RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552897.5

TPCN1-222, Transcript of two pore segment channel 1, human

TSL 4

Gene TPCN1, Length 596 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TPCN1-222	ENST00000552897	USP16	Q9Y5T5	823 aa		31.76	■■■□□ 2.67
TPCN1-222	ENST00000552897	KDM3B	Q7LBC6	1761 aa		31.74	■■■□□ 2.67
TPCN1-222	ENST00000552897	EIF4A1	P60842	406 aa	Known RBP	31.74	■■■□□ 2.67
TPCN1-222	ENST00000552897	STARD3NL	O95772	234 aa		31.73	■■■□□ 2.67
TPCN1-222	ENST00000552897	ADRA2B	P18089	450 aa		31.73	■■■□□ 2.67
TPCN1-222	ENST00000552897	FAM9B	Q8IZU0	186 aa		31.73	■■■□□ 2.67
TPCN1-222	ENST00000552897	TEX13A	Q9BXU3	409 aa	Predicted RBP	31.73	■■■□□ 2.67
TPCN1-222	ENST00000552897	SOS1	Q07889	1333 aa	Predicted RBP	31.73	■■■□□ 2.67
TPCN1-222	ENST00000552897	COL24A1	Q17RW2	1714 aa		31.72	■■■□□ 2.67
TPCN1-222	ENST00000552897	SNRPA1	P09661	255 aa	Known RBP	31.72	■■■□□ 2.67
TPCN1-222	ENST00000552897	TSPYL4	Q9UJ04	414 aa		31.72	■■■□□ 2.67
TPCN1-222	ENST00000552897	A1BG	P04217	495 aa		31.71	■■■□□ 2.67
TPCN1-222	ENST00000552897	CANX	P27824	592 aa	Known RBP	31.71	■■■□□ 2.67
TPCN1-222	ENST00000552897	PPP1R1B	Q9UD71	204 aa	Predicted RBP	31.7	■■■□□ 2.67
TPCN1-222	ENST00000552897	CHL1	O00533	1208 aa		31.69	■■■□□ 2.66
TPCN1-222	ENST00000552897	DIEXF	Q68CQ4	756 aa	Known RBP	31.69	■■■□□ 2.66
TPCN1-222	ENST00000552897	GIGYF1	O75420	1035 aa	Predicted RBP	31.68	■■■□□ 2.66
TPCN1-222	ENST00000552897	RFC4	P35249	363 aa		31.68	■■■□□ 2.66
TPCN1-222	ENST00000552897	BABAM1	Q9NWV8	329 aa		31.68	■■■□□ 2.66
TPCN1-222	ENST00000552897	SRP68	Q9UHB9	627 aa	Known RBP	31.68	■■■□□ 2.66
TPCN1-222	ENST00000552897	ARX	Q96QS3	562 aa		31.67	■■■□□ 2.66
TPCN1-222	ENST00000552897	LAS1L	Q9Y4W2	734 aa	Known RBP	31.67	■■■□□ 2.66
TPCN1-222	ENST00000552897	PIP4K2A	P48426	406 aa	Predicted RBP	31.66	■■■□□ 2.66
TPCN1-222	ENST00000552897	EIF5	P55010	431 aa	Known RBP	31.66	■■■□□ 2.66
TPCN1-222	ENST00000552897	POLD1	P28340	1107 aa		31.65	■■■□□ 2.66
TPCN1-222	ENST00000552897	C4A	P0C0L4	1744 aa		31.65	■■■□□ 2.66
TPCN1-222	ENST00000552897	GYS1	P13807	737 aa		31.64	■■■□□ 2.66
TPCN1-222	ENST00000552897	USP42	Q9H9J4	1324 aa	Known RBP	31.63	■■■□□ 2.65
TPCN1-222	ENST00000552897	COL15A1	P39059	1388 aa		31.63	■■■□□ 2.65
TPCN1-222	ENST00000552897	NBPF26	B4DH59	902 aa		31.62	■■■□□ 2.65
TPCN1-222	ENST00000552897	ZNF853	P0CG23	659 aa		31.62	■■■□□ 2.65
