RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000431413.5

HERC3-206, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 761 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-206ENST00000431413 DPEP1P16444 411 aa20.23■□□□□ 0.83
HERC3-206ENST00000431413 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
HERC3-206ENST00000431413 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
HERC3-206ENST00000431413 KIF13BQ9NQT8 1826 aa20.23■□□□□ 0.83
HERC3-206ENST00000431413 A0A087WZG4 1122 aa20.22■□□□□ 0.83
HERC3-206ENST00000431413 CANXP27824 592 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
HERC3-206ENST00000431413 TM4SF1P30408 202 aa20.22■□□□□ 0.83
HERC3-206ENST00000431413 DDR1Q08345 913 aa20.22■□□□□ 0.83
HERC3-206ENST00000431413 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
HERC3-206ENST00000431413 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
HERC3-206ENST00000431413 FMNL2Q96PY5 1086 aa20.22■□□□□ 0.83
HERC3-206ENST00000431413 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
HERC3-206ENST00000431413 NEFMP07197 916 aa20.21■□□□□ 0.83
HERC3-206ENST00000431413 PIM2Q9P1W9 311 aa20.21■□□□□ 0.83
HERC3-206ENST00000431413 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa20.21■□□□□ 0.83
HERC3-206ENST00000431413 HEG1Q9ULI3 1381 aa20.21■□□□□ 0.83
HERC3-206ENST00000431413 BTBD11A6QL63 1104 aa20.2■□□□□ 0.82
HERC3-206ENST00000431413 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
HERC3-206ENST00000431413 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa20.19■□□□□ 0.82
HERC3-206ENST00000431413 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa20.19■□□□□ 0.82
HERC3-206ENST00000431413 ADCY9O60503 1353 aa20.19■□□□□ 0.82
HERC3-206ENST00000431413 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
HERC3-206ENST00000431413 UBR2Q8IWV8 1755 aa20.18■□□□□ 0.82
HERC3-206ENST00000431413 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
HERC3-206ENST00000431413 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
HERC3-206ENST00000431413 EIF5P55010 431 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
HERC3-206ENST00000431413 NFIXQ14938 502 aa20.17■□□□□ 0.82
HERC3-206ENST00000431413 KCNA3P22001 575 aa20.16■□□□□ 0.82
HERC3-206ENST00000431413 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
HERC3-206ENST00000431413 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
HERC3-206ENST00000431413 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
HERC3-206ENST00000431413 SERPINB2P05120 415 aa20.15■□□□□ 0.82
HERC3-206ENST00000431413 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa20.15■□□□□ 0.82
HERC3-206ENST00000431413 MCM10Q7L590 875 aa20.14■□□□□ 0.81
HERC3-206ENST00000431413 BCL2L12Q9HB09 334 aa20.14■□□□□ 0.81
HERC3-206ENST00000431413 CHRNA5P30532 468 aa20.13■□□□□ 0.81
HERC3-206ENST00000431413 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
HERC3-206ENST00000431413 BICDL1Q6ZP65 573 aa20.12■□□□□ 0.81
HERC3-206ENST00000431413 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
HERC3-206ENST00000431413 KCNQ3O43525 872 aa20.11■□□□□ 0.81
HERC3-206ENST00000431413 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
HERC3-206ENST00000431413 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa20.11■□□□□ 0.81
HERC3-206ENST00000431413 A1BGP04217 495 aa20.1■□□□□ 0.81
HERC3-206ENST00000431413 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
HERC3-206ENST00000431413 DCTN1Q14203 1278 aa20.09■□□□□ 0.81
HERC3-206ENST00000431413 USP16Q9Y5T5 823 aa20.09■□□□□ 0.81
HERC3-206ENST00000431413 H0YIN7 160 aa20.08■□□□□ 0.81
HERC3-206ENST00000431413 TBC1D9BQ66K14 1250 aa20.08■□□□□ 0.81
