT2	P08679	460 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BUD27	YFL023W	SBA1	P28707	216 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
BUD27	YFL023W	NUP157	P40064	1391 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
BUD27	YFL023W	RPL8B	P29453	256 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
BUD27	YFL023W	HRQ1	Q05549	1077 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BUD27	YFL023W	MCM7	P38132	845 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BUD27	YFL023W	LSB3	P43603	459 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
BUD27	YFL023W	VPS53	P47061	822 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BUD27	YFL023W	BUD21	Q08492	214 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
BUD27	YFL023W	LPX1	Q12405	387 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
BUD27	YFL023W	RKM4	Q12504	494 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BUD27	YFL023W	YRF1-1	P0CX20	1796 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BUD27	YFL023W	YRF1-5	P0CX21	1796 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BUD27	YFL023W	YRF1-8	P0CX22	1796 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BUD27	YFL023W	BET3	P36149	193 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BUD27	YFL023W	GNT1	Q12096	491 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BUD27	YFL023W	NPP1	P25353	742 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BUD27	YFL023W	ENP1	P38333	483 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
BUD27	YFL023W	RTA1	P53047	317 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BUD27	YFL023W	YGR130C	P53278	816 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BUD27	YFL023W	SDH1	Q00711	640 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BUD27	YFL023W	PUS1	Q12211	544 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
BUD27	YFL023W	YLL054C	Q12244	843 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BUD27	YFL023W	BUD3	P25558	1636 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BUD27	YFL023W	MMS1	Q06211	1407 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BUD27	YFL023W	TOP3	P13099	656 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BUD27	YFL023W	RAD27	P26793	382 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BUD27	YFL023W	UGA2	P38067	497 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BUD27	YFL023W	NOP2	P40991	618 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
BUD27	YFL023W	MMM1	P41800	426 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BUD27	YFL023W	RPN4	Q03465	531 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BUD27	YFL023W	SEC3	P33332	1336 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
BUD27	YFL023W	YSP2	Q06681	1438 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BUD27	YFL023W	NNF1	P47149	201 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BUD27	YFL023W	MAL11	P53048	616 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BUD27	YFL023W	YPL260W	Q08977	551 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BUD27	YFL023W	SRM1	P21827	482 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BUD27	YFL023W	YKL107W	P34251	309 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BUD27	YFL023W	PBP2	P38151	413 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.86	□□□□□ -1.63	not detected
BUD27	YFL023W	UBX5	Q06682	500 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BUD27	YFL023W	XYL2	Q07993	356 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BUD27	YFL023W	WRS1	Q12109	432 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
BUD27	YFL023W	MET5	P47169	1442 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BUD27	YFL023W	IQG1	Q12280	1495 aa		4.85	□□□□□ -1.63
BUD27	YFL023W	ERR1	P0CX10	437 aa		4.85	□□□□□ -1.63
BUD27	YFL023W	ERR2	P0CX11	437 aa		4.85	□□□□□ -1.63
BUD27	YFL023W	HNT2	P49775	206 aa		4.85	□□□□□ -1.63
BUD27	YFL023W	TAF8	Q03750	510 aa		4.85	□□□□□ -1.63
BUD27	YFL023W	LAP2	Q10740	671 aa		4.85	□□□□□ -1.63
BUD27	YFL023W	BI4	P03879	638 aa		4.85	□□□□□ -1.63

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