RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558187.5

EFTUD1P1-201, humanhuman

TSL 4 BASIC

Gene EFTUD1P1, Length 596 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD1P1-201ENST00000558187 MMP10P09238 476 aa25.78■■□□□ 1.72
EFTUD1P1-201ENST00000558187 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP25.77■■□□□ 1.72
EFTUD1P1-201ENST00000558187 EIF5P55010 431 aaKnown RBP25.76■■□□□ 1.71
EFTUD1P1-201ENST00000558187 COL15A1P39059 1388 aa25.74■■□□□ 1.71
EFTUD1P1-201ENST00000558187 FKBP8Q14318 412 aa25.74■■□□□ 1.71
EFTUD1P1-201ENST00000558187 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP25.74■■□□□ 1.71
EFTUD1P1-201ENST00000558187 NARFQ9UHQ1 456 aa25.74■■□□□ 1.71
EFTUD1P1-201ENST00000558187 ADAMTS8Q9UP79 889 aa25.74■■□□□ 1.71
EFTUD1P1-201ENST00000558187 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP25.73■■□□□ 1.71
EFTUD1P1-201ENST00000558187 CANXP27824 592 aaKnown RBP25.73■■□□□ 1.71
EFTUD1P1-201ENST00000558187 TMPOP42166 694 aaKnown RBP25.73■■□□□ 1.71
EFTUD1P1-201ENST00000558187 RIPK4P57078 832 aa25.73■■□□□ 1.71
EFTUD1P1-201ENST00000558187 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP25.73■■□□□ 1.71
EFTUD1P1-201ENST00000558187 USP16Q9Y5T5 823 aa25.73■■□□□ 1.71
EFTUD1P1-201ENST00000558187 ZPR1O75312 459 aa25.72■■□□□ 1.71
EFTUD1P1-201ENST00000558187 TM4SF1P30408 202 aa25.72■■□□□ 1.71
EFTUD1P1-201ENST00000558187 MIS18AQ9NYP9 233 aa25.72■■□□□ 1.71
EFTUD1P1-201ENST00000558187 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP25.71■■□□□ 1.71
EFTUD1P1-201ENST00000558187 USPL1Q5W0Q7 1092 aa25.71■■□□□ 1.71
EFTUD1P1-201ENST00000558187 RUNDC1Q96C34 613 aa25.71■■□□□ 1.71
EFTUD1P1-201ENST00000558187 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP25.71■■□□□ 1.71
EFTUD1P1-201ENST00000558187 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa25.7■■□□□ 1.7
EFTUD1P1-201ENST00000558187 A1BGP04217 495 aa25.7■■□□□ 1.7
EFTUD1P1-201ENST00000558187 GPR162Q16538 588 aa25.7■■□□□ 1.7
EFTUD1P1-201ENST00000558187 BCL2L12Q9HB09 334 aa25.7■■□□□ 1.7
EFTUD1P1-201ENST00000558187 PARP3Q9Y6F1 533 aa25.7■■□□□ 1.7
EFTUD1P1-201ENST00000558187 UTRNP46939 3433 aa25.7■■□□□ 1.7
EFTUD1P1-201ENST00000558187 A0A087WZG4 1122 aa25.69■■□□□ 1.7
EFTUD1P1-201ENST00000558187 CCDC146Q8IYE0 955 aa25.68■■□□□ 1.7
EFTUD1P1-201ENST00000558187 DDR1Q08345 913 aa25.67■■□□□ 1.7
EFTUD1P1-201ENST00000558187 LMOD3Q0VAK6 560 aa25.67■■□□□ 1.7
EFTUD1P1-201ENST00000558187 KIF13BQ9NQT8 1826 aa25.67■■□□□ 1.7
EFTUD1P1-201ENST00000558187 KDM3BQ7LBC6 1761 aa25.67■■□□□ 1.7
EFTUD1P1-201ENST00000558187 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP25.66■■□□□ 1.7
EFTUD1P1-201ENST00000558187 C10orf71Q711Q0 1435 aa25.65■■□□□ 1.7
EFTUD1P1-201ENST00000558187 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP25.65■■□□□ 1.7
EFTUD1P1-201ENST00000558187 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP25.65■■□□□ 1.7
EFTUD1P1-201ENST00000558187 TGFB2P61812 414 aa25.65■■□□□ 1.7
EFTUD1P1-201ENST00000558187 BABAM1Q9NWV8 329 aa25.65■■□□□ 1.7
EFTUD1P1-201ENST00000558187 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP25.64■■□□□ 1.7
EFTUD1P1-201ENST00000558187 YY1P25490 414 aa25.64■■□□□ 1.7
EFTUD1P1-201ENST00000558187 GRIN3BO60391 1043 aa25.63■■□□□ 1.69
EFTUD1P1-201ENST00000558187 NFIXQ14938 502 aa25.63■■□□□ 1.69
EFTUD1P1-201ENST00000558187 TRIM35Q9UPQ4 493 aa25.63■■□□□ 1.69
EFTUD1P1-201ENST00000558187 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP25.63■■□□□ 1.69
EFTUD1P1-201ENST00000558187 CCDC184Q52MB2 194 aa25.62■■□□□ 1.69
EFTUD1P1-201ENST00000558187 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP25.62■■□□□ 1.69
EFTUD1P1-201ENST00000558187 NBPF26B4DH59 902 aa25.61■■□□□ 1.69
EFTUD1P1-201ENST00000558187 NEUROD2Q15784 382 aa25.61■■□□□ 1.69
