RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492730.1

C4BPB-208, Transcript of complement component 4 binding protein beta, human

TSL 4

Gene C4BPB, Length 564 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
C4BPB-208	ENST00000492730	ARHGEF25	Q86VW2	580 aa		7.52	□□□□□ -1.21
C4BPB-208	ENST00000492730	UNC5CL	Q8IV45	518 aa		7.52	□□□□□ -1.21
C4BPB-208	ENST00000492730	PHACTR3	Q96KR7	559 aa		7.52	□□□□□ -1.21
C4BPB-208	ENST00000492730	BCL2L13	Q9BXK5	485 aa		7.52	□□□□□ -1.21
C4BPB-208	ENST00000492730	USP35	Q9P2H5	1018 aa		7.52	□□□□□ -1.21
C4BPB-208	ENST00000492730	MARF1	Q9Y4F3	1742 aa	Known RBP	7.52	□□□□□ -1.21
C4BPB-208	ENST00000492730	USP19	O94966	1318 aa		7.52	□□□□□ -1.21
C4BPB-208	ENST00000492730	USP31	Q70CQ4	1352 aa		7.51	□□□□□ -1.21
C4BPB-208	ENST00000492730	CSB-PGBD3	P0DP91	1061 aa		7.51	□□□□□ -1.21
C4BPB-208	ENST00000492730	EXOSC9	Q06265	439 aa	Known RBP	7.51	□□□□□ -1.21
C4BPB-208	ENST00000492730	LTV1	Q96GA3	475 aa	Predicted RBP	7.51	□□□□□ -1.21
C4BPB-208	ENST00000492730	BACH2	Q9BYV9	841 aa		7.51	□□□□□ -1.21
C4BPB-208	ENST00000492730	TRPC5	Q9UL62	973 aa	Predicted RBP	7.51	□□□□□ -1.21
C4BPB-208	ENST00000492730	PDZRN3	Q9UPQ7	1066 aa		7.51	□□□□□ -1.21
C4BPB-208	ENST00000492730	COG6	Q9Y2V7	657 aa		7.51	□□□□□ -1.21
C4BPB-208	ENST00000492730	CDK12	Q9NYV4	1490 aa	Predicted RBP	7.5	□□□□□ -1.21
C4BPB-208	ENST00000492730	AATK	Q6ZMQ8	1374 aa		7.5	□□□□□ -1.21
C4BPB-208	ENST00000492730	POTEC	B2RU33	542 aa		7.5	□□□□□ -1.21
C4BPB-208	ENST00000492730	STK25	O00506	426 aa		7.5	□□□□□ -1.21
C4BPB-208	ENST00000492730	PDE3A	Q14432	1141 aa		7.5	□□□□□ -1.21
C4BPB-208	ENST00000492730	LARP1	Q6PKG0	1096 aa	Known RBP	7.5	□□□□□ -1.21
C4BPB-208	ENST00000492730	ILDR2	Q71H61	639 aa		7.5	□□□□□ -1.21
C4BPB-208	ENST00000492730	ANKK1	Q8NFD2	765 aa		7.5	□□□□□ -1.21
C4BPB-208	ENST00000492730	GJD4	Q96KN9	370 aa	Predicted RBP	7.5	□□□□□ -1.21
C4BPB-208	ENST00000492730	MED1	Q15648	1581 aa	Predicted RBP	7.5	□□□□□ -1.21
C4BPB-208	ENST00000492730	RGPD1	P0DJD0	1748 aa		7.49	□□□□□ -1.21
C4BPB-208	ENST00000492730	TRPM3	Q9HCF6	1732 aa	Predicted RBP	7.49	□□□□□ -1.21
C4BPB-208	ENST00000492730	HMOX1	P09601	288 aa		7.49	□□□□□ -1.21
C4BPB-208	ENST00000492730	MS4A1	P11836	297 aa		7.49	□□□□□ -1.21
C4BPB-208	ENST00000492730	PRKAR2B	P31323	418 aa		7.49	□□□□□ -1.21
C4BPB-208	ENST00000492730	RIPK4	P57078	832 aa		7.49	□□□□□ -1.21
