RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489424.5

HDAC10-216, Transcript of histone deacetylase 10, human

TSL 5

Gene HDAC10, Length 759 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDAC10-216	ENST00000489424	BTBD11	A6QL63	1104 aa		22.93	■■□□□ 1.26
HDAC10-216	ENST00000489424	EIF5	P55010	431 aa	Known RBP	22.93	■■□□□ 1.26
HDAC10-216	ENST00000489424	C10orf71	Q711Q0	1435 aa		22.92	■■□□□ 1.26
HDAC10-216	ENST00000489424	UBR2	Q8IWV8	1755 aa		22.92	■■□□□ 1.26
HDAC10-216	ENST00000489424	IL6ST	P40189	918 aa	Predicted RBP	22.91	■■□□□ 1.26
HDAC10-216	ENST00000489424	PLEKHF1	Q96S99	279 aa		22.91	■■□□□ 1.26
HDAC10-216	ENST00000489424	ZBTB1	Q9Y2K1	713 aa		22.91	■■□□□ 1.26
HDAC10-216	ENST00000489424	C4A	P0C0L4	1744 aa		22.91	■■□□□ 1.26
HDAC10-216	ENST00000489424	COL15A1	P39059	1388 aa		22.9	■■□□□ 1.26
HDAC10-216	ENST00000489424	GOLGB1	Q14789	3259 aa	Known RBP	22.9	■■□□□ 1.26
HDAC10-216	ENST00000489424	FKBP8	Q14318	412 aa		22.9	■■□□□ 1.26
HDAC10-216	ENST00000489424	TAF7	Q15545	349 aa	Predicted RBP	22.89	■■□□□ 1.25
HDAC10-216	ENST00000489424	PNISR	Q8TF01	805 aa	Known RBP	22.89	■■□□□ 1.25
HDAC10-216	ENST00000489424	SRP68	Q9UHB9	627 aa	Known RBP	22.89	■■□□□ 1.25
HDAC10-216	ENST00000489424	WWC3	Q9ULE0	1092 aa		22.89	■■□□□ 1.25
HDAC10-216	ENST00000489424	RGL2	O15211	777 aa		22.88	■■□□□ 1.25
HDAC10-216	ENST00000489424	SIPA1L3	O60292	1781 aa	Predicted RBP	22.87	■■□□□ 1.25
HDAC10-216	ENST00000489424	N4BP2	Q86UW6	1770 aa	Predicted RBP	22.87	■■□□□ 1.25
HDAC10-216	ENST00000489424	POLRMT	O00411	1230 aa	Known RBP	22.87	■■□□□ 1.25
HDAC10-216	ENST00000489424	SNRPA1	P09661	255 aa	Known RBP	22.87	■■□□□ 1.25
HDAC10-216	ENST00000489424	USPL1	Q5W0Q7	1092 aa		22.87	■■□□□ 1.25
HDAC10-216	ENST00000489424	KIF13B	Q9NQT8	1826 aa		22.87	■■□□□ 1.25
HDAC10-216	ENST00000489424	PXDNL	A1KZ92	1463 aa		22.86	■■□□□ 1.25
HDAC10-216	ENST00000489424	NFE2L2	Q16236	605 aa		22.86	■■□□□ 1.25
HDAC10-216	ENST00000489424	MYBBP1A	Q9BQG0	1328 aa	Known RBP	22.85	■■□□□ 1.25
HDAC10-216	ENST00000489424	DDR1	Q08345	913 aa		22.85	■■□□□ 1.25
HDAC10-216	ENST00000489424	MCM10	Q7L590	875 aa		22.85	■■□□□ 1.25
HDAC10-216	ENST00000489424	NPM2	Q86SE8	214 aa	Known RBP	22.85	■■□□□ 1.25
HDAC10-216	ENST00000489424	CANX	P27824	592 aa	Known RBP	22.84	■■□□□ 1.25
HDAC10-216	ENST00000489424	BCL2L12	Q9HB09	334 aa		22.83	■■□□□ 1.25
HDAC10-216	ENST00000489424	MAPK8IP3	Q9UPT6	1336 aa		22.82	■■□□□ 1.24
HDAC10-216	ENST00000489424	KCNA3	P22001	575 aa		22.82	■■□□□ 1.24
