RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486420.1

C9orf16-202, Transcript of chromosome 9 open reading frame 16, humanhuman

TSL 5

Gene C9orf16, Length 434 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16-202ENST00000486420 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP16.1■□□□□ 0.17
C9orf16-202ENST00000486420 CRKLP46109 303 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
C9orf16-202ENST00000486420 TRAPPC3LQ5T215 181 aa16.1■□□□□ 0.17
C9orf16-202ENST00000486420 WWC1Q8IX03 1113 aa16.1■□□□□ 0.17
C9orf16-202ENST00000486420 MIER1Q8N108 512 aa16.1■□□□□ 0.17
C9orf16-202ENST00000486420 LINC00116Q8NCU8 138 aa16.1■□□□□ 0.17
C9orf16-202ENST00000486420 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP16.1■□□□□ 0.17
C9orf16-202ENST00000486420 KCNQ4P56696 695 aa16.09■□□□□ 0.17
C9orf16-202ENST00000486420 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
C9orf16-202ENST00000486420 SGIP1Q9BQI5 828 aa16.09■□□□□ 0.17
C9orf16-202ENST00000486420 MYH16Q9H6N6 1097 aa16.09■□□□□ 0.17
C9orf16-202ENST00000486420 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.17
C9orf16-202ENST00000486420 KDM3BQ7LBC6 1761 aa16.08■□□□□ 0.17
C9orf16-202ENST00000486420 RGL2O15211 777 aa16.08■□□□□ 0.16
C9orf16-202ENST00000486420 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
C9orf16-202ENST00000486420 DNAJC10Q8IXB1 793 aa16.08■□□□□ 0.16
C9orf16-202ENST00000486420 SLC4A9Q96Q91 983 aa16.08■□□□□ 0.16
C9orf16-202ENST00000486420 DCAF8L1A6NGE4 600 aa16.07■□□□□ 0.16
C9orf16-202ENST00000486420 ZNF853P0CG23 659 aa16.07■□□□□ 0.16
C9orf16-202ENST00000486420 RFC4P35249 363 aa16.07■□□□□ 0.16
C9orf16-202ENST00000486420 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
C9orf16-202ENST00000486420 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
C9orf16-202ENST00000486420 TJP1Q07157 1748 aa16.06■□□□□ 0.16
C9orf16-202ENST00000486420 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
C9orf16-202ENST00000486420 MSH5O43196 834 aa16.06■□□□□ 0.16
C9orf16-202ENST00000486420 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
C9orf16-202ENST00000486420 POLD1P28340 1107 aa16.06■□□□□ 0.16
C9orf16-202ENST00000486420 NLGN1Q8N2Q7 840 aa16.06■□□□□ 0.16
C9orf16-202ENST00000486420 ARXQ96QS3 562 aa16.05■□□□□ 0.16
C9orf16-202ENST00000486420 ZPR1O75312 459 aa16.04■□□□□ 0.16
C9orf16-202ENST00000486420 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
C9orf16-202ENST00000486420 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
C9orf16-202ENST00000486420 MIS18AQ9NYP9 233 aa16.04■□□□□ 0.16
C9orf16-202ENST00000486420 GOLGA2Q08379 1002 aa16.03■□□□□ 0.16
C9orf16-202ENST00000486420 KCNQ3O43525 872 aa16.02■□□□□ 0.16
C9orf16-202ENST00000486420 EIF5P55010 431 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
C9orf16-202ENST00000486420 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
C9orf16-202ENST00000486420 MBIPQ9NS73 344 aa16.02■□□□□ 0.16
C9orf16-202ENST00000486420 ZNF652Q9Y2D9 606 aa16.02■□□□□ 0.16
C9orf16-202ENST00000486420 LAMB4A4D0S4 1761 aa16.02■□□□□ 0.15
C9orf16-202ENST00000486420 CHD4Q14839 1912 aa16.02■□□□□ 0.15
C9orf16-202ENST00000486420 COL15A1P39059 1388 aa16.01■□□□□ 0.15
C9orf16-202ENST00000486420 E9PSI1 815 aa16.01■□□□□ 0.15
C9orf16-202ENST00000486420 PHF14O94880 888 aa16.01■□□□□ 0.15
C9orf16-202ENST00000486420 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
C9orf16-202ENST00000486420 SYT17Q9BSW7 474 aa16.01■□□□□ 0.15
C9orf16-202ENST00000486420 NARFQ9UHQ1 456 aa16.01■□□□□ 0.15
C9orf16-202ENST00000486420 CANXP27824 592 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
C9orf16-202ENST00000486420 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