C4BPB-208	ENST00000492730	RBM6	P78332	1123 aa	Known RBP	7.49	□□□□□ -1.21
C4BPB-208	ENST00000492730	TOM1L2	Q6ZVM7	507 aa		7.49	□□□□□ -1.21
C4BPB-208	ENST00000492730	CENPQ	Q7L2Z9	268 aa	Predicted RBP	7.49	□□□□□ -1.21
C4BPB-208	ENST00000492730	GOLGA6L2	Q8N9W4	650 aa	Predicted RBP	7.49	□□□□□ -1.21
C4BPB-208	ENST00000492730	IP6K1	Q92551	441 aa		7.49	□□□□□ -1.21
C4BPB-208	ENST00000492730	THUMPD2	Q9BTF0	503 aa	Known RBP	7.49	□□□□□ -1.21
C4BPB-208	ENST00000492730	PCDHB15	Q9Y5E8	787 aa		7.49	□□□□□ -1.21
C4BPB-208	ENST00000492730	OVOS2	A0A0J9YW53	1432 aa		7.49	□□□□□ -1.21
C4BPB-208	ENST00000492730	OVOS2	Q6IE36	1432 aa		7.49	□□□□□ -1.21
C4BPB-208	ENST00000492730	MAP3K19	Q56UN5	1328 aa		7.49	□□□□□ -1.21
C4BPB-208	ENST00000492730	BCL9L	Q86UU0	1499 aa		7.49	□□□□□ -1.21
C4BPB-208	ENST00000492730	FCHSD2	O94868	740 aa		7.48	□□□□□ -1.21
C4BPB-208	ENST00000492730	MYT1	Q01538	1121 aa		7.48	□□□□□ -1.21
C4BPB-208	ENST00000492730	VPS72	Q15906	364 aa		7.48	□□□□□ -1.21
C4BPB-208	ENST00000492730	HSP90AB2P	Q58FF8	381 aa		7.48	□□□□□ -1.21
C4BPB-208	ENST00000492730	SSH1	Q8WYL5	1049 aa		7.48	□□□□□ -1.21
C4BPB-208	ENST00000492730	FRAT1	Q92837	279 aa	Predicted RBP	7.48	□□□□□ -1.21
C4BPB-208	ENST00000492730	BCL11B	Q9C0K0	894 aa	Predicted RBP	7.48	□□□□□ -1.21
C4BPB-208	ENST00000492730	NLRP2	Q9NX02	1062 aa		7.48	□□□□□ -1.21
C4BPB-208	ENST00000492730	STK24	Q9Y6E0	443 aa		7.48	□□□□□ -1.21
C4BPB-208	ENST00000492730	IL16	Q14005	1332 aa		7.48	□□□□□ -1.21
C4BPB-208	ENST00000492730	ALS2	Q96Q42	1657 aa		7.47	□□□□□ -1.21
C4BPB-208	ENST00000492730	CPD	O75976	1380 aa		7.47	□□□□□ -1.21
C4BPB-208	ENST00000492730	SOWAHB	A6NEL2	793 aa		7.47	□□□□□ -1.21
C4BPB-208	ENST00000492730	HOXC9	P31274	260 aa		7.47	□□□□□ -1.21
C4BPB-208	ENST00000492730	NFE2L2	Q16236	605 aa		7.47	□□□□□ -1.21
C4BPB-208	ENST00000492730	FAM98C	Q17RN3	349 aa	Known RBP	7.47	□□□□□ -1.21
C4BPB-208	ENST00000492730	C8orf34	Q49A92	452 aa		7.47	□□□□□ -1.21
C4BPB-208	ENST00000492730	AEBP1	Q8IUX7	1158 aa		7.47	□□□□□ -1.21
C4BPB-208	ENST00000492730	ANKRD24	Q8TF21	1146 aa		7.47	□□□□□ -1.21
C4BPB-208	ENST00000492730	MYH16	Q9H6N6	1097 aa		7.47	□□□□□ -1.21
C4BPB-208	ENST00000492730	COL22A1	Q8NFW1	1626 aa	Predicted RBP	7.47	□□□□□ -1.21
C4BPB-208	ENST00000492730	VIRMA	Q69YN4	1812 aa	Known RBP	7.47	□□□□□ -1.21
C4BPB-208	ENST00000492730	PIK3C2A	O00443	1686 aa		7.47	□□□□□ -1.21
C4BPB-208	ENST00000492730	TBC1D12	O60347	775 aa		7.46	□□□□□ -1.22
