RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000444916.5

SH3BP4-205, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 4

Gene SH3BP4, Length 570 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-205ENST00000444916 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP18.74■□□□□ 0.59
SH3BP4-205ENST00000444916 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP18.74■□□□□ 0.59
SH3BP4-205ENST00000444916 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP18.74■□□□□ 0.59
SH3BP4-205ENST00000444916 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP18.74■□□□□ 0.59
SH3BP4-205ENST00000444916 BTBD11A6QL63 1104 aa18.73■□□□□ 0.59
SH3BP4-205ENST00000444916 DCTN1Q14203 1278 aa18.73■□□□□ 0.59
SH3BP4-205ENST00000444916 NFE2L2Q16236 605 aa18.73■□□□□ 0.59
SH3BP4-205ENST00000444916 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP18.73■□□□□ 0.59
SH3BP4-205ENST00000444916 CCDC87Q9NVE4 849 aa18.73■□□□□ 0.59
SH3BP4-205ENST00000444916 HEG1Q9ULI3 1381 aa18.72■□□□□ 0.59
SH3BP4-205ENST00000444916 RFC4P35249 363 aa18.72■□□□□ 0.59
SH3BP4-205ENST00000444916 MMP10P09238 476 aa18.71■□□□□ 0.59
SH3BP4-205ENST00000444916 FMNL2Q96PY5 1086 aa18.71■□□□□ 0.59
SH3BP4-205ENST00000444916 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa18.71■□□□□ 0.59
SH3BP4-205ENST00000444916 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP18.71■□□□□ 0.59
SH3BP4-205ENST00000444916 PXDNLA1KZ92 1463 aa18.71■□□□□ 0.59
SH3BP4-205ENST00000444916 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP18.69■□□□□ 0.58
SH3BP4-205ENST00000444916 KCNQ3O43525 872 aa18.69■□□□□ 0.58
SH3BP4-205ENST00000444916 STARD3NLO95772 234 aa18.69■□□□□ 0.58
SH3BP4-205ENST00000444916 GYS1P13807 737 aa18.69■□□□□ 0.58
SH3BP4-205ENST00000444916 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP18.69■□□□□ 0.58
SH3BP4-205ENST00000444916 NLGN1Q8N2Q7 840 aa18.69■□□□□ 0.58
SH3BP4-205ENST00000444916 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP18.69■□□□□ 0.58
SH3BP4-205ENST00000444916 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP18.69■□□□□ 0.58
SH3BP4-205ENST00000444916 A0A0G2JLW4 131 aa18.68■□□□□ 0.58
SH3BP4-205ENST00000444916 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa18.68■□□□□ 0.58
SH3BP4-205ENST00000444916 KDM3BQ7LBC6 1761 aa18.68■□□□□ 0.58
SH3BP4-205ENST00000444916 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP18.67■□□□□ 0.58
SH3BP4-205ENST00000444916 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa18.67■□□□□ 0.58
SH3BP4-205ENST00000444916 NMRK2Q9NPI5 230 aa18.67■□□□□ 0.58
SH3BP4-205ENST00000444916 BCS1LQ9Y276 419 aa18.67■□□□□ 0.58
SH3BP4-205ENST00000444916 COL15A1P39059 1388 aa18.67■□□□□ 0.58
SH3BP4-205ENST00000444916 KIF13BQ9NQT8 1826 aa18.66■□□□□ 0.58
SH3BP4-205ENST00000444916 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP18.66■□□□□ 0.58
SH3BP4-205ENST00000444916 APLP1P51693 650 aa18.65■□□□□ 0.58
SH3BP4-205ENST00000444916 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP18.65■□□□□ 0.58
SH3BP4-205ENST00000444916 ZPR1O75312 459 aa18.64■□□□□ 0.57
SH3BP4-205ENST00000444916 TOMM70O94826 608 aa18.64■□□□□ 0.57
SH3BP4-205ENST00000444916 CANXP27824 592 aaKnown RBP18.64■□□□□ 0.57
SH3BP4-205ENST00000444916 TMPOP42166 694 aaKnown RBP18.64■□□□□ 0.57
SH3BP4-205ENST00000444916 RIPK4P57078 832 aa18.64■□□□□ 0.57
SH3BP4-205ENST00000444916 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa18.64■□□□□ 0.57
SH3BP4-205ENST00000444916 CCDC146Q8IYE0 955 aa18.64■□□□□ 0.57
SH3BP4-205ENST00000444916 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP18.64■□□□□ 0.57
SH3BP4-205ENST00000444916 ADAMTS8Q9UP79 889 aa18.64■□□□□ 0.57
SH3BP4-205ENST00000444916 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP18.63■□□□□ 0.57
SH3BP4-205ENST00000444916 DPEP1P16444 411 aa18.63■□□□□ 0.57
SH3BP4-205ENST00000444916 EIF5P55010 431 aaKnown RBP18.63■□□□□ 0.57