HERC3-206ENST00000431413 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
HERC3-206ENST00000431413 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa20.08■□□□□ 0.81
HERC3-206ENST00000431413 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
HERC3-206ENST00000431413 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa20.07■□□□□ 0.8
HERC3-206ENST00000431413 NPHP1O15259 732 aa20.07■□□□□ 0.8
HERC3-206ENST00000431413 RALBP1Q15311 655 aa20.07■□□□□ 0.8
HERC3-206ENST00000431413 C9orf131Q5VYM1 1079 aa20.07■□□□□ 0.8
HERC3-206ENST00000431413 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
HERC3-206ENST00000431413 C2CD5Q86YS7 1000 aa20.07■□□□□ 0.8
HERC3-206ENST00000431413 TTLL6Q8N841 843 aa20.07■□□□□ 0.8
HERC3-206ENST00000431413 SETDB2Q96T68 719 aa20.07■□□□□ 0.8
HERC3-206ENST00000431413 CARMIL3Q8ND23 1372 aa20.07■□□□□ 0.8
HERC3-206ENST00000431413 PDE6BP35913 854 aa20.06■□□□□ 0.8
HERC3-206ENST00000431413 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa20.06■□□□□ 0.8
HERC3-206ENST00000431413 CAMTA2O94983 1202 aa20.05■□□□□ 0.8
HERC3-206ENST00000431413 BRIP1Q9BX63 1249 aa20.05■□□□□ 0.8
HERC3-206ENST00000431413 ZNF652Q9Y2D9 606 aa20.05■□□□□ 0.8
HERC3-206ENST00000431413 NRXN2Q9P2S2 1712 aa20.05■□□□□ 0.8
HERC3-206ENST00000431413 NFE2L2Q16236 605 aa20.04■□□□□ 0.8
HERC3-206ENST00000431413 CLEC4GQ6UXB4 293 aa20.04■□□□□ 0.8
HERC3-206ENST00000431413 PLEKHF1Q96S99 279 aa20.04■□□□□ 0.8
HERC3-206ENST00000431413 RNF181Q9P0P0 153 aa20.04■□□□□ 0.8
HERC3-206ENST00000431413 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa20.03■□□□□ 0.8
HERC3-206ENST00000431413 KIF3CO14782 793 aa20.03■□□□□ 0.8
HERC3-206ENST00000431413 CNBD1Q8NA66 436 aa20.03■□□□□ 0.8
HERC3-206ENST00000431413 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
HERC3-206ENST00000431413 ST5P78524 1137 aa20.02■□□□□ 0.8
HERC3-206ENST00000431413 PRR5LQ6MZQ0 368 aa20.02■□□□□ 0.8
HERC3-206ENST00000431413 SCN7AQ01118 1682 aa20.01■□□□□ 0.79
HERC3-206ENST00000431413 RGL2O15211 777 aa20.01■□□□□ 0.79
HERC3-206ENST00000431413 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP20.01■□□□□ 0.79
HERC3-206ENST00000431413 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP20.01■□□□□ 0.79
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HERC3-206ENST00000431413 KDM2BQ8NHM5 1336 aa20.01■□□□□ 0.79
HERC3-206ENST00000431413 TOMM70O94826 608 aa19.99■□□□□ 0.79
HERC3-206ENST00000431413 HSPA6P17066 643 aa19.99■□□□□ 0.79
HERC3-206ENST00000431413 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP19.99■□□□□ 0.79
HERC3-206ENST00000431413 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP19.99■□□□□ 0.79
HERC3-206ENST00000431413 NBPF26B4DH59 902 aa19.98■□□□□ 0.79
HERC3-206ENST00000431413 LMNB1P20700 586 aa19.98■□□□□ 0.79
HERC3-206ENST00000431413 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP19.98■□□□□ 0.79
HERC3-206ENST00000431413 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP19.98■□□□□ 0.79
HERC3-206ENST00000431413 NBPF15Q8N660 670 aa19.98■□□□□ 0.79
HERC3-206ENST00000431413 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP19.98■□□□□ 0.79
HERC3-206ENST00000431413 CCDC24Q8N4L8 307 aa19.97■□□□□ 0.79
HERC3-206ENST00000431413 NMRK2Q9NPI5 230 aa19.97■□□□□ 0.79
HERC3-206ENST00000431413 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP19.96■□□□□ 0.79
HERC3-206ENST00000431413 RASSF7Q02833 373 aa19.96■□□□□ 0.79
HERC3-206ENST00000431413 LMOD3Q0VAK6 560 aa19.96■□□□□ 0.79
HERC3-206ENST00000431413 TPTE2Q6XPS3 522 aa19.96■□□□□ 0.79
HERC3-206ENST00000431413 CNKSR1Q969H4 720 aa19.96■□□□□ 0.79
HERC3-206ENST00000431413 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP19.96■□□□□ 0.79
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