C4BPB-208	ENST00000492730	ZNF853	P0CG23	659 aa		7.46	□□□□□ -1.22
C4BPB-208	ENST00000492730	PTPRE	P23469	700 aa		7.46	□□□□□ -1.22
C4BPB-208	ENST00000492730	BCAM	P50895	628 aa		7.46	□□□□□ -1.22
C4BPB-208	ENST00000492730	EIF4A2	Q14240	407 aa	Known RBP	7.46	□□□□□ -1.22
C4BPB-208	ENST00000492730	SEPT12	Q8IYM1	358 aa		7.46	□□□□□ -1.22
C4BPB-208	ENST00000492730	HS6ST3	Q8IZP7	471 aa		7.46	□□□□□ -1.22
C4BPB-208	ENST00000492730	TSPYL6	Q8N831	410 aa		7.46	□□□□□ -1.22
C4BPB-208	ENST00000492730	CLUAP1	Q96AJ1	413 aa		7.46	□□□□□ -1.22
C4BPB-208	ENST00000492730	SLIT2	O94813	1529 aa		7.46	□□□□□ -1.22
C4BPB-208	ENST00000492730	SPATA31A5	Q5VU36	1347 aa		7.46	□□□□□ -1.22
C4BPB-208	ENST00000492730	SPATA31A7	Q8IWB4	1347 aa		7.46	□□□□□ -1.22
C4BPB-208	ENST00000492730	MAPK8IP3	Q9UPT6	1336 aa		7.46	□□□□□ -1.22
C4BPB-208	ENST00000492730	CAMTA1	Q9Y6Y1	1673 aa		7.45	□□□□□ -1.22
C4BPB-208	ENST00000492730	ONECUT3	O60422	494 aa	Predicted RBP	7.45	□□□□□ -1.22
C4BPB-208	ENST00000492730	NBPF6	Q5VWK0	638 aa		7.45	□□□□□ -1.22
C4BPB-208	ENST00000492730	NBPF4	Q96M43	638 aa		7.45	□□□□□ -1.22
C4BPB-208	ENST00000492730	IPO9	Q96P70	1041 aa	Known RBP	7.45	□□□□□ -1.22
C4BPB-208	ENST00000492730	WBP1L	Q9NX94	342 aa		7.45	□□□□□ -1.22
C4BPB-208	ENST00000492730	SPATA31A1	Q5TZJ5	1347 aa		7.45	□□□□□ -1.22
C4BPB-208	ENST00000492730	USP54	Q70EL1	1684 aa		7.44	□□□□□ -1.22
C4BPB-208	ENST00000492730	VAMP4	O75379	141 aa		7.44	□□□□□ -1.22
C4BPB-208	ENST00000492730	TRIM27	P14373	513 aa		7.44	□□□□□ -1.22
C4BPB-208	ENST00000492730	RGS3	P49796	1198 aa		7.44	□□□□□ -1.22
C4BPB-208	ENST00000492730	DCTN1	Q14203	1278 aa		7.44	□□□□□ -1.22
C4BPB-208	ENST00000492730	SUZ12	Q15022	739 aa	Known RBP	7.44	□□□□□ -1.22
C4BPB-208	ENST00000492730	NPM2	Q86SE8	214 aa	Known RBP	7.44	□□□□□ -1.22
C4BPB-208	ENST00000492730	CARD10	Q9BWT7	1032 aa		7.44	□□□□□ -1.22
C4BPB-208	ENST00000492730	NOB1	Q9ULX3	412 aa	Known RBP	7.44	□□□□□ -1.22
C4BPB-208	ENST00000492730	WDR17	Q8IZU2	1322 aa		7.44	□□□□□ -1.22
C4BPB-208	ENST00000492730	ATRN	O75882	1429 aa		7.44	□□□□□ -1.22
C4BPB-208	ENST00000492730	SLIT3	O75094	1523 aa		7.43	□□□□□ -1.22
C4BPB-208	ENST00000492730	EXOC5	O00471	708 aa		7.43	□□□□□ -1.22
C4BPB-208	ENST00000492730	WIPF1	O43516	503 aa		7.43	□□□□□ -1.22
C4BPB-208	ENST00000492730	MVP	Q14764	893 aa	Known RBP	7.43	□□□□□ -1.22

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