HDAC10-216	ENST00000489424	NFIX	Q14938	502 aa		22.82	■■□□□ 1.24
HDAC10-216	ENST00000489424	BABAM1	Q9NWV8	329 aa		22.82	■■□□□ 1.24
HDAC10-216	ENST00000489424	PIM2	Q9P1W9	311 aa		22.82	■■□□□ 1.24
HDAC10-216	ENST00000489424	PDZRN3	Q9UPQ7	1066 aa		22.82	■■□□□ 1.24
HDAC10-216	ENST00000489424	KIAA1551	Q9HCM1	1747 aa		22.82	■■□□□ 1.24
HDAC10-216	ENST00000489424		A0A0G2JLW4	131 aa		22.81	■■□□□ 1.24
HDAC10-216	ENST00000489424	KCNQ3	O43525	872 aa		22.81	■■□□□ 1.24
HDAC10-216	ENST00000489424	DPEP1	P16444	411 aa		22.81	■■□□□ 1.24
HDAC10-216	ENST00000489424	CLEC4G	Q6UXB4	293 aa		22.81	■■□□□ 1.24
HDAC10-216	ENST00000489424	SERPINB2	P05120	415 aa		22.79	■■□□□ 1.24
HDAC10-216	ENST00000489424	DCTN1	Q14203	1278 aa		22.79	■■□□□ 1.24
HDAC10-216	ENST00000489424	USP16	Q9Y5T5	823 aa		22.79	■■□□□ 1.24
HDAC10-216	ENST00000489424	A1BG	P04217	495 aa		22.78	■■□□□ 1.24
HDAC10-216	ENST00000489424	LMOD3	Q0VAK6	560 aa		22.78	■■□□□ 1.24
HDAC10-216	ENST00000489424	BCS1L	Q9Y276	419 aa		22.77	■■□□□ 1.24
HDAC10-216	ENST00000489424	ADCY9	O60503	1353 aa		22.76	■■□□□ 1.23
HDAC10-216	ENST00000489424	ANP32C	O43423	234 aa		22.76	■■□□□ 1.23
HDAC10-216	ENST00000489424	DALRD3	Q5D0E6	543 aa	Known RBP	22.76	■■□□□ 1.23
HDAC10-216	ENST00000489424	BRCA1	P38398	1863 aa	Known RBP	22.75	■■□□□ 1.23
HDAC10-216	ENST00000489424	CAMTA2	O94983	1202 aa		22.75	■■□□□ 1.23
HDAC10-216	ENST00000489424	PRKRIP1	Q9H875	184 aa	Predicted RBP	22.75	■■□□□ 1.23
HDAC10-216	ENST00000489424	TBC1D2B	Q9UPU7	963 aa		22.74	■■□□□ 1.23
HDAC10-216	ENST00000489424	CARMIL3	Q8ND23	1372 aa		22.74	■■□□□ 1.23
HDAC10-216	ENST00000489424	GIGYF1	O75420	1035 aa	Predicted RBP	22.73	■■□□□ 1.23
HDAC10-216	ENST00000489424	EIF4A1	P60842	406 aa	Known RBP	22.73	■■□□□ 1.23
HDAC10-216	ENST00000489424	DZIP3	Q86Y13	1208 aa	Known RBP	22.73	■■□□□ 1.23
HDAC10-216	ENST00000489424	BRIP1	Q9BX63	1249 aa		22.73	■■□□□ 1.23
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF652	Q9Y2D9	606 aa		22.73	■■□□□ 1.23
HDAC10-216	ENST00000489424	NRXN2	Q9P2S2	1712 aa		22.73	■■□□□ 1.23
HDAC10-216	ENST00000489424	RIPK4	P57078	832 aa		22.72	■■□□□ 1.23
HDAC10-216	ENST00000489424	C1QTNF8	P60827	252 aa		22.72	■■□□□ 1.23
HDAC10-216	ENST00000489424	SETDB2	Q96T68	719 aa		22.72	■■□□□ 1.23
HDAC10-216	ENST00000489424	AFDN	P55196	1824 aa	Known RBP	22.71	■■□□□ 1.23
HDAC10-216	ENST00000489424	TMPO	P42166	694 aa	Known RBP	22.71	■■□□□ 1.23
