RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485349.5

SKIV2L-211, Transcript of Ski2 like RNA helicase, humanhuman

TSL 2

Gene SKIV2L, Length 734 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2L-211ENST00000485349 ZPR1O75312 459 aa22.81■■□□□ 1.24
SKIV2L-211ENST00000485349 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa22.81■■□□□ 1.24
SKIV2L-211ENST00000485349 TM4SF1P30408 202 aa22.8■■□□□ 1.24
SKIV2L-211ENST00000485349 VSIG10Q8N0Z9 540 aa22.8■■□□□ 1.24
SKIV2L-211ENST00000485349 DLEC1Q9Y238 1755 aa22.79■■□□□ 1.24
SKIV2L-211ENST00000485349 SCN7AQ01118 1682 aa22.78■■□□□ 1.24
SKIV2L-211ENST00000485349 CHRNA5P30532 468 aa22.78■■□□□ 1.24
SKIV2L-211ENST00000485349 GAS2L2Q8NHY3 880 aa22.78■■□□□ 1.24
SKIV2L-211ENST00000485349 PIM2Q9P1W9 311 aa22.78■■□□□ 1.24
SKIV2L-211ENST00000485349 NARFQ9UHQ1 456 aa22.78■■□□□ 1.24
SKIV2L-211ENST00000485349 GNAT3A8MTJ3 354 aa22.77■■□□□ 1.24
SKIV2L-211ENST00000485349 KIF3CO14782 793 aa22.77■■□□□ 1.24
SKIV2L-211ENST00000485349 TTC5Q8N0Z6 440 aa22.77■■□□□ 1.24
SKIV2L-211ENST00000485349 IL17REQ8NFR9 667 aa22.77■■□□□ 1.24
SKIV2L-211ENST00000485349 TEFQ10587 303 aa22.76■■□□□ 1.23
SKIV2L-211ENST00000485349 NFIXQ14938 502 aa22.76■■□□□ 1.23
SKIV2L-211ENST00000485349 BCL2L12Q9HB09 334 aa22.76■■□□□ 1.23
SKIV2L-211ENST00000485349 CANXP27824 592 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
SKIV2L-211ENST00000485349 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
SKIV2L-211ENST00000485349 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
SKIV2L-211ENST00000485349 PHACTR3Q96KR7 559 aa22.74■■□□□ 1.23
SKIV2L-211ENST00000485349 SBF1O95248 1867 aa22.74■■□□□ 1.23
SKIV2L-211ENST00000485349 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa22.74■■□□□ 1.23
SKIV2L-211ENST00000485349 HEG1Q9ULI3 1381 aa22.74■■□□□ 1.23
SKIV2L-211ENST00000485349 PRKAR2BP31323 418 aa22.73■■□□□ 1.23
SKIV2L-211ENST00000485349 ZNF790Q6PG37 636 aa22.73■■□□□ 1.23
SKIV2L-211ENST00000485349 RSPH6AQ9H0K4 717 aa22.73■■□□□ 1.23
SKIV2L-211ENST00000485349 STARD3NLO95772 234 aa22.72■■□□□ 1.23
SKIV2L-211ENST00000485349 HSPA6P17066 643 aa22.72■■□□□ 1.23
SKIV2L-211ENST00000485349 C9orf131Q5VYM1 1079 aa22.72■■□□□ 1.23
SKIV2L-211ENST00000485349 CFAP53Q96M91 514 aa22.72■■□□□ 1.23
SKIV2L-211ENST00000485349 CARMIL3Q8ND23 1372 aa22.72■■□□□ 1.23
SKIV2L-211ENST00000485349 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa22.71■■□□□ 1.23
SKIV2L-211ENST00000485349 EIF5P55010 431 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
SKIV2L-211ENST00000485349 BCORQ6W2J9 1755 aa22.69■■□□□ 1.22
SKIV2L-211ENST00000485349 SERPINB2P05120 415 aa22.69■■□□□ 1.22
SKIV2L-211ENST00000485349 PPP2R1AP30153 589 aa22.69■■□□□ 1.22
SKIV2L-211ENST00000485349 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
SKIV2L-211ENST00000485349 NMRK2Q9NPI5 230 aa22.68■■□□□ 1.22
SKIV2L-211ENST00000485349 A0A087WZG4 1122 aa22.67■■□□□ 1.22
SKIV2L-211ENST00000485349 KCNQ3O43525 872 aa22.67■■□□□ 1.22
SKIV2L-211ENST00000485349 BICDL1Q6ZP65 573 aa22.67■■□□□ 1.22
SKIV2L-211ENST00000485349 FMNL2Q96PY5 1086 aa22.67■■□□□ 1.22
SKIV2L-211ENST00000485349 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
SKIV2L-211ENST00000485349 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
SKIV2L-211ENST00000485349 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP22.66■■□□□ 1.22
SKIV2L-211ENST00000485349 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
SKIV2L-211ENST00000485349 RNF181Q9P0P0 153 aa22.66■■□□□ 1.22
SKIV2L-211ENST00000485349 NUDCQ9Y266 331 aa22.66■■□□□ 1.22
SKIV2L-211ENST00000485349 BTBD11A6QL63 1104 aa22.65■■□□□ 1.22
