RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000537075.2

KCNS1-202, Transcript of potassium voltage-gated channel modifier subfamily S member 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene KCNS1, Length 2,136 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNS1-202ENST00000537075 FOXD4L1Q9NU39 408 aa27.8■■■□□ 2.04
KCNS1-202ENST00000537075 STAP2Q9UGK3 403 aa27.8■■■□□ 2.04
KCNS1-202ENST00000537075 REC8O95072 547 aa27.79■■■□□ 2.04
KCNS1-202ENST00000537075 BEND3Q5T5X7 828 aa27.79■■■□□ 2.04
KCNS1-202ENST00000537075 ABCC6O95255 1503 aa27.79■■■□□ 2.04
KCNS1-202ENST00000537075 ADCY9O60503 1353 aa27.79■■■□□ 2.04
KCNS1-202ENST00000537075 HEG1Q9ULI3 1381 aa27.79■■■□□ 2.04
KCNS1-202ENST00000537075 POLA2Q14181 598 aa27.79■■■□□ 2.04
KCNS1-202ENST00000537075 C1orf141Q5JVX7 400 aa27.79■■■□□ 2.04
KCNS1-202ENST00000537075 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP27.78■■■□□ 2.04
KCNS1-202ENST00000537075 DNAAF4Q8WXU2 420 aa27.78■■■□□ 2.04
KCNS1-202ENST00000537075 ABCA3Q99758 1704 aa27.78■■■□□ 2.04
KCNS1-202ENST00000537075 PI4KAP2A4QPH2 592 aa27.77■■■□□ 2.04
KCNS1-202ENST00000537075 DDX11L8A8MPP1 907 aa27.77■■■□□ 2.04
KCNS1-202ENST00000537075 ANXA1P04083 346 aa27.77■■■□□ 2.04
KCNS1-202ENST00000537075 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa27.77■■■□□ 2.04
KCNS1-202ENST00000537075 CHMP4AQ9BY43 222 aa27.77■■■□□ 2.04
KCNS1-202ENST00000537075 CPDO75976 1380 aa27.77■■■□□ 2.04
KCNS1-202ENST00000537075 TRAK2O60296 914 aa27.77■■■□□ 2.04
KCNS1-202ENST00000537075 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP27.76■■■□□ 2.03
KCNS1-202ENST00000537075 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa27.76■■■□□ 2.03
KCNS1-202ENST00000537075 ERBB3P21860 1342 aa27.75■■■□□ 2.03
KCNS1-202ENST00000537075 AOX1Q06278 1338 aa27.74■■■□□ 2.03
KCNS1-202ENST00000537075 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP27.73■■■□□ 2.03
KCNS1-202ENST00000537075 AK9Q5TCS8 1911 aa27.73■■■□□ 2.03
KCNS1-202ENST00000537075 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa27.73■■■□□ 2.03
KCNS1-202ENST00000537075 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP27.73■■■□□ 2.03
KCNS1-202ENST00000537075 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP27.72■■■□□ 2.03
KCNS1-202ENST00000537075 SCN11AQ9UI33 1791 aa27.72■■■□□ 2.03
KCNS1-202ENST00000537075 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa27.71■■■□□ 2.03
KCNS1-202ENST00000537075 RAB11FIP3O75154 756 aa27.71■■■□□ 2.03
KCNS1-202ENST00000537075 PROSER3Q2NL68 480 aa27.71■■■□□ 2.03
KCNS1-202ENST00000537075 CHMLP26374 656 aa27.7■■■□□ 2.03
KCNS1-202ENST00000537075 CHRNA2Q15822 529 aa27.7■■■□□ 2.03
KCNS1-202ENST00000537075 UNC5CLQ8IV45 518 aa27.7■■■□□ 2.03
KCNS1-202ENST00000537075 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa27.7■■■□□ 2.02
KCNS1-202ENST00000537075 GBP4Q96PP9 640 aa27.7■■■□□ 2.02
KCNS1-202ENST00000537075 SRGAP3O43295 1099 aa27.69■■■□□ 2.02
KCNS1-202ENST00000537075 SURF6O75683 361 aaKnown RBP27.69■■■□□ 2.02
KCNS1-202ENST00000537075 SSFA2P28290 1259 aa27.69■■■□□ 2.02
KCNS1-202ENST00000537075 FSD2A1L4K1 749 aa27.68■■■□□ 2.02
KCNS1-202ENST00000537075 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP27.68■■■□□ 2.02
KCNS1-202ENST00000537075 C5P01031 1676 aa27.68■■■□□ 2.02
KCNS1-202ENST00000537075 RHPN1Q8TCX5 695 aa27.68■■■□□ 2.02
KCNS1-202ENST00000537075 RILPL2Q969X0 211 aa27.67■■■□□ 2.02
KCNS1-202ENST00000537075 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa27.67■■■□□ 2.02
KCNS1-202ENST00000537075 ST18O60284 1047 aa27.67■■■□□ 2.02
KCNS1-202ENST00000537075 CLEC17AQ6ZS10 378 aa27.67■■■□□ 2.02
KCNS1-202ENST00000537075 NUTM1Q86Y26 1132 aa27.67■■■□□ 2.02
KCNS1-202ENST00000537075 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP27.66■■■□□ 2.02
