RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560971.1

GCSHP2-201, Transcript of glycine cleavage system protein H pseudogene 2, humanhuman

BASIC

Gene GCSHP2, Length 527 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSHP2-201ENST00000560971 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa24.49■■□□□ 1.51
GCSHP2-201ENST00000560971 STARD3NLO95772 234 aa24.49■■□□□ 1.51
GCSHP2-201ENST00000560971 MRS2Q9HD23 443 aa24.49■■□□□ 1.51
GCSHP2-201ENST00000560971 CANXP27824 592 aaKnown RBP24.48■■□□□ 1.51
GCSHP2-201ENST00000560971 SYT17Q9BSW7 474 aa24.48■■□□□ 1.51
GCSHP2-201ENST00000560971 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP24.48■■□□□ 1.51
GCSHP2-201ENST00000560971 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP24.47■■□□□ 1.51
GCSHP2-201ENST00000560971 LMOD3Q0VAK6 560 aa24.47■■□□□ 1.51
GCSHP2-201ENST00000560971 KLHL34Q8N239 644 aa24.47■■□□□ 1.51
GCSHP2-201ENST00000560971 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP24.47■■□□□ 1.51
GCSHP2-201ENST00000560971 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP24.47■■□□□ 1.51
GCSHP2-201ENST00000560971 TRIM35Q9UPQ4 493 aa24.47■■□□□ 1.51
GCSHP2-201ENST00000560971 USP16Q9Y5T5 823 aa24.46■■□□□ 1.51
GCSHP2-201ENST00000560971 APAF1O14727 1248 aa24.45■■□□□ 1.5
GCSHP2-201ENST00000560971 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP24.45■■□□□ 1.5
GCSHP2-201ENST00000560971 GYS1P13807 737 aa24.45■■□□□ 1.5
GCSHP2-201ENST00000560971 C4AP0C0L4 1744 aa24.44■■□□□ 1.5
GCSHP2-201ENST00000560971 A1BGP04217 495 aa24.44■■□□□ 1.5
GCSHP2-201ENST00000560971 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP24.43■■□□□ 1.5
GCSHP2-201ENST00000560971 COL15A1P39059 1388 aa24.42■■□□□ 1.5
GCSHP2-201ENST00000560971 MMP10P09238 476 aa24.42■■□□□ 1.5
GCSHP2-201ENST00000560971 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP24.42■■□□□ 1.5
GCSHP2-201ENST00000560971 NLGN1Q8N2Q7 840 aa24.42■■□□□ 1.5
GCSHP2-201ENST00000560971 TSPYL4Q9UJ04 414 aa24.42■■□□□ 1.5
GCSHP2-201ENST00000560971 KDM3BQ7LBC6 1761 aa24.42■■□□□ 1.5
GCSHP2-201ENST00000560971 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP24.41■■□□□ 1.5
GCSHP2-201ENST00000560971 EIF5P55010 431 aaKnown RBP24.41■■□□□ 1.5
GCSHP2-201ENST00000560971 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa24.4■■□□□ 1.5
GCSHP2-201ENST00000560971 FKBP8Q14318 412 aa24.4■■□□□ 1.5
GCSHP2-201ENST00000560971 USPL1Q5W0Q7 1092 aa24.4■■□□□ 1.5
GCSHP2-201ENST00000560971 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP24.4■■□□□ 1.5
GCSHP2-201ENST00000560971 ZPR1O75312 459 aa24.39■■□□□ 1.49
GCSHP2-201ENST00000560971 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP24.38■■□□□ 1.49
GCSHP2-201ENST00000560971 NLGN2Q8NFZ4 835 aa24.38■■□□□ 1.49
GCSHP2-201ENST00000560971 NARFQ9UHQ1 456 aa24.38■■□□□ 1.49
GCSHP2-201ENST00000560971 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP24.37■■□□□ 1.49
GCSHP2-201ENST00000560971 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
GCSHP2-201ENST00000560971 BABAM1Q9NWV8 329 aa24.36■■□□□ 1.49
GCSHP2-201ENST00000560971 A0A087WZG4 1122 aa24.35■■□□□ 1.49
GCSHP2-201ENST00000560971 NBPF26B4DH59 902 aa24.35■■□□□ 1.49
GCSHP2-201ENST00000560971 CHL1O00533 1208 aa24.35■■□□□ 1.49
GCSHP2-201ENST00000560971 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
GCSHP2-201ENST00000560971 NBPF15Q8N660 670 aa24.35■■□□□ 1.49
GCSHP2-201ENST00000560971 BCL2L12Q9HB09 334 aa24.35■■□□□ 1.49
GCSHP2-201ENST00000560971 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa24.35■■□□□ 1.49
GCSHP2-201ENST00000560971 CD2APQ9Y5K6 639 aa24.34■■□□□ 1.49
GCSHP2-201ENST00000560971 PARP3Q9Y6F1 533 aa24.33■■□□□ 1.49
