RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000457363.1

ANKRD60-201, Transcript of ankyrin repeat domain 60, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene ANKRD60, Length 1,038 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD60-201ENST00000457363 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP41.98■■■■■ 4.31
ANKRD60-201ENST00000457363 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP41.96■■■■■ 4.31
ANKRD60-201ENST00000457363 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP41.96■■■■■ 4.31
ANKRD60-201ENST00000457363 CANXP27824 592 aaKnown RBP41.94■■■■■ 4.3
ANKRD60-201ENST00000457363 ZPR1O75312 459 aa41.92■■■■■ 4.3
ANKRD60-201ENST00000457363 COL15A1P39059 1388 aa41.91■■■■■ 4.3
ANKRD60-201ENST00000457363 GPR162Q16538 588 aa41.91■■■■■ 4.3
ANKRD60-201ENST00000457363 RIPK4P57078 832 aa41.9■■■■■ 4.3
ANKRD60-201ENST00000457363 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP41.89■■■■■ 4.3
ANKRD60-201ENST00000457363 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP41.89■■■■■ 4.3
ANKRD60-201ENST00000457363 MIS18AQ9NYP9 233 aa41.89■■■■■ 4.3
ANKRD60-201ENST00000457363 TMPOP42166 694 aaKnown RBP41.88■■■■■ 4.29
ANKRD60-201ENST00000457363 FKBP8Q14318 412 aa41.88■■■■■ 4.29
ANKRD60-201ENST00000457363 CCDC146Q8IYE0 955 aa41.88■■■■■ 4.29
ANKRD60-201ENST00000457363 ADAMTS8Q9UP79 889 aa41.88■■■■■ 4.29
ANKRD60-201ENST00000457363 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP41.87■■■■■ 4.29
ANKRD60-201ENST00000457363 USPL1Q5W0Q7 1092 aa41.87■■■■■ 4.29
ANKRD60-201ENST00000457363 NARFQ9UHQ1 456 aa41.87■■■■■ 4.29
ANKRD60-201ENST00000457363 PARP3Q9Y6F1 533 aa41.87■■■■■ 4.29
ANKRD60-201ENST00000457363 EIF5P55010 431 aaKnown RBP41.86■■■■■ 4.29
ANKRD60-201ENST00000457363 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP41.86■■■■■ 4.29
ANKRD60-201ENST00000457363 RUNDC1Q96C34 613 aa41.86■■■■■ 4.29
ANKRD60-201ENST00000457363 USP16Q9Y5T5 823 aa41.85■■■■■ 4.29
ANKRD60-201ENST00000457363 A0A087WZG4 1122 aa41.83■■■■■ 4.29
ANKRD60-201ENST00000457363 A1BGP04217 495 aa41.83■■■■■ 4.29
ANKRD60-201ENST00000457363 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa41.82■■■■■ 4.29
ANKRD60-201ENST00000457363 LMOD3Q0VAK6 560 aa41.82■■■■■ 4.29
ANKRD60-201ENST00000457363 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP41.81■■■■■ 4.28
ANKRD60-201ENST00000457363 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP41.8■■■■■ 4.28
ANKRD60-201ENST00000457363 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP41.79■■■■■ 4.28
ANKRD60-201ENST00000457363 YY1P25490 414 aa41.78■■■■■ 4.28
ANKRD60-201ENST00000457363 TM4SF1P30408 202 aa41.77■■■■■ 4.28
ANKRD60-201ENST00000457363 NEUROD2Q15784 382 aa41.77■■■■■ 4.28
ANKRD60-201ENST00000457363 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP41.77■■■■■ 4.28
ANKRD60-201ENST00000457363 KDM3BQ7LBC6 1761 aa41.76■■■■■ 4.28
ANKRD60-201ENST00000457363 DDR1Q08345 913 aa41.76■■■■■ 4.28
ANKRD60-201ENST00000457363 BCL2L12Q9HB09 334 aa41.75■■■■■ 4.27
ANKRD60-201ENST00000457363 C10orf71Q711Q0 1435 aa41.74■■■■■ 4.27
ANKRD60-201ENST00000457363 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP41.73■■■■■ 4.27
ANKRD60-201ENST00000457363 KIF13BQ9NQT8 1826 aa41.73■■■■■ 4.27
ANKRD60-201ENST00000457363 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP41.72■■■■■ 4.27
ANKRD60-201ENST00000457363 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP41.72■■■■■ 4.27
ANKRD60-201ENST00000457363 TGFB2P61812 414 aa41.72■■■■■ 4.27
ANKRD60-201ENST00000457363 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa41.72■■■■■ 4.27
ANKRD60-201ENST00000457363 ANP32CO43423 234 aa41.71■■■■■ 4.27
ANKRD60-201ENST00000457363 NFIXQ14938 502 aa41.71■■■■■ 4.27
ANKRD60-201ENST00000457363 TSPYL4Q9UJ04 414 aa41.71■■■■■ 4.27
