RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477486.1

RBMS1-211, Transcript of RNA binding motif single stranded interacting protein 1, humanhuman

TSL 4

Gene RBMS1, Length 562 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBMS1-211ENST00000477486 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP29.37■■■□□ 2.29
RBMS1-211ENST00000477486 FCHSD2O94868 740 aa29.36■■■□□ 2.29
RBMS1-211ENST00000477486 DDR1Q08345 913 aa29.36■■■□□ 2.29
RBMS1-211ENST00000477486 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP29.36■■■□□ 2.29
RBMS1-211ENST00000477486 NARFQ9UHQ1 456 aa29.36■■■□□ 2.29
RBMS1-211ENST00000477486 BTBD11A6QL63 1104 aa29.35■■■□□ 2.29
RBMS1-211ENST00000477486 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP29.35■■■□□ 2.29
RBMS1-211ENST00000477486 KIF13BQ9NQT8 1826 aa29.35■■■□□ 2.29
RBMS1-211ENST00000477486 COL15A1P39059 1388 aa29.35■■■□□ 2.29
RBMS1-211ENST00000477486 ATP10DQ9P241 1426 aa29.35■■■□□ 2.29
RBMS1-211ENST00000477486 TM4SF1P30408 202 aa29.34■■■□□ 2.29
RBMS1-211ENST00000477486 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa29.34■■■□□ 2.29
RBMS1-211ENST00000477486 FMNL2Q96PY5 1086 aa29.34■■■□□ 2.29
RBMS1-211ENST00000477486 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP29.34■■■□□ 2.29
RBMS1-211ENST00000477486 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP29.34■■■□□ 2.29
RBMS1-211ENST00000477486 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP29.33■■■□□ 2.29
RBMS1-211ENST00000477486 HEG1Q9ULI3 1381 aa29.32■■■□□ 2.28
RBMS1-211ENST00000477486 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP29.32■■■□□ 2.28
RBMS1-211ENST00000477486 NEFMP07197 916 aa29.32■■■□□ 2.28
RBMS1-211ENST00000477486 PIM2Q9P1W9 311 aa29.32■■■□□ 2.28
RBMS1-211ENST00000477486 A0A087WZG4 1122 aa29.31■■■□□ 2.28
RBMS1-211ENST00000477486 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa29.3■■■□□ 2.28
RBMS1-211ENST00000477486 NFIXQ14938 502 aa29.3■■■□□ 2.28
RBMS1-211ENST00000477486 MCM10Q7L590 875 aa29.3■■■□□ 2.28
RBMS1-211ENST00000477486 UBR2Q8IWV8 1755 aa29.29■■■□□ 2.28
RBMS1-211ENST00000477486 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa29.28■■■□□ 2.28
RBMS1-211ENST00000477486 BICDL1Q6ZP65 573 aa29.28■■■□□ 2.28
RBMS1-211ENST00000477486 KCNQ3O43525 872 aa29.27■■■□□ 2.28
RBMS1-211ENST00000477486 KCNA3P22001 575 aa29.27■■■□□ 2.28
RBMS1-211ENST00000477486 CHRNA5P30532 468 aa29.27■■■□□ 2.28
RBMS1-211ENST00000477486 EIF5P55010 431 aaKnown RBP29.27■■■□□ 2.28
RBMS1-211ENST00000477486 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP29.27■■■□□ 2.28
RBMS1-211ENST00000477486 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa29.26■■■□□ 2.27
RBMS1-211ENST00000477486 SERPINB2P05120 415 aa29.25■■■□□ 2.27
RBMS1-211ENST00000477486 DCTN1Q14203 1278 aa29.25■■■□□ 2.27
RBMS1-211ENST00000477486 BCL2L12Q9HB09 334 aa29.25■■■□□ 2.27
RBMS1-211ENST00000477486 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa29.25■■■□□ 2.27
RBMS1-211ENST00000477486 A1BGP04217 495 aa29.24■■■□□ 2.27
RBMS1-211ENST00000477486 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP29.24■■■□□ 2.27
RBMS1-211ENST00000477486 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP29.22■■■□□ 2.27
RBMS1-211ENST00000477486 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP29.22■■■□□ 2.27
RBMS1-211ENST00000477486 ADCY9O60503 1353 aa29.22■■■□□ 2.27
RBMS1-211ENST00000477486 USP16Q9Y5T5 823 aa29.2■■■□□ 2.26
RBMS1-211ENST00000477486 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP29.19■■■□□ 2.26
RBMS1-211ENST00000477486 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP29.18■■■□□ 2.26
RBMS1-211ENST00000477486 TBC1D9BQ66K14 1250 aa29.18■■■□□ 2.26
RBMS1-211ENST00000477486 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP29.18■■■□□ 2.26
RBMS1-211ENST00000477486 NPHP1O15259 732 aa29.17■■■□□ 2.26