SH3BP4-205ENST00000444916 LMOD3Q0VAK6 560 aa18.63■□□□□ 0.57
SH3BP4-205ENST00000444916 FKBP8Q14318 412 aa18.63■□□□□ 0.57
SH3BP4-205ENST00000444916 RUNDC1Q96C34 613 aa18.63■□□□□ 0.57
SH3BP4-205ENST00000444916 C10orf71Q711Q0 1435 aa18.63■□□□□ 0.57
SH3BP4-205ENST00000444916 HTRA3P83110 453 aa18.62■□□□□ 0.57
SH3BP4-205ENST00000444916 USPL1Q5W0Q7 1092 aa18.62■□□□□ 0.57
SH3BP4-205ENST00000444916 MIS18AQ9NYP9 233 aa18.62■□□□□ 0.57
SH3BP4-205ENST00000444916 NARFQ9UHQ1 456 aa18.62■□□□□ 0.57
SH3BP4-205ENST00000444916 LAMB4A4D0S4 1761 aa18.62■□□□□ 0.57
SH3BP4-205ENST00000444916 A0A087WZG4 1122 aa18.61■□□□□ 0.57
SH3BP4-205ENST00000444916 TGFB2P61812 414 aa18.61■□□□□ 0.57
SH3BP4-205ENST00000444916 USP16Q9Y5T5 823 aa18.61■□□□□ 0.57
SH3BP4-205ENST00000444916 PARP3Q9Y6F1 533 aa18.61■□□□□ 0.57
SH3BP4-205ENST00000444916 SCN7AQ01118 1682 aa18.6■□□□□ 0.57
SH3BP4-205ENST00000444916 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa18.6■□□□□ 0.57
SH3BP4-205ENST00000444916 A1BGP04217 495 aa18.6■□□□□ 0.57
SH3BP4-205ENST00000444916 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP18.6■□□□□ 0.57
SH3BP4-205ENST00000444916 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP18.59■□□□□ 0.57
SH3BP4-205ENST00000444916 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP18.58■□□□□ 0.57
SH3BP4-205ENST00000444916 KCNA3P22001 575 aa18.58■□□□□ 0.56
SH3BP4-205ENST00000444916 DDR1Q08345 913 aa18.58■□□□□ 0.56
SH3BP4-205ENST00000444916 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP18.58■□□□□ 0.56
SH3BP4-205ENST00000444916 ANP32CO43423 234 aa18.57■□□□□ 0.56
SH3BP4-205ENST00000444916 TM4SF1P30408 202 aa18.57■□□□□ 0.56
SH3BP4-205ENST00000444916 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP18.57■□□□□ 0.56
SH3BP4-205ENST00000444916 NEUROD2Q15784 382 aa18.57■□□□□ 0.56
SH3BP4-205ENST00000444916 C9orf131Q5VYM1 1079 aa18.57■□□□□ 0.56
SH3BP4-205ENST00000444916 BCL2L12Q9HB09 334 aa18.57■□□□□ 0.56
SH3BP4-205ENST00000444916 WDR90Q96KV7 1748 aa18.57■□□□□ 0.56
SH3BP4-205ENST00000444916 BCORQ6W2J9 1755 aa18.56■□□□□ 0.56
SH3BP4-205ENST00000444916 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP18.56■□□□□ 0.56
SH3BP4-205ENST00000444916 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP18.56■□□□□ 0.56
SH3BP4-205ENST00000444916 BABAM1Q9NWV8 329 aa18.56■□□□□ 0.56
SH3BP4-205ENST00000444916 TSPYL4Q9UJ04 414 aa18.56■□□□□ 0.56
SH3BP4-205ENST00000444916 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP18.56■□□□□ 0.56
SH3BP4-205ENST00000444916 NRXN2Q9P2S2 1712 aa18.55■□□□□ 0.56
SH3BP4-205ENST00000444916 NFIXQ14938 502 aa18.55■□□□□ 0.56
SH3BP4-205ENST00000444916 CCDC184Q52MB2 194 aa18.55■□□□□ 0.56
SH3BP4-205ENST00000444916 TRIM35Q9UPQ4 493 aa18.55■□□□□ 0.56
SH3BP4-205ENST00000444916 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP18.54■□□□□ 0.56
SH3BP4-205ENST00000444916 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP18.54■□□□□ 0.56
SH3BP4-205ENST00000444916 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa18.54■□□□□ 0.56
SH3BP4-205ENST00000444916 NBPF26B4DH59 902 aa18.53■□□□□ 0.56
SH3BP4-205ENST00000444916 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP18.53■□□□□ 0.56
SH3BP4-205ENST00000444916 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP18.53■□□□□ 0.56
SH3BP4-205ENST00000444916 NBPF15Q8N660 670 aa18.53■□□□□ 0.56
SH3BP4-205ENST00000444916 PCNTO95613 3336 aa18.53■□□□□ 0.56
SH3BP4-205ENST00000444916 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa18.52■□□□□ 0.56
SH3BP4-205ENST00000444916 CAMTA2O94983 1202 aa18.52■□□□□ 0.56
SH3BP4-205ENST00000444916 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP18.52■□□□□ 0.56
SH3BP4-205ENST00000444916 APAF1O14727 1248 aa18.51■□□□□ 0.55
SH3BP4-205ENST00000444916 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP18.51■□□□□ 0.55
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