EFTUD1P1-201ENST00000558187 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP25.61■■□□□ 1.69
EFTUD1P1-201ENST00000558187 NBPF15Q8N660 670 aa25.61■■□□□ 1.69
EFTUD1P1-201ENST00000558187 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa25.61■■□□□ 1.69
EFTUD1P1-201ENST00000558187 PXDNLA1KZ92 1463 aa25.6■■□□□ 1.69
EFTUD1P1-201ENST00000558187 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP25.6■■□□□ 1.69
EFTUD1P1-201ENST00000558187 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa25.6■■□□□ 1.69
EFTUD1P1-201ENST00000558187 TSPYL4Q9UJ04 414 aa25.59■■□□□ 1.69
EFTUD1P1-201ENST00000558187 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP25.59■■□□□ 1.69
EFTUD1P1-201ENST00000558187 CAMTA2O94983 1202 aa25.58■■□□□ 1.69
EFTUD1P1-201ENST00000558187 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP25.58■■□□□ 1.69
EFTUD1P1-201ENST00000558187 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP25.58■■□□□ 1.69
EFTUD1P1-201ENST00000558187 CHD4Q14839 1912 aa25.58■■□□□ 1.69
EFTUD1P1-201ENST00000558187 A0A0G2JLW4 131 aa25.57■■□□□ 1.68
EFTUD1P1-201ENST00000558187 ANP32CO43423 234 aa25.57■■□□□ 1.68
EFTUD1P1-201ENST00000558187 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP25.57■■□□□ 1.68
EFTUD1P1-201ENST00000558187 CHL1O00533 1208 aa25.56■■□□□ 1.68
EFTUD1P1-201ENST00000558187 SERPINB2P05120 415 aa25.56■■□□□ 1.68
EFTUD1P1-201ENST00000558187 KCNA3P22001 575 aa25.56■■□□□ 1.68
EFTUD1P1-201ENST00000558187 TBC1D9BQ66K14 1250 aa25.56■■□□□ 1.68
EFTUD1P1-201ENST00000558187 NRXN2Q9P2S2 1712 aa25.56■■□□□ 1.68
EFTUD1P1-201ENST00000558187 LAMB4A4D0S4 1761 aa25.55■■□□□ 1.68
EFTUD1P1-201ENST00000558187 RGL2O15211 777 aa25.55■■□□□ 1.68
EFTUD1P1-201ENST00000558187 DPEP1P16444 411 aa25.55■■□□□ 1.68
EFTUD1P1-201ENST00000558187 SCN7AQ01118 1682 aa25.55■■□□□ 1.68
EFTUD1P1-201ENST00000558187 APAF1O14727 1248 aa25.54■■□□□ 1.68
EFTUD1P1-201ENST00000558187 CLEC4GQ6UXB4 293 aa25.54■■□□□ 1.68
EFTUD1P1-201ENST00000558187 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP25.53■■□□□ 1.68
EFTUD1P1-201ENST00000558187 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP25.53■■□□□ 1.68
EFTUD1P1-201ENST00000558187 BICDL1Q6ZP65 573 aa25.52■■□□□ 1.68
EFTUD1P1-201ENST00000558187 ERBB4Q15303 1308 aa25.5■■□□□ 1.67
EFTUD1P1-201ENST00000558187 BCORQ6W2J9 1755 aa25.5■■□□□ 1.67
EFTUD1P1-201ENST00000558187 WWC3Q9ULE0 1092 aa25.5■■□□□ 1.67
EFTUD1P1-201ENST00000558187 CFAP44Q96MT7 982 aa25.49■■□□□ 1.67
EFTUD1P1-201ENST00000558187 SETDB2Q96T68 719 aa25.49■■□□□ 1.67
EFTUD1P1-201ENST00000558187 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP25.49■■□□□ 1.67
EFTUD1P1-201ENST00000558187 CARMIL3Q8ND23 1372 aa25.48■■□□□ 1.67
EFTUD1P1-201ENST00000558187 PIM2Q9P1W9 311 aa25.48■■□□□ 1.67
EFTUD1P1-201ENST00000558187 ZNF853P0CG23 659 aa25.47■■□□□ 1.67
EFTUD1P1-201ENST00000558187 PDIA6Q15084 440 aa25.47■■□□□ 1.67
EFTUD1P1-201ENST00000558187 MRS2Q9HD23 443 aa25.47■■□□□ 1.67
EFTUD1P1-201ENST00000558187 ZNF652Q9Y2D9 606 aa25.47■■□□□ 1.67
EFTUD1P1-201ENST00000558187 CHRNA5P30532 468 aa25.46■■□□□ 1.67
EFTUD1P1-201ENST00000558187 LRP10Q7Z4F1 713 aa25.46■■□□□ 1.67
EFTUD1P1-201ENST00000558187 BCS1LQ9Y276 419 aa25.46■■□□□ 1.67
EFTUD1P1-201ENST00000558187 ERVV-1B6SEH8 477 aa25.45■■□□□ 1.66
EFTUD1P1-201ENST00000558187 PRR5LQ6MZQ0 368 aa25.45■■□□□ 1.66
EFTUD1P1-201ENST00000558187 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP25.45■■□□□ 1.66
EFTUD1P1-201ENST00000558187 HLFQ16534 295 aa25.44■■□□□ 1.66
EFTUD1P1-201ENST00000558187 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP25.44■■□□□ 1.66
EFTUD1P1-201ENST00000558187 MYL6BP14649 208 aa25.43■■□□□ 1.66
EFTUD1P1-201ENST00000558187 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.7 ms