SKIV2L-211ENST00000485349 TBC1D9BQ66K14 1250 aa22.65■■□□□ 1.22
SKIV2L-211ENST00000485349 TIAM2Q8IVF5 1701 aa22.65■■□□□ 1.22
SKIV2L-211ENST00000485349 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
SKIV2L-211ENST00000485349 A1BGP04217 495 aa22.64■■□□□ 1.21
SKIV2L-211ENST00000485349 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.21
SKIV2L-211ENST00000485349 RASSF7Q02833 373 aa22.64■■□□□ 1.21
SKIV2L-211ENST00000485349 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa22.64■■□□□ 1.21
SKIV2L-211ENST00000485349 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa22.63■■□□□ 1.21
SKIV2L-211ENST00000485349 MCM10Q7L590 875 aa22.63■■□□□ 1.21
SKIV2L-211ENST00000485349 C2CD5Q86YS7 1000 aa22.63■■□□□ 1.21
SKIV2L-211ENST00000485349 TOMM70O94826 608 aa22.62■■□□□ 1.21
SKIV2L-211ENST00000485349 DLG5Q8TDM6 1919 aa22.62■■□□□ 1.21
SKIV2L-211ENST00000485349 CACNA1SQ13698 1873 aa22.62■■□□□ 1.21
SKIV2L-211ENST00000485349 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa22.6■■□□□ 1.21
SKIV2L-211ENST00000485349 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
SKIV2L-211ENST00000485349 TTLL6Q8N841 843 aa22.6■■□□□ 1.21
SKIV2L-211ENST00000485349 H0YIN7 160 aa22.59■■□□□ 1.21
SKIV2L-211ENST00000485349 CAMTA2O94983 1202 aa22.59■■□□□ 1.21
SKIV2L-211ENST00000485349 PRELPP51888 382 aa22.59■■□□□ 1.21
SKIV2L-211ENST00000485349 DCTN1Q14203 1278 aa22.59■■□□□ 1.21
SKIV2L-211ENST00000485349 PRR5LQ6MZQ0 368 aa22.59■■□□□ 1.21
SKIV2L-211ENST00000485349 CCDC24Q8N4L8 307 aa22.59■■□□□ 1.21
SKIV2L-211ENST00000485349 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
SKIV2L-211ENST00000485349 KDM2BQ8NHM5 1336 aa22.58■■□□□ 1.21
SKIV2L-211ENST00000485349 LAMB4A4D0S4 1761 aa22.58■■□□□ 1.21
SKIV2L-211ENST00000485349 USP16Q9Y5T5 823 aa22.58■■□□□ 1.21
SKIV2L-211ENST00000485349 WDR90Q96KV7 1748 aa22.57■■□□□ 1.2
SKIV2L-211ENST00000485349 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa22.56■■□□□ 1.2
SKIV2L-211ENST00000485349 KDM3BQ7LBC6 1761 aa22.56■■□□□ 1.2
SKIV2L-211ENST00000485349 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa22.56■■□□□ 1.2
SKIV2L-211ENST00000485349 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
SKIV2L-211ENST00000485349 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
SKIV2L-211ENST00000485349 BRIP1Q9BX63 1249 aa22.56■■□□□ 1.2
SKIV2L-211ENST00000485349 NFKBIEO00221 500 aa22.55■■□□□ 1.2
SKIV2L-211ENST00000485349 LMNB1P20700 586 aa22.55■■□□□ 1.2
SKIV2L-211ENST00000485349 APLP1P51693 650 aa22.55■■□□□ 1.2
SKIV2L-211ENST00000485349 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
SKIV2L-211ENST00000485349 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
SKIV2L-211ENST00000485349 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP22.55■■□□□ 1.2
SKIV2L-211ENST00000485349 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
SKIV2L-211ENST00000485349 PDE6BP35913 854 aa22.54■■□□□ 1.2
SKIV2L-211ENST00000485349 CNBD1Q8NA66 436 aa22.54■■□□□ 1.2
SKIV2L-211ENST00000485349 SETDB2Q96T68 719 aa22.54■■□□□ 1.2
SKIV2L-211ENST00000485349 RRAGCQ9HB90 399 aa22.54■■□□□ 1.2
SKIV2L-211ENST00000485349 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
SKIV2L-211ENST00000485349 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
SKIV2L-211ENST00000485349 SLX4Q8IY92 1834 aa22.53■■□□□ 1.2
SKIV2L-211ENST00000485349 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
SKIV2L-211ENST00000485349 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP22.51■■□□□ 1.19
SKIV2L-211ENST00000485349 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 60.1 ms