RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436901.2

KLF3-AS1-201, KLF3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene KLF3-AS1, Length 1,896 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF3-AS1-201ENST00000436901 BECN1Q14457 450 aa27.45■■□□□ 1.99
KLF3-AS1-201ENST00000436901 APBB1O00213 710 aa27.44■■□□□ 1.98
KLF3-AS1-201ENST00000436901 ALDH1L1O75891 902 aa27.44■■□□□ 1.98
KLF3-AS1-201ENST00000436901 TTC22Q5TAA0 569 aa27.44■■□□□ 1.98
KLF3-AS1-201ENST00000436901 FMNL2Q96PY5 1086 aa27.44■■□□□ 1.98
KLF3-AS1-201ENST00000436901 STRN4Q9NRL3 753 aa27.44■■□□□ 1.98
KLF3-AS1-201ENST00000436901 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa27.44■■□□□ 1.98
KLF3-AS1-201ENST00000436901 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa27.44■■□□□ 1.98
KLF3-AS1-201ENST00000436901 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP27.44■■□□□ 1.98
KLF3-AS1-201ENST00000436901 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP27.44■■□□□ 1.98
KLF3-AS1-201ENST00000436901 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP27.44■■□□□ 1.98
KLF3-AS1-201ENST00000436901 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP27.44■■□□□ 1.98
KLF3-AS1-201ENST00000436901 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP27.44■■□□□ 1.98
KLF3-AS1-201ENST00000436901 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP27.43■■□□□ 1.98
KLF3-AS1-201ENST00000436901 SHANK3Q9BYB0 1731 aa27.43■■□□□ 1.98
KLF3-AS1-201ENST00000436901 LAMB4A4D0S4 1761 aa27.43■■□□□ 1.98
KLF3-AS1-201ENST00000436901 CDC45O75419 566 aa27.42■■□□□ 1.98
KLF3-AS1-201ENST00000436901 PDIA6Q15084 440 aa27.42■■□□□ 1.98
KLF3-AS1-201ENST00000436901 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP27.42■■□□□ 1.98
KLF3-AS1-201ENST00000436901 HDAC5Q9UQL6 1122 aa27.42■■□□□ 1.98
KLF3-AS1-201ENST00000436901 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa27.42■■□□□ 1.98
KLF3-AS1-201ENST00000436901 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP27.41■■□□□ 1.98
KLF3-AS1-201ENST00000436901 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP27.41■■□□□ 1.98
KLF3-AS1-201ENST00000436901 SSH3Q8TE77 659 aa27.41■■□□□ 1.98
KLF3-AS1-201ENST00000436901 LRRCC1Q9C099 1032 aa27.41■■□□□ 1.98
KLF3-AS1-201ENST00000436901 ERVV-2B6SEH9 535 aa27.4■■□□□ 1.98
KLF3-AS1-201ENST00000436901 SLC4A3P48751 1232 aa27.4■■□□□ 1.98
KLF3-AS1-201ENST00000436901 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP27.4■■□□□ 1.98
KLF3-AS1-201ENST00000436901 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP27.4■■□□□ 1.98
KLF3-AS1-201ENST00000436901 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP27.4■■□□□ 1.98
KLF3-AS1-201ENST00000436901 BCL11AQ9H165 835 aa27.4■■□□□ 1.98
KLF3-AS1-201ENST00000436901 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP27.39■■□□□ 1.98
KLF3-AS1-201ENST00000436901 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa27.39■■□□□ 1.98
KLF3-AS1-201ENST00000436901 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP27.38■■□□□ 1.97
KLF3-AS1-201ENST00000436901 LINS1Q8NG48 757 aa27.38■■□□□ 1.97
KLF3-AS1-201ENST00000436901 OSBPL3Q9H4L5 887 aa27.38■■□□□ 1.97
KLF3-AS1-201ENST00000436901 UBR2Q8IWV8 1755 aa27.37■■□□□ 1.97
KLF3-AS1-201ENST00000436901 POLA2Q14181 598 aa27.37■■□□□ 1.97
KLF3-AS1-201ENST00000436901 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa27.37■■□□□ 1.97
KLF3-AS1-201ENST00000436901 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP27.37■■□□□ 1.97
KLF3-AS1-201ENST00000436901 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP27.36■■□□□ 1.97
KLF3-AS1-201ENST00000436901 PAPPAQ13219 1627 aa27.36■■□□□ 1.97
KLF3-AS1-201ENST00000436901 LTBP4Q8N2S1 1624 aa27.36■■□□□ 1.97
KLF3-AS1-201ENST00000436901 GLI3P10071 1580 aa27.35■■□□□ 1.97
KLF3-AS1-201ENST00000436901 RAB11FIP3O75154 756 aa27.35■■□□□ 1.97
KLF3-AS1-201ENST00000436901 MYL6BP14649 208 aa27.34■■□□□ 1.97
KLF3-AS1-201ENST00000436901 RBM25P49756 843 aaKnown RBP27.34■■□□□ 1.97
