RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493436.5

SH3BP4-211, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP4, Length 481 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-211ENST00000493436 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
SH3BP4-211ENST00000493436 KCNQ3O43525 872 aa22.2■■□□□ 1.14
SH3BP4-211ENST00000493436 ZPR1O75312 459 aa22.2■■□□□ 1.14
SH3BP4-211ENST00000493436 FKBP8Q14318 412 aa22.2■■□□□ 1.14
SH3BP4-211ENST00000493436 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
SH3BP4-211ENST00000493436 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
SH3BP4-211ENST00000493436 PARP3Q9Y6F1 533 aa22.2■■□□□ 1.14
SH3BP4-211ENST00000493436 COL15A1P39059 1388 aa22.2■■□□□ 1.14
SH3BP4-211ENST00000493436 CANXP27824 592 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
SH3BP4-211ENST00000493436 GRIN3BO60391 1043 aa22.18■■□□□ 1.14
SH3BP4-211ENST00000493436 USPL1Q5W0Q7 1092 aa22.18■■□□□ 1.14
SH3BP4-211ENST00000493436 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa22.17■■□□□ 1.14
SH3BP4-211ENST00000493436 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
SH3BP4-211ENST00000493436 NFE2L2Q16236 605 aa22.16■■□□□ 1.14
SH3BP4-211ENST00000493436 NARFQ9UHQ1 456 aa22.16■■□□□ 1.14
SH3BP4-211ENST00000493436 WWC3Q9ULE0 1092 aa22.16■■□□□ 1.14
SH3BP4-211ENST00000493436 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
SH3BP4-211ENST00000493436 C10orf71Q711Q0 1435 aa22.14■■□□□ 1.14
SH3BP4-211ENST00000493436 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.14
SH3BP4-211ENST00000493436 EIF5P55010 431 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
SH3BP4-211ENST00000493436 DDR1Q08345 913 aa22.14■■□□□ 1.13
SH3BP4-211ENST00000493436 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa22.14■■□□□ 1.13
SH3BP4-211ENST00000493436 A1BGP04217 495 aa22.13■■□□□ 1.13
SH3BP4-211ENST00000493436 TM4SF1P30408 202 aa22.13■■□□□ 1.13
SH3BP4-211ENST00000493436 TGFB2P61812 414 aa22.13■■□□□ 1.13
SH3BP4-211ENST00000493436 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
SH3BP4-211ENST00000493436 PXDNLA1KZ92 1463 aa22.13■■□□□ 1.13
SH3BP4-211ENST00000493436 A0A087WZG4 1122 aa22.12■■□□□ 1.13
SH3BP4-211ENST00000493436 USP16Q9Y5T5 823 aa22.12■■□□□ 1.13
SH3BP4-211ENST00000493436 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
SH3BP4-211ENST00000493436 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
SH3BP4-211ENST00000493436 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
SH3BP4-211ENST00000493436 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
SH3BP4-211ENST00000493436 BCL2L12Q9HB09 334 aa22.11■■□□□ 1.13
SH3BP4-211ENST00000493436 MIS18AQ9NYP9 233 aa22.11■■□□□ 1.13
SH3BP4-211ENST00000493436 A0A0G2JLW4 131 aa22.1■■□□□ 1.13
SH3BP4-211ENST00000493436 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa22.1■■□□□ 1.13
SH3BP4-211ENST00000493436 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
SH3BP4-211ENST00000493436 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
SH3BP4-211ENST00000493436 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
SH3BP4-211ENST00000493436 KDM3BQ7LBC6 1761 aa22.1■■□□□ 1.13
SH3BP4-211ENST00000493436 NFIXQ14938 502 aa22.09■■□□□ 1.13
SH3BP4-211ENST00000493436 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
SH3BP4-211ENST00000493436 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
SH3BP4-211ENST00000493436 DPEP1P16444 411 aa22.08■■□□□ 1.13
SH3BP4-211ENST00000493436 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP22.08■■□□□ 1.13
SH3BP4-211ENST00000493436 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa22.08■■□□□ 1.13
