RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460558.5

ECHDC1-211, Transcript of ethylmalonyl-CoA decarboxylase 1, humanhuman

TSL 5

Gene ECHDC1, Length 301 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC1-211ENST00000460558 GPRASP1Q5JY77 1395 aa6.18□□□□□ -1.42
ECHDC1-211ENST00000460558 SPDYE5A6NIY4 337 aa6.18□□□□□ -1.42
ECHDC1-211ENST00000460558 C3orf80F5H4A9 247 aa6.18□□□□□ -1.42
ECHDC1-211ENST00000460558 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP6.18□□□□□ -1.42
ECHDC1-211ENST00000460558 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP6.18□□□□□ -1.42
ECHDC1-211ENST00000460558 CHRNA2Q15822 529 aa6.18□□□□□ -1.42
ECHDC1-211ENST00000460558 MAMSTRQ6ZN01 415 aa6.18□□□□□ -1.42
ECHDC1-211ENST00000460558 WAPLQ7Z5K2 1190 aa6.18□□□□□ -1.42
ECHDC1-211ENST00000460558 POLR3EQ9NVU0 708 aa6.18□□□□□ -1.42
ECHDC1-211ENST00000460558 LMO7Q8WWI1 1683 aa6.17□□□□□ -1.42
ECHDC1-211ENST00000460558 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa6.17□□□□□ -1.42
ECHDC1-211ENST00000460558 SPTLC1O15269 473 aa6.17□□□□□ -1.42
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ECHDC1-211ENST00000460558 DNAJB2P25686 324 aa6.17□□□□□ -1.42
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ECHDC1-211ENST00000460558 HTRA3P83110 453 aa6.17□□□□□ -1.42
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ECHDC1-211ENST00000460558 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa6.17□□□□□ -1.42
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ECHDC1-211ENST00000460558 TMEM134Q9H6X4 195 aa6.17□□□□□ -1.42
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ECHDC1-211ENST00000460558 LIMD1Q9UGP4 676 aa6.17□□□□□ -1.42
ECHDC1-211ENST00000460558 BTAF1O14981 1849 aa6.17□□□□□ -1.42
ECHDC1-211ENST00000460558 NHSQ6T4R5 1651 aa6.17□□□□□ -1.42
ECHDC1-211ENST00000460558 NBPF26B4DH59 902 aa6.16□□□□□ -1.42
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ECHDC1-211ENST00000460558 SULF1Q8IWU6 871 aa6.16□□□□□ -1.42
ECHDC1-211ENST00000460558 ZNF710Q8N1W2 664 aa6.16□□□□□ -1.42
ECHDC1-211ENST00000460558 STK26Q9P289 416 aa6.16□□□□□ -1.42
ECHDC1-211ENST00000460558 NUP155O75694 1391 aa6.16□□□□□ -1.42
ECHDC1-211ENST00000460558 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa6.16□□□□□ -1.42
ECHDC1-211ENST00000460558 BCL9O00512 1426 aa6.16□□□□□ -1.42
ECHDC1-211ENST00000460558 ANKARQ7Z5J8 1434 aa6.16□□□□□ -1.42
ECHDC1-211ENST00000460558 PIK3C2AO00443 1686 aa6.15□□□□□ -1.42
ECHDC1-211ENST00000460558 DDB1Q16531 1140 aa6.15□□□□□ -1.42
ECHDC1-211ENST00000460558 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
ECHDC1-211ENST00000460558 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
ECHDC1-211ENST00000460558 NUDT18Q6ZVK8 323 aa6.15□□□□□ -1.42
ECHDC1-211ENST00000460558 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
ECHDC1-211ENST00000460558 TATDN2Q93075 761 aa6.15□□□□□ -1.42
ECHDC1-211ENST00000460558 ITSN1Q15811 1721 aa6.15□□□□□ -1.42
ECHDC1-211ENST00000460558 ABCC11Q96J66 1382 aa6.15□□□□□ -1.43
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ECHDC1-211ENST00000460558 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP6.14□□□□□ -1.43
ECHDC1-211ENST00000460558 FSTL1Q12841 308 aa6.14□□□□□ -1.43
ECHDC1-211ENST00000460558 TMEM259Q4ZIN3 620 aa6.14□□□□□ -1.43
ECHDC1-211ENST00000460558 RIC3Q7Z5B4 369 aa6.14□□□□□ -1.43
ECHDC1-211ENST00000460558 POM121Q96HA1 1249 aa6.14□□□□□ -1.43
