RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429504.6

CERS1-201, Transcript of ceramide synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CERS1, Length 2,094 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CERS1-201ENST00000429504 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa33.94■■■■□ 3.02
CERS1-201ENST00000429504 AK9Q5TCS8 1911 aa33.91■■■■□ 3.02
CERS1-201ENST00000429504 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP33.91■■■■□ 3.02
CERS1-201ENST00000429504 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP33.91■■■■□ 3.02
CERS1-201ENST00000429504 TSHZ3Q63HK5 1081 aa33.91■■■■□ 3.02
CERS1-201ENST00000429504 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP33.89■■■■□ 3.02
CERS1-201ENST00000429504 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa33.89■■■■□ 3.02
CERS1-201ENST00000429504 ANXA1P04083 346 aa33.89■■■■□ 3.02
CERS1-201ENST00000429504 SRGAP3O43295 1099 aa33.88■■■■□ 3.01
CERS1-201ENST00000429504 SURF6O75683 361 aaKnown RBP33.87■■■■□ 3.01
CERS1-201ENST00000429504 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa33.87■■■■□ 3.01
CERS1-201ENST00000429504 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa33.87■■■■□ 3.01
CERS1-201ENST00000429504 ALDH1L1O75891 902 aa33.86■■■■□ 3.01
CERS1-201ENST00000429504 GBP4Q96PP9 640 aa33.86■■■■□ 3.01
CERS1-201ENST00000429504 ST18O60284 1047 aa33.86■■■■□ 3.01
CERS1-201ENST00000429504 HYPKQ9NX55 129 aa33.86■■■■□ 3.01
CERS1-201ENST00000429504 KSR2Q6VAB6 950 aa33.85■■■■□ 3.01
CERS1-201ENST00000429504 MTX1Q13505 466 aa33.84■■■■□ 3.01
CERS1-201ENST00000429504 TNS3Q68CZ2 1445 aa33.84■■■■□ 3.01
CERS1-201ENST00000429504 NPHP3Q7Z494 1330 aa33.84■■■■□ 3.01
CERS1-201ENST00000429504 RHPN1Q8TCX5 695 aa33.84■■■■□ 3.01
CERS1-201ENST00000429504 KIF1BPQ96EK5 621 aa33.84■■■■□ 3.01
CERS1-201ENST00000429504 TRAK2O60296 914 aa33.84■■■■□ 3.01
CERS1-201ENST00000429504 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP33.84■■■■□ 3.01
CERS1-201ENST00000429504 CHMLP26374 656 aa33.83■■■■□ 3.01
CERS1-201ENST00000429504 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa33.83■■■■□ 3.01
CERS1-201ENST00000429504 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa33.83■■■■□ 3.01
CERS1-201ENST00000429504 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa33.83■■■■□ 3.01
CERS1-201ENST00000429504 PROSER3Q2NL68 480 aa33.83■■■■□ 3.01
CERS1-201ENST00000429504 CADPS2Q86UW7 1296 aa33.83■■■■□ 3.01
CERS1-201ENST00000429504 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP33.82■■■■□ 3
CERS1-201ENST00000429504 C5P01031 1676 aa33.82■■■■□ 3
CERS1-201ENST00000429504 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa33.82■■■■□ 3
CERS1-201ENST00000429504 FOXD4L1Q9NU39 408 aa33.82■■■■□ 3
CERS1-201ENST00000429504 NLRP2Q9NX02 1062 aa33.82■■■■□ 3
CERS1-201ENST00000429504 HDAC5Q9UQL6 1122 aa33.81■■■■□ 3
CERS1-201ENST00000429504 MEGF6O75095 1541 aa33.8■■■■□ 3
CERS1-201ENST00000429504 TATP17735 454 aaPredicted RBP33.8■■■■□ 3
CERS1-201ENST00000429504 RILPL2Q969X0 211 aa33.8■■■■□ 3
CERS1-201ENST00000429504 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP33.8■■■■□ 3
CERS1-201ENST00000429504 SPG7Q9UQ90 795 aa33.8■■■■□ 3
CERS1-201ENST00000429504 PKD1L3Q7Z443 1732 aa33.8■■■■□ 3
CERS1-201ENST00000429504 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa33.79■■■■□ 3
CERS1-201ENST00000429504 PTMSP20962 102 aa33.79■■■■□ 3
CERS1-201ENST00000429504 SLC52A2Q9HAB3 445 aa33.79■■■■□ 3
CERS1-201ENST00000429504 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP33.78■■■■□ 3
CERS1-201ENST00000429504 PHKG2P15735 406 aa33.78■■■■□ 3
CERS1-201ENST00000429504 ZNF790Q6PG37 636 aa33.78■■■■□ 3
CERS1-201ENST00000429504 CLEC17AQ6ZS10 378 aa33.78■■■■□ 3
