RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462130.1

HDLBP-230, Transcript of high density lipoprotein binding protein, human

TSL 4

Gene HDLBP, Length 464 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDLBP-230	ENST00000462130	BRCA1	P38398	1863 aa	Known RBP	13.69	□□□□□ -0.22
HDLBP-230	ENST00000462130	KIF7	Q2M1P5	1343 aa		13.68	□□□□□ -0.22
HDLBP-230	ENST00000462130	TJP1	Q07157	1748 aa		13.68	□□□□□ -0.22
HDLBP-230	ENST00000462130	C10orf71	Q711Q0	1435 aa		13.67	□□□□□ -0.22
HDLBP-230	ENST00000462130	FCHSD2	O94868	740 aa		13.67	□□□□□ -0.22
HDLBP-230	ENST00000462130	IL13	P35225	146 aa		13.67	□□□□□ -0.22
HDLBP-230	ENST00000462130	CRKL	P46109	303 aa	Known RBP	13.67	□□□□□ -0.22
HDLBP-230	ENST00000462130	ARFGEF1	Q9Y6D6	1849 aa		13.67	□□□□□ -0.22
HDLBP-230	ENST00000462130	DPEP1	P16444	411 aa		13.66	□□□□□ -0.22
HDLBP-230	ENST00000462130	AKAP4	Q5JQC9	854 aa		13.66	□□□□□ -0.22
HDLBP-230	ENST00000462130	ARHGAP27	Q6ZUM4	889 aa		13.66	□□□□□ -0.22
HDLBP-230	ENST00000462130	CEP350	Q5VT06	3117 aa		13.66	□□□□□ -0.22
HDLBP-230	ENST00000462130	HSPA6	P17066	643 aa		13.65	□□□□□ -0.22
HDLBP-230	ENST00000462130	SRP68	Q9UHB9	627 aa	Known RBP	13.65	□□□□□ -0.22
HDLBP-230	ENST00000462130	HMOX1	P09601	288 aa		13.64	□□□□□ -0.23
HDLBP-230	ENST00000462130	SLC52A2	Q9HAB3	445 aa		13.64	□□□□□ -0.23
HDLBP-230	ENST00000462130	USP42	Q9H9J4	1324 aa	Known RBP	13.64	□□□□□ -0.23
HDLBP-230	ENST00000462130	C19orf67	A6NJJ6	358 aa		13.63	□□□□□ -0.23
HDLBP-230	ENST00000462130	KIF3C	O14782	793 aa		13.63	□□□□□ -0.23
HDLBP-230	ENST00000462130	ZPR1	O75312	459 aa		13.63	□□□□□ -0.23
HDLBP-230	ENST00000462130	FKBP8	Q14318	412 aa		13.63	□□□□□ -0.23
HDLBP-230	ENST00000462130	AMER1	Q5JTC6	1135 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
HDLBP-230	ENST00000462130	DNAJC10	Q8IXB1	793 aa		13.63	□□□□□ -0.23
HDLBP-230	ENST00000462130	LGR6	Q9HBX8	967 aa		13.63	□□□□□ -0.23
HDLBP-230	ENST00000462130	PIM2	Q9P1W9	311 aa		13.63	□□□□□ -0.23
HDLBP-230	ENST00000462130	AFDN	P55196	1824 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
HDLBP-230	ENST00000462130	RNMT	O43148	476 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
HDLBP-230	ENST00000462130	DIAPH1	O60610	1272 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
HDLBP-230	ENST00000462130	SLC39A6	Q13433	755 aa		13.61	□□□□□ -0.23
HDLBP-230	ENST00000462130	CNGB1	Q14028	1251 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
HDLBP-230	ENST00000462130	CC2D1B	Q5T0F9	858 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
HDLBP-230	ENST00000462130	INTS5	Q6P9B9	1019 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
HDLBP-230	ENST00000462130	ADAMTS7	Q9UKP4	1686 aa		13.6	□□□□□ -0.23
HDLBP-230	ENST00000462130	SBF1	O95248	1867 aa		13.6	□□□□□ -0.23
HDLBP-230	ENST00000462130	KCNA3	P22001	575 aa		13.6	□□□□□ -0.23
HDLBP-230	ENST00000462130	DDR1	Q08345	913 aa		13.6	□□□□□ -0.23
HDLBP-230	ENST00000462130	DALRD3	Q5D0E6	543 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
HDLBP-230	ENST00000462130	USPL1	Q5W0Q7	1092 aa		13.6	□□□□□ -0.23
HDLBP-230	ENST00000462130	CHADL	Q6NUI6	762 aa		13.6	□□□□□ -0.23
HDLBP-230	ENST00000462130	TOMM70	O94826	608 aa		13.59	□□□□□ -0.23
HDLBP-230	ENST00000462130	MTHFSD	Q2M296	383 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
HDLBP-230	ENST00000462130	C9orf131	Q5VYM1	1079 aa		13.59	□□□□□ -0.23
HDLBP-230	ENST00000462130	MRC1	P22897	1456 aa		13.59	□□□□□ -0.23
HDLBP-230	ENST00000462130	SOS1	Q07889	1333 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
HDLBP-230	ENST00000462130	POLRMT	O00411	1230 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
HDLBP-230	ENST00000462130	PER1	O15534	1290 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
HDLBP-230	ENST00000462130	CYP19A1	P11511	503 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
HDLBP-230	ENST00000462130	TM4SF1	P30408	202 aa		13.58	□□□□□ -0.24
