RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000569573.1

E2F4-213, Transcript of E2F transcription factor 4, humanhuman

TSL 3

Gene E2F4, Length 849 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4-213ENST00000569573 NMRK2Q9NPI5 230 aa34.54■■■■□ 3.12
E2F4-213ENST00000569573 NARFQ9UHQ1 456 aa34.54■■■■□ 3.12
E2F4-213ENST00000569573 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP34.53■■■■□ 3.12
E2F4-213ENST00000569573 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa34.53■■■■□ 3.12
E2F4-213ENST00000569573 KCPQ6ZWJ8 1503 aa34.52■■■■□ 3.12
E2F4-213ENST00000569573 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa34.52■■■■□ 3.12
E2F4-213ENST00000569573 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP34.52■■■■□ 3.12
E2F4-213ENST00000569573 VSIG10Q8N0Z9 540 aa34.52■■■■□ 3.12
E2F4-213ENST00000569573 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP34.51■■■■□ 3.12
E2F4-213ENST00000569573 APLP1P51693 650 aa34.51■■■■□ 3.12
E2F4-213ENST00000569573 RNF181Q9P0P0 153 aa34.51■■■■□ 3.12
E2F4-213ENST00000569573 CANXP27824 592 aaKnown RBP34.49■■■■□ 3.11
E2F4-213ENST00000569573 NFIXQ14938 502 aa34.49■■■■□ 3.11
E2F4-213ENST00000569573 KDM2BQ8NHM5 1336 aa34.48■■■■□ 3.11
E2F4-213ENST00000569573 STARD3NLO95772 234 aa34.47■■■■□ 3.11
E2F4-213ENST00000569573 TEFQ10587 303 aa34.47■■■■□ 3.11
E2F4-213ENST00000569573 IFFO2Q5TF58 517 aa34.47■■■■□ 3.11
E2F4-213ENST00000569573 SERPINB2P05120 415 aa34.45■■■■□ 3.11
E2F4-213ENST00000569573 GAS2L2Q8NHY3 880 aa34.45■■■■□ 3.11
E2F4-213ENST00000569573 GNAT3A8MTJ3 354 aa34.43■■■■□ 3.1
E2F4-213ENST00000569573 A0A087WZG4 1122 aa34.42■■■■□ 3.1
E2F4-213ENST00000569573 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa34.41■■■■□ 3.1
E2F4-213ENST00000569573 BICDL1Q6ZP65 573 aa34.41■■■■□ 3.1
E2F4-213ENST00000569573 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP34.41■■■■□ 3.1
E2F4-213ENST00000569573 BCL2L12Q9HB09 334 aa34.41■■■■□ 3.1
E2F4-213ENST00000569573 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP34.4■■■■□ 3.1
E2F4-213ENST00000569573 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP34.4■■■■□ 3.1
E2F4-213ENST00000569573 UBR2Q8IWV8 1755 aa34.4■■■■□ 3.1
E2F4-213ENST00000569573 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP34.39■■■■□ 3.1
E2F4-213ENST00000569573 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP34.39■■■■□ 3.1
E2F4-213ENST00000569573 ZNF790Q6PG37 636 aa34.38■■■■□ 3.09
E2F4-213ENST00000569573 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP34.38■■■■□ 3.09
E2F4-213ENST00000569573 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP34.38■■■■□ 3.09
E2F4-213ENST00000569573 C2CD5Q86YS7 1000 aa34.37■■■■□ 3.09
E2F4-213ENST00000569573 TTLL6Q8N841 843 aa34.37■■■■□ 3.09
E2F4-213ENST00000569573 HEG1Q9ULI3 1381 aa34.36■■■■□ 3.09
E2F4-213ENST00000569573 H0YIN7 160 aa34.36■■■■□ 3.09
E2F4-213ENST00000569573 EIF5P55010 431 aaKnown RBP34.36■■■■□ 3.09
E2F4-213ENST00000569573 RASSF7Q02833 373 aa34.36■■■■□ 3.09
E2F4-213ENST00000569573 IL17REQ8NFR9 667 aa34.36■■■■□ 3.09
E2F4-213ENST00000569573 CFAP53Q96M91 514 aa34.36■■■■□ 3.09
E2F4-213ENST00000569573 RRAGCQ9HB90 399 aa34.36■■■■□ 3.09
E2F4-213ENST00000569573 NRXN2Q9P2S2 1712 aa34.35■■■■□ 3.09
E2F4-213ENST00000569573 FMNL2Q96PY5 1086 aa34.33■■■■□ 3.09
E2F4-213ENST00000569573 LMNB1P20700 586 aa34.32■■■■□ 3.08
E2F4-213ENST00000569573 FSTL1Q12841 308 aa34.32■■■■□ 3.08
E2F4-213ENST00000569573 SBF1O95248 1867 aa34.32■■■■□ 3.08
E2F4-213ENST00000569573 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP34.31■■■■□ 3.08
E2F4-213ENST00000569573 TBC1D9BQ66K14 1250 aa34.3■■■■□ 3.08
E2F4-213ENST00000569573 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa34.3■■■■□ 3.08