KLF3-AS1-201ENST00000436901 RIC3Q7Z5B4 369 aa27.34■■□□□ 1.97
KLF3-AS1-201ENST00000436901 BTG4Q9NY30 223 aa27.34■■□□□ 1.97
KLF3-AS1-201ENST00000436901 USP16Q9Y5T5 823 aa27.34■■□□□ 1.97
KLF3-AS1-201ENST00000436901 SRGAP3O43295 1099 aa27.34■■□□□ 1.97
KLF3-AS1-201ENST00000436901 PDE1AP54750 535 aa27.33■■□□□ 1.97
KLF3-AS1-201ENST00000436901 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP27.33■■□□□ 1.97
KLF3-AS1-201ENST00000436901 MYT1Q01538 1121 aa27.32■■□□□ 1.96
KLF3-AS1-201ENST00000436901 NEXNQ0ZGT2 675 aa27.32■■□□□ 1.96
KLF3-AS1-201ENST00000436901 XAGE3Q8WTP9 111 aa27.32■■□□□ 1.96
KLF3-AS1-201ENST00000436901 MTX1Q13505 466 aa27.32■■□□□ 1.96
KLF3-AS1-201ENST00000436901 ERBB4Q15303 1308 aa27.31■■□□□ 1.96
KLF3-AS1-201ENST00000436901 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP27.31■■□□□ 1.96
KLF3-AS1-201ENST00000436901 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa27.31■■□□□ 1.96
KLF3-AS1-201ENST00000436901 CASC1Q6TDU7 716 aa27.31■■□□□ 1.96
KLF3-AS1-201ENST00000436901 COPS6Q7L5N1 327 aa27.31■■□□□ 1.96
KLF3-AS1-201ENST00000436901 SALL3Q9BXA9 1300 aa27.31■■□□□ 1.96
KLF3-AS1-201ENST00000436901 SURF6O75683 361 aaKnown RBP27.3■■□□□ 1.96
KLF3-AS1-201ENST00000436901 SDSP20132 328 aa27.3■■□□□ 1.96
KLF3-AS1-201ENST00000436901 UTYO14607 1347 aa27.3■■□□□ 1.96
KLF3-AS1-201ENST00000436901 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa27.3■■□□□ 1.96
KLF3-AS1-201ENST00000436901 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP27.3■■□□□ 1.96
KLF3-AS1-201ENST00000436901 GRM8O00222 908 aa27.29■■□□□ 1.96
KLF3-AS1-201ENST00000436901 MX1P20591 662 aa27.28■■□□□ 1.96
KLF3-AS1-201ENST00000436901 LRP10Q7Z4F1 713 aa27.28■■□□□ 1.96
KLF3-AS1-201ENST00000436901 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP27.28■■□□□ 1.96
KLF3-AS1-201ENST00000436901 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa27.28■■□□□ 1.96
KLF3-AS1-201ENST00000436901 PLCH1Q4KWH8 1693 aa27.28■■□□□ 1.96
KLF3-AS1-201ENST00000436901 KCPQ6ZWJ8 1503 aa27.28■■□□□ 1.96
KLF3-AS1-201ENST00000436901 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa27.28■■□□□ 1.96
KLF3-AS1-201ENST00000436901 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa27.27■■□□□ 1.96
KLF3-AS1-201ENST00000436901 USP35Q9P2H5 1018 aa27.27■■□□□ 1.96
KLF3-AS1-201ENST00000436901 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP27.27■■□□□ 1.96
KLF3-AS1-201ENST00000436901 NBR1Q14596 966 aa27.27■■□□□ 1.96
KLF3-AS1-201ENST00000436901 KIF1BPQ96EK5 621 aa27.27■■□□□ 1.96
KLF3-AS1-201ENST00000436901 PHLPP1O60346 1717 aa27.26■■□□□ 1.95
KLF3-AS1-201ENST00000436901 STAP2Q9UGK3 403 aa27.26■■□□□ 1.95
KLF3-AS1-201ENST00000436901 IGKV5-2P06315 115 aa27.25■■□□□ 1.95
KLF3-AS1-201ENST00000436901 TBC1D2Q9BYX2 928 aa27.25■■□□□ 1.95
KLF3-AS1-201ENST00000436901 AOX1Q06278 1338 aa27.25■■□□□ 1.95
KLF3-AS1-201ENST00000436901 RHPN1Q8TCX5 695 aa27.25■■□□□ 1.95
KLF3-AS1-201ENST00000436901 TNS2Q63HR2 1409 aa27.25■■□□□ 1.95
KLF3-AS1-201ENST00000436901 NEURL1BA8MQ27 555 aa27.24■■□□□ 1.95
KLF3-AS1-201ENST00000436901 MYD88Q99836 296 aa27.23■■□□□ 1.95
KLF3-AS1-201ENST00000436901 DISP2A7MBM2 1401 aa27.23■■□□□ 1.95
KLF3-AS1-201ENST00000436901 WNK3Q9BYP7 1800 aa27.23■■□□□ 1.95
KLF3-AS1-201ENST00000436901 TMOD3Q9NYL9 352 aa27.22■■□□□ 1.95
KLF3-AS1-201ENST00000436901 GCKRQ14397 625 aa27.21■■□□□ 1.95
KLF3-AS1-201ENST00000436901 SUCLG2Q96I99 432 aa27.21■■□□□ 1.95
KLF3-AS1-201ENST00000436901 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa27.21■■□□□ 1.95
KLF3-AS1-201ENST00000436901 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP27.21■■□□□ 1.95
KLF3-AS1-201ENST00000436901 ITGB4P16144 1822 aa27.2■■□□□ 1.95
KLF3-AS1-201ENST00000436901 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP27.2■■□□□ 1.94
KLF3-AS1-201ENST00000436901 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP27.2■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.5 ms