HDLBP-230	ENST00000462130	CHRNA5	P30532	468 aa		13.58	□□□□□ -0.24
HDLBP-230	ENST00000462130	CCDC88A	Q3V6T2	1871 aa		13.58	□□□□□ -0.24
HDLBP-230	ENST00000462130	UBR2	Q8IWV8	1755 aa		13.58	□□□□□ -0.24
HDLBP-230	ENST00000462130	PRR29	P0C7W0	189 aa		13.57	□□□□□ -0.24
HDLBP-230	ENST00000462130	C16orf71	Q8IYS4	520 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
HDLBP-230	ENST00000462130	TTC5	Q8N0Z6	440 aa		13.57	□□□□□ -0.24
HDLBP-230	ENST00000462130	NMRK2	Q9NPI5	230 aa		13.57	□□□□□ -0.24
HDLBP-230	ENST00000462130	NARF	Q9UHQ1	456 aa		13.57	□□□□□ -0.24
HDLBP-230	ENST00000462130	ZBTB1	Q9Y2K1	713 aa		13.57	□□□□□ -0.24
HDLBP-230	ENST00000462130	KCP	Q6ZWJ8	1503 aa		13.57	□□□□□ -0.24
HDLBP-230	ENST00000462130	COL15A1	P39059	1388 aa		13.57	□□□□□ -0.24
HDLBP-230	ENST00000462130	U2SURP	O15042	1029 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
HDLBP-230	ENST00000462130	APLP1	P51693	650 aa		13.56	□□□□□ -0.24
HDLBP-230	ENST00000462130	DDX10	Q13206	875 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
HDLBP-230	ENST00000462130	VSIG10	Q8N0Z9	540 aa		13.56	□□□□□ -0.24
HDLBP-230	ENST00000462130	RNF181	Q9P0P0	153 aa		13.56	□□□□□ -0.24
HDLBP-230	ENST00000462130	CANX	P27824	592 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
HDLBP-230	ENST00000462130	TEF	Q10587	303 aa		13.55	□□□□□ -0.24
HDLBP-230	ENST00000462130	NFIX	Q14938	502 aa		13.55	□□□□□ -0.24
HDLBP-230	ENST00000462130	IFFO2	Q5TF58	517 aa		13.55	□□□□□ -0.24
HDLBP-230	ENST00000462130	KDM2B	Q8NHM5	1336 aa		13.55	□□□□□ -0.24
HDLBP-230	ENST00000462130	NRXN2	Q9P2S2	1712 aa		13.55	□□□□□ -0.24
HDLBP-230	ENST00000462130	DLEC1	Q9Y238	1755 aa		13.55	□□□□□ -0.24
HDLBP-230	ENST00000462130	STARD3NL	O95772	234 aa		13.54	□□□□□ -0.24
HDLBP-230	ENST00000462130	SERPINB2	P05120	415 aa		13.54	□□□□□ -0.24
HDLBP-230	ENST00000462130	SIPA1L3	O60292	1781 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
HDLBP-230	ENST00000462130	GNAT3	A8MTJ3	354 aa		13.53	□□□□□ -0.24
HDLBP-230	ENST00000462130	GAS2L2	Q8NHY3	880 aa		13.53	□□□□□ -0.24
HDLBP-230	ENST00000462130	TNRC6C	Q9HCJ0	1690 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
HDLBP-230	ENST00000462130	WDR90	Q96KV7	1748 aa		13.53	□□□□□ -0.24
HDLBP-230	ENST00000462130		A0A087WZG4	1122 aa		13.52	□□□□□ -0.25
HDLBP-230	ENST00000462130	ZNF316	A6NFI3	1004 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
HDLBP-230	ENST00000462130	BICDL1	Q6ZP65	573 aa		13.52	□□□□□ -0.25
HDLBP-230	ENST00000462130	NPM2	Q86SE8	214 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
HDLBP-230	ENST00000462130	RBM46	Q8TBY0	533 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
HDLBP-230	ENST00000462130	BCL2L12	Q9HB09	334 aa		13.52	□□□□□ -0.25
HDLBP-230	ENST00000462130	ZNF330	Q9Y3S2	320 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
HDLBP-230	ENST00000462130	COL3A1	P02461	1466 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
HDLBP-230	ENST00000462130		H0YIN7	160 aa		13.51	□□□□□ -0.25
HDLBP-230	ENST00000462130	ZNF790	Q6PG37	636 aa		13.51	□□□□□ -0.25
HDLBP-230	ENST00000462130	TTLL6	Q8N841	843 aa		13.51	□□□□□ -0.25
HDLBP-230	ENST00000462130	TEX13A	Q9BXU3	409 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
HDLBP-230	ENST00000462130	RRAGC	Q9HB90	399 aa		13.51	□□□□□ -0.25
HDLBP-230	ENST00000462130	NPC1L1	Q9UHC9	1359 aa		13.5	□□□□□ -0.25
HDLBP-230	ENST00000462130	HEG1	Q9ULI3	1381 aa		13.5	□□□□□ -0.25
HDLBP-230	ENST00000462130	GABBR2	O75899	941 aa		13.5	□□□□□ -0.25
HDLBP-230	ENST00000462130	EIF5	P55010	431 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
HDLBP-230	ENST00000462130	RASSF7	Q02833	373 aa		13.5	□□□□□ -0.25
HDLBP-230	ENST00000462130	C2CD5	Q86YS7	1000 aa		13.5	□□□□□ -0.25
HDLBP-230	ENST00000462130	IL17RE	Q8NFR9	667 aa		13.5	□□□□□ -0.25
HDLBP-230	ENST00000462130	ZNF496	Q96IT1	587 aa	Predicted RBP	13.5	□□□□□ -0.25
HDLBP-230	ENST00000462130	CACNA1S	Q13698	1873 aa		13.5	□□□□□ -0.25

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