E2F4-213ENST00000569573 CARMIL3Q8ND23 1372 aa34.3■■■■□ 3.08
E2F4-213ENST00000569573 DLEC1Q9Y238 1755 aa34.29■■■■□ 3.08
E2F4-213ENST00000569573 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP34.29■■■■□ 3.08
E2F4-213ENST00000569573 NPHP1O15259 732 aa34.29■■■■□ 3.08
E2F4-213ENST00000569573 PRKAR2BP31323 418 aa34.29■■■■□ 3.08
E2F4-213ENST00000569573 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP34.29■■■■□ 3.08
E2F4-213ENST00000569573 NUDCQ9Y266 331 aa34.28■■■■□ 3.08
E2F4-213ENST00000569573 BTBD11A6QL63 1104 aa34.27■■■■□ 3.08
E2F4-213ENST00000569573 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa34.27■■■■□ 3.08
E2F4-213ENST00000569573 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP34.27■■■■□ 3.08
E2F4-213ENST00000569573 PDE6BP35913 854 aa34.26■■■■□ 3.08
E2F4-213ENST00000569573 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa34.26■■■■□ 3.08
E2F4-213ENST00000569573 WDR90Q96KV7 1748 aa34.25■■■■□ 3.07
E2F4-213ENST00000569573 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP34.25■■■■□ 3.07
E2F4-213ENST00000569573 SMC1BQ8NDV3 1235 aa34.24■■■■□ 3.07
E2F4-213ENST00000569573 PHACTR3Q96KR7 559 aa34.24■■■■□ 3.07
E2F4-213ENST00000569573 BRIP1Q9BX63 1249 aa34.24■■■■□ 3.07
E2F4-213ENST00000569573 SCN7AQ01118 1682 aa34.24■■■■□ 3.07
E2F4-213ENST00000569573 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa34.23■■■■□ 3.07
E2F4-213ENST00000569573 A1BGP04217 495 aa34.23■■■■□ 3.07
E2F4-213ENST00000569573 RSPH6AQ9H0K4 717 aa34.23■■■■□ 3.07
E2F4-213ENST00000569573 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP34.22■■■■□ 3.07
E2F4-213ENST00000569573 SETDB2Q96T68 719 aa34.22■■■■□ 3.07
E2F4-213ENST00000569573 GLTPD2A6NH11 291 aa34.21■■■■□ 3.07
E2F4-213ENST00000569573 PRR5LQ6MZQ0 368 aa34.21■■■■□ 3.07
E2F4-213ENST00000569573 CCDC24Q8N4L8 307 aa34.21■■■■□ 3.07
E2F4-213ENST00000569573 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP34.21■■■■□ 3.07
E2F4-213ENST00000569573 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP34.2■■■■□ 3.07
E2F4-213ENST00000569573 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP34.2■■■■□ 3.07
E2F4-213ENST00000569573 CNBD1Q8NA66 436 aa34.2■■■■□ 3.07
E2F4-213ENST00000569573 KCNQ3O43525 872 aa34.19■■■■□ 3.06
E2F4-213ENST00000569573 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP34.19■■■■□ 3.06
E2F4-213ENST00000569573 HTRA3P83110 453 aa34.19■■■■□ 3.06
E2F4-213ENST00000569573 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP34.19■■■■□ 3.06
E2F4-213ENST00000569573 NFKBIEO00221 500 aa34.18■■■■□ 3.06
E2F4-213ENST00000569573 PRELPP51888 382 aa34.18■■■■□ 3.06
E2F4-213ENST00000569573 ST5P78524 1137 aa34.18■■■■□ 3.06
E2F4-213ENST00000569573 C21orf2O43822 256 aa34.17■■■■□ 3.06
E2F4-213ENST00000569573 CAMTA2O94983 1202 aa34.17■■■■□ 3.06
E2F4-213ENST00000569573 KLRG1Q96E93 195 aa34.17■■■■□ 3.06
E2F4-213ENST00000569573 DPY19L2Q6NUT2 758 aa34.16■■■■□ 3.06
E2F4-213ENST00000569573 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa34.16■■■■□ 3.06
E2F4-213ENST00000569573 TIAM2Q8IVF5 1701 aa34.16■■■■□ 3.06
E2F4-213ENST00000569573 USP16Q9Y5T5 823 aa34.14■■■■□ 3.06
E2F4-213ENST00000569573 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa34.14■■■■□ 3.06
E2F4-213ENST00000569573 MCM10Q7L590 875 aa34.13■■■■□ 3.05
E2F4-213ENST00000569573 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP34.12■■■■□ 3.05
E2F4-213ENST00000569573 PPP2R1AP30153 589 aa34.12■■■■□ 3.05
E2F4-213ENST00000569573 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP34.12■■■■□ 3.05
E2F4-213ENST00000569573 CNKSR1Q969H4 720 aa34.12■■■■□ 3.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.9 ms