TPCN1-222	ENST00000552897	NBPF10	Q6P3W6	841 aa	Known RBP	31.62	■■■□□ 2.65
TPCN1-222	ENST00000552897	NBPF15	Q8N660	670 aa		31.62	■■■□□ 2.65
TPCN1-222	ENST00000552897	CFAP44	Q96MT7	982 aa		31.62	■■■□□ 2.65
TPCN1-222	ENST00000552897	CCER2	I3L3R5	266 aa		31.61	■■■□□ 2.65
TPCN1-222	ENST00000552897	KRT24	Q2M2I5	525 aa		31.61	■■■□□ 2.65
TPCN1-222	ENST00000552897	IL6ST	P40189	918 aa	Predicted RBP	31.6	■■■□□ 2.65
TPCN1-222	ENST00000552897	CCDC27	Q2M243	656 aa		31.6	■■■□□ 2.65
TPCN1-222	ENST00000552897	WWC1	Q8IX03	1113 aa		31.6	■■■□□ 2.65
TPCN1-222	ENST00000552897	MIER1	Q8N108	512 aa		31.6	■■■□□ 2.65
TPCN1-222	ENST00000552897	FHDC1	Q9C0D6	1143 aa	Predicted RBP	31.6	■■■□□ 2.65
TPCN1-222	ENST00000552897	FKBP8	Q14318	412 aa		31.59	■■■□□ 2.65
TPCN1-222	ENST00000552897	USPL1	Q5W0Q7	1092 aa		31.59	■■■□□ 2.65
TPCN1-222	ENST00000552897	MBIP	Q9NS73	344 aa		31.59	■■■□□ 2.65
TPCN1-222	ENST00000552897	SALL2	Q9Y467	1007 aa	Predicted RBP	31.59	■■■□□ 2.65
TPCN1-222	ENST00000552897	NLGN1	Q8N2Q7	840 aa		31.58	■■■□□ 2.65
TPCN1-222	ENST00000552897	BCL2L12	Q9HB09	334 aa		31.58	■■■□□ 2.65
TPCN1-222	ENST00000552897	NARF	Q9UHQ1	456 aa		31.58	■■■□□ 2.65
TPCN1-222	ENST00000552897	ZNF330	Q9Y3S2	320 aa	Predicted RBP	31.58	■■■□□ 2.65
TPCN1-222	ENST00000552897	MMP10	P09238	476 aa		31.56	■■■□□ 2.64
TPCN1-222	ENST00000552897	IFT57	Q9NWB7	429 aa		31.56	■■■□□ 2.64
TPCN1-222	ENST00000552897	ZPR1	O75312	459 aa		31.55	■■■□□ 2.64
TPCN1-222	ENST00000552897	NCBP3	Q53F19	620 aa	Known RBP	31.55	■■■□□ 2.64
TPCN1-222	ENST00000552897	SYT17	Q9BSW7	474 aa		31.55	■■■□□ 2.64
TPCN1-222	ENST00000552897	TBC1D2B	Q9UPU7	963 aa		31.55	■■■□□ 2.64
TPCN1-222	ENST00000552897	LAMB4	A4D0S4	1761 aa		31.53	■■■□□ 2.64
TPCN1-222	ENST00000552897	GNAI1	P63096	354 aa		31.53	■■■□□ 2.64
TPCN1-222	ENST00000552897	CALD1	Q05682	793 aa	Known RBP	31.53	■■■□□ 2.64
TPCN1-222	ENST00000552897		A0A087WZG4	1122 aa		31.52	■■■□□ 2.64
TPCN1-222	ENST00000552897	EIF2S2	P20042	333 aa	Known RBP	31.51	■■■□□ 2.63
TPCN1-222	ENST00000552897	KLHL34	Q8N239	644 aa		31.51	■■■□□ 2.63
TPCN1-222	ENST00000552897	DDR1	Q08345	913 aa		31.5	■■■□□ 2.63
TPCN1-222	ENST00000552897	CAMTA2	O94983	1202 aa		31.49	■■■□□ 2.63
TPCN1-222	ENST00000552897	TM4SF1	P30408	202 aa		31.49	■■■□□ 2.63
TPCN1-222	ENST00000552897	PDIA6	Q15084	440 aa		31.48	■■■□□ 2.63
TPCN1-222	ENST00000552897	DZIP3	Q86Y13	1208 aa	Known RBP	31.48	■■■□□ 2.63