CERS1-201ENST00000429504 MRC1P22897 1456 aa33.78■■■■□ 3
CERS1-201ENST00000429504 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP33.77■■■■□ 3
CERS1-201ENST00000429504 STRCQ7RTU9 1775 aa33.76■■■■□ 3
CERS1-201ENST00000429504 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP33.76■■■■□ 3
CERS1-201ENST00000429504 DDX58O95786 925 aaKnown RBP33.76■■■■□ 3
CERS1-201ENST00000429504 NUTM1Q86Y26 1132 aa33.76■■■■□ 3
CERS1-201ENST00000429504 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP33.76■■■■□ 3
CERS1-201ENST00000429504 MCCP23508 829 aa33.76■■■□□ 2.99
CERS1-201ENST00000429504 UNC5CLQ8IV45 518 aa33.76■■■□□ 2.99
CERS1-201ENST00000429504 PI4K2BQ8TCG2 481 aa33.76■■■□□ 2.99
CERS1-201ENST00000429504 BRPF3Q9ULD4 1205 aa33.76■■■□□ 2.99
CERS1-201ENST00000429504 ANAPC15P60006 121 aa33.75■■■□□ 2.99
CERS1-201ENST00000429504 LINS1Q8NG48 757 aa33.75■■■□□ 2.99
CERS1-201ENST00000429504 IL17RAQ96F46 866 aa33.74■■■□□ 2.99
CERS1-201ENST00000429504 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP33.74■■■□□ 2.99
CERS1-201ENST00000429504 PDIA6Q15084 440 aa33.73■■■□□ 2.99
CERS1-201ENST00000429504 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP33.73■■■□□ 2.99
CERS1-201ENST00000429504 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP33.73■■■□□ 2.99
CERS1-201ENST00000429504 CPDO75976 1380 aa33.73■■■□□ 2.99
CERS1-201ENST00000429504 IFNL2Q8IZJ0 200 aa33.73■■■□□ 2.99
CERS1-201ENST00000429504 UTYO14607 1347 aa33.73■■■□□ 2.99
CERS1-201ENST00000429504 IL27Q8NEV9 243 aa33.72■■■□□ 2.99
CERS1-201ENST00000429504 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa33.72■■■□□ 2.99
CERS1-201ENST00000429504 SSFA2P28290 1259 aa33.71■■■□□ 2.99
CERS1-201ENST00000429504 NUCB2P80303 420 aa33.71■■■□□ 2.99
CERS1-201ENST00000429504 ANO2Q9NQ90 1003 aa33.71■■■□□ 2.99
CERS1-201ENST00000429504 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa33.7■■■□□ 2.99
CERS1-201ENST00000429504 FSD2A1L4K1 749 aa33.7■■■□□ 2.98
CERS1-201ENST00000429504 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP33.7■■■□□ 2.98
CERS1-201ENST00000429504 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP33.69■■■□□ 2.98
CERS1-201ENST00000429504 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP33.69■■■□□ 2.98
CERS1-201ENST00000429504 CABLES1Q8TDN4 633 aa33.69■■■□□ 2.98
CERS1-201ENST00000429504 TTC41PQ6P2S7 1318 aa33.69■■■□□ 2.98
CERS1-201ENST00000429504 GRM8O00222 908 aa33.68■■■□□ 2.98
CERS1-201ENST00000429504 MCM2P49736 904 aa33.68■■■□□ 2.98
CERS1-201ENST00000429504 SLC39A6Q13433 755 aa33.68■■■□□ 2.98
CERS1-201ENST00000429504 ERC1Q8IUD2 1116 aa33.68■■■□□ 2.98
CERS1-201ENST00000429504 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa33.68■■■□□ 2.98
CERS1-201ENST00000429504 DCAF5Q96JK2 942 aa33.68■■■□□ 2.98
CERS1-201ENST00000429504 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP33.67■■■□□ 2.98
CERS1-201ENST00000429504 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP33.67■■■□□ 2.98
CERS1-201ENST00000429504 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP33.67■■■□□ 2.98
CERS1-201ENST00000429504 CNTROBQ8N137 903 aa33.66■■■□□ 2.98
CERS1-201ENST00000429504 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa33.65■■■□□ 2.98
CERS1-201ENST00000429504 NEK4P51957 841 aa33.65■■■□□ 2.98
CERS1-201ENST00000429504 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP33.65■■■□□ 2.98
CERS1-201ENST00000429504 GOLGA6L22H0YM25 854 aa33.64■■■□□ 2.98
CERS1-201ENST00000429504 CHRNA2Q15822 529 aa33.64■■■□□ 2.98
CERS1-201ENST00000429504 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP33.64■■■□□ 2.98
CERS1-201ENST00000429504 PALD1Q9ULE6 856 aa33.64■■■□□ 2.98
CERS1-201ENST00000429504 CYP27B1O15528 508 aa33.63■■■□□ 2.97
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