GCSHP2-201ENST00000560971 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP24.32■■□□□ 1.48
GCSHP2-201ENST00000560971 TM4SF1P30408 202 aa24.32■■□□□ 1.48
GCSHP2-201ENST00000560971 DDR1Q08345 913 aa24.32■■□□□ 1.48
GCSHP2-201ENST00000560971 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP24.31■■□□□ 1.48
GCSHP2-201ENST00000560971 FAM9BQ8IZU0 186 aa24.31■■□□□ 1.48
GCSHP2-201ENST00000560971 UTRNP46939 3433 aa24.3■■□□□ 1.48
GCSHP2-201ENST00000560971 KRT24Q2M2I5 525 aa24.3■■□□□ 1.48
GCSHP2-201ENST00000560971 CFAP44Q96MT7 982 aa24.3■■□□□ 1.48
GCSHP2-201ENST00000560971 LAMB4A4D0S4 1761 aa24.29■■□□□ 1.48
GCSHP2-201ENST00000560971 DCAF8L1A6NGE4 600 aa24.29■■□□□ 1.48
GCSHP2-201ENST00000560971 NFIXQ14938 502 aa24.29■■□□□ 1.48
GCSHP2-201ENST00000560971 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP24.29■■□□□ 1.48
GCSHP2-201ENST00000560971 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP24.28■■□□□ 1.48
GCSHP2-201ENST00000560971 CAMTA2O94983 1202 aa24.28■■□□□ 1.48
GCSHP2-201ENST00000560971 ZNF853P0CG23 659 aa24.27■■□□□ 1.48
GCSHP2-201ENST00000560971 BICDL1Q6ZP65 573 aa24.27■■□□□ 1.48
GCSHP2-201ENST00000560971 MBIPQ9NS73 344 aa24.27■■□□□ 1.48
GCSHP2-201ENST00000560971 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP24.26■■□□□ 1.47
GCSHP2-201ENST00000560971 TBC1D9BQ66K14 1250 aa24.26■■□□□ 1.47
GCSHP2-201ENST00000560971 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP24.26■■□□□ 1.47
GCSHP2-201ENST00000560971 NGEFQ8N5V2 710 aa24.26■■□□□ 1.47
GCSHP2-201ENST00000560971 MYL6BP14649 208 aa24.25■■□□□ 1.47
GCSHP2-201ENST00000560971 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP24.25■■□□□ 1.47
GCSHP2-201ENST00000560971 IFT57Q9NWB7 429 aa24.25■■□□□ 1.47
GCSHP2-201ENST00000560971 C10orf71Q711Q0 1435 aa24.25■■□□□ 1.47
GCSHP2-201ENST00000560971 GPR162Q16538 588 aa24.24■■□□□ 1.47
GCSHP2-201ENST00000560971 WWC1Q8IX03 1113 aa24.24■■□□□ 1.47
GCSHP2-201ENST00000560971 NECTIN2Q92692 538 aa24.24■■□□□ 1.47
GCSHP2-201ENST00000560971 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP24.24■■□□□ 1.47
GCSHP2-201ENST00000560971 SCN7AQ01118 1682 aa24.24■■□□□ 1.47
GCSHP2-201ENST00000560971 GNAI1P63096 354 aa24.23■■□□□ 1.47
GCSHP2-201ENST00000560971 CCDC27Q2M243 656 aa24.23■■□□□ 1.47
GCSHP2-201ENST00000560971 WWC3Q9ULE0 1092 aa24.23■■□□□ 1.47
GCSHP2-201ENST00000560971 SERPINB2P05120 415 aa24.22■■□□□ 1.47
GCSHP2-201ENST00000560971 PDIA6Q15084 440 aa24.22■■□□□ 1.47
GCSHP2-201ENST00000560971 A0A0G2JLW4 131 aa24.2■■□□□ 1.46
GCSHP2-201ENST00000560971 ANXA1P04083 346 aa24.2■■□□□ 1.46
GCSHP2-201ENST00000560971 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP24.2■■□□□ 1.46
GCSHP2-201ENST00000560971 PROSER3Q2NL68 480 aa24.2■■□□□ 1.46
GCSHP2-201ENST00000560971 TTLL7Q6ZT98 887 aa24.2■■□□□ 1.46
GCSHP2-201ENST00000560971 PXDNLA1KZ92 1463 aa24.19■■□□□ 1.46
GCSHP2-201ENST00000560971 KIF13BQ9NQT8 1826 aa24.19■■□□□ 1.46
GCSHP2-201ENST00000560971 BCORQ6W2J9 1755 aa24.19■■□□□ 1.46
GCSHP2-201ENST00000560971 ERBB4Q15303 1308 aa24.19■■□□□ 1.46
GCSHP2-201ENST00000560971 TGFB2P61812 414 aa24.19■■□□□ 1.46
GCSHP2-201ENST00000560971 HLFQ16534 295 aa24.19■■□□□ 1.46
GCSHP2-201ENST00000560971 DUSP27Q5VZP5 1158 aa24.19■■□□□ 1.46
GCSHP2-201ENST00000560971 DPEP1P16444 411 aa24.18■■□□□ 1.46
GCSHP2-201ENST00000560971 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
GCSHP2-201ENST00000560971 CLEC4GQ6UXB4 293 aa24.18■■□□□ 1.46
GCSHP2-201ENST00000560971 LRP10Q7Z4F1 713 aa24.18■■□□□ 1.46
GCSHP2-201ENST00000560971 SETDB2Q96T68 719 aa24.18■■□□□ 1.46
GCSHP2-201ENST00000560971 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 9.7 ms