RBMS1-211ENST00000477486 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP29.16■■■□□ 2.26
RBMS1-211ENST00000477486 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP29.16■■■□□ 2.26
RBMS1-211ENST00000477486 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP29.15■■■□□ 2.26
RBMS1-211ENST00000477486 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa29.15■■■□□ 2.26
RBMS1-211ENST00000477486 H0YIN7 160 aa29.15■■■□□ 2.26
RBMS1-211ENST00000477486 C2CD5Q86YS7 1000 aa29.15■■■□□ 2.26
RBMS1-211ENST00000477486 MIS18AQ9NYP9 233 aa29.15■■■□□ 2.26
RBMS1-211ENST00000477486 C9orf131Q5VYM1 1079 aa29.14■■■□□ 2.26
RBMS1-211ENST00000477486 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP29.14■■■□□ 2.26
RBMS1-211ENST00000477486 SETDB2Q96T68 719 aa29.14■■■□□ 2.26
RBMS1-211ENST00000477486 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa29.14■■■□□ 2.25
RBMS1-211ENST00000477486 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP29.13■■■□□ 2.25
RBMS1-211ENST00000477486 RALBP1Q15311 655 aa29.12■■■□□ 2.25
RBMS1-211ENST00000477486 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa29.12■■■□□ 2.25
RBMS1-211ENST00000477486 TTLL6Q8N841 843 aa29.11■■■□□ 2.25
RBMS1-211ENST00000477486 CAMTA2O94983 1202 aa29.1■■■□□ 2.25
RBMS1-211ENST00000477486 CCDC24Q8N4L8 307 aa29.1■■■□□ 2.25
RBMS1-211ENST00000477486 PLEKHF1Q96S99 279 aa29.1■■■□□ 2.25
RBMS1-211ENST00000477486 RNF181Q9P0P0 153 aa29.1■■■□□ 2.25
RBMS1-211ENST00000477486 PDE6BP35913 854 aa29.09■■■□□ 2.25
RBMS1-211ENST00000477486 NFE2L2Q16236 605 aa29.09■■■□□ 2.25
RBMS1-211ENST00000477486 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP29.09■■■□□ 2.25
RBMS1-211ENST00000477486 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP29.09■■■□□ 2.25
RBMS1-211ENST00000477486 CARMIL3Q8ND23 1372 aa29.09■■■□□ 2.25
RBMS1-211ENST00000477486 NRXN2Q9P2S2 1712 aa29.08■■■□□ 2.25
RBMS1-211ENST00000477486 BRIP1Q9BX63 1249 aa29.07■■■□□ 2.24
RBMS1-211ENST00000477486 PRR5LQ6MZQ0 368 aa29.06■■■□□ 2.24
RBMS1-211ENST00000477486 CNBD1Q8NA66 436 aa29.06■■■□□ 2.24
RBMS1-211ENST00000477486 ZNF652Q9Y2D9 606 aa29.06■■■□□ 2.24
RBMS1-211ENST00000477486 KIF3CO14782 793 aa29.05■■■□□ 2.24
RBMS1-211ENST00000477486 ST5P78524 1137 aa29.05■■■□□ 2.24
RBMS1-211ENST00000477486 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP29.05■■■□□ 2.24
RBMS1-211ENST00000477486 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa29.05■■■□□ 2.24
RBMS1-211ENST00000477486 SCN7AQ01118 1682 aa29.03■■■□□ 2.24
RBMS1-211ENST00000477486 DLG5Q8TDM6 1919 aa29.03■■■□□ 2.24
RBMS1-211ENST00000477486 CLEC4GQ6UXB4 293 aa29.03■■■□□ 2.24
RBMS1-211ENST00000477486 NBPF26B4DH59 902 aa29.02■■■□□ 2.24
RBMS1-211ENST00000477486 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP29.02■■■□□ 2.24
RBMS1-211ENST00000477486 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP29.02■■■□□ 2.24
RBMS1-211ENST00000477486 NGEFQ8N5V2 710 aa29.02■■■□□ 2.24
RBMS1-211ENST00000477486 NBPF15Q8N660 670 aa29.02■■■□□ 2.24
RBMS1-211ENST00000477486 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP29.02■■■□□ 2.24
RBMS1-211ENST00000477486 RASSF7Q02833 373 aa29.01■■■□□ 2.23
RBMS1-211ENST00000477486 NMRK2Q9NPI5 230 aa29.01■■■□□ 2.23
RBMS1-211ENST00000477486 RIPK4P57078 832 aa29■■■□□ 2.23
RBMS1-211ENST00000477486 KDM2BQ8NHM5 1336 aa28.99■■■□□ 2.23
RBMS1-211ENST00000477486 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP28.99■■■□□ 2.23
RBMS1-211ENST00000477486 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP28.98■■■□□ 2.23
RBMS1-211ENST00000477486 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP28.98■■■□□ 2.23
RBMS1-211ENST00000477486 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP28.98■■■□□ 2.23
RBMS1-211ENST00000477486 FAM177BA6PVY3 158 aa28.97■■■□□ 2.23
RBMS1-211ENST00000477486 TOMM70O94826 608 aa28.97■■■□□ 2.23
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