ECHDC1-211ENST00000460558 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa6.14□□□□□ -1.43
ECHDC1-211ENST00000460558 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa6.14□□□□□ -1.43
ECHDC1-211ENST00000460558 CRB1P82279 1406 aa6.14□□□□□ -1.43
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ECHDC1-211ENST00000460558 ZNF827Q17R98 1081 aa6.13□□□□□ -1.43
ECHDC1-211ENST00000460558 PACS2Q86VP3 889 aa6.13□□□□□ -1.43
ECHDC1-211ENST00000460558 COG6Q9Y2V7 657 aa6.13□□□□□ -1.43
ECHDC1-211ENST00000460558 USP19O94966 1318 aa6.13□□□□□ -1.43
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ECHDC1-211ENST00000460558 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
ECHDC1-211ENST00000460558 LILRB3O75022 631 aa6.12□□□□□ -1.43
ECHDC1-211ENST00000460558 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
ECHDC1-211ENST00000460558 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa6.12□□□□□ -1.43
ECHDC1-211ENST00000460558 SNRKQ9NRH2 765 aa6.12□□□□□ -1.43
ECHDC1-211ENST00000460558 PLSCR2Q9NRY7 297 aa6.12□□□□□ -1.43
ECHDC1-211ENST00000460558 PNMA3Q9UL41 463 aa6.12□□□□□ -1.43
ECHDC1-211ENST00000460558 PKD1L3Q7Z443 1732 aa6.11□□□□□ -1.43
ECHDC1-211ENST00000460558 VPS8Q8N3P4 1428 aa6.11□□□□□ -1.43
ECHDC1-211ENST00000460558 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
ECHDC1-211ENST00000460558 MOXD2PA6NHM9 499 aa6.11□□□□□ -1.43
ECHDC1-211ENST00000460558 LHX8Q68G74 356 aa6.11□□□□□ -1.43
ECHDC1-211ENST00000460558 CCDC82Q8N4S0 544 aa6.11□□□□□ -1.43
ECHDC1-211ENST00000460558 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP6.11□□□□□ -1.43
ECHDC1-211ENST00000460558 MTMR14Q8NCE2 650 aa6.11□□□□□ -1.43
ECHDC1-211ENST00000460558 ZBED2Q9BTP6 218 aa6.11□□□□□ -1.43
ECHDC1-211ENST00000460558 SLC4A5Q9BY07 1137 aa6.11□□□□□ -1.43
ECHDC1-211ENST00000460558 NMRK2Q9NPI5 230 aa6.11□□□□□ -1.43
ECHDC1-211ENST00000460558 CD2APQ9Y5K6 639 aa6.11□□□□□ -1.43
ECHDC1-211ENST00000460558 RGPD5Q99666 1765 aa6.11□□□□□ -1.43
ECHDC1-211ENST00000460558 CPDO75976 1380 aa6.1□□□□□ -1.43
ECHDC1-211ENST00000460558 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP6.1□□□□□ -1.43
ECHDC1-211ENST00000460558 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa6.1□□□□□ -1.43
ECHDC1-211ENST00000460558 DDX11L8A8MPP1 907 aa6.1□□□□□ -1.43
ECHDC1-211ENST00000460558 RAD21O60216 631 aa6.1□□□□□ -1.43
ECHDC1-211ENST00000460558 PROX2Q3B8N5 592 aa6.1□□□□□ -1.43
ECHDC1-211ENST00000460558 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP6.1□□□□□ -1.43
ECHDC1-211ENST00000460558 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP6.1□□□□□ -1.43
ECHDC1-211ENST00000460558 SIRT1Q96EB6 747 aa6.1□□□□□ -1.43
ECHDC1-211ENST00000460558 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP6.1□□□□□ -1.43
ECHDC1-211ENST00000460558 PRDM10Q9NQV6 1147 aa6.1□□□□□ -1.43
ECHDC1-211ENST00000460558 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa6.1□□□□□ -1.43
ECHDC1-211ENST00000460558 GCGRP47871 477 aa6.09□□□□□ -1.43
ECHDC1-211ENST00000460558 USP46P62068 366 aa6.09□□□□□ -1.43
ECHDC1-211ENST00000460558 QPCTQ16769 361 aa6.09□□□□□ -1.43
ECHDC1-211ENST00000460558 TMEM132EQ6IEE7 984 aa6.09□□□□□ -1.43
ECHDC1-211ENST00000460558 NUTM1Q86Y26 1132 aa6.09□□□□□ -1.43
ECHDC1-211ENST00000460558 LY75O60449 1722 aa6.08□□□□□ -1.44
ECHDC1-211ENST00000460558 KDM4AO75164 1064 aa6.08□□□□□ -1.44
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