RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000633035.1

JMJD1C-211, Transcript of jumonji domain containing 1C, humanhuman

TSL 3

Gene JMJD1C, Length 499 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JMJD1C-211ENST00000633035 LMOD3Q0VAK6 560 aa21.83■■□□□ 1.09
JMJD1C-211ENST00000633035 CCDC146Q8IYE0 955 aa21.83■■□□□ 1.09
JMJD1C-211ENST00000633035 PARP3Q9Y6F1 533 aa21.83■■□□□ 1.09
JMJD1C-211ENST00000633035 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.08
JMJD1C-211ENST00000633035 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
JMJD1C-211ENST00000633035 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
JMJD1C-211ENST00000633035 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
JMJD1C-211ENST00000633035 NLGN2Q8NFZ4 835 aa21.82■■□□□ 1.08
JMJD1C-211ENST00000633035 RUNDC1Q96C34 613 aa21.82■■□□□ 1.08
JMJD1C-211ENST00000633035 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
JMJD1C-211ENST00000633035 ADAMTS8Q9UP79 889 aa21.82■■□□□ 1.08
JMJD1C-211ENST00000633035 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
JMJD1C-211ENST00000633035 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
JMJD1C-211ENST00000633035 A0A087WZG4 1122 aa21.81■■□□□ 1.08
JMJD1C-211ENST00000633035 ANP32CO43423 234 aa21.81■■□□□ 1.08
JMJD1C-211ENST00000633035 NEUROD2Q15784 382 aa21.81■■□□□ 1.08
JMJD1C-211ENST00000633035 MIS18AQ9NYP9 233 aa21.81■■□□□ 1.08
JMJD1C-211ENST00000633035 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP21.81■■□□□ 1.08
JMJD1C-211ENST00000633035 UBR2Q8IWV8 1755 aa21.8■■□□□ 1.08
JMJD1C-211ENST00000633035 TMPOP42166 694 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
JMJD1C-211ENST00000633035 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
JMJD1C-211ENST00000633035 COL15A1P39059 1388 aa21.79■■□□□ 1.08
JMJD1C-211ENST00000633035 USPL1Q5W0Q7 1092 aa21.79■■□□□ 1.08
JMJD1C-211ENST00000633035 NARFQ9UHQ1 456 aa21.79■■□□□ 1.08
JMJD1C-211ENST00000633035 A1BGP04217 495 aa21.78■■□□□ 1.08
JMJD1C-211ENST00000633035 FKBP8Q14318 412 aa21.78■■□□□ 1.08
JMJD1C-211ENST00000633035 EIF5P55010 431 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
JMJD1C-211ENST00000633035 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
JMJD1C-211ENST00000633035 USP16Q9Y5T5 823 aa21.77■■□□□ 1.08
JMJD1C-211ENST00000633035 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
JMJD1C-211ENST00000633035 DLG5Q8TDM6 1919 aa21.76■■□□□ 1.07
JMJD1C-211ENST00000633035 YY1P25490 414 aa21.75■■□□□ 1.07
JMJD1C-211ENST00000633035 TSPYL4Q9UJ04 414 aa21.74■■□□□ 1.07
JMJD1C-211ENST00000633035 C4AP0C0L4 1744 aa21.73■■□□□ 1.07
JMJD1C-211ENST00000633035 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa21.73■■□□□ 1.07
JMJD1C-211ENST00000633035 GRIN3BO60391 1043 aa21.73■■□□□ 1.07
JMJD1C-211ENST00000633035 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa21.73■■□□□ 1.07
JMJD1C-211ENST00000633035 TGFB2P61812 414 aa21.72■■□□□ 1.07
JMJD1C-211ENST00000633035 TM4SF1P30408 202 aa21.71■■□□□ 1.07
JMJD1C-211ENST00000633035 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP21.71■■□□□ 1.07
JMJD1C-211ENST00000633035 BABAM1Q9NWV8 329 aa21.71■■□□□ 1.07
JMJD1C-211ENST00000633035 BICDL1Q6ZP65 573 aa21.7■■□□□ 1.06
