RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493436.5

SH3BP4-211, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP4, Length 481 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-211ENST00000493436 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
SH3BP4-211ENST00000493436 KCNQ3O43525 872 aa22.2■■□□□ 1.14
SH3BP4-211ENST00000493436 ZPR1O75312 459 aa22.2■■□□□ 1.14
SH3BP4-211ENST00000493436 FKBP8Q14318 412 aa22.2■■□□□ 1.14
SH3BP4-211ENST00000493436 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
SH3BP4-211ENST00000493436 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
SH3BP4-211ENST00000493436 PARP3Q9Y6F1 533 aa22.2■■□□□ 1.14
SH3BP4-211ENST00000493436 COL15A1P39059 1388 aa22.2■■□□□ 1.14
SH3BP4-211ENST00000493436 CANXP27824 592 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
SH3BP4-211ENST00000493436 GRIN3BO60391 1043 aa22.18■■□□□ 1.14
SH3BP4-211ENST00000493436 USPL1Q5W0Q7 1092 aa22.18■■□□□ 1.14
SH3BP4-211ENST00000493436 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa22.17■■□□□ 1.14
SH3BP4-211ENST00000493436 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
SH3BP4-211ENST00000493436 NFE2L2Q16236 605 aa22.16■■□□□ 1.14
SH3BP4-211ENST00000493436 NARFQ9UHQ1 456 aa22.16■■□□□ 1.14
SH3BP4-211ENST00000493436 WWC3Q9ULE0 1092 aa22.16■■□□□ 1.14
SH3BP4-211ENST00000493436 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
SH3BP4-211ENST00000493436 C10orf71Q711Q0 1435 aa22.14■■□□□ 1.14
SH3BP4-211ENST00000493436 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.14
SH3BP4-211ENST00000493436 EIF5P55010 431 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
SH3BP4-211ENST00000493436 DDR1Q08345 913 aa22.14■■□□□ 1.13
SH3BP4-211ENST00000493436 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa22.14■■□□□ 1.13
SH3BP4-211ENST00000493436 A1BGP04217 495 aa22.13■■□□□ 1.13
SH3BP4-211ENST00000493436 TM4SF1P30408 202 aa22.13■■□□□ 1.13
SH3BP4-211ENST00000493436 TGFB2P61812 414 aa22.13■■□□□ 1.13
SH3BP4-211ENST00000493436 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
SH3BP4-211ENST00000493436 PXDNLA1KZ92 1463 aa22.13■■□□□ 1.13
SH3BP4-211ENST00000493436 A0A087WZG4 1122 aa22.12■■□□□ 1.13
SH3BP4-211ENST00000493436 USP16Q9Y5T5 823 aa22.12■■□□□ 1.13
SH3BP4-211ENST00000493436 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
SH3BP4-211ENST00000493436 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
SH3BP4-211ENST00000493436 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
SH3BP4-211ENST00000493436 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
SH3BP4-211ENST00000493436 BCL2L12Q9HB09 334 aa22.11■■□□□ 1.13
SH3BP4-211ENST00000493436 MIS18AQ9NYP9 233 aa22.11■■□□□ 1.13
SH3BP4-211ENST00000493436 A0A0G2JLW4 131 aa22.1■■□□□ 1.13
SH3BP4-211ENST00000493436 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa22.1■■□□□ 1.13
SH3BP4-211ENST00000493436 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
SH3BP4-211ENST00000493436 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
SH3BP4-211ENST00000493436 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
SH3BP4-211ENST00000493436 KDM3BQ7LBC6 1761 aa22.1■■□□□ 1.13
SH3BP4-211ENST00000493436 NFIXQ14938 502 aa22.09■■□□□ 1.13
SH3BP4-211ENST00000493436 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
SH3BP4-211ENST00000493436 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
SH3BP4-211ENST00000493436 DPEP1P16444 411 aa22.08■■□□□ 1.13
SH3BP4-211ENST00000493436 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP22.08■■□□□ 1.13
SH3BP4-211ENST00000493436 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa22.08■■□□□ 1.13