C9orf16-202ENST00000486420 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa16■□□□□ 0.15
C9orf16-202ENST00000486420 USP16Q9Y5T5 823 aa16■□□□□ 0.15
C9orf16-202ENST00000486420 CCDC30Q5VVM6 783 aa15.99■□□□□ 0.15
C9orf16-202ENST00000486420 CLEC4GQ6UXB4 293 aa15.99■□□□□ 0.15
C9orf16-202ENST00000486420 ZNF428Q96B54 188 aa15.99■□□□□ 0.15
C9orf16-202ENST00000486420 C4AP0C0L4 1744 aa15.99■□□□□ 0.15
C9orf16-202ENST00000486420 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
C9orf16-202ENST00000486420 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa15.98■□□□□ 0.15
C9orf16-202ENST00000486420 DUSP27Q5VZP5 1158 aa15.98■□□□□ 0.15
C9orf16-202ENST00000486420 KIF6Q6ZMV9 814 aa15.98■□□□□ 0.15
C9orf16-202ENST00000486420 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP15.98■□□□□ 0.15
C9orf16-202ENST00000486420 HYPKQ9NX55 129 aa15.98■□□□□ 0.15
C9orf16-202ENST00000486420 ZNF521Q96K83 1311 aa15.97■□□□□ 0.15
C9orf16-202ENST00000486420 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
C9orf16-202ENST00000486420 STK31Q9BXU1 1019 aa15.97■□□□□ 0.15
C9orf16-202ENST00000486420 ERVV-1B6SEH8 477 aa15.96■□□□□ 0.15
C9orf16-202ENST00000486420 A1BGP04217 495 aa15.96■□□□□ 0.15
C9orf16-202ENST00000486420 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
C9orf16-202ENST00000486420 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
C9orf16-202ENST00000486420 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
C9orf16-202ENST00000486420 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
C9orf16-202ENST00000486420 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
C9orf16-202ENST00000486420 PARP3Q9Y6F1 533 aa15.95■□□□□ 0.14
C9orf16-202ENST00000486420 FANCIQ9NVI1 1328 aa15.94■□□□□ 0.14
C9orf16-202ENST00000486420 GYS1P13807 737 aa15.94■□□□□ 0.14
C9orf16-202ENST00000486420 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
C9orf16-202ENST00000486420 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa15.94■□□□□ 0.14
C9orf16-202ENST00000486420 MSL1Q68DK7 614 aa15.94■□□□□ 0.14
C9orf16-202ENST00000486420 KLHL34Q8N239 644 aa15.94■□□□□ 0.14
C9orf16-202ENST00000486420 UTRNP46939 3433 aa15.94■□□□□ 0.14
C9orf16-202ENST00000486420 DDX58O95786 925 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
C9orf16-202ENST00000486420 YY1P25490 414 aa15.93■□□□□ 0.14
C9orf16-202ENST00000486420 KIF13BQ9NQT8 1826 aa15.92■□□□□ 0.14
C9orf16-202ENST00000486420 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP15.92■□□□□ 0.14
C9orf16-202ENST00000486420 USPL1Q5W0Q7 1092 aa15.92■□□□□ 0.14
C9orf16-202ENST00000486420 AMIGO3Q86WK7 504 aa15.92■□□□□ 0.14
C9orf16-202ENST00000486420 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa15.92■□□□□ 0.14
C9orf16-202ENST00000486420 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa15.91■□□□□ 0.14
C9orf16-202ENST00000486420 NBPF26B4DH59 902 aa15.91■□□□□ 0.14
C9orf16-202ENST00000486420 MYL6BP14649 208 aa15.91■□□□□ 0.14
C9orf16-202ENST00000486420 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
C9orf16-202ENST00000486420 NBPF15Q8N660 670 aa15.91■□□□□ 0.14
C9orf16-202ENST00000486420 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
C9orf16-202ENST00000486420 SETDB2Q96T68 719 aa15.91■□□□□ 0.14
C9orf16-202ENST00000486420 CD2APQ9Y5K6 639 aa15.91■□□□□ 0.14
C9orf16-202ENST00000486420 ZBED9Q6R2W3 1325 aa15.91■□□□□ 0.14
C9orf16-202ENST00000486420 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa15.91■□□□□ 0.14
C9orf16-202ENST00000486420 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
C9orf16-202ENST00000486420 CARMIL3Q8ND23 1372 aa15.9■□□□□ 0.14
C9orf16-202ENST00000486420 SLFN5Q08AF3 891 aa15.9■□□□□ 0.14
C9orf16-202ENST00000486420 C8orf58Q8NAV2 365 aa15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.4 ms