ANKRD60-201ENST00000457363 GRIN3BO60391 1043 aa41.7■■■■■ 4.27
ANKRD60-201ENST00000457363 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP41.7■■■■■ 4.27
ANKRD60-201ENST00000457363 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP41.69■■■■■ 4.26
ANKRD60-201ENST00000457363 BABAM1Q9NWV8 329 aa41.68■■■■■ 4.26
ANKRD60-201ENST00000457363 UTRNP46939 3433 aa41.68■■■■■ 4.26
ANKRD60-201ENST00000457363 TRIM35Q9UPQ4 493 aa41.67■■■■■ 4.26
ANKRD60-201ENST00000457363 CCDC184Q52MB2 194 aa41.66■■■■■ 4.26
ANKRD60-201ENST00000457363 PXDNLA1KZ92 1463 aa41.66■■■■■ 4.26
ANKRD60-201ENST00000457363 CHD4Q14839 1912 aa41.65■■■■■ 4.26
ANKRD60-201ENST00000457363 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP41.64■■■■■ 4.26
ANKRD60-201ENST00000457363 NBPF26B4DH59 902 aa41.63■■■■■ 4.25
ANKRD60-201ENST00000457363 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP41.63■■■■■ 4.25
ANKRD60-201ENST00000457363 NBPF15Q8N660 670 aa41.63■■■■■ 4.25
ANKRD60-201ENST00000457363 WWC3Q9ULE0 1092 aa41.63■■■■■ 4.25
ANKRD60-201ENST00000457363 LAMB4A4D0S4 1761 aa41.63■■■■■ 4.25
ANKRD60-201ENST00000457363 A0A0G2JLW4 131 aa41.62■■■■■ 4.25
ANKRD60-201ENST00000457363 CAMTA2O94983 1202 aa41.62■■■■■ 4.25
ANKRD60-201ENST00000457363 SCN7AQ01118 1682 aa41.61■■■■■ 4.25
ANKRD60-201ENST00000457363 BICDL1Q6ZP65 573 aa41.61■■■■■ 4.25
ANKRD60-201ENST00000457363 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa41.61■■■■■ 4.25
ANKRD60-201ENST00000457363 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP41.6■■■■■ 4.25
ANKRD60-201ENST00000457363 SERPINB2P05120 415 aa41.6■■■■■ 4.25
ANKRD60-201ENST00000457363 TBC1D9BQ66K14 1250 aa41.6■■■■■ 4.25
ANKRD60-201ENST00000457363 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP41.6■■■■■ 4.25
ANKRD60-201ENST00000457363 DPEP1P16444 411 aa41.59■■■■■ 4.25
ANKRD60-201ENST00000457363 APAF1O14727 1248 aa41.58■■■■■ 4.25
ANKRD60-201ENST00000457363 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP41.56■■■■■ 4.24
ANKRD60-201ENST00000457363 CHL1O00533 1208 aa41.54■■■■■ 4.24
ANKRD60-201ENST00000457363 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP41.54■■■■■ 4.24
ANKRD60-201ENST00000457363 NRXN2Q9P2S2 1712 aa41.54■■■■■ 4.24
ANKRD60-201ENST00000457363 MRS2Q9HD23 443 aa41.53■■■■■ 4.24
ANKRD60-201ENST00000457363 BCORQ6W2J9 1755 aa41.53■■■■■ 4.24
ANKRD60-201ENST00000457363 CLEC4GQ6UXB4 293 aa41.52■■■■■ 4.24
ANKRD60-201ENST00000457363 KCNA3P22001 575 aa41.51■■■■■ 4.24
ANKRD60-201ENST00000457363 SETDB2Q96T68 719 aa41.51■■■■■ 4.24
ANKRD60-201ENST00000457363 ZNF652Q9Y2D9 606 aa41.51■■■■■ 4.24
ANKRD60-201ENST00000457363 BCS1LQ9Y276 419 aa41.5■■■■■ 4.23
ANKRD60-201ENST00000457363 CARMIL3Q8ND23 1372 aa41.5■■■■■ 4.23
ANKRD60-201ENST00000457363 NGEFQ8N5V2 710 aa41.48■■■■■ 4.23
ANKRD60-201ENST00000457363 ERBB4Q15303 1308 aa41.47■■■■■ 4.23
ANKRD60-201ENST00000457363 RGL2O15211 777 aa41.47■■■■■ 4.23
ANKRD60-201ENST00000457363 PIM2Q9P1W9 311 aa41.47■■■■■ 4.23
ANKRD60-201ENST00000457363 MYL6BP14649 208 aa41.46■■■■■ 4.23
ANKRD60-201ENST00000457363 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP41.46■■■■■ 4.23
ANKRD60-201ENST00000457363 CHRNA5P30532 468 aa41.46■■■■■ 4.23
ANKRD60-201ENST00000457363 CFAP44Q96MT7 982 aa41.46■■■■■ 4.23
ANKRD60-201ENST00000457363 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP41.44■■■■■ 4.22
ANKRD60-201ENST00000457363 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP41.42■■■■■ 4.22
ANKRD60-201ENST00000457363 PRR5LQ6MZQ0 368 aa41.41■■■■■ 4.22
ANKRD60-201ENST00000457363 HLFQ16534 295 aa41.39■■■■■ 4.22
ANKRD60-201ENST00000457363 KRT24Q2M2I5 525 aa41.39■■■■■ 4.22
ANKRD60-201ENST00000457363 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP41.39■■■■■ 4.22
ANKRD60-201ENST00000457363 KIF6Q6ZMV9 814 aa41.39■■■■■ 4.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 7.5 ms