JMJD1C-211ENST00000633035 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.06
JMJD1C-211ENST00000633035 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP21.69■■□□□ 1.06
JMJD1C-211ENST00000633035 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP21.69■■□□□ 1.06
JMJD1C-211ENST00000633035 DDR1Q08345 913 aa21.69■■□□□ 1.06
JMJD1C-211ENST00000633035 NFIXQ14938 502 aa21.69■■□□□ 1.06
JMJD1C-211ENST00000633035 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP21.69■■□□□ 1.06
JMJD1C-211ENST00000633035 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP21.68■■□□□ 1.06
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JMJD1C-211ENST00000633035 WWC3Q9ULE0 1092 aa21.68■■□□□ 1.06
JMJD1C-211ENST00000633035 APAF1O14727 1248 aa21.67■■□□□ 1.06
JMJD1C-211ENST00000633035 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP21.67■■□□□ 1.06
JMJD1C-211ENST00000633035 BCL2L12Q9HB09 334 aa21.67■■□□□ 1.06
JMJD1C-211ENST00000633035 A0A0G2JLW4 131 aa21.66■■□□□ 1.06
JMJD1C-211ENST00000633035 SERPINB2P05120 415 aa21.66■■□□□ 1.06
JMJD1C-211ENST00000633035 CCDC184Q52MB2 194 aa21.66■■□□□ 1.06
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JMJD1C-211ENST00000633035 ZNF652Q9Y2D9 606 aa21.66■■□□□ 1.06
JMJD1C-211ENST00000633035 NPHP1O15259 732 aa21.65■■□□□ 1.06
JMJD1C-211ENST00000633035 C10orf71Q711Q0 1435 aa21.64■■□□□ 1.06
JMJD1C-211ENST00000633035 DPEP1P16444 411 aa21.64■■□□□ 1.05
JMJD1C-211ENST00000633035 TBC1D9BQ66K14 1250 aa21.64■■□□□ 1.05
JMJD1C-211ENST00000633035 NGEFQ8N5V2 710 aa21.64■■□□□ 1.05
JMJD1C-211ENST00000633035 SETDB2Q96T68 719 aa21.64■■□□□ 1.05
JMJD1C-211ENST00000633035 NBPF26B4DH59 902 aa21.63■■□□□ 1.05
JMJD1C-211ENST00000633035 CAMTA2O94983 1202 aa21.63■■□□□ 1.05
JMJD1C-211ENST00000633035 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP21.63■■□□□ 1.05
JMJD1C-211ENST00000633035 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP21.63■■□□□ 1.05
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JMJD1C-211ENST00000633035 NBPF15Q8N660 670 aa21.63■■□□□ 1.05
JMJD1C-211ENST00000633035 KDM3BQ7LBC6 1761 aa21.63■■□□□ 1.05
JMJD1C-211ENST00000633035 CHL1O00533 1208 aa21.62■■□□□ 1.05
JMJD1C-211ENST00000633035 CLEC4GQ6UXB4 293 aa21.62■■□□□ 1.05
JMJD1C-211ENST00000633035 BCS1LQ9Y276 419 aa21.62■■□□□ 1.05
JMJD1C-211ENST00000633035 MYL6BP14649 208 aa21.61■■□□□ 1.05
JMJD1C-211ENST00000633035 PIM2Q9P1W9 311 aa21.61■■□□□ 1.05
JMJD1C-211ENST00000633035 PXDNLA1KZ92 1463 aa21.6■■□□□ 1.05
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JMJD1C-211ENST00000633035 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP21.56■■□□□ 1.04
JMJD1C-211ENST00000633035 LAMB4A4D0S4 1761 aa21.56■■□□□ 1.04
JMJD1C-211ENST00000633035 CHD4Q14839 1912 aa21.55■■□□□ 1.04
JMJD1C-211ENST00000633035 KCNA3P22001 575 aa21.55■■□□□ 1.04
JMJD1C-211ENST00000633035 PDE6BP35913 854 aa21.55■■□□□ 1.04
JMJD1C-211ENST00000633035 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
JMJD1C-211ENST00000633035 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
JMJD1C-211ENST00000633035 SCN7AQ01118 1682 aa21.54■■□□□ 1.04
JMJD1C-211ENST00000633035 ERVV-1B6SEH8 477 aa21.54■■□□□ 1.04
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