SH3BP4-211ENST00000493436 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
SH3BP4-211ENST00000493436 RIPK4P57078 832 aa22.07■■□□□ 1.12
SH3BP4-211ENST00000493436 SCN7AQ01118 1682 aa22.07■■□□□ 1.12
SH3BP4-211ENST00000493436 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
SH3BP4-211ENST00000493436 TMPOP42166 694 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
SH3BP4-211ENST00000493436 BICDL1Q6ZP65 573 aa22.05■■□□□ 1.12
SH3BP4-211ENST00000493436 CCDC146Q8IYE0 955 aa22.05■■□□□ 1.12
SH3BP4-211ENST00000493436 NRXN2Q9P2S2 1712 aa22.05■■□□□ 1.12
SH3BP4-211ENST00000493436 LAMB4A4D0S4 1761 aa22.04■■□□□ 1.12
SH3BP4-211ENST00000493436 SERPINB2P05120 415 aa22.04■■□□□ 1.12
SH3BP4-211ENST00000493436 BCS1LQ9Y276 419 aa22.04■■□□□ 1.12
SH3BP4-211ENST00000493436 TBC1D9BQ66K14 1250 aa22.03■■□□□ 1.12
SH3BP4-211ENST00000493436 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
SH3BP4-211ENST00000493436 BCORQ6W2J9 1755 aa22.02■■□□□ 1.12
SH3BP4-211ENST00000493436 KCNA3P22001 575 aa22.02■■□□□ 1.12
SH3BP4-211ENST00000493436 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
SH3BP4-211ENST00000493436 LMOD3Q0VAK6 560 aa22.02■■□□□ 1.12
SH3BP4-211ENST00000493436 RUNDC1Q96C34 613 aa22.02■■□□□ 1.12
SH3BP4-211ENST00000493436 ADAMTS8Q9UP79 889 aa22.02■■□□□ 1.12
SH3BP4-211ENST00000493436 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
SH3BP4-211ENST00000493436 CAMTA2O94983 1202 aa22.01■■□□□ 1.11
SH3BP4-211ENST00000493436 NEUROD2Q15784 382 aa22.01■■□□□ 1.11
SH3BP4-211ENST00000493436 PIM2Q9P1W9 311 aa22.01■■□□□ 1.11
SH3BP4-211ENST00000493436 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa22.01■■□□□ 1.11
SH3BP4-211ENST00000493436 NBPF26B4DH59 902 aa22■■□□□ 1.11
SH3BP4-211ENST00000493436 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
SH3BP4-211ENST00000493436 CHRNA5P30532 468 aa22■■□□□ 1.11
SH3BP4-211ENST00000493436 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
SH3BP4-211ENST00000493436 NBPF15Q8N660 670 aa22■■□□□ 1.11
SH3BP4-211ENST00000493436 TSPYL4Q9UJ04 414 aa21.99■■□□□ 1.11
SH3BP4-211ENST00000493436 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
SH3BP4-211ENST00000493436 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
SH3BP4-211ENST00000493436 SETDB2Q96T68 719 aa21.97■■□□□ 1.11
SH3BP4-211ENST00000493436 CARMIL3Q8ND23 1372 aa21.97■■□□□ 1.11
SH3BP4-211ENST00000493436 DLEC1Q9Y238 1755 aa21.95■■□□□ 1.1
SH3BP4-211ENST00000493436 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa21.95■■□□□ 1.1
SH3BP4-211ENST00000493436 CLEC4GQ6UXB4 293 aa21.95■■□□□ 1.1
SH3BP4-211ENST00000493436 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa21.95■■□□□ 1.1
SH3BP4-211ENST00000493436 BABAM1Q9NWV8 329 aa21.95■■□□□ 1.1
SH3BP4-211ENST00000493436 ZNF652Q9Y2D9 606 aa21.95■■□□□ 1.1
SH3BP4-211ENST00000493436 TRIM35Q9UPQ4 493 aa21.94■■□□□ 1.1
SH3BP4-211ENST00000493436 PRR5LQ6MZQ0 368 aa21.93■■□□□ 1.1
SH3BP4-211ENST00000493436 C2CD5Q86YS7 1000 aa21.93■■□□□ 1.1
SH3BP4-211ENST00000493436 NGEFQ8N5V2 710 aa21.93■■□□□ 1.1
SH3BP4-211ENST00000493436 ATP10DQ9P241 1426 aa21.93■■□□□ 1.1
SH3BP4-211ENST00000493436 ADCY9O60503 1353 aa21.92■■□□□ 1.1
SH3BP4-211ENST00000493436 NPHP1O15259 732 aa21.92■■□□□ 1.1
SH3BP4-211ENST00000493436 CCDC24Q8N4L8 307 aa21.92■■□□□ 1.1
SH3BP4-211ENST00000493436 H0YIN7 160 aa21.91■■□□□ 1.1
SH3BP4-211ENST00000493436 RGL2O15211 777 aa21.91■■□□□ 1.1
SH3BP4-211ENST00000493436 CNBD1Q8NA66 436 aa21.91■■□□□ 1.1
SH3BP4-211ENST00000493436 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
SH3BP4-211ENST00000493436 NUP98P52948 1817 aa21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.2 ms