RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558534.5

RABGGTA-205, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTA, Length 753 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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RABGGTA-205ENST00000558534 TSPYL4Q9UJ04 414 aa20.64■□□□□ 0.89
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RABGGTA-205ENST00000558534 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
RABGGTA-205ENST00000558534 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
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RABGGTA-205ENST00000558534 APAF1O14727 1248 aa20.62■□□□□ 0.89
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RABGGTA-205ENST00000558534 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
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RABGGTA-205ENST00000558534 MIS18AQ9NYP9 233 aa20.57■□□□□ 0.88
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RABGGTA-205ENST00000558534 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
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RABGGTA-205ENST00000558534 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
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RABGGTA-205ENST00000558534 USP16Q9Y5T5 823 aa20.54■□□□□ 0.88
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RABGGTA-205ENST00000558534 WWC1Q8IX03 1113 aa20.48■□□□□ 0.87
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RABGGTA-205ENST00000558534 ZNF853P0CG23 659 aa20.47■□□□□ 0.87
RABGGTA-205ENST00000558534 FKBP8Q14318 412 aa20.47■□□□□ 0.87
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RABGGTA-205ENST00000558534 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
RABGGTA-205ENST00000558534 TM4SF1P30408 202 aa20.44■□□□□ 0.86
RABGGTA-205ENST00000558534 TGFB2P61812 414 aa20.44■□□□□ 0.86
RABGGTA-205ENST00000558534 C10orf71Q711Q0 1435 aa20.44■□□□□ 0.86
RABGGTA-205ENST00000558534 NBPF26B4DH59 902 aa20.43■□□□□ 0.86
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RABGGTA-205ENST00000558534 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa20.42■□□□□ 0.86
RABGGTA-205ENST00000558534 NPHP1O15259 732 aa20.41■□□□□ 0.86
RABGGTA-205ENST00000558534 MYL6BP14649 208 aa20.41■□□□□ 0.86
RABGGTA-205ENST00000558534 DUSP27Q5VZP5 1158 aa20.41■□□□□ 0.86
RABGGTA-205ENST00000558534 MYH16Q9H6N6 1097 aa20.41■□□□□ 0.86
RABGGTA-205ENST00000558534 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP20.41■□□□□ 0.86
RABGGTA-205ENST00000558534 NUP98P52948 1817 aa20.41■□□□□ 0.86
RABGGTA-205ENST00000558534 SERPINB2P05120 415 aa20.4■□□□□ 0.86
RABGGTA-205ENST00000558534 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP20.4■□□□□ 0.86
RABGGTA-205ENST00000558534 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa20.4■□□□□ 0.86
RABGGTA-205ENST00000558534 BCL2L12Q9HB09 334 aa20.4■□□□□ 0.86
RABGGTA-205ENST00000558534 DDR1Q08345 913 aa20.39■□□□□ 0.85
RABGGTA-205ENST00000558534 GPR162Q16538 588 aa20.39■□□□□ 0.85
RABGGTA-205ENST00000558534 HYPKQ9NX55 129 aa20.39■□□□□ 0.85
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