RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514384.1

SMIM20-202, Transcript of small integral membrane protein 20, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SMIM20, Length 774 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM20-202ENST00000514384 MCOLN1Q9GZU1 580 aa9.64□□□□□ -0.87
SMIM20-202ENST00000514384 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa9.64□□□□□ -0.87
SMIM20-202ENST00000514384 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
SMIM20-202ENST00000514384 AMIGO3Q86WK7 504 aa9.63□□□□□ -0.87
SMIM20-202ENST00000514384 SPNS2Q8IVW8 549 aa9.63□□□□□ -0.87
SMIM20-202ENST00000514384 CARD10Q9BWT7 1032 aa9.63□□□□□ -0.87
SMIM20-202ENST00000514384 MRS2Q9HD23 443 aa9.63□□□□□ -0.87
SMIM20-202ENST00000514384 TSKSQ9UJT2 592 aa9.63□□□□□ -0.87
SMIM20-202ENST00000514384 INSRP06213 1382 aa9.63□□□□□ -0.87
SMIM20-202ENST00000514384 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
SMIM20-202ENST00000514384 WASLO00401 505 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
SMIM20-202ENST00000514384 PKD1L3Q7Z443 1732 aa9.62□□□□□ -0.87
SMIM20-202ENST00000514384 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP9.61□□□□□ -0.87
SMIM20-202ENST00000514384 CFAP70Q5T0N1 1121 aa9.61□□□□□ -0.87
SMIM20-202ENST00000514384 ACEP12821 1306 aa9.6□□□□□ -0.87
SMIM20-202ENST00000514384 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa9.6□□□□□ -0.87
SMIM20-202ENST00000514384 PHF14O94880 888 aa9.6□□□□□ -0.87
SMIM20-202ENST00000514384 DPEP1P16444 411 aa9.6□□□□□ -0.87
SMIM20-202ENST00000514384 MMRN1Q13201 1228 aa9.6□□□□□ -0.87
SMIM20-202ENST00000514384 CCDC184Q52MB2 194 aa9.6□□□□□ -0.87
SMIM20-202ENST00000514384 NLRP13Q86W25 1043 aa9.6□□□□□ -0.87
SMIM20-202ENST00000514384 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
SMIM20-202ENST00000514384 NUDCQ9Y266 331 aa9.6□□□□□ -0.87
SMIM20-202ENST00000514384 KAT6BQ8WYB5 2073 aa9.6□□□□□ -0.87
SMIM20-202ENST00000514384 PIK3C2GO75747 1445 aa9.59□□□□□ -0.87
SMIM20-202ENST00000514384 PIK3C2AO00443 1686 aa9.59□□□□□ -0.87
SMIM20-202ENST00000514384 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
SMIM20-202ENST00000514384 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
SMIM20-202ENST00000514384 ERICH6Q7L0X2 663 aa9.59□□□□□ -0.87
SMIM20-202ENST00000514384 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
SMIM20-202ENST00000514384 ABCC6O95255 1503 aa9.58□□□□□ -0.88
SMIM20-202ENST00000514384 POTECB2RU33 542 aa9.58□□□□□ -0.88
SMIM20-202ENST00000514384 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
SMIM20-202ENST00000514384 MS4A4AQ96JQ5 239 aa9.58□□□□□ -0.88
SMIM20-202ENST00000514384 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
SMIM20-202ENST00000514384 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
SMIM20-202ENST00000514384 TRAK1Q9UPV9 953 aa9.57□□□□□ -0.88
SMIM20-202ENST00000514384 USP47Q96K76 1375 aa9.57□□□□□ -0.88
SMIM20-202ENST00000514384 COL18A1P39060 1754 aa9.57□□□□□ -0.88
SMIM20-202ENST00000514384 GLTPD2A6NH11 291 aa9.56□□□□□ -0.88
SMIM20-202ENST00000514384 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
SMIM20-202ENST00000514384 RASSF7Q02833 373 aa9.56□□□□□ -0.88
SMIM20-202ENST00000514384 DGKZQ13574 1117 aa9.56□□□□□ -0.88
SMIM20-202ENST00000514384 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa9.56□□□□□ -0.88
SMIM20-202ENST00000514384 NSD2O96028 1365 aa9.55□□□□□ -0.88
SMIM20-202ENST00000514384 MMP10P09238 476 aa9.55□□□□□ -0.88
SMIM20-202ENST00000514384 TGFB2P61812 414 aa9.55□□□□□ -0.88