HDAC10-216	ENST00000489424	TBC1D9B	Q66K14	1250 aa		22.71	■■□□□ 1.23
HDAC10-216	ENST00000489424	ERBB4	Q15303	1308 aa		22.71	■■□□□ 1.23
HDAC10-216	ENST00000489424	ATP10D	Q9P241	1426 aa		22.71	■■□□□ 1.23
HDAC10-216	ENST00000489424	PDE6B	P35913	854 aa		22.7	■■□□□ 1.22
HDAC10-216	ENST00000489424	WDR43	Q15061	677 aa	Known RBP eCLIP	22.7	■■□□□ 1.22
HDAC10-216	ENST00000489424	RUNDC1	Q96C34	613 aa		22.7	■■□□□ 1.22
HDAC10-216	ENST00000489424	PRAMEF22	A3QJZ6	481 aa		22.69	■■□□□ 1.22
HDAC10-216	ENST00000489424	NBPF26	B4DH59	902 aa		22.69	■■□□□ 1.22
HDAC10-216	ENST00000489424		H0YIN7	160 aa		22.69	■■□□□ 1.22
HDAC10-216	ENST00000489424	NBPF10	Q6P3W6	841 aa	Known RBP	22.69	■■□□□ 1.22
HDAC10-216	ENST00000489424	ARHGAP27	Q6ZUM4	889 aa		22.69	■■□□□ 1.22
HDAC10-216	ENST00000489424	NBPF15	Q8N660	670 aa		22.69	■■□□□ 1.22
HDAC10-216	ENST00000489424	ERVV-1	B6SEH8	477 aa		22.68	■■□□□ 1.22
HDAC10-216	ENST00000489424	MIS18A	Q9NYP9	233 aa		22.68	■■□□□ 1.22
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF330	Q9Y3S2	320 aa	Predicted RBP	22.68	■■□□□ 1.22
HDAC10-216	ENST00000489424	ARFGEF1	Q9Y6D6	1849 aa		22.68	■■□□□ 1.22
HDAC10-216	ENST00000489424	CHRNA5	P30532	468 aa		22.67	■■□□□ 1.22
HDAC10-216	ENST00000489424	TTLL6	Q8N841	843 aa		22.67	■■□□□ 1.22
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF526	Q8TF50	670 aa	Predicted RBP	22.67	■■□□□ 1.22
HDAC10-216	ENST00000489424	GPBP1L1	Q9HC44	474 aa	Predicted RBP	22.67	■■□□□ 1.22
HDAC10-216	ENST00000489424	SCN7A	Q01118	1682 aa		22.66	■■□□□ 1.22
HDAC10-216	ENST00000489424	PRR5L	Q6MZQ0	368 aa		22.66	■■□□□ 1.22
HDAC10-216	ENST00000489424	BICDL1	Q6ZP65	573 aa		22.66	■■□□□ 1.22
HDAC10-216	ENST00000489424	SENP3-EIF4A1	A0A087X0R7	540 aa		22.65	■■□□□ 1.22
HDAC10-216	ENST00000489424	CNBD1	Q8NA66	436 aa		22.65	■■□□□ 1.22
HDAC10-216	ENST00000489424	ZC3H4	Q9UPT8	1303 aa	Known RBP	22.64	■■□□□ 1.22
HDAC10-216	ENST00000489424	ST5	P78524	1137 aa		22.64	■■□□□ 1.21
HDAC10-216	ENST00000489424	C2CD5	Q86YS7	1000 aa		22.64	■■□□□ 1.21
HDAC10-216	ENST00000489424	TSPYL4	Q9UJ04	414 aa		22.64	■■□□□ 1.21
HDAC10-216	ENST00000489424	ADAMTS8	Q9UP79	889 aa		22.64	■■□□□ 1.21
HDAC10-216	ENST00000489424	KLRG2	A4D1S0	409 aa	Predicted RBP	22.63	■■□□□ 1.21
HDAC10-216	ENST00000489424	TPTE2	Q6XPS3	522 aa		22.63	■■□□□ 1.21
HDAC10-216	ENST00000489424	THUMPD2	Q9BTF0	503 aa	Known RBP	22.63	■■□□□ 1.21
HDAC10-216	ENST00000489424	DLG5	Q8TDM6	1919 aa		22.63	■■□□□ 1.21

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