RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563857.1

RNPS1-208, Transcript of RNA binding protein with serine rich domain 1, humanhuman

TSL 2

Gene RNPS1, Length 739 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNPS1-208ENST00000563857 UBR2Q8IWV8 1755 aa21.09■□□□□ 0.97
RNPS1-208ENST00000563857 TJP1Q07157 1748 aa21.09■□□□□ 0.97
RNPS1-208ENST00000563857 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP21.08■□□□□ 0.97
RNPS1-208ENST00000563857 ADAMTS8Q9UP79 889 aa21.08■□□□□ 0.97
RNPS1-208ENST00000563857 PARP3Q9Y6F1 533 aa21.08■□□□□ 0.97
RNPS1-208ENST00000563857 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP21.07■□□□□ 0.96
RNPS1-208ENST00000563857 GYS1P13807 737 aa21.07■□□□□ 0.96
RNPS1-208ENST00000563857 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP21.07■□□□□ 0.96
RNPS1-208ENST00000563857 NARFQ9UHQ1 456 aa21.07■□□□□ 0.96
RNPS1-208ENST00000563857 MMP10P09238 476 aa21.06■□□□□ 0.96
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RNPS1-208ENST00000563857 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa21.05■□□□□ 0.96
RNPS1-208ENST00000563857 COL15A1P39059 1388 aa21.05■□□□□ 0.96
RNPS1-208ENST00000563857 EIF5P55010 431 aaKnown RBP21.04■□□□□ 0.96
RNPS1-208ENST00000563857 SMIM5Q71RC9 77 aa21.04■□□□□ 0.96
RNPS1-208ENST00000563857 GPR162Q16538 588 aa21.03■□□□□ 0.96
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RNPS1-208ENST00000563857 GRIN3BO60391 1043 aa21.02■□□□□ 0.96
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RNPS1-208ENST00000563857 NEUROD2Q15784 382 aa21.01■□□□□ 0.95
RNPS1-208ENST00000563857 USPL1Q5W0Q7 1092 aa21.01■□□□□ 0.95
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RNPS1-208ENST00000563857 MIS18AQ9NYP9 233 aa20.98■□□□□ 0.95
RNPS1-208ENST00000563857 ZNF652Q9Y2D9 606 aa20.98■□□□□ 0.95
RNPS1-208ENST00000563857 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP20.98■□□□□ 0.95
RNPS1-208ENST00000563857 ERBB4Q15303 1308 aa20.98■□□□□ 0.95
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RNPS1-208ENST00000563857 TM4SF1P30408 202 aa20.97■□□□□ 0.95
RNPS1-208ENST00000563857 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP20.97■□□□□ 0.95
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RNPS1-208ENST00000563857 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP20.95■□□□□ 0.94
RNPS1-208ENST00000563857 NLGN2Q8NFZ4 835 aa20.95■□□□□ 0.94
RNPS1-208ENST00000563857 CHL1O00533 1208 aa20.94■□□□□ 0.94
RNPS1-208ENST00000563857 APAF1O14727 1248 aa20.94■□□□□ 0.94
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RNPS1-208ENST00000563857 C10orf71Q711Q0 1435 aa20.91■□□□□ 0.94
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RNPS1-208ENST00000563857 YY1P25490 414 aa20.9■□□□□ 0.94
RNPS1-208ENST00000563857 KIF6Q6ZMV9 814 aa20.9■□□□□ 0.94
RNPS1-208ENST00000563857 IFT57Q9NWB7 429 aa20.9■□□□□ 0.94
RNPS1-208ENST00000563857 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa20.89■□□□□ 0.93
RNPS1-208ENST00000563857 NPHP1O15259 732 aa20.89■□□□□ 0.93
RNPS1-208ENST00000563857 CAMTA2O94983 1202 aa20.89■□□□□ 0.93
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RNPS1-208ENST00000563857 CCDC27Q2M243 656 aa20.89■□□□□ 0.93
RNPS1-208ENST00000563857 BCL2L12Q9HB09 334 aa20.89■□□□□ 0.93
RNPS1-208ENST00000563857 CARMIL3Q8ND23 1372 aa20.88■□□□□ 0.93
RNPS1-208ENST00000563857 ERVV-1B6SEH8 477 aa20.88■□□□□ 0.93
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RNPS1-208ENST00000563857 NBPF15Q8N660 670 aa20.87■□□□□ 0.93
RNPS1-208ENST00000563857 PIM2Q9P1W9 311 aa20.87■□□□□ 0.93
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RNPS1-208ENST00000563857 DPEP1P16444 411 aa20.84■□□□□ 0.93
RNPS1-208ENST00000563857 CCDC184Q52MB2 194 aa20.84■□□□□ 0.93
RNPS1-208ENST00000563857 TPTE2Q6XPS3 522 aa20.84■□□□□ 0.93
RNPS1-208ENST00000563857 BRIP1Q9BX63 1249 aa20.84■□□□□ 0.93
RNPS1-208ENST00000563857 PXDNLA1KZ92 1463 aa20.83■□□□□ 0.93
RNPS1-208ENST00000563857 H0YIN7 160 aa20.83■□□□□ 0.93
RNPS1-208ENST00000563857 ZNF853P0CG23 659 aa20.83■□□□□ 0.93
RNPS1-208ENST00000563857 MYL6BP14649 208 aa20.83■□□□□ 0.93
RNPS1-208ENST00000563857 CNBD1Q8NA66 436 aa20.83■□□□□ 0.93
RNPS1-208ENST00000563857 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa20.82■□□□□ 0.92
RNPS1-208ENST00000563857 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP20.82■□□□□ 0.92
RNPS1-208ENST00000563857 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP20.82■□□□□ 0.92
RNPS1-208ENST00000563857 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP20.82■□□□□ 0.92
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