SH3BP4-211ENST00000493436 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
SH3BP4-211ENST00000493436 RIPK4P57078 832 aa22.07■■□□□ 1.12
SH3BP4-211ENST00000493436 SCN7AQ01118 1682 aa22.07■■□□□ 1.12
SH3BP4-211ENST00000493436 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
SH3BP4-211ENST00000493436 TMPOP42166 694 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
SH3BP4-211ENST00000493436 BICDL1Q6ZP65 573 aa22.05■■□□□ 1.12
SH3BP4-211ENST00000493436 CCDC146Q8IYE0 955 aa22.05■■□□□ 1.12
SH3BP4-211ENST00000493436 NRXN2Q9P2S2 1712 aa22.05■■□□□ 1.12
SH3BP4-211ENST00000493436 LAMB4A4D0S4 1761 aa22.04■■□□□ 1.12
SH3BP4-211ENST00000493436 SERPINB2P05120 415 aa22.04■■□□□ 1.12
SH3BP4-211ENST00000493436 BCS1LQ9Y276 419 aa22.04■■□□□ 1.12
SH3BP4-211ENST00000493436 TBC1D9BQ66K14 1250 aa22.03■■□□□ 1.12
SH3BP4-211ENST00000493436 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
SH3BP4-211ENST00000493436 BCORQ6W2J9 1755 aa22.02■■□□□ 1.12
SH3BP4-211ENST00000493436 KCNA3P22001 575 aa22.02■■□□□ 1.12
SH3BP4-211ENST00000493436 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
SH3BP4-211ENST00000493436 LMOD3Q0VAK6 560 aa22.02■■□□□ 1.12
SH3BP4-211ENST00000493436 RUNDC1Q96C34 613 aa22.02■■□□□ 1.12
SH3BP4-211ENST00000493436 ADAMTS8Q9UP79 889 aa22.02■■□□□ 1.12
SH3BP4-211ENST00000493436 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
SH3BP4-211ENST00000493436 CAMTA2O94983 1202 aa22.01■■□□□ 1.11
SH3BP4-211ENST00000493436 NEUROD2Q15784 382 aa22.01■■□□□ 1.11
SH3BP4-211ENST00000493436 PIM2Q9P1W9 311 aa22.01■■□□□ 1.11
SH3BP4-211ENST00000493436 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa22.01■■□□□ 1.11
SH3BP4-211ENST00000493436 NBPF26B4DH59 902 aa22■■□□□ 1.11
SH3BP4-211ENST00000493436 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
SH3BP4-211ENST00000493436 CHRNA5P30532 468 aa22■■□□□ 1.11
SH3BP4-211ENST00000493436 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
SH3BP4-211ENST00000493436 NBPF15Q8N660 670 aa22■■□□□ 1.11
SH3BP4-211ENST00000493436 TSPYL4Q9UJ04 414 aa21.99■■□□□ 1.11
SH3BP4-211ENST00000493436 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
SH3BP4-211ENST00000493436 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
SH3BP4-211ENST00000493436 SETDB2Q96T68 719 aa21.97■■□□□ 1.11
SH3BP4-211ENST00000493436 CARMIL3Q8ND23 1372 aa21.97■■□□□ 1.11
SH3BP4-211ENST00000493436 DLEC1Q9Y238 1755 aa21.95■■□□□ 1.1
SH3BP4-211ENST00000493436 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa21.95■■□□□ 1.1
SH3BP4-211ENST00000493436 CLEC4GQ6UXB4 293 aa21.95■■□□□ 1.1
SH3BP4-211ENST00000493436 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa21.95■■□□□ 1.1
SH3BP4-211ENST00000493436 BABAM1Q9NWV8 329 aa21.95■■□□□ 1.1
SH3BP4-211ENST00000493436 ZNF652Q9Y2D9 606 aa21.95■■□□□ 1.1
SH3BP4-211ENST00000493436 TRIM35Q9UPQ4 493 aa21.94■■□□□ 1.1
SH3BP4-211ENST00000493436 PRR5LQ6MZQ0 368 aa21.93■■□□□ 1.1
SH3BP4-211ENST00000493436 C2CD5Q86YS7 1000 aa21.93■■□□□ 1.1
SH3BP4-211ENST00000493436 NGEFQ8N5V2 710 aa21.93■■□□□ 1.1
SH3BP4-211ENST00000493436 ATP10DQ9P241 1426 aa21.93■■□□□ 1.1
SH3BP4-211ENST00000493436 ADCY9O60503 1353 aa21.92■■□□□ 1.1
SH3BP4-211ENST00000493436 NPHP1O15259 732 aa21.92■■□□□ 1.1
SH3BP4-211ENST00000493436 CCDC24Q8N4L8 307 aa21.92■■□□□ 1.1
SH3BP4-211ENST00000493436 H0YIN7 160 aa21.91■■□□□ 1.1
SH3BP4-211ENST00000493436 RGL2O15211 777 aa21.91■■□□□ 1.1
SH3BP4-211ENST00000493436 CNBD1Q8NA66 436 aa21.91■■□□□ 1.1
SH3BP4-211ENST00000493436 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
SH3BP4-211ENST00000493436 NUP98P52948 1817 aa21.91■■□□□ 1.1
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