RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436072.6

SFRP4-201, Transcript of secreted frizzled related protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SFRP4, Length 2,966 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFRP4-201ENST00000436072 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP18.62■□□□□ 0.57
SFRP4-201ENST00000436072 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa18.62■□□□□ 0.57
SFRP4-201ENST00000436072 OVOS2Q6IE36 1432 aa18.62■□□□□ 0.57
SFRP4-201ENST00000436072 MX1P20591 662 aa18.62■□□□□ 0.57
SFRP4-201ENST00000436072 GIMAP6Q6P9H5 292 aa18.62■□□□□ 0.57
SFRP4-201ENST00000436072 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP18.62■□□□□ 0.57
SFRP4-201ENST00000436072 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa18.61■□□□□ 0.57
SFRP4-201ENST00000436072 CPA1P15085 419 aa18.61■□□□□ 0.57
SFRP4-201ENST00000436072 PIBF1Q8WXW3 757 aa18.61■□□□□ 0.57
SFRP4-201ENST00000436072 CHMP3Q9Y3E7 222 aa18.61■□□□□ 0.57
SFRP4-201ENST00000436072 IGSF3O75054 1194 aa18.6■□□□□ 0.57
SFRP4-201ENST00000436072 NUTM1Q86Y26 1132 aa18.6■□□□□ 0.57
SFRP4-201ENST00000436072 ABTB2Q8N961 1025 aa18.6■□□□□ 0.57
SFRP4-201ENST00000436072 LRRCC1Q9C099 1032 aa18.6■□□□□ 0.57
SFRP4-201ENST00000436072 CHL1O00533 1208 aa18.6■□□□□ 0.57
SFRP4-201ENST00000436072 PHF14O94880 888 aa18.6■□□□□ 0.57
SFRP4-201ENST00000436072 MCM2P49736 904 aa18.6■□□□□ 0.57
SFRP4-201ENST00000436072 ATP2B3Q16720 1220 aa18.6■□□□□ 0.57
SFRP4-201ENST00000436072 KIF24Q5T7B8 1368 aa18.59■□□□□ 0.57
SFRP4-201ENST00000436072 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP18.59■□□□□ 0.57
SFRP4-201ENST00000436072 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP18.59■□□□□ 0.57
SFRP4-201ENST00000436072 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP18.58■□□□□ 0.57
SFRP4-201ENST00000436072 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP18.58■□□□□ 0.57
SFRP4-201ENST00000436072 SLIT1O75093 1534 aa18.58■□□□□ 0.57
SFRP4-201ENST00000436072 GNAI2P04899 355 aa18.58■□□□□ 0.56
SFRP4-201ENST00000436072 OSBPL3Q9H4L5 887 aa18.58■□□□□ 0.56
SFRP4-201ENST00000436072 PEAK1Q9H792 1746 aa18.58■□□□□ 0.56
SFRP4-201ENST00000436072 ARHGAP23Q9P227 1491 aa18.58■□□□□ 0.56
SFRP4-201ENST00000436072 AP5Z1O43299 807 aa18.57■□□□□ 0.56
SFRP4-201ENST00000436072 EYA1Q99502 592 aa18.57■□□□□ 0.56
SFRP4-201ENST00000436072 DIP2AQ14689 1571 aa18.57■□□□□ 0.56
SFRP4-201ENST00000436072 CCDC183Q5T5S1 534 aa18.57■□□□□ 0.56
SFRP4-201ENST00000436072 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP18.57■□□□□ 0.56
SFRP4-201ENST00000436072 PYCARDQ9ULZ3 195 aa18.57■□□□□ 0.56
SFRP4-201ENST00000436072 USHBP1Q8N6Y0 703 aa18.57■□□□□ 0.56
SFRP4-201ENST00000436072 TSPYL4Q9UJ04 414 aa18.57■□□□□ 0.56
SFRP4-201ENST00000436072 PTPRCP08575 1304 aa18.56■□□□□ 0.56
SFRP4-201ENST00000436072 BCL2L12Q9HB09 334 aa18.56■□□□□ 0.56
SFRP4-201ENST00000436072 KIF3AQ9Y496 699 aa18.56■□□□□ 0.56
SFRP4-201ENST00000436072 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa18.56■□□□□ 0.56
SFRP4-201ENST00000436072 NRKQ7Z2Y5 1582 aa18.56■□□□□ 0.56
SFRP4-201ENST00000436072 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP18.56■□□□□ 0.56
SFRP4-201ENST00000436072 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP18.55■□□□□ 0.56
SFRP4-201ENST00000436072 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP18.55■□□□□ 0.56
SFRP4-201ENST00000436072 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP18.55■□□□□ 0.56
SFRP4-201ENST00000436072 TTC21AQ8NDW8 1320 aa18.55■□□□□ 0.56
SFRP4-201ENST00000436072 SSH2Q76I76 1423 aa18.54■□□□□ 0.56
