RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548567.5

CS-212, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CS, Length 3,057 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-212ENST00000548567 GAS2L2Q8NHY3 880 aa9.87□□□□□ -0.83
CS-212ENST00000548567 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
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CS-212ENST00000548567 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
CS-212ENST00000548567 SLIT3O75094 1523 aa9.87□□□□□ -0.83
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CS-212ENST00000548567 SGIP1Q9BQI5 828 aa9.86□□□□□ -0.83
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CS-212ENST00000548567 C9orf131Q5VYM1 1079 aa9.86□□□□□ -0.83
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CS-212ENST00000548567 CLEC11AQ9Y240 323 aa9.85□□□□□ -0.83
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CS-212ENST00000548567 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
CS-212ENST00000548567 NBPF26B4DH59 902 aa9.84□□□□□ -0.83
CS-212ENST00000548567 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
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CS-212ENST00000548567 JAG2Q9Y219 1238 aa9.84□□□□□ -0.83
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CS-212ENST00000548567 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
CS-212ENST00000548567 CHMP3Q9Y3E7 222 aa9.84□□□□□ -0.83
CS-212ENST00000548567 CEP290O15078 2479 aa9.84□□□□□ -0.83
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CS-212ENST00000548567 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa9.83□□□□□ -0.84
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CS-212ENST00000548567 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP9.83□□□□□ -0.84
CS-212ENST00000548567 SLC4A10Q6U841 1118 aa9.83□□□□□ -0.84
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CS-212ENST00000548567 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
CS-212ENST00000548567 ZNF408Q9H9D4 720 aa9.83□□□□□ -0.84
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CS-212ENST00000548567 TSPYL6Q8N831 410 aa9.82□□□□□ -0.84
CS-212ENST00000548567 BCL2L12Q9HB09 334 aa9.82□□□□□ -0.84
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CS-212ENST00000548567 LRRC37A3O60309 1634 aa9.82□□□□□ -0.84
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CS-212ENST00000548567 DDNO94850 711 aaPredicted RBP9.81□□□□□ -0.84
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CS-212ENST00000548567 SLC16A10Q8TF71 515 aa9.81□□□□□ -0.84
CS-212ENST00000548567 XAGE3Q8WTP9 111 aa9.81□□□□□ -0.84
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CS-212ENST00000548567 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa9.81□□□□□ -0.84
CS-212ENST00000548567 LAMA3Q16787 3333 aa9.81□□□□□ -0.84
CS-212ENST00000548567 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP9.81□□□□□ -0.84
CS-212ENST00000548567 SNAP23O00161 211 aa9.81□□□□□ -0.84
CS-212ENST00000548567 COL18A1P39060 1754 aa9.8□□□□□ -0.84
CS-212ENST00000548567 RTL1A6NKG5 1358 aa9.8□□□□□ -0.84
CS-212ENST00000548567 MAP3K5Q99683 1374 aa9.8□□□□□ -0.84
CS-212ENST00000548567 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP9.8□□□□□ -0.842e-6■■□□□ 11.9
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CS-212ENST00000548567 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP9.8□□□□□ -0.84
CS-212ENST00000548567 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
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CS-212ENST00000548567 COL15A1P39059 1388 aa9.79□□□□□ -0.84
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CS-212ENST00000548567 C8orf58Q8NAV2 365 aa9.78□□□□□ -0.84
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CS-212ENST00000548567 NARFQ9UHQ1 456 aa9.78□□□□□ -0.84
CS-212ENST00000548567 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP9.78□□□□□ -0.84
CS-212ENST00000548567 BTAF1O14981 1849 aa9.78□□□□□ -0.84
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