KCNS1-202ENST00000537075 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP27.65■■■□□ 2.02
KCNS1-202ENST00000537075 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa27.65■■■□□ 2.02
KCNS1-202ENST00000537075 PI4K2BQ8TCG2 481 aa27.65■■■□□ 2.02
KCNS1-202ENST00000537075 PRDM11Q9NQV5 511 aa27.65■■■□□ 2.02
KCNS1-202ENST00000537075 MTX1Q13505 466 aa27.64■■■□□ 2.02
KCNS1-202ENST00000537075 KIF1BPQ96EK5 621 aa27.64■■■□□ 2.02
KCNS1-202ENST00000537075 KSR2Q6VAB6 950 aa27.64■■■□□ 2.01
KCNS1-202ENST00000537075 MEGF6O75095 1541 aa27.63■■■□□ 2.01
KCNS1-202ENST00000537075 ALDH1L1O75891 902 aa27.63■■■□□ 2.01
KCNS1-202ENST00000537075 NLRP2Q9NX02 1062 aa27.63■■■□□ 2.01
KCNS1-202ENST00000537075 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP27.62■■■□□ 2.01
KCNS1-202ENST00000537075 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa27.62■■■□□ 2.01
KCNS1-202ENST00000537075 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP27.62■■■□□ 2.01
KCNS1-202ENST00000537075 PALD1Q9ULE6 856 aa27.62■■■□□ 2.01
KCNS1-202ENST00000537075 PHLPP1O60346 1717 aa27.62■■■□□ 2.01
KCNS1-202ENST00000537075 TOM1O60784 492 aa27.61■■■□□ 2.01
KCNS1-202ENST00000537075 IL25Q9H293 177 aa27.61■■■□□ 2.01
KCNS1-202ENST00000537075 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP27.61■■■□□ 2.01
KCNS1-202ENST00000537075 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa27.61■■■□□ 2.01
KCNS1-202ENST00000537075 PDIA6Q15084 440 aa27.6■■■□□ 2.01
KCNS1-202ENST00000537075 IL17RAQ96F46 866 aa27.6■■■□□ 2.01
KCNS1-202ENST00000537075 HYPKQ9NX55 129 aa27.6■■■□□ 2.01
KCNS1-202ENST00000537075 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa27.59■■■□□ 2.01
KCNS1-202ENST00000537075 ANO2Q9NQ90 1003 aa27.59■■■□□ 2.01
KCNS1-202ENST00000537075 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP27.59■■■□□ 2.01
KCNS1-202ENST00000537075 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP27.59■■■□□ 2.01
KCNS1-202ENST00000537075 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP27.58■■■□□ 2.01
KCNS1-202ENST00000537075 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP27.58■■■□□ 2.01
KCNS1-202ENST00000537075 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP27.58■■■□□ 2.01
KCNS1-202ENST00000537075 PKD1L3Q7Z443 1732 aa27.58■■■□□ 2.01
KCNS1-202ENST00000537075 BAG4O95429 457 aaKnown RBP27.58■■■□□ 2.01
KCNS1-202ENST00000537075 PTMSP20962 102 aa27.58■■■□□ 2.01
KCNS1-202ENST00000537075 ANAPC15P60006 121 aa27.58■■■□□ 2.01
KCNS1-202ENST00000537075 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa27.58■■■□□ 2.01
KCNS1-202ENST00000537075 SLC52A2Q9HAB3 445 aa27.58■■■□□ 2.01
KCNS1-202ENST00000537075 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP27.57■■■□□ 2
KCNS1-202ENST00000537075 PHKG2P15735 406 aa27.57■■■□□ 2
KCNS1-202ENST00000537075 PKP1Q13835 747 aa27.57■■■□□ 2
KCNS1-202ENST00000537075 ZNF790Q6PG37 636 aa27.57■■■□□ 2
KCNS1-202ENST00000537075 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP27.57■■■□□ 2
KCNS1-202ENST00000537075 NEK4P51957 841 aa27.56■■■□□ 2
KCNS1-202ENST00000537075 NUCB2P80303 420 aa27.56■■■□□ 2
KCNS1-202ENST00000537075 MRC1P22897 1456 aa27.56■■■□□ 2
KCNS1-202ENST00000537075 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP27.56■■■□□ 2
KCNS1-202ENST00000537075 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP27.56■■■□□ 2
KCNS1-202ENST00000537075 SLC39A6Q13433 755 aa27.56■■■□□ 2
KCNS1-202ENST00000537075 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP27.56■■■□□ 2
KCNS1-202ENST00000537075 MCCP23508 829 aa27.55■■■□□ 2
KCNS1-202ENST00000537075 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP27.55■■■□□ 2
KCNS1-202ENST00000537075 UTYO14607 1347 aa27.55■■■□□ 2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 88.9 ms