RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551936.5

CS-229, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 744 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-229ENST00000551936 DPEP1P16444 411 aa19.38■□□□□ 0.69
CS-229ENST00000551936 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP19.38■□□□□ 0.69
CS-229ENST00000551936 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP19.38■□□□□ 0.69
CS-229ENST00000551936 NARFQ9UHQ1 456 aa19.38■□□□□ 0.69
CS-229ENST00000551936 COL15A1P39059 1388 aa19.37■□□□□ 0.69
CS-229ENST00000551936 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP19.37■□□□□ 0.69
CS-229ENST00000551936 KCNA3P22001 575 aa19.37■□□□□ 0.69
CS-229ENST00000551936 C1QTNF8P60827 252 aa19.37■□□□□ 0.69
CS-229ENST00000551936 HEG1Q9ULI3 1381 aa19.36■□□□□ 0.69
CS-229ENST00000551936 BCS1LQ9Y276 419 aa19.36■□□□□ 0.69
CS-229ENST00000551936 ADCY9O60503 1353 aa19.35■□□□□ 0.69
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CS-229ENST00000551936 BCL2L12Q9HB09 334 aa19.35■□□□□ 0.69
CS-229ENST00000551936 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP19.35■□□□□ 0.69
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CS-229ENST00000551936 KCNQ3O43525 872 aa19.34■□□□□ 0.69
CS-229ENST00000551936 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP19.34■□□□□ 0.69
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CS-229ENST00000551936 FMNL2Q96PY5 1086 aa19.33■□□□□ 0.68
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CS-229ENST00000551936 A0A087WZG4 1122 aa19.3■□□□□ 0.68
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CS-229ENST00000551936 DCTN1Q14203 1278 aa19.29■□□□□ 0.68
CS-229ENST00000551936 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa19.29■□□□□ 0.68
CS-229ENST00000551936 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa19.28■□□□□ 0.68
CS-229ENST00000551936 CHRNA5P30532 468 aa19.28■□□□□ 0.68
CS-229ENST00000551936 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP19.28■□□□□ 0.68
CS-229ENST00000551936 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP19.28■□□□□ 0.68
CS-229ENST00000551936 USP16Q9Y5T5 823 aa19.28■□□□□ 0.68
CS-229ENST00000551936 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP19.27■□□□□ 0.68
CS-229ENST00000551936 PLEKHF1Q96S99 279 aa19.27■□□□□ 0.68
CS-229ENST00000551936 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa19.26■□□□□ 0.67
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CS-229ENST00000551936 TBC1D9BQ66K14 1250 aa19.25■□□□□ 0.67
CS-229ENST00000551936 BICDL1Q6ZP65 573 aa19.25■□□□□ 0.67
CS-229ENST00000551936 DLG5Q8TDM6 1919 aa19.24■□□□□ 0.67
CS-229ENST00000551936 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa19.24■□□□□ 0.67
CS-229ENST00000551936 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP19.24■□□□□ 0.67
CS-229ENST00000551936 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP19.24■□□□□ 0.67
CS-229ENST00000551936 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP19.23■□□□□ 0.67
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CS-229ENST00000551936 DLEC1Q9Y238 1755 aa19.19■□□□□ 0.66
CS-229ENST00000551936 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP19.19■□□□□ 0.66
CS-229ENST00000551936 C2CD5Q86YS7 1000 aa19.19■□□□□ 0.66
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CS-229ENST00000551936 H0YIN7 160 aa19.18■□□□□ 0.66
CS-229ENST00000551936 PRR5LQ6MZQ0 368 aa19.18■□□□□ 0.66
CS-229ENST00000551936 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP19.18■□□□□ 0.66
CS-229ENST00000551936 NBPF15Q8N660 670 aa19.18■□□□□ 0.66
CS-229ENST00000551936 BCORQ6W2J9 1755 aa19.18■□□□□ 0.66
CS-229ENST00000551936 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa19.18■□□□□ 0.66
CS-229ENST00000551936 TTLL6Q8N841 843 aa19.17■□□□□ 0.66
CS-229ENST00000551936 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP19.17■□□□□ 0.66
CS-229ENST00000551936 SETDB2Q96T68 719 aa19.17■□□□□ 0.66
CS-229ENST00000551936 BRIP1Q9BX63 1249 aa19.17■□□□□ 0.66
CS-229ENST00000551936 SBF1O95248 1867 aa19.17■□□□□ 0.66
CS-229ENST00000551936 KDM3BQ7LBC6 1761 aa19.16■□□□□ 0.66
CS-229ENST00000551936 CLEC4GQ6UXB4 293 aa19.16■□□□□ 0.66
CS-229ENST00000551936 CCDC24Q8N4L8 307 aa19.16■□□□□ 0.66
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CS-229ENST00000551936 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP19.15■□□□□ 0.66
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CS-229ENST00000551936 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa19.15■□□□□ 0.66
CS-229ENST00000551936 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP19.14■□□□□ 0.65
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CS-229ENST00000551936 PRELPP51888 382 aa19.12■□□□□ 0.65
CS-229ENST00000551936 CNBD1Q8NA66 436 aa19.12■□□□□ 0.65
CS-229ENST00000551936 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP19.12■□□□□ 0.65
CS-229ENST00000551936 NMRK2Q9NPI5 230 aa19.12■□□□□ 0.65
CS-229ENST00000551936 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP19.11■□□□□ 0.65
CS-229ENST00000551936 RGL2O15211 777 aa19.11■□□□□ 0.65
CS-229ENST00000551936 RIPK4P57078 832 aa19.11■□□□□ 0.65
CS-229ENST00000551936 ZNF652Q9Y2D9 606 aa19.11■□□□□ 0.65
CS-229ENST00000551936 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP19.11■□□□□ 0.65
CS-229ENST00000551936 HSPA6P17066 643 aa19.1■□□□□ 0.65
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