TPCN1-222	ENST00000552897	NECTIN2	Q92692	538 aa		31.48	■■■□□ 2.63
TPCN1-222	ENST00000552897	NLGN2	Q8NFZ4	835 aa		31.47	■■■□□ 2.63
TPCN1-222	ENST00000552897	TSR2	Q969E8	191 aa	Known RBP	31.47	■■■□□ 2.63
TPCN1-222	ENST00000552897	MYL6B	P14649	208 aa		31.46	■■■□□ 2.63
TPCN1-222	ENST00000552897	NFIX	Q14938	502 aa		31.46	■■■□□ 2.63
TPCN1-222	ENST00000552897	PROSER3	Q2NL68	480 aa		31.46	■■■□□ 2.63
TPCN1-222	ENST00000552897	DUSP27	Q5VZP5	1158 aa		31.46	■■■□□ 2.63
TPCN1-222	ENST00000552897	NGEF	Q8N5V2	710 aa		31.46	■■■□□ 2.63
TPCN1-222	ENST00000552897	ANXA1	P04083	346 aa		31.45	■■■□□ 2.63
TPCN1-222	ENST00000552897	LRP10	Q7Z4F1	713 aa		31.45	■■■□□ 2.63
TPCN1-222	ENST00000552897	NPM2	Q86SE8	214 aa	Known RBP	31.44	■■■□□ 2.62
TPCN1-222	ENST00000552897	C8orf58	Q8NAV2	365 aa		31.44	■■■□□ 2.62
TPCN1-222	ENST00000552897	IL16	Q14005	1332 aa		31.44	■■■□□ 2.62
TPCN1-222	ENST00000552897	POLRMT	O00411	1230 aa	Known RBP	31.43	■■■□□ 2.62
TPCN1-222	ENST00000552897	WDR63	Q8IWG1	891 aa		31.43	■■■□□ 2.62
TPCN1-222	ENST00000552897	SPINK5	Q9NQ38	1064 aa	Predicted RBP	31.43	■■■□□ 2.62
TPCN1-222	ENST00000552897	PARP3	Q9Y6F1	533 aa		31.43	■■■□□ 2.62
TPCN1-222	ENST00000552897	ERBB4	Q15303	1308 aa		31.43	■■■□□ 2.62
TPCN1-222	ENST00000552897	ELL2	O00472	640 aa	Predicted RBP	31.42	■■■□□ 2.62
TPCN1-222	ENST00000552897	TBC1D9B	Q66K14	1250 aa		31.42	■■■□□ 2.62
TPCN1-222	ENST00000552897	TTLL7	Q6ZT98	887 aa		31.42	■■■□□ 2.62
TPCN1-222	ENST00000552897	CD2AP	Q9Y5K6	639 aa		31.42	■■■□□ 2.62
TPCN1-222	ENST00000552897	HOXB7	P09629	217 aa		31.41	■■■□□ 2.62
TPCN1-222	ENST00000552897	BICDL1	Q6ZP65	573 aa		31.41	■■■□□ 2.62
TPCN1-222	ENST00000552897	SCN7A	Q01118	1682 aa		31.41	■■■□□ 2.62
TPCN1-222	ENST00000552897	TSPYL6	Q8N831	410 aa		31.4	■■■□□ 2.62
TPCN1-222	ENST00000552897	HDGFL1	Q5TGJ6	251 aa		31.39	■■■□□ 2.62
TPCN1-222	ENST00000552897	ZNF521	Q96K83	1311 aa		31.39	■■■□□ 2.62
TPCN1-222	ENST00000552897	HLF	Q16534	295 aa		31.38	■■■□□ 2.61
TPCN1-222	ENST00000552897	CHPF2	Q9P2E5	772 aa		31.37	■■■□□ 2.61
TPCN1-222	ENST00000552897	BCOR	Q6W2J9	1755 aa		31.37	■■■□□ 2.61
TPCN1-222	ENST00000552897	C10orf71	Q711Q0	1435 aa		31.35	■■■□□ 2.61
TPCN1-222	ENST00000552897	FANCI	Q9NVI1	1328 aa		31.35	■■■□□ 2.61
TPCN1-222	ENST00000552897	DDX21	Q9NR30	783 aa	Known RBP eCLIP	31.35	■■■□□ 2.61

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 67.1 ms