SFRP4-201ENST00000436072 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP18.54■□□□□ 0.56
SFRP4-201ENST00000436072 KDM4AO75164 1064 aa18.54■□□□□ 0.56
SFRP4-201ENST00000436072 PRIMPOLQ96LW4 560 aa18.54■□□□□ 0.56
SFRP4-201ENST00000436072 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP18.54■□□□□ 0.56
SFRP4-201ENST00000436072 TCHHQ07283 1943 aa18.54■□□□□ 0.56
SFRP4-201ENST00000436072 USP31Q70CQ4 1352 aa18.54■□□□□ 0.56
SFRP4-201ENST00000436072 SYT1P21579 422 aa18.54■□□□□ 0.56
SFRP4-201ENST00000436072 ANKLE2Q86XL3 938 aa18.54■□□□□ 0.56
SFRP4-201ENST00000436072 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP18.53■□□□□ 0.56
SFRP4-201ENST00000436072 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP18.53■□□□□ 0.56
SFRP4-201ENST00000436072 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP18.53■□□□□ 0.56
SFRP4-201ENST00000436072 ESCO1Q5FWF5 840 aa18.53■□□□□ 0.56
SFRP4-201ENST00000436072 LMOD2Q6P5Q4 547 aa18.53■□□□□ 0.56
SFRP4-201ENST00000436072 RASEFQ8IZ41 740 aa18.53■□□□□ 0.56
SFRP4-201ENST00000436072 FAM184AQ8NB25 1140 aa18.53■□□□□ 0.56
SFRP4-201ENST00000436072 SPG7Q9UQ90 795 aa18.53■□□□□ 0.56
SFRP4-201ENST00000436072 FLT4P35916 1363 aa18.53■□□□□ 0.56
SFRP4-201ENST00000436072 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP18.52■□□□□ 0.56
SFRP4-201ENST00000436072 AK2P54819 239 aa18.52■□□□□ 0.56
SFRP4-201ENST00000436072 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP18.52■□□□□ 0.56
SFRP4-201ENST00000436072 DMTNQ08495 405 aa18.52■□□□□ 0.56
SFRP4-201ENST00000436072 KCNF1Q9H3M0 494 aa18.52■□□□□ 0.56
SFRP4-201ENST00000436072 STX6O43752 255 aa18.52■□□□□ 0.56
SFRP4-201ENST00000436072 LARGE1O95461 756 aa18.52■□□□□ 0.56
SFRP4-201ENST00000436072 CCT4P50991 539 aaKnown RBP18.52■□□□□ 0.56
SFRP4-201ENST00000436072 UVSSAQ2YD98 709 aa18.52■□□□□ 0.56
SFRP4-201ENST00000436072 PODXL2Q9NZ53 605 aa18.52■□□□□ 0.56
SFRP4-201ENST00000436072 SALL3Q9BXA9 1300 aa18.52■□□□□ 0.55
SFRP4-201ENST00000436072 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP18.51■□□□□ 0.55
SFRP4-201ENST00000436072 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP18.51■□□□□ 0.55
SFRP4-201ENST00000436072 ANAPC15P60006 121 aa18.51■□□□□ 0.55
SFRP4-201ENST00000436072 CAMK4Q16566 473 aa18.51■□□□□ 0.55
SFRP4-201ENST00000436072 SBNO1A3KN83 1393 aa18.51■□□□□ 0.55
SFRP4-201ENST00000436072 CCDC83Q8IWF9 413 aa18.51■□□□□ 0.55
SFRP4-201ENST00000436072 SMC3Q9UQE7 1217 aa18.51■□□□□ 0.55
SFRP4-201ENST00000436072 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
SFRP4-201ENST00000436072 PHF8Q9UPP1 1060 aa18.5■□□□□ 0.55
SFRP4-201ENST00000436072 SNX14Q9Y5W7 946 aa18.5■□□□□ 0.55
SFRP4-201ENST00000436072 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP18.5■□□□□ 0.55
SFRP4-201ENST00000436072 HOXC9P31274 260 aa18.5■□□□□ 0.55
SFRP4-201ENST00000436072 UBE2HP62256 183 aa18.5■□□□□ 0.55
SFRP4-201ENST00000436072 RUFY3Q7L099 469 aa18.5■□□□□ 0.55
SFRP4-201ENST00000436072 PDCL2Q8N4E4 241 aa18.5■□□□□ 0.55
SFRP4-201ENST00000436072 STK31Q9BXU1 1019 aa18.49■□□□□ 0.55
SFRP4-201ENST00000436072 HSPA4P34932 840 aa18.49■□□□□ 0.55
SFRP4-201ENST00000436072 ATP8B2P98198 1209 aa18.49■□□□□ 0.55
SFRP4-201ENST00000436072 FAM173BQ6P4H8 233 aa18.49■□□□□ 0.55
SFRP4-201ENST00000436072 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
SFRP4-201ENST00000436072 F13A1P00488 732 aa18.48■□□□□ 0.55
SFRP4-201ENST00000436072 PSME1Q06323 249 aa18.48■□□□□ 0.55
SFRP4-201ENST00000436072 SURF6O75683 361 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
SFRP4-201ENST00000436072 FERMT3Q86UX7 667 aa18.48■□□□□ 0.55
SFRP4-201ENST00000436072 FLIIQ13045 1269 aa18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 7.8 ms