SMIM20-202ENST00000514384 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
SMIM20-202ENST00000514384 FAM9BQ8IZU0 186 aa9.55□□□□□ -0.88
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SMIM20-202ENST00000514384 TMC2Q8TDI7 906 aa9.55□□□□□ -0.88
SMIM20-202ENST00000514384 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
SMIM20-202ENST00000514384 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
SMIM20-202ENST00000514384 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
SMIM20-202ENST00000514384 IL2RBP14784 551 aa9.54□□□□□ -0.88
SMIM20-202ENST00000514384 RALBP1Q15311 655 aa9.54□□□□□ -0.88
SMIM20-202ENST00000514384 DCAF5Q96JK2 942 aa9.54□□□□□ -0.88
SMIM20-202ENST00000514384 QRICH2Q9H0J4 1663 aa9.54□□□□□ -0.88
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SMIM20-202ENST00000514384 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
SMIM20-202ENST00000514384 USP54Q70EL1 1684 aa9.53□□□□□ -0.88
SMIM20-202ENST00000514384 TMEM88BA6NKF7 163 aa9.53□□□□□ -0.88
SMIM20-202ENST00000514384 KCNA3P22001 575 aa9.53□□□□□ -0.88
SMIM20-202ENST00000514384 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP9.53□□□□□ -0.88
SMIM20-202ENST00000514384 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
SMIM20-202ENST00000514384 GRM1Q13255 1194 aa9.53□□□□□ -0.88
SMIM20-202ENST00000514384 FBXO22Q8NEZ5 403 aa9.53□□□□□ -0.88
SMIM20-202ENST00000514384 NLRP2Q9NX02 1062 aa9.53□□□□□ -0.88
SMIM20-202ENST00000514384 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
SMIM20-202ENST00000514384 LY75O60449 1722 aa9.53□□□□□ -0.88
SMIM20-202ENST00000514384 PASKQ96RG2 1323 aa9.53□□□□□ -0.88
SMIM20-202ENST00000514384 RGL2O15211 777 aa9.52□□□□□ -0.89
SMIM20-202ENST00000514384 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
SMIM20-202ENST00000514384 DEFB115Q30KQ5 88 aa9.52□□□□□ -0.89
SMIM20-202ENST00000514384 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa9.52□□□□□ -0.89
SMIM20-202ENST00000514384 SLC17A8Q8NDX2 589 aa9.52□□□□□ -0.89
SMIM20-202ENST00000514384 GCC1Q96CN9 775 aa9.52□□□□□ -0.89
SMIM20-202ENST00000514384 AK7Q96M32 723 aa9.52□□□□□ -0.89
SMIM20-202ENST00000514384 MFRPQ9BY79 579 aa9.52□□□□□ -0.89
SMIM20-202ENST00000514384 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
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SMIM20-202ENST00000514384 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
SMIM20-202ENST00000514384 ITSN1Q15811 1721 aa9.51□□□□□ -0.89
SMIM20-202ENST00000514384 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa9.5□□□□□ -0.89
SMIM20-202ENST00000514384 TMEM92Q6UXU6 159 aa9.5□□□□□ -0.89
SMIM20-202ENST00000514384 CDK19Q9BWU1 502 aa9.5□□□□□ -0.89
SMIM20-202ENST00000514384 PIM2Q9P1W9 311 aa9.5□□□□□ -0.89
SMIM20-202ENST00000514384 SLIT3O75094 1523 aa9.5□□□□□ -0.89
SMIM20-202ENST00000514384 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa9.49□□□□□ -0.89
SMIM20-202ENST00000514384 RASSF10A6NK89 507 aa9.49□□□□□ -0.89
SMIM20-202ENST00000514384 MS4A1P11836 297 aa9.49□□□□□ -0.89
SMIM20-202ENST00000514384 ARSIQ5FYB1 569 aa9.49□□□□□ -0.89
SMIM20-202ENST00000514384 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
SMIM20-202ENST00000514384 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
SMIM20-202ENST00000514384 POTEB3A0JP26 581 aa9.48□□□□□ -0.89
SMIM20-202ENST00000514384 PLEKHG3A1L390 1219 aa9.48□□□□□ -0.89
